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.2002年2月;79(2):266-70.
doi:10.1006/geno.2002.6698。

使用onto-express分析基因表达

附属公司

使用onto-express分析基因表达

Purvesh Khatri公司等。 基因组学. 2002年2月.

摘要

通过微阵列或数据挖掘分析获得的基因表达谱通常作为庞大的数据串存在。为了解释这些遗传图谱的生物学特性,研究人员必须在其他信息的背景下分析这些数据,例如翻译蛋白质的生物、生化或分子功能。这对人类分析师来说尤其具有挑战性,因为大量不相关的数据往往会掩盖这些信息。为了满足这一需求,我们实现了一个自动化例程,名为Onto-Express(http://vorth.cs.wayne.edu:8080)系统地将遗传指纹转化为功能图谱。Onto Express使用登录号或聚类识别号字符串搜索公共数据库,并返回将表达谱与细胞遗传学位置、生物化学和分子功能、生物过程、细胞成分和翻译蛋白的细胞作用相关的表。Onto-Express创建的配置文件通过促进数量值集转换为包含生物学含义的记录,从根本上增加了基因表达分析的价值。

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