跳到主页面内容
美国国旗

美国政府的官方网站

Dot政府

gov意味着它是官方的。
联邦政府网站通常以.gov或.mil结尾。之前分享敏感信息,确保你在联邦政府政府网站。

Https系统

该站点是安全的。
这个https(https)://确保您连接到官方网站,并且您提供的任何信息都是加密的并安全传输。

访问密钥 NCBI主页 MyNCBI主页 主要内容 主导航
.2005年11月1日;21(21):4067-8.
doi:10.1093/bioinformatics/bti652。 Epub 2005年9月1日。

BiQ分析仪:亚硫酸氢盐测序中DNA甲基化数据的可视化和质量控制

附属公司

BiQ分析仪:亚硫酸氢盐测序中DNA甲基化数据的可视化和质量控制

克里斯托夫·博克等。 生物信息学. .

摘要

总结:手工处理亚硫酸氢盐测序中的DNA甲基化数据是一项繁琐且容易出错的任务。这里我们介绍了一个交互式软件工具,它为这个过程提供了从头到脚的支持。该工具以易于使用的方式帮助用户从定序器中导入序列文件,对齐它们,排除或纠正关键序列,记录实验,执行基本统计,并生成公开质量图。重点放在质量控制上:程序自动评估数据质量,并为处理关键序列提供警告和建议。BiQ Analyzer程序是用Java编程语言实现的,可以在任何有最新Java虚拟机的平台上运行。

可利用性:该程序对非商业用户免费提供,可从以下网址下载http://biq-analyzer.bioinf.mpi-inf.mpg.de/

PubMed免责声明

类似文章

引用人

  • Pramel15促进合子核DNMT1降解和DNA去甲基化。
    Tan J、Li Y、Li X、Zhu X、Liu L、Huang H、Wei J、Wang H、Tian Y、Wang Z、Zhang Z和Zhu B。 Tan J等人。 国家公社。2024年8月25日;15(1):7310. doi:10.1038/s41467-024-51614-0。 国家公社。2024 PMID:39181896 免费PMC文章。
  • CRISPR/dCas9-介导的DNA甲基化编辑emx2中国鞋底(半滑舌鳎)睾丸细胞。
    孙毅、王慧、刘乙、岳乙、刘Q、刘毅、罗莎·IF、多雷托·LB、韩S、林L、龚X、邵C。 孙毅等。 国际分子科学杂志。2024年7月11日;25(14):7637. doi:10.3390/ijms25147637。 国际分子科学杂志。2024 PMID:39062879 免费PMC文章。
  • 小鼠原始生殖细胞样细胞的可扩展高效生成。
    丁X,李莉,高J,易D,斯基门蒂JC。 丁X等。 bioRxiv[预印本]。2024年2月15日:2024.02.15.580543。doi:10.1101/2024.02.15.580543。 生物Rxiv。2024 PMID:38405756 免费PMC文章。 预打印。
  • CDCA7相关的全局异常DNA低甲基化转化为局部、组织特异性转录反应。
    Vukic M、Chouaref J、Della Chiara V、Dogan S、Ratner F、Hogenboom JZM、Epp TA、Chawengsaksophak K、Vonk KKD、Breukel C、Ariyurek Y、San Leon Granado D、Kloet SL、Daxinger L。 Vukic M等人。 科学进展2024年2月9日;10(6):eadk3384。doi:10.1126/sciadv.adk3384。Epub 2024年2月9日。 科学进展2024。 PMID:38335290 免费PMC文章。
  • 雌激素受体-α和PNPLA3 p.I148M变异体之间的相互作用导致女性对脂肪肝的易感性。
    Cherubini A、Ostadreza M、Jamialahmadi O、Pelusi S、Rrapaj E、Casirati E、Passignani G、Norouziesfahani M、Sinopoli E、Baselli G、Meda C、Dongiovanni P、Dondosola D、Youngson N、Tourna A、Chokshi S、Bugianesi E;流行病研究调查员;Della Torre S、Prati D、Romeo S、Valenti L。 Cherubini A等人。 《自然医学》,2023年10月;29(10):2643-2655. doi:10.1038/s41591-023-02553-8。Epub 2023年9月25日。 《国家医学》,2023年。 PMID:37749332 免费PMC文章。

出版物类型

LinkOut-更多资源