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.2001年2月;8(2):121-5.
doi:10.1038/84104。

N6-腺嘌呤DNA甲基转移酶M.TaqI与DNA和辅因子类似物复合物的结构

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N6-腺嘌呤DNA甲基转移酶M.TaqI与DNA和辅因子类似物复合物的结构

K戈德克等人。 自然结构生物. 2001年2月.

摘要

N6腺嘌呤DNA甲基转移酶M.TaqI与特异性DNA和非活性辅因子类似物的复合物的2.0A晶体结构揭示了螺旋外靶碱基的先前未被识别的稳定性。为了催化双链DNA序列5'-TCGA-3'中甲基从辅因子S-腺苷-l-甲硫氨酸转移到腺嘌呤的6-氨基,靶核苷从DNA螺旋中旋转出来。螺旋外构象的稳定是通过在靶碱基对位置垂直于DNA螺旋轴的DNA压缩和将伙伴碱基胸腺嘧啶重新定位在序列间的pi堆叠位置来实现的,在该位置,胸腺嘧啶与内螺旋靶腺嘌呤空间重叠。螺旋外靶腺嘌呤在活性部位特异识别,腺嘌呤的6-氨基给Asn 105和Pro 106提供了两个氢键,它们都属于N6-adenine DNA甲基转移酶的保守催化基序IV。这些氢键似乎增加了腺嘌呤N6原子的部分负电荷,并激活它以对辅因子的甲基进行直接亲核攻击。

PubMed免责声明

中的注释

  • 塔克人的攻击会使基地移位。
    Blumenthal RM,Cheng X。 Blumenthal RM等人。 自然结构生物。2001年2月;8(2):101-3. doi:10.1038/84072。 自然结构生物。2001 PMID:11175890 没有可用的摘要。

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