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.1999年12月;12(12):1041-50.
doi:10.1093/protein/12.12.1041。

蛋白质二级结构含量预测

附属公司

蛋白质二级结构含量预测

W刘等人。 蛋白质工程. 1999年12月.

摘要

所有现有的预测蛋白质二级结构元素含量的算法都是基于传统的氨基酸组成,其中没有考虑序列耦合效应。在本文中,开发了一种基于新氨基酸组成的蛋白质二级结构元素含量预测算法,其中通过一系列条件概率元素明确包括序列耦合效应。预测通过自我一致性测试和独立数据集测试进行检验。两者都表明,使用当前算法预测α-螺旋、β-片、β-桥、3(10)-螺旋、π-螺旋、H键匝、弯曲和随机线圈的含量时取得了显著的改进。文中讨论了通过引入新的氨基酸组分提高精确度的示例,以及它对蛋白质结构类别和生物功能研究的影响。

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