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.2005年5月23日;579(13):2878-82.
doi:10.1016/j.febslet.2005.04.045。

基于广义字符串核和支持向量机的siRNA功能预测

附属公司
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基于广义字符串核和支持向量机的siRNA功能预测

Reiji Teramoto公司等。 FEBS信函. .
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摘要

小干扰RNA(siRNAs)被广泛用于哺乳动物细胞中的序列特异性基因沉默,但设计有效的siRNA仍然是一项具有挑战性的任务。在本研究中,我们利用广义字符串核(GSK)结合支持向量机(SVM)开发了一种预测siRNA功能的算法。使用GSK,根据每个siRNA中的子序列数,将siRNA序列表示为多维特征空间中的向量,然后使用SVM将其分类为有效或无效的siRNA。我们将该算法应用于已发表的siRNAs,可以分别以90.6%和86.2%的准确率对有效和无效的siRNA进行分类。

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