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.2005年8月;37(8):853-62.
doi:10.1038/ng1598。 Epub 2005年7月10日。

染色体和启动子特异性分析确定正常和转化人类细胞中差异DNA甲基化的位点

附属公司

染色体和启动子特异性分析确定正常和转化人类细胞中差异DNA甲基化的位点

米夏埃尔·韦伯等。 自然基因. 2005年8月.

摘要

胞嘧啶甲基化是哺乳动物发育所必需的,在人类癌症中经常受到干扰。为了确定这种表观遗传修饰是如何分布在原始细胞和转化细胞的基因组中的,我们使用免疫捕获方法,然后进行DNA微阵列分析,以80-kb分辨率和一大组CpG岛生成所有人类染色体的甲基化简档。在原代细胞中,我们发现了广泛的基因组差异甲基化区域,在基因丰富的社区中甲基化水平较高。雌性和雄性细胞的常染色体特征无法区分,但在X染色体上存在差异。非活性X染色体(Xi)仅在基因丰富区域的一个子集发生了高甲基化,而相对于其活性对应物,却意外地发生了整体低甲基化。转化细胞的染色体甲基化特征与原代细胞相似。然而,我们在基因贫困地区的转化细胞中检测到大量低甲基化的基因组片段。此外,对6000个CpG岛的分析表明,只有一小部分启动子发生了不同的甲基化,这表明恶性肿瘤中CpG岛屿启动子的异常甲基化可能比先前假设的要少。

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