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.2006年7月1日；34（Web服务器问题）：W451-4。
doi:10.1093/nar/gkl243。

RNAhybrid：microRNA靶点预测简单、快速、灵活

扬·克吕格 1, 马克·雷姆斯迈耶
附属公司

RNAhybrid：microRNA靶点预测简单、快速、灵活

扬·克鲁格等。 核酸研究. .

摘要

在阐明microRNA调控网络时，潜在靶点的知识至关重要。在现有的目标预测方法中，RNA杂交[M.Rehmsmeier、P.Steffen、M.Höchsmann和R.Giegerich（2004）RNA，101507-1517]在提供灵活的在线预测方面是独一无二的。最近，添加了一些有用的功能，其中包括在种子区域禁止G:U碱基对的可能性，以及种子匹配加速，这将程序加速了8倍。此外，该程序现在可以用作来自用户实现程序的远程调用的Web服务。我们通过在lin-39的3'非翻译区预测秀丽隐杆线虫miR-241的非标准靶点来证明RNA杂交的灵活性。RNAhybrid可在http://bibiserv.techfak.uni-bielefeld.de/rnahidd。

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