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.2005年9月;2(9):691-7.
doi:10.1038/nmeth778。

用于初级人类标本高含量功能蛋白质组学的流线型平台

附属公司

用于初级人类标本高含量功能蛋白质组学的流线型平台

纳迪姆·杰萨尼等。 Nat方法. 2005年9月.

摘要

实现令人满意的广度和深度的信息内容仍然是蛋白质组学的一项艰巨挑战。这个问题与原始人类标本的研究特别相关,例如肿瘤活检,这些标本是异质的,数量有限。在此,我们提出了一种功能蛋白质组学策略,该策略将基于活性的蛋白质分析和多维蛋白质识别技术(ABPP-MudPIT)结合起来,用于简化人体样本分析。这个聚合平台涉及一个快速的初始阶段,在此阶段生成酶活性特征以对样品进行功能分类,然后对每个类别的代表性成员进行深入分析。使用这种双层方法,我们在人类乳腺肿瘤中鉴定出50多种酶活性,其中近三分之一代表以前未经特征化的蛋白质。与cDNA微阵列的比较显示,酶的活性(而非mRNA表达)描述了肿瘤类别,这突显了ABPP-MudPIT在发现新的人类疾病标记物方面的威力,这些标记物可能会逃避其他分子分析方法的检测。

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