Transcription in archaea

doi:10.1073/pnas.96.15.8545

.1999年7月20日；96(15):8545-50.

doi:10.1073/pnas.96.15.8545。

古菌中的转录

N C Kyrpides公司¹, C A Ouzounis公司

合作者，附属公司

合作者

C R Woese公司²

附属公司

¹伊利诺伊大学厄本那-香槟分校微生物系，B103化学与生命科学，MC 110，407 South Goodwin Avenue，Urbana，IL 61801，USA。
²伊利诺伊州乌尔班纳

PMID： 10411912
PMCID公司：项目经理17553
内政部： 10.1073/pnas.96.15.8545

古菌中的转录

N C Kyrpides公司等。美国国家科学院程序. 1999.

.1999年7月20日；96(15):8545-50.

doi:10.1073/pnas.96.15.8545。

作者

N C Kyrpides公司¹, C A Ouzounis公司

合作者

C R Woese公司²

附属公司

¹伊利诺伊大学厄本那-香槟分校微生物系，B103化学与生命科学，MC 110，407 South Goodwin Avenue，Urbana，IL 61801，USA。
²伊利诺伊州乌尔班纳

PMID： 10411912
PMCID公司：项目经理17553
内政部： 10.1073/pnas.96.15.8545

摘要

利用细菌和真核生物（共4147个）中所有已知转录相关蛋白的序列，我们已经在四个完整的古生物基因组中鉴定了它们的同源物。通过广泛的序列比较，我们确定在四个古生物基因组中存在280个预测转录因子或转录相关蛋白，其中168个仅在细菌中有同源物，51个仅在真核生物中有同源，其余61个在两个系统发育域中都有同源物。虽然细菌和真核生物的转录几乎没有共同的因素，但每一种都与古生菌，尤其是细菌有着显著的共同数量。这最后一个事实与古生生物和真核细胞转录机制之间的明显密切关系形成了鲜明对比，尤其是，基本转录起始。我们将这些结果解释为，古菌转录系统保留了比其他两个结构域中的转录机制更多的祖先特征。

PubMed免责声明

数字

图1
细菌、真核生物和普遍转录相关同源物在四个完整的古生物基因组中的分布*詹纳西伊先生*（蓝色），*A.富列杜斯*（绿色），*M.热自养菌*（红色），和*P.horikoshii先生*（黄色）。此处列出的转录相关同源物的标准化基因组组成（数据未显示）的双向方差分析3（结构域）×4（物种）（df=12–1=11）表明，差异主要来自结构域差异(F类^d日_2,11= 7.76 >F类_2,11=7.21），而不是物种差异(F类^秒_3,11= 0.73 <F类_3,11=6.22），显著性水平为99%。这个插入表示转录相关蛋白家族的分布。关于特定科的ORF标识符和物种分布，见表1-3。

图2
转录相关蛋白的普遍（ABE）、细菌/真核生物（BE）、古细菌/细菌（AB）和古细菌/真核生物（AE）家族的分布。

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[1] Ouzounis C，Kyrpides N.FEBS信函。1996;390:119–123.-公共医学

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[7] Nicolov T B，Burley S K.美国国家科学院院刊，1997年；94:15–22.-项目管理咨询公司-公共医学

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[9] Langer D、Hain J、Thuriaux P、Zillig W.美国国家科学院学报1995；92:5768–5772.-项目管理咨询公司-公共医学

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