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.2005年7月1日；19(13):1512-7.
doi:10.1101/gad.1302205。

剪接期间人类TREX复合物对mRNA的招募

Masuda先生 1, 丽塔·达斯, 洪成, 埃德·赫特, 尼杰·多曼, 罗宾·里德
附属机构

剪接期间人类TREX复合物对mRNA的招募

Masuda先生等。 基因开发. .

摘要

在酵母中，TREX复合物包含THO转录延伸复合物，其在mRNA输出蛋白Sub2和Yra1向新生转录物的直接共转录招募中发挥作用。在这里，我们报告了对人类THO复合物的鉴定，并表明它与剪接的mRNA相关，但与体外未剪接的前mRNA无关。本次招聘不需要成绩单。我们还表明，人体THO复合物与体内核斑点域中的剪接因子共定位。考虑到剪接在人类中是共转录的，我们的数据表明，人类TREX复合物向剪接mRNA的募集不是直接与转录偶联，而是通过剪接间接与转录偶联。

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数字

图1。
图1。
人类TREX复合物的特征。(A类)GST-UAP56不在时下拉（车道1)或存在（车道2,3)RNase处理的HeLa核提取物。用150 mM盐（车道）清洗GST-UAP56下拉装置2)或350 mM盐（车道三). 所示谱带通过质谱鉴定。（*）GST-UAP56二聚体和分解产物；（**）HeLa核提取物中的GST结合蛋白；鱼图标表示ARS2，这是一种在低盐和亚化学计量学上与hTREX复合物相关的蛋白质。(B类)GST-Aly在不在场的情况下下拉（车道1)或存在（车道2)RNase处理的HeLa核提取物。a–i是hTREX复合物中不存在的Aly相关蛋白。这些蛋白质的特性显示给正确的属于B类未显示核糖体蛋白等丰富蛋白质。(C类)GST-UAP56下拉物用谷胱甘肽洗脱，在Sephacryl S-500凝胶过滤柱上运行，部分在SDS凝胶上运行，然后进行银染色。（车道1)输入。（车道2)凝胶过滤分数。(D类)hTREX复合蛋白示意图。（死亡）死亡域；（DECD）DECD RNA解旋酶基序；（WD40）WD40重复；（RRM）RNA识别基序。(E类)用所示抗体对核提取物进行西方分析。特定蛋白质用星号表示。
图2。
图2。
核斑点中人类THO复合物的鉴定及其与剪接因子的共定位。(A类)使用抗hTho2抗体（lane）从RNase处理的HeLa核提取物中的免疫沉淀1)，抗fSAP79抗体（lane2)和免疫前血清（lane三). （H） 重型链条；（五十） 轻链。蛋白质通过质谱法鉴定。鱼图标指示的条带来自顶部到底部、RAD 50同源物、SAP 145、CDC27同源物和NMT 55。破折号表示分子量标记，从顶部到底部（千道尔顿）：181、115、82、63、48、37和26。(下部小组）免疫沉淀样品的西方分析。（NE）核提取物。(B类)模拟和hTho2免疫缺失核提取物的西方分析。方形表示非特定带。(C类)HeLa细胞的免疫荧光。Merge显示与SC35抗体共免疫荧光。
图3。
图3。
Aly和hTHO复合物与UAP56的不同区域结合。(A、 B类)在RNase处理的HeLa核提取物不存在（–）或存在（+）的情况下，GST下拉显示的蛋白质。hTHO成分用星号表示。在正确的如图所示的凝胶B类，破折号表示图1B中确定的Aly-相关蛋白。(下部小组）使用来自GST-UAP-N、GST-UAP、GST-Aly和GST-Aly-ΔC洗脱液的指示抗体进行西方分析A类和B类指出了UAP-N（氨基酸1-247）、UAP-C（氨基酸247-428）和AlyΔC（氨基酸1-239）的结构。(C类)hTHO复合物和Aly与UAP56相互作用的模型。hTHO复合体以虚线显示，因为它与UAP-N的结合较弱，这表明UAP56的其他区域需要有效的结合。
图4。
图4。
hTREX复合物通过转录依赖机制被招募到剪接mRNA。(A类)在剪接条件下培养T7 AdML前体mRNA 90分钟，并将反应的等分（5μL）用于免疫沉淀。(B类)T7-AdML前体mRNA（通道1–5)或相应的cDNA转录本（通道6–10)在剪接条件下培养，然后进行免疫沉淀。用荧光成像仪定量免疫沉淀相对于输入的百分比。四分之一的输入被加载到凝胶上。(C类–E类)Ftz前mRNA在HeLa核提取物的RNAP II转录/剪接系统中合成并剪接，时间为指定的时间（输入）。每个时间点取一等分（5μL）用于免疫沉淀。四分之一(C类)或十分之一(D、 电子)在凝胶上加载输入。（*）非特异性带。在RNAP II转录/剪接系统的孵育过程中标记U6 snRNA。对照抗体（cntrl a–c）是针对无关蛋白的兔抗体。
图5。
图5。
TREX综合招聘模型。(A类)Yra1（Y）和Sub2（S）通过THO复合物（THO）向新生酵母转录物直接共转录招募。(B类)hTREX复合物对剪接mRNA UAP56（U）、Aly（A）的间接共转录募集。
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    1. Abruzzi K.C.、Lacadie S.和Rosbash M.，2004年。TREX复合体向无内含子和含内含子酵母基因募集的生化分析。EMBO J.23:2620–2631。-项目管理咨询公司-公共医学
    1. Bentley D.2002年。mRNA组装线：转录和加工机器在同一工厂。货币。操作。细胞生物学。14: 336–342.-公共医学
    1. Chavez S.、Beilharz，T.、Rondon，A.G.、Erdjument Bromage，H.、Tempst，P.、Svejstrup，J.Q.、Lithgow，T.和Aguilera，A.2000。在酿酒酵母中，一种含有Tho2、Hpr1、Mft1和一种新蛋白Thp2的蛋白质复合物将转录延长与有丝分裂重组联系起来。EMBO期刊19:5824–5834。-项目管理咨询公司-公共医学
    1. Chavez S.、Garcia-Rubio M.、Prado F.和Aguilera A.，2001年。在酿酒酵母中，Hpr1优先用于长DNA序列或富含G+C的DNA序列的转录。分子细胞。生物学21:7054–7064。-项目管理咨询公司-公共医学
    1. Custodio N.、Carvalho C.、Condado I.、Antoniou M.、Blencowe B.J.和Carmo-Fonseca M.，2004年。哺乳动物细胞核内外显子连接复合体蛋白向转录位点的体内募集。RNA 10:622-633。-项目管理咨询公司-公共医学