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.2000年8月22日;39(33):10082-9.
doi:10.1021/bi000952h。

羧肽酶A与D-半胱氨酸在1.75 A抑制剂诱导的构象变化下的晶体结构

附属公司

羧肽酶A与D-半胱氨酸在1.75 A抑制剂诱导的构象变化下的晶体结构

D M van Aalten公司等。 生物化学. .

摘要

D-半胱氨酸与抗关节炎药物D-青霉胺的区别仅在于β-碳上的两个甲基,但通过一种独特的机制抑制羧肽酶A(CPD):D-半月氨酸与活性部位锌紧密结合,而D-青霉素催化金属去除。为了研究这种差异的结构基础,我们以1.75-A的分辨率求解了羧肽酶A与D-半胱氨酸(D-Cys)络合的晶体结构。D-Cys将活性中心锌与硫配体结合,并与酶的周围侧链形成额外的相互作用。该结构解释了D-Cys和L-Cys之间的效力差异,并提供了对D-青霉胺抑制机制的见解。D-Cys结合诱导锌离子周围侧链的协同运动,类似于在其他羧肽酶抑制剂晶体结构中发现的运动,并且沿着有限的路径。对CPD和CPD抑制剂晶体结构的协同运动分析表明,这些结构聚集成不同的组。在这种类型的分析中使用药物靶标的有限构象灵活性可以大大提高药物设计的效率。

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