Tissue-specific expression of TRP channel genes in the mouse and its variation in three different mouse strains

doi:10.1186/1471-2164-7-159

比较研究

.2006年6月20:7:159。

doi:10.1186/1471-2164-7-159。

小鼠TRP通道基因的组织特异性表达及其在三种不同小鼠品系中的变异

克里斯蒂安·库内特·基尔¹, 弗雷德里克·比斯平, 贾娜·克鲁格, 海因里希·布林克梅尔

附属公司

PMID： 16787531
预防性维修识别码：项目经理1557673
内政部： 10.1186/1471-2164-7-159

比较研究

小鼠TRP通道基因的组织特异性表达及其在三种不同小鼠品系中的变异

克里斯蒂安·库内特·基尔等。 BMC基因组学. 2006.

.2006年6月20:7:159。

doi:10.1186/1471-2164-7-159。

作者

克里斯蒂安·库内特·基尔¹, 弗雷德里克·比斯平, 贾娜·克鲁格, 海因里希·布林克梅尔

附属

¹Ernst Moritz Arndt Greifswald大学病理生理学研究所，德国卡尔斯堡，11C，D-17495。keil@uni-greifswald.de

PMID： 16787531
预防性维修识别码：项目经理1557673
内政部： 10.1186/1471-2164-7-159

摘要

背景：本研究旨在研究小鼠瞬时受体电位（TRP）通道的基因表达。标准化定量技术TaqMan RT-PCR的应用应提供关于TRP通道对小鼠组织和细胞类型的模式和相对重要性的信息。为了用独立的方法验证数据集，我们通过原位杂交研究了一些转录物的出现。

结果：我们对小鼠22个TRP通道的mRNA表达进行了表征，重点是神经和肌肉组织。这是首次采用标准化和定量技术描述四个相关的第1组亚家族（TRPC、TRPV、TRPM和TRPA）的所有通道亚型的表达谱。转录物丰度的比较显示，TRPM7和TRPC3在大多数组织中始终占优势。我们进一步观察到超过三个数量级的单个通道的特征模式和基因表达差异。TRP通道mRNA的总体水平在脑区最高，其次是肾、肺、生殖器官和肌肉。在大脑中，TRPM3和TRPM7占主导地位，检测到19种其他亚型。在肺和肾中，TRPV4、TRPV5和TRPM7的水平最高。所有受试肌肉组织中均存在TRPM7、TRPC3、TRPC6和TRPM3 mRNA。用C57Bl/10小鼠株获得的大多数数据均经Balb/c和NOD小鼠证实。然而，TRPC3、C6、TRPM7、M3、TRPV2和V4在三种受试小鼠菌株中的表达存在显著差异。原位杂交揭示了转录物在细胞水平上的共表达，并广泛证实了RT-PCR获得的数据。

结论：编码TRP阳离子通道的TRPC、TRPV、TRPM和TRPA亚家族成员的转录物存在于广泛的小鼠组织中。几种通道异构体通常共存于特定的组织或细胞类型中。如其他离子通道家族所知，TRP通道的表达并没有显示出个体成员的典型组织特异性优势。小鼠品系特异性TRP通道表达的变化表明，遗传背景或生理需求会显著影响表达水平。

PubMed免责声明

数字

图1
**标准RT-PCR检测小鼠组织中TRP通道mRNA的表达**将来自成年（100 d）C57Bl/10SC小鼠组织的反转录RNA（8 ng）添加到反应混合物中，并在40个周期内扩增PCR产物。产物在琼脂糖凝胶上分离并用溴化乙锭染色。水作为阴性对照。1）睾丸；2）肝脏；3）肺；4）脾脏；5）骨骼肌；6）附睾；7）肾脏；8）卵巢；9）精囊；10）子宫；11） C2C12细胞；12） H（H）₂O；13）主动脉；14）肠；15）心脏；16）海马；17）脑干18）前脑；19）大脑20）小脑；21）脑干。

图2
**实时RT-PCR定量小鼠组织中TRP离子通道mRNA水平**使用实时RT-PCR分析小鼠组织中TRPC1-7（A）、TRPV1-6和TRPA1（B）以及TRPM1-8（C）mRNA的表达。样本来自成年（100天）C57Bl/10SC小鼠。TRP离子通道的mRNA水平是相对于18S rRNA给出的。所有情况下，n=3-10个样本的平均值±S.E.M.都是给出的。

图3
**组织特异性TRP通道基因表达综述**通过实时RT-PCR测定小鼠组织中TRPC1-7、TRPM1-8、TRPV1-6和TRPA1 mRNA的表达。mRNA水平与18S rRNA水平相关；所有数据都乘以1000。平均值由3–10个样本计算得出，并分为5类。如果40个扩增周期后未达到TaqMan RT-PCR技术规定的荧光阈值水平，则相应的通道转录物和组织的表达水平为零（0）。为了更好地说明，基因表达水平的类别由从零（白色）到高于10（深蓝色）的值的不同颜色表示。

图4
**利用原位杂交技术对三种TRPC mRNA在小鼠不同器官中的原位定位**.现场用成年（100d）C57Bl/10SC小鼠的组织切片进行TRPC3、TRPC5和TRPC6 mRNA的杂交。将两个左侧柱的切片分别与TRPC3的反义探针和有义探针（对照）孵育。对于TRPC5和TRPC6，仅显示反义探针的结果。组织切片：A类：海马体，B类：肾脏，C类：肺，D类：附睾，E类：骨骼肌。在所有情况下，都进行了甲基绿反击训练。放大倍数：×200。

图5
**不同品系小鼠TRP通道mRNA水平的比较**通过实时RT-PCR测定三种不同小鼠菌株的选定组织中TRPC3、C6、M3、M7、V2和V4通道的表达。从成年（100天）C57Bl/10SC（灰色柱）、NOD（黑色柱）和Balb/c小鼠（虚线柱）中采集组织样本。TRP通道的mRNA水平与大脑（A）、肾脏（B）、骨骼肌（C）和心脏（D）的18S rRNA有关。对于n=3-10个样品，给出了所有情况下的平均值±S.E.M。

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