Inheritance of gene density-related higher order chromatin arrangements in normal and tumor cell nuclei

doi:10.1083/jcb.200304096

.2003年9月1日；162(5):809-20.

doi:10.1083/jcb.200304096。

正常和肿瘤细胞核中与基因密度相关的高阶染色质排列的遗传

马里恩·克里默¹, 凯特琳·库珀, 巴贝特·瓦格勒, 莉娅·威泽尔曼, 约翰·冯·哈斯, 亚尼娜·威兰, 路德维卡·克雷亚, 约阿希姆·迪博尔德, 迈克尔·R·斯派克, 托马斯·克莱默

附属公司

PMID： 12952935
预防性维修识别码： PMC2172812型
内政部： 10.1083/jcb.200304096

正常和肿瘤细胞核中与基因密度相关的高阶染色质排列的遗传

马里恩·克里默等。 J细胞生物学. 2003.

.2003年9月1日；162(5):809-20.

doi:10.1083/jcb.200304096。

作者

附属

¹德国慕尼黑80333号路德维希·马克西米利安大学生物二系。Marion.Cremer@lrz.uni-muenchen.de

PMID： 12952935
预防性维修识别码： PMC2172812型
内政部： 10.1083/jcb.200304096

摘要

以前曾描述过人类淋巴细胞细胞核染色体区域径向排列（CTs）中的基因密度相关差异，基因差的CT#18位于核外周，基因感的CT#19位于核内（Croft，J.A.，J.M.Bridger，S.Boyle，P.Perry，P.Teague，and W.A.Bickmore，1999）。《细胞生物学杂志》。145:1119-1131). 在这里，我们分析了6种正常细胞类型和8种肿瘤细胞系中18号和19号染色体染色质的径向分布，其中一些细胞系存在两条染色体的不平衡和重排。我们的研究结果表明，#18和#19染色质的径向分布的显著差异是正常和恶性细胞中高级染色质结构的共同特征。然而，在八个肿瘤细胞系中的七个细胞系中，与正常细胞核相比，差异不太明显，这是因为细胞核显示倒置CT位置的比例较高，即CT#18比CT#19位于更内部。这一观察结果强调了肿瘤细胞核中放射状染色质顺序的部分丢失。

PubMed免责声明

数字

**图1。**
**考虑到每个细胞系核型的倍性信息，通过CGH分析估计染色体片段的拷贝数。**每个条代表特定细胞系中的染色体拷贝数；根据所示的键，不同的拷贝号用不同的颜色表示。从左至右的细胞系为：（1）Jurkat；（2） HDLM-2；（3）梅尔朱索；（4）赫拉；（5） SW480；（6） SW620（离染色体象形图最远）。请注意，HeLa细胞系接近三倍体。因此，物质（即染色体4和18q）的丢失表明二体状态（与表i相比）。

**图2。**
**在涂上18号染色体（红色）和19号染色体（绿色）特异DNA探针后，对放射状CT#18和CT#19在25个同心核壳中分布的不同细胞类型进行定量3D评估。**蓝色曲线代表反染DNA。横坐标表示相对半径第页在核壳中，纵坐标是指定给给定壳的各个荧光色素的体素强度的归一化总和。对于标准化，每种颜色曲线下的面积（总相对DNA含量）设置为100。注意培养细胞细胞核（A-F、H和K-N）和组织切片细胞核（G、I和J）中的DNA反染曲线不同。有关说明，请参见材料和方法。所有图表显示了CT#18和CT#19材料的不同径向位置。条形图表示SEM。

**图3。**
**在所选细胞类型的3D重建中可视化CT#18（红色）和CT#19（绿色）。**部分核边界通过反染色边缘的重建显示出来（外部为蓝色，内部为银色）。请注意，在正常细胞的细胞核（用白色星号标记的面板）中，CTs#19紧密附着在核内部，而CTs#18位于核外围，并排或位于偏远位置。在肿瘤细胞核（用黄色星号标记的面板）中，这种径向分布差异通常不太明显；请注意，例如，霍奇金衍生细胞核（右上角）中的外围CT#19或位于所显示的两个DLD1细胞核之一中两个CT#19之间的CT#18的内部位置（右下角面板）。棒材，5μm。

**图4。**
**评估携带易位t（17；18）的SW620细胞系的CT#17和CT#18分布。**（A） 17号染色体（蓝色显示）和18号染色体（绿色显示）绘制完成后，中期部分扩散。18号染色体着丝粒显示为红色。在所示的中期，17号染色体呈现为两个自由的正常拷贝和两条不同的易位染色体，其中一条形成序列（18）t（17；18）（箭头）。该重排染色体的着丝粒是18号染色体特有的。18号染色体也是一个正常拷贝。（B） 22个核内放射状CT#17和CT#18分布的定量3D评估。横坐标表示相对半径第页在核壳中，纵坐标是指定给给定壳的各个荧光色素的体素强度的归一化总和。在顶部面板中，深蓝色曲线表示涂上17号染色体特有的DNA探针后整个17号染色体材料的径向分布，浅蓝色曲线表示只有17号染色体的材料易位到18号染色体。注意两种CT#17材料组分的几乎相同的曲线。在底部面板中，深绿色曲线表示游离CTs#18的径向分布，浅绿色曲线表示18号染色体材料易位到17号染色体。注意，与易位组分相比，18号CTs非易位组份的外围位置明显更多。条形图显示SEM。

**图5。**
**对比分析的所有细胞类型的强度加权荧光平均相对半径，以CT#18（黑色菱形）和CT#19（白色圆圈）材料表示。**左侧面板（白色背景）显示正常细胞的数据，右侧面板（灰色背景）显示肿瘤细胞的数据。在所有细胞类型中，CT#18的平均相对半径（<r_{CT18号机组}>)与19号CT相比更大（<r_{CT19号机组}>). <r之间的距离_第18版>和<r_{CT19号机组}>与正常细胞核相比，大多数肿瘤细胞系中的细胞核较小（与表III相比）。括号中的数字表示平均相对半径的精确值。

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1. Abdel-Rahman、W.M.、K.Katsura、W.Rens、P.A.Gorman、D.Sheer、D.Bicknell、W.F.Bodmer、M.J.Arends、A.H.Wyllie和P.A.Edwards。光谱核型分析表明，以染色体重排模式为特征的其他大肠癌亚群。程序。国家。阿卡德。科学。美国98:2538–2543。-项目管理咨询公司-公共医学
1. 巴赫、S.P.、A.G.雷尼汉和C.S.波顿。2000.干细胞：作为范例的肠干细胞。致癌。21:469–476.-公共医学
1. 鲍尔，R.K.1962。中间值-四分位测试。梅特里卡。5:1–16.
1. Bennett，D.C.、K.Bridges和I.A.McKay。1985.二倍体人类细胞株中成熟黑色素细胞与前黑色素细胞的克隆分离：前黑素细胞的自发和诱导色素沉着。细胞科学杂志。77:167–183.-公共医学
1. Boyle，S.、S.Gilchrist、J.M.Bridger、N.L.Mahy、J.A.Ellis和W.A.Bickmore。2001.正常和突变细胞细胞核内人类染色体的空间组织。嗯，分子遗传学。10:211–219.-公共医学

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[9] Boyle，S.、S.Gilchrist、J.M.Bridger、N.L.Mahy、J.A.Ellis和W.A.Bickmore。2001.正常和突变细胞细胞核内人类染色体的空间组织。嗯，分子遗传学。10:211–219.-公共医学

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