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比较研究
.2004年3月1日;13(5):495-507.
doi:10.1093/hmg/ddh056。 Epub 2004年1月13日。

Muscleblind蛋白MBNL1/EXP与CHHG重复序列特异性结合

附属公司
比较研究

肌盲蛋白MBNL1/EXP与CHHG重复序列特异结合

吉弘基诺等人。 人类分子遗传学. .

摘要

1型强直性肌营养不良(DM)是由DMPK基因中CTG重复序列的扩增引起的,2型是由ZNF9基因中CCTG重复序列引起的。先前的报道表明,含有扩展的CUG/CCUG重复序列的转录物可能具有毒性的获得功能效应,可能影响RNA结合蛋白在糖尿病发病中的功能。这里,我们试图比较CUG-BP、MBNL1/EXP和PKR三种蛋白的RNA结合特性,它们以前被建议与CUG重复序列相互作用。在酵母三杂交系统中,MBNL1(而非CUG-BP或PKR)与CUG和CCUG重复序列相互作用。通过使用各种合成RNA,发现MBNL1与被概括为CHHG和CHG重复序列的重复序列特异性相互作用,其中H是A、U或C。有趣的是,MBNL1没有与包含CAG/CUG重复的真正的双链RNA相互作用,这表明MBNL1更喜欢含隆起的双链RNAs。缺失分析表明MBNL1剪接变异体之间的RNA结合能力存在差异。研究还发现,MBNL1可以与ZNF9中的重复基序结合,其中包含最小长度的CCUG重复序列和非CCUG插入序列。

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