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.2004年6月;5(2):150-63.
doi:10.1093/bib/5.2.150。

MEGA3:用于分子进化遗传学分析和序列比对的集成软件

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MEGA3:分子进化遗传学分析和序列比对集成软件

苏迪尔·库马尔等。 生物信息简介. 2004年6月.

摘要

比较DNA和蛋白质序列分析在重建物种和多基因家族的进化历史、估计分子进化速度、,并推断影响基因和基因组进化的选择力的性质和范围。由于高通量测序技术以及新型统计和计算方法的发展,这些研究的范围现已大大扩大。这些方法需要易于使用的计算机程序。其中一项工作是开发分子进化遗传学分析(MEGA)软件,其重点是从进化的角度促进对DNA和蛋白质序列变异的探索和分析。目前,在其第三个主要版本中,MEGA3包含自动和手动序列比对、基于web的数据库挖掘、系统发育树推断、进化距离估计和进化假设测试等功能。本文概述了用于数据输入的统计方法、计算工具和可视化探索模块,以及在MEGA中获得的结果。

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