A microRNA expression signature of human solid tumors defines cancer gene targets

doi:10.1073/pnas.0510565103

.2006年2月14日；103(7):2257-61.

doi:10.1073/pnas.0510565103。 Epub 2006年2月3日。

人类实体肿瘤的microRNA表达特征确定了肿瘤基因靶点

斯特凡诺·沃利尼亚¹, 乔治·A·卡林, 刘长工, 斯特凡·安布斯, 阿米莉亚·西米诺, 法比奥·彼得罗卡, 罗莎·维松, 玛丽莲娜·伊奥里奥, 克劳迪娅·罗尔多, 曼纽拉·费拉辛, 罗宾·L·普鲁埃特, Nozumu Yanaihara公司, 乔瓦尼·兰扎, 阿尔多·斯卡帕, 安德烈亚·维基奥内, 马西莫·内格里尼, 柯蒂斯·C·哈里斯, 卡洛·克罗斯

附属公司

PMID： 16461460
预防性维修识别码：项目经理1413718
内政部： 10.1073/pnas.0510565103

人类实体肿瘤的microRNA表达特征确定了肿瘤基因靶点

斯特凡诺·沃利尼亚等。美国国家科学院程序. 2006.

.2006年2月14日；103(7):2257-61.

doi:10.1073/pnas.0510565103。 Epub 2006年2月3日。

作者

附属

¹俄亥俄州立大学分子病毒学、免疫学、医学遗传学和癌症综合中心系，美国俄亥俄州哥伦布43210。

PMID： 16461460
预防性维修识别码：项目经理1413718
内政部： 10.1073/pnas.0510565103

摘要

小的非编码microRNAs（miRNAs）可以促进癌症的发展和进展，并且在正常组织和癌症中有不同的表达。通过对540个样本（包括肺、乳腺、胃、前列腺、结肠和胰腺肿瘤）进行大规模miRnome分析，我们发现了一个由大量过度表达的miRNA组成的实体癌miRNA标志。在这些miRNA中，有一些具有良好特征的癌症相关性，如miR-17-5p、miR-20a、miR-21、miR-92、miR-106a和miR-155。差异表达miRNAs的预测靶点在蛋白编码的肿瘤抑制因子和癌基因中显著富集（P<0.0001）。许多预测的靶点，包括肿瘤抑制因子RB1（视网膜母细胞瘤1）和TGFBR2（转化生长因子，β受体II）基因已通过实验证实。我们的结果表明，miRNAs广泛参与实体肿瘤的癌症发病机制，并支持其作为显性或隐性癌症基因的功能。

PubMed免责声明

利益冲突声明

利益冲突声明：未声明冲突。

数字

**图1。**
对代表六种实体癌和各自正常组织的540个样本进行聚类分析。当MiRNAs在至少90%的样本中的表达水平（背景吸收强度）高于阈值（256）时，将其纳入树中。保留137个miRNAs进行聚类。阵列以中位数为中心，通过使用基因簇2.0使用无中心相关度量进行平均连锁聚类。

**图2。**
六种实体癌的miRNA表达特征。(A类)实体癌中差异调节miRNAs的表达。至少90%的组织中存在61个miRNA。树显示log2转换后的平均绝对表达式值。计算来自相同组织或肿瘤组织类型的所有样本的平均值。基因和阵列以平均值为中心，并通过使用基因簇2.0利用欧氏距离进行平均连锁聚类。(B类)至少75%的实体肿瘤中存在miRNAs的折叠变化（癌症与正常），其中至少有一个肿瘤绝对值高于2。该树显示平均折叠变化的log2转换（癌症高于正常）。计算来自相同组织或肿瘤组织类型的所有样本的平均值。数组以平均值为中心，并使用基因簇2.0使用无中心相关度量进行平均连锁聚类。(C类)至少50%实体肿瘤的特征中存在miRNAs的折叠变化（癌症与正常）。该树显示平均折叠变化的log2转换（癌症高于正常）。对来自相同组织或肿瘤组织类型的所有样本计算平均值。数组以平均值为中心，并使用基因簇2.0使用无中心相关度量进行平均连锁聚类。

**图3。**
以蛋白质编码的癌症基因为靶点的固体癌症miRNA标记成分。(A类)不同癌症蛋白编码基因的3′UTR能够调节癌症miRNA。这些数据显示了萤火虫荧光素酶表达的相对抑制，该抑制标准化为转染对照肾小球荧光素酶。如图2和表2所示，miRNAs是从实体癌中差异调节的细胞中选择的。PLAG1，多形性腺瘤基因1；TGFBR2、转化生长因子、β受体II、Rb、视网膜母细胞瘤基因。pGL-3（Promega）用作空载体。*miR-20a型*，*miR-26a-1型*、和*miR-106型*寡核苷酸（sense和scrambled）用于转染。第二个实验使用缺乏5′miRNA-end互补位点（MUT）的每个靶mRNA的突变版本作为对照，如赖特.所有实验均进行了两次，一式三份(n个= 6). (B类)在癌症患者中，RB1蛋白水平与*miR-106a型*表达。为了正常化，我们使用了β肌动蛋白。

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