跳到主页内容
美国国旗

美国政府的官方网站

Dot政府

gov意味着它是官方的。
联邦政府网站通常以.gov或.mil结尾。之前分享敏感信息,确保你在联邦政府政府网站。

HTTP服务器

该站点是安全的。
这个https(https)://确保您连接到官方网站,并且您提供的任何信息都是加密的并安全传输。

访问密钥 NCBI主页 MyNCBI主页 主要内容 主导航
.2004年12月22日;16(6):929-41。
doi:10.1016/j.molcel.2004.12.004。

利用定量微阵列平台揭示哺乳动物选择性剪接的全球调控特征

附属公司
免费文章

利用定量微阵列平台揭示哺乳动物选择性剪接的全球调控特征

群盘等。 分子电池. .
免费文章

摘要

我们描述了微阵列平台的应用,该平台结合了外显子体和剪接连接探针的信息,对哺乳动物细胞中数千个外显子的组织特异性选择性剪接(AS)进行定量分析。通过该系统,我们分析了AS在小鼠主要组织中的整体特征。这些结果为组织特异性AS的功能提供了许多推论,深入了解了外显子的进化史如何影响其内含物水平,也提供了AS的全球调节特性如何定义组织类型的信息。与全球转录谱一样,全球AS谱反映了组织特性。有趣的是,我们发现转录和AS独立作用于不同的基因集,以定义组织特异性表达谱。这些结果证明了我们的定量微阵列平台和数据在揭示AS重要的全球调控特征方面的实用性。

PubMed免责声明

类似文章

  • 哺乳动物中枢神经系统中选择性剪接的功能协调。
    Fagnani M、Barash Y、Ip JY、Miswetta C、Pan Q、Saltzman AL、Shai O、Lee L、Rozenhek A、Mohammad N、Willaime-Morawek S、Babak T、Zhang W、Hughes TR、van der Kooy D、Frey BJ、BJ。 Fagnani M等人。 基因组生物学。2007;8(6):R108。doi:10.1186/gb-2007-8-6-r108。 基因组生物学。2007 PMID:17565696 免费PMC文章。
  • 选择性剪接的微阵列分析。
    Cuperlovic-Culf M、Belacel N、Culf AS、Ouellette RJ。 Cuperlovic-Culf M等人。 组学。2006年秋季;10(3):344-57. doi:10.1089/omi.2006.10.344。 OMICS公司。2006 PMID:17069512 审查。
  • 替代拼接:来自全球分析的新见解。
    布伦科BJ。 布伦科BJ。 单元格。2006年7月14日;126(1):37-47. doi:10.1016/j.cell.2006.06.023。 单元格。2006 PMID:16839875 审查。
  • 剪接微阵列发现的组织调节外显子附近异常的内含子保守性。
    Sugnet CW、Srinivasan K、Clark TA、O'Brien G、Cline MS、Wang H、Williams A、Kulp D、Blume JE、Haussler D、Ares M Jr。 Sugnet CW等人。 公共科学图书馆计算生物学。2006年1月;2(1):e4。doi:10.1371/journal.pcbi.0020004。Epub 2006年1月20日。 公共科学图书馆计算生物学。2006 PMID:16424921 免费PMC文章。
  • 人类组织中选择性剪接的变化。
    Yeo G、Holste D、Kreiman G、Burge CB。 Yeo G等人。 基因组生物学。2004;5(10):R74。doi:10.1186/gb-2004-5-10-r74。Epub 2004年9月13日。 基因组生物学。2004 PMID:15461793 免费PMC文章。

引用人

  • KDM3A和KDM3B通过调节选择性剪接保持天真的多能性。
    Dillingham CM、Cormaty H、Morgan EC、Tak AI、Esgdaille DE、Boutz PL、Sridharan R。 Dillingham CM等人。 bioRxiv[预印本]。2024年1月23日:2023.05.31.543088。doi:10.1101/2023.05.31.543088。 生物Rxiv。2024 PMID:37398291 免费PMC文章。 预打印。
  • Arg-tRNA合成酶通过SRRM2将炎症代谢与RNA剪接和核贩运联系起来。
    Cui H、Diedrich JK、Wu DC、Lim JJ、Nottingham RM、Moresco JJ、Yates JR 3rd、Blencowe BJ、Lambowitz AM、Schimmel P。 崔浩等。 自然细胞生物学。2023年4月;25(4):592-603. doi:10.1038/s41556-023-01118-8。Epub 2023年4月14日。 自然细胞生物学。2023 PMID:37059883
  • 时间分类器可预测炎症性肠病患者的组织病理学状态并分析其急性-慢性分期。
    Peters LA、Friedman JR、Stojmirovic A、Hagen J、Houten S、Dodatko T、Amaro MP、Restrepo P、Chai Z、Rodrigo Mora J、Raymond HA、Curran M、Dobrin R、Das A、Xiong H、Schadt EE、Argmann C、Losic B。 Peters LA等人。 公共生物。2023年1月24日;6(1):95. doi:10.1038/s42003-023-04469-y。 公共生物。2023 PMID:36694043 免费PMC文章。
  • 分支点强度控制物种特定凸轮2B选择性剪接和调节LTP。
    Franz A、Weber AI、Preußner M、Dimos N、Stumpf A、Ji Y、Moreno-Velasquez L、Voigt A、Schulz F、Neumann A、Kuropka B、Kühn R、Urlaub H、Schmitz D、Wahl MC、Heyd F。 Franz A等人。 生命科学联盟。2022年12月21日;6(3):e202201826。doi:10.26508/lsa.202201826。打印日期:2023年3月。 生命科学联盟。2022 PMID:36543542 免费PMC文章。
  • P2X7受体的选择性剪接异构体:结构、功能和疾病关联。
    De Salis SKF、Li L、Chen Z、Lam KW、Skarratt KK、Balle T、Fuller SJ。 De Salis SKF等人。 国际分子科学杂志。2022年7月25日;23(15):8174. doi:10.3390/ijms23158174。 国际分子科学杂志。2022 PMID:35897750 免费PMC文章。 审查。

出版物类型

LinkOut-更多资源