Gene expression patterns of breast carcinomas distinguish tumor subclasses with clinical implications

doi:10.1073/pnas.191367098

.2001年9月11日；98（19）：10869-74。

doi:10.1073/pnas.191367098。

乳腺癌基因表达模式区分肿瘤亚类的临床意义

T瑟利¹, C M Perou公司, R Tibshirani先生, T Aas公司, S盖斯勒, H约翰森, T哈斯蒂, M B艾森, M van de Rijn公司, S S杰弗里, T托森, H奎斯特, J C Matese公司, P O棕色, D博茨坦, 佩勒宁, A勒瑞森-代尔

附属公司

PMID： 11553815
预防性维修识别码：项目经理58566
内政部： 10.1073/pnas.191367098

乳腺癌基因表达模式区分肿瘤亚类的临床意义

T瑟利等。美国国家科学院程序. 2001.

.2001年9月11日；98(19):10869-74.

doi:10.1073/pnas.191367098。

作者

附属

¹挪威奥斯陆N-0310 Montebello挪威镭医院遗传科。

PMID： 11553815
预防性维修识别码：项目经理58566
内政部： 1997年10月10日/第19页1367098

摘要

本研究的目的是根据cDNA微阵列中基因表达模式的变化对乳腺癌进行分类，并将肿瘤特征与临床结果相关联。共对78例癌症、3例纤维腺瘤和4例正常乳腺组织的85个cDNA微阵列实验进行了分层聚类分析。如前所述，这些癌症可分为基底上皮样组，ERBB2过度表达组和基于基因表达变化的正常乳腺样组。一项新的发现是，先前描述的管腔上皮/雌激素受体阳性组可分为至少两个亚组，每个亚组具有不同的表达谱。通过使用两个不同的基因集进行聚类，这些亚型被证明是相当稳健的：首先，一组456个cDNA克隆先前被选择来反映肿瘤的内在特性，其次，一组与患者预后高度相关的基因集。在一项前瞻性研究中，对局部晚期乳腺癌患者亚组进行了生存分析，结果表明，不同组的患者的预后存在显著差异，包括基底样亚型预后不良，两个雌激素受体阳性组的结果有显著差异。

PubMed免责声明

数字

图1
使用476 cDNA固有克隆集通过层次聚类分析了85个实验样本的基因表达模式，这些样本代表78个癌、3个良性肿瘤和4个正常组织。(A类)根据基因表达的差异，将肿瘤标本分为五（或六）个亚型。显示五（6）种肿瘤亚型的聚类树状图颜色为：管腔亚型A，深蓝色；管腔亚型B，黄色；管腔亚型C，浅蓝色；正常乳房状，绿色；类基底，红色；和ERBB2+，粉红色。(B类)完整的集群图缩小了（完整的456个集群图如图4所示）。右侧的彩色条表示C类–*G公司*. (C类)*ERBB2号机组*放大子簇。(D类)新的未知簇。(E类)基底上皮细胞富集簇。(如果)正常的乳房样簇。(*G公司*)含内脏上皮基因簇*急诊室*.

图2
两种不同层次聚类分析的实验样本关联树状图的比较。(上部)树状图取自图1（85个样本），状态为*TP53型*由末端树状图线的颜色表示。红线表示肿瘤有突变*TP53型*基因，绿线野生型*TP53型*和未测试的黑线样本。(下部)使用51个挪威癌、3个良性肿瘤和4个正常乳腺组织（58个样本）进行分层聚类分析得出的实验树状图。子组相应地着色，并显示与图1中的树状图相比，以橙色突出显示的肿瘤组的位置发生了变化A类此外，以红色显示的基底样肿瘤被插入管腔亚型A和C之间。左侧显示了树状图分支的相关系数。

图3
在一项前瞻性研究中，根据不同的基因表达分类，对49名接受统一治疗的乳腺癌患者进行了总体和无复发生存分析。(A类)总体生存率和(B类)根据图1所示的分类，五种基于表达的肿瘤亚型的无复发生存率（管腔B和C被视为一组）。(C类)图1所示的三种不同管腔亚型的六种亚型分类的总生存率估计。(D类)基于图2所示的五种亚型分类的总生存率下部和5。

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