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2004年7月;9(7):611-8.
doi:10.1111/j.1356-9597.2004.00750.x。

酿酒酵母Atg8哺乳动物同源物微管相关蛋白轻链3的晶体结构

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酿酒酵母Atg8哺乳动物同源物微管相关蛋白轻链3的晶体结构

苏加瓦拉(Kenji Sugawara)等。 基因细胞 2004年7月
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摘要

微管相关蛋白轻链3(Microtube-associated protein light chain 3,LC3)是酵母Atg8的哺乳动物同源物,在自噬中起着重要作用,自噬参与溶酶体系统对细胞质成分的大量降解。在这里,我们报告了LC3的晶体结构,分辨率为2.05 A,R因子为21.8%,自由R因子为24.9%。LC3的结构类似于16kDa高尔基相关ATP酶增强子(GATE-16)和GABAA受体相关蛋白(GABARAP)的结构,它包含一个泛素核,在其N末端连接有两个α螺旋,即α1和α2。在这些蛋白质中观察到一些共同和独特的特征,包括保持在α1、α2和泛素核心之间形成相互作用所需的残基。然而,这些螺旋的静电势表面不同,这意味着特定的作用是选择特定的结合伙伴。LC3、GABARAP和GATE-16泛素核上的疏水性斑块具有很好的保守性,与泛素和NEDD8的E1结合面相似。因此,我们认为疏水贴片是哺乳动物Atg7的结合表面,类似于泛素样结合系统。我们还提出了泛素折叠作为靶蛋白识别模块的功能含义。

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