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.2001年4月26日;20(18):2225-34.
doi:10.1038/sj.onc.1204319。

p53调控的初级和次级靶基因的DNA微阵列鉴定

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p53调控的初级和次级靶基因的DNA微阵列鉴定

K坎南等人。 癌基因. .

摘要

用寡核苷酸微阵列分析肿瘤抑制因子p53调节的转录程序。利用表达温度敏感性小鼠p53的人肺癌细胞系,在将温度移到32℃后的不同时间点定量各种基因的mRNA水平。环己酰亚胺(CHX)抑制蛋白质合成用于区分p53调节的初级和次级靶基因。在没有CHX的情况下,259和125个基因分别上调或下调;在这些基因中,只有38和24个在CHX存在下由p53上调或下调,被认为是该细胞系的主要靶点。使用超顺磁聚类(SPC)算法对这些数据进行聚类分析表明,初级基因可以作为一个大的p53调节基因库中的单个簇来区分。这一过程确定了与主要靶点共簇的其他基因,也可以归类为此类基因。除了细胞周期(如p21、TGF-β、Cyclin e)和凋亡(如Fas、Bak、IAP)相关基因外,p53的主要靶点还包括参与细胞功能许多方面的基因,包括细胞粘附(如胸腺素、Smoothelin)、信号传导(如H-Ras、二酰甘油激酶)、转录(如ATF3、LISCH7)、神经元生长(如。Ninjurin,NSCL2)和DNA修复(例如BTG2,DDB2)。结果表明,p53激活协同的相反信号,并通过多种转录变化网络发挥作用,这些转录变化共同改变细胞表型以应对应激。

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