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2002年7月25日;418(6896):387-91.
doi:10.1038/nature00935。

酿酒酵母基因组的功能分析

古里·贾维尔 1安吉拉·朱棣文李妮卡拉·康奈利琳达·赖尔斯陡峭的Véronneau萨利·道安库塔·卢卡·达尼拉基思·安德森布鲁诺·安德烈亚当·阿金安娜·阿斯特罗莫夫穆罕默德·埃尔巴科里(Mohamed El-Bakkoury)朗达·班加姆罗西奥·贝尼托索菲·布拉查特斯特凡诺·坎帕纳罗马特·柯蒂斯凯伦·戴维斯亚当·德施鲍尔卡尔·迪特尔·恩蒂安帕特里克·弗拉赫蒂弗朗索瓦斯·福里大卫·J·加芬克尔马克·格斯坦迪安娜·戈特乌尔里希·吉尔德纳约翰内斯·海格曼斯文贾·亨佩尔泽勒克·赫尔曼丹尼尔·贾拉米洛黛安娜·E·凯利史蒂文·凯利彼得·科特达琳·拉博特大卫·C·兰姆宁兰洪亮Hong Liao公司Lucy Liu(露西·刘)罗传云马克·卢西尔荣茂帕特里斯·梅纳德Siew Loon Ooi公司何塞·勒维尔塔克里斯托弗·罗伯茨马提亚斯·罗斯佩特拉·罗斯-麦克唐纳巴特·谢伦斯格雷格·希马克布伦达·谢弗丹尼尔·D·鞋匠沙伦·索哈伊·马哈迪奥雷金纳德K风暴杰弗里·斯特拉瑟恩乔治·瓦莱马琳·沃特吉多·沃尔卡特王清扬(音译)特蕾莎·R·沃德朱莉·威廉伊丽莎白·A·温泽勒杨永红Grace Yen公司伊莱恩·杨曼俞可欣霍华德·布西杰夫·德·博克迈克尔·斯奈德彼得·菲利普森罗纳德·戴维斯庄士敦
附属公司

酿酒酵母基因组的功能分析

古里·贾维尔等。 自然

摘要

确定基因缺失的影响是理解基因功能的基本途径。传统的基因筛查显示出偏见,导致表型的基因常常被遗漏。我们系统地构建了一个几乎完整的酿酒酵母基因缺失突变体集合(96%的注释开放阅读框,或ORF)。被称为“分子条形码”的DNA序列能够唯一地识别每个菌株,从而可以并行分析其生长情况,并通过与高密度寡核苷酸阵列杂交来定量评估每个基因的适合度贡献。我们发现,在六种经过充分研究的条件下,先前已知和新的基因对于最佳生长是必要的:高盐、山梨醇、半乳糖、pH 8、最低培养基和制霉菌素处理。在四种测试条件下,只有不到7%的信使RNA表达显著增加的基因才能实现最佳生长。我们的结果验证了酵母基因删除收集作为功能基因组学的宝贵资源。

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