跳到主页内容
美国国旗

美国政府的官方网站

Dot政府

gov意味着它是官方的。
联邦政府网站通常以.gov或.mil结尾。之前分享敏感信息，确保你在联邦政府政府网站。

Https系统

该站点是安全的。
这个https（https）：//确保您连接到官方网站，并且您提供的任何信息都是加密的并安全传输。

访问密钥 NCBI主页 MyNCBI主页 主要内容 主导航
.2006年1月17日；103(3):732-7.
doi:10.1073/pnas.0506655103。 Epub 2006年1月4日。

人体胃中细菌微生物群的分子分析

伊丽莎白·M·自行车 1, 保罗·B·埃克伯格, 史蒂文·R·吉尔, 凯伦·尼尔森, 伊丽莎白·阿普多姆, 弗里茨·弗朗索瓦, 吉列尔莫·佩雷斯, 马丁·布拉泽, 大卫·A·雷尔曼
附属公司

人体胃内细菌菌群的分子分析

伊丽莎白·M·自行车等。 美国国家科学院程序. .

摘要

人类胃的微生物群以及幽门螺杆菌定植对其组成的影响在很大程度上仍然未知。我们使用16S rDNA小亚基克隆文库方法对人类胃粘膜内的细菌多样性进行了表征，并分析了23个胃内窥镜活检样本的广谱细菌PCR产生的1833个序列。鉴定出一个由128种藻型组成的多样性群落，该群落的多样性高于先前描述的群落。大多数序列被指定为变形杆菌、厚壁菌、放线菌、拟杆菌和梭杆菌门。百分之十的门型以前没有特征，包括一种与Deinococcus相关的生物，其亲属在极端环境中被发现，但在人类中以前没有报道过。19名受试者的胃克隆文库含有幽门螺杆菌rDNA；然而，这些受试者中只有12人通过常规实验室方法检测出幽门螺杆菌阳性。统计分析显示胃生态系统存在很大程度的受试者间差异。幽门螺杆菌的存在并不影响胃群落的组成。该胃细菌rDNA数据集与其他研究中描述的人类口腔和食道的序列收集有显著差异，表明人类胃可能是一个独特的微生物生态系统的家园。胃微生物群在人类健康和疾病中可能发挥着重要的、尚未发现的作用。

PubMed免责声明

数字

图1。
图1。
来自23名受试者的128个胃16S rDNA门型代表的系统发育树。GenBank条目以正常字体显示；先前未标记的藻型代表的名称（<99%的序列与已发表序列的一致性）以粗体显示。括号中显示了每个门型中的克隆数。该树是通过使用奥尔森校正的邻接分析构建的。>50的引导值（表示为100次复制的百分比）显示在分支点。比例尺表示进化距离（每100个核苷酸有10个取代）。图的右侧以灰色显示了每个胃标本的相对丰度（白色，0%存在；黑色，100%克隆库）。丰度图上方的字母对应于表3中的受试者A–W，发布为支持信息在PNAS网站上。受试者根据幽门螺杆菌如表2所示，通过常规和分子测试确定的状态，按百分比递增幽门螺杆菌克隆。
图2。
图2。
对从人类胃活检标本中回收的全部组合细菌16S rRNA基因克隆文库进行稀有分析。绘制观察到的藻型数量的稀疏曲线(S公司光突发事件)作为克隆数的函数，计算公式为估计同时绘制了物种丰富度的校正Chao1估计值（1000次随机化后）。虚线表示95%置信区间。
图3。
图3。
胃标本分离克隆的相对门型频率。根据序列在图1中的系统发育树中的位置，将其分配给细菌门。∑，来自所有23个学科的联合图书馆，包括幽门螺杆菌序列（1833个序列）。胃文库分为三组；构件如图1和表3所示。组：1，克隆库不包含幽门螺杆菌四名受试者的rDNA序列为阴性幽门螺杆菌通过常规测试；2，克隆库包含幽门螺杆菌七名阴性受试者的序列幽门螺杆菌通过常规测试；3，克隆库包含幽门螺杆菌来自12名受试者的序列幽门螺杆菌通过常规测试。对于第1-3组，只有非-幽门螺杆菌显示了序列。
请参阅PMC中的此图像和版权信息

类似文章

查看所有类似文章

引用人

查看所有“被引用”文章

工具书类

    1. Peek，R.M.，Jr.和Blaser，M.J.（2002）《国家癌症评论》2，28-37。-公共医学
    1. Adamsson，I.、Nord，C.E.、Lundquist，P.、Sjostedt，S.和Edlund，C.（1999）《抗微生物杂志》。Chemother公司。44, 629–640.-公共医学
    1. Savage，D.C.（1977）《年度报告》。微生物评论。31, 107–133.-公共医学
    1. Amann，R.I.，Ludwig，W.&Schleifer，K.H.（1995）《微生物》。第59/143–169版。-项目管理咨询公司-公共医学
    1. Hugenholtz，P.、Goebel，B.M.和Pace，N.R.（1998）细菌杂志。180, 4765–4774.-项目管理咨询公司-公共医学

出版物类型

关联数据

LinkOut-更多资源