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比较研究
.2005年4月;37(4):382-90.
doi:10.1038/ng1532。 Epub 2005年3月20日。

人体B细胞调控网络的逆向工程

附属公司
比较研究

人体B细胞调控网络的逆向工程

卡蒂亚·巴索等。 自然基因. 2005年4月.

摘要

细胞表型由连接共调控基因的网络的差异活性决定。根据全基因组表达谱对此类网络进行反向工程的现有方法仅在分析具有简单基因组的低等真核生物时获得成功。使用一种名为ARACNe(精确细胞网络重建算法)的新方法,我们报道了从人类B细胞的表达谱重建调节网络。结果表明,这是一个分层的、无标度的网络,其中几个高度互联的基因(中心)占据了大多数交互作用。根据现有数据对网络进行验证后,将MYC确定为一个主要枢纽,该枢纽控制着一个由已知靶基因和新基因组成的网络,这些基因都经过了生物化学验证。新确定的MYC目标包括一些主要枢纽。这种方法通常可用于分析哺乳动物细胞中的正常和病理网络。

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