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.2003:2:104-13.

结合微阵列和生物知识通过贝叶斯网络估计基因网络

附属公司
  • PMID: 16452784

结合微阵列和生物知识通过贝叶斯网络估计基因网络

Seiya Imoto公司等。 程序IEEE Compute Soc Bioinform Conf. 2003.

摘要

我们提出了一种基于贝叶斯网络的统计方法,用于从微阵列基因表达数据以及生物知识(包括蛋白质相互作用、蛋白质-DNA相互作用、结合位点信息、现有文献等)估计基因网络。不幸的是,在许多情况下,微阵列数据不包含准确构建基因网络所需的足够信息。我们的方法在贝叶斯统计框架下将生物知识添加到基因网络的估计方法中,并自动控制微阵列信息和生物知识之间的权衡。我们进行了蒙特卡罗模拟,以证明该方法的有效性。我们分析酿酒酵母基因表达数据作为应用。

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