Human microRNAs target a functionally distinct population of genes with AT-rich 3' UTRs

doi:10.1073/pnas.0507443102

.2005年10月25日；102(43):15557-62.

doi:10.1073/pnas.0507443102。 Epub 2005年10月17日。

人类microRNAs靶向具有AT-rich 3'UTR的功能不同的基因群体

哈兰·罗宾斯¹, 威廉H出版社

附属机构

PMID： 16230613
预防性维修识别码：项目经理1257391
DOI（操作界面）： 10.1073/pnas.0507443102

人类microRNAs靶向具有AT-rich 3'UTR的功能不同的基因群体

哈兰·罗宾斯等。美国国家科学院程序. 2005.

.2005年10月25日；102(43):15557-62.

doi:10.1073/pnas.0507443102。 Epub 2005年10月17日。

作者

哈兰·罗宾斯¹, 威廉H出版社

附属

¹美国新泽西州普林斯顿爱因斯坦大道高等研究所，邮编08540。

PMID： 16230613
预防性维修识别码：项目经理1257391
DOI（操作界面）： 10.1073/pnas.0507443102

摘要

在研究微小RNA靶点时，我们发现人类基因根据其3'UTR中A加T碱基的比例分为两个大致相等的群体。使用基因本体数据库，我们发现两个基因群体之间存在显著的功能差异，富含AT-的基因参与转录和翻译过程，富含GC-的基因涉及信号转导和翻译后蛋白修饰。更好地了解3'UTR中核苷酸的背景分布可能有助于改进对人类微小RNA靶向基因的预测。我们预测至少有1200个KnownGene转录物受microRNAs调控。这些microRNA靶标中的大多数位于富含AT-的3'UTR人群中。然而，尽管对富含AT的靶标有这种偏好，但发现微小RNA靶标优先是调节基因本身，包括转录因子和翻译后修饰物。这些结果表明，一些涉及mRNA的过程（其中microRNA调节可能只是其中之一）需要3'UTR的AT富集度才能发挥功能。本文描述了这3’UTR群体与大规模基因组等容线之间的关系，而不仅仅是一对一的关系。

PubMed免责声明

数字

**图1。**
人类3′UTR的组成A类+T型在水平轴上C类–克在垂直轴上。(顶部)所有人类基因均以红色绘制。红色椭圆是具有两个分量的最大似然高斯混合模型的2-σ等高线。(中部)无脊椎动物，包括*秀丽线虫*和*D.黑腹果蝇*，在同一轴线上绘制时，不要显示超过一个总体。(底部)与相同顶部（浅红色），可能的miRNA靶基因现在标为绿色（Lewis等。“高信噪比”设置；参考文献6）和蓝色（根据本文方法确定的可能目标）。miRNA靶点位于右侧（富含AT-）组分中，选择性约为3:1。

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