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从人体体细胞诱导的多能干细胞系。
Yu J、Vodyanik MA、Smuga-Otto K、Antosiewicz-Bourget J、Frane JL、Tian S、Nie J、Jonsdottir GA、,鲁蒂五世Stewart R、Slukvin II、Thomson JA。 Yu J等。作者:鲁蒂五世 科学。2007年12月21日;318(5858):1917-20. doi:10.1126/science.11151526。Epub 2007年11月20日。 科学。2007 PMID:18029452
人类iPSC衍生和培养的化学定义条件。
Chen G、Gulbranson DR、Hou Z、Bolin JM、,若蒂五世Probasco MD、Smuga-Otto K、Howden SE、Diol NR、Propson NE、Wagner R、Lee GO、Antosiewicz-Bourget J、Teng JM、Thomson JA。 Chen G等。作者:鲁蒂五世 Nat方法。2011年5月;8(5):424-9。doi:10.1038/nmeth.1593。Epub 2011年4月10日。 Nat方法。2011 PMID:21478862 免费PMC文章。
碱基分辨率的人类DNA甲基体显示出广泛的表观基因组差异。
Lister R、Pelizzola M、Dowen RH、Hawkins RD、Hon G、Tonti-Filippini J、Nery JR、Lee L、Ye Z、Ngo QM、Edsall L、Antosiewicz-Bourget J、Stewart R、,鲁蒂五世、Millar AH、Thomson JA、Ren B、Ecker JR。 Lister R等人,作者:鲁蒂五世 自然。2009年11月19日;462(7271):315-22. doi:10.1038/nature08514。Epub 2009年10月14日。 自然。2009 PMID:19829295 免费PMC文章。
全基因组亚硫酸氢盐测序数据的饱和分析。
Libertini E、Heath SC、Hamoudi RA、Gut M、Ziller MJ、Herrero J、Czyz A、,鲁蒂五世、Stunnenberg HG、Frontini M、Ouwehand WH、Meissner A、Gut IG、Beck S。 Libertini E等人。作者:鲁蒂五世 国家生物技术。2016年7月;34(7):691-693. doi:10.1038/nbt.3524。Epub 2016年6月27日。 国家生物技术。2016 PMID:27347755 没有可用的摘要。
合理的探针设计,以有效去除rRNA并改进人类微生物组的转录组学分析。
Tan A、Murugapiran S、Mikalauskas A、Koble J、Kennedy D、Hyde F、,鲁蒂五世Law E、Jensen J、Schroth GP、Macklaim JM、Kuersten S、LeFrançois B、Gohl DM。 Tan A等。作者:鲁蒂五世 BMC微生物。2023年10月20日;23(1):299. doi:10.1186/s12866-023-03037-y。 BMC微生物。2023 PMID:37864136 免费PMC文章。
从低覆盖率全基因组亚硫酸氢盐测序中恢复信息。
Libertini E、Heath SC、Hamoudi RA、Gut M、Ziller MJ、Czyz A、,鲁蒂五世、Stunnenberg HG、Frontini M、Ouwehand WH、Meissner A、Gut IG、Beck S。 Libertini E等人。作者:鲁蒂五世 国家通讯社。2016年6月27日;7:11306. doi:10.1038/ncomms11306。 国家通讯社。2016 PMID:27346250 免费PMC文章。
具有读映射不确定性的RNA-Seq基因表达估计。
李波,鲁蒂五世、Stewart RM、Thomson JA、Dewey CN。 李B等。作者:鲁蒂五世 生物信息学。2010年2月15日;26(4):493-500. doi:10.1093/bioinformatics/btp692。Epub 2009年12月18日。 生物信息学。2010 PMID:20022975 免费PMC文章。
人类ES和iPS细胞的蛋白质组和磷酸蛋白质组比较。
Phanstiel DH、Brumbaugh J、Wenger CD、Tian S、Probasco MD、Bailey DJ、Swaney DL、Tervo MA、Bolin JM、,鲁蒂五世、Stewart R、Thomson JA、Coon JJ。 Phanstiel DH等人。作者:鲁蒂五世 Nat方法。2011年9月11日;8(10):821-7. doi:10.1038/nmeth.1699。 Nat方法。2011 PMID:21983960 免费PMC文章。
多能干细胞和谱系承诺的人类细胞的独特表观基因组景观。
Hawkins RD、Hon GC、Lee LK、Ngo Q、Lister R、Pelizzola M、Edsall LE、Kuan S、Luu Y、Klugman S、Antosiewicz Bourget J、Ye Z、Espinoza C、Agarwahl S、Shen L、,鲁蒂五世王伟、斯图尔特·R、汤姆森·JA、埃克·JR、任·B。 Hawkins RD等人。作者:鲁奥蒂诉 细胞干细胞。2010年5月7日;6(5):479-91. doi:10.1016/j.stem.2010.03.018。 细胞干细胞。2010 PMID:20452322 免费PMC文章。
二维或三维培养中人类多能干细胞衍生内皮细胞的全基因组分析。
Zhang J、Schwartz议员、Hou Z、Bai Y、Ardalani H、Swanson S、Steill J、,鲁蒂五世,Elwell A、Nguyen BK、Bolin J、Stewart R、Thomson JA、Murphy WL。 张杰等。作者:鲁蒂五世 干细胞报告。2017年4月11日;8(4):907-918. doi:10.1016/j.stemcr.2017.02.014。Epub 2017年3月23日。 干细胞报告。2017 PMID:28343999 免费PMC文章。
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