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2017 5
2019 4
2020 6
2021 6
2022 6
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第1页
人类肠道微生物的肠型。
Arumugam M、Raes J、Pelletier E、Le Paslier D、Yamada T、，门德DRFernandes GR、Tap J、Bruls T、Batto JM、Bertalan M、Borruel N、Casellas F、Fernandez L、Gautier L、Hansen T、Hattori M、Hayashi T、Kleerebezem M、Kurokawa K、Leclerc M、Levenez F、Manichanh C、Nielsen HB、Nielson T、Pons N、Poulain J、Qin J、Sicheritz-Ponten T、Tims S、Torrents D、Ugarte E、Zoetendal EG、Wang J、Guarner F、Pedersen O、de Vos WM、，Brunak S，DoréJ；MetaHIT财团；Antolín M、Artiguenave F、Blottiere HM、Almeida M、Brechot C、Cara C、Chervaux C、Cultrone A、Delorme C、Denariaz G、Dervyn R、Foerstner KU、Friss C、van de Guchte M、Guedon E、Haimet F、Huber W、van Hylckama-Vlieg J、Jamet A、Juste C、Kaci G、Knol J、Lakhdari O、Layec S、Le Roux K、Maguin E、Mérieux A、Melo Minardi R、M'rini C、穆勒J、，Oozeer R、Parkhill J、Renault P、Rescigno M、Sanchez N、Sunagawa S、Torrejon A、Turner K、Vandemeulebrouck G、Varela E、Winogradsky Y、Zeller G、Weissenbach J、Ehrlich SD、Bork P。 Arumugam M等人。作者：mende博士. 自然。2011年5月12日；473(7346):174-80. doi:10.1038/nature09944。Epub 2011年4月20日。 自然。2011 PMID：21508958 免费PMC文章。
通过宏基因组测序建立的人类肠道微生物基因目录。
秦J、李R、雷斯J、阿鲁穆加姆M、伯格多夫KS、马尼琴C、尼尔森T、彭斯N、莱维内兹F、山田T、，门德DR李J、徐J、李S、李D、曹J、王B、梁H、郑H、谢Y、塔普J、利佩奇P、贝塔兰M、巴托·JM、汉森T、勒·帕斯利埃D、林内贝格A、尼尔森HB、佩莱蒂埃E、雷诺P、西切里茨-蓬顿T、特纳K、朱H、余C、李S、简M、周Y、李Y、张X、李S，秦N、杨H、王J、布鲁纳克S、多雷J、瓜纳F、克里斯蒂安森K、佩德森O、，Parkhill J、Weissenbach J；MetaHIT财团；Bork P、Ehrlich SD、Wang J。 秦杰等。作者：门德医生. 自然。2010年3月4日；464(7285):59-65. doi:10.1038/nature08821。 自然。2010 PMID：20203603 免费PMC文章。
海洋浮游生物。全球海洋微生物组的结构和功能。
Sunagawa S、Coelho LP、Chaffron S、Kultima JR、Labadie K、Salazar G、Djahanschiri B、Zeller G、，门德DR阿尔贝蒂（Alberti A）、科尔内乔·卡斯蒂略（Cornejo-Castillo FM）、科斯蒂亚（Costea PI）、克鲁德（Cruaud C）、德奥维迪奥（d'Ovido F）、恩格伦（Engelen S）、费雷拉（Ferrera I）、加索尔（Gasol JM）、吉迪（Guidi L）、希尔德布兰德（Hildebrand F）、科科什卡（Kokoszka F）、莱波夫（Lepoivre C）、利马·门德斯（Lima-Mendez G）、普兰（Poulain J）、普洛斯（；塔拉海洋协调员；Bowler C、de Vargas C、Gorsky G、Grimsley N、Hingamp P、Iudicone D、Jaillon O、Not F、Ogata H、Pesant S、Speich S、Stemmann L、Sullivan MB、Weissenbach J、Wincker P、Karsenti E、Raes J、Acinas SG、Bork P。 Sunagawa S等人。作者：门德医生. 科学。2015年5月22日；348(6237):1261359. doi:10.1126/science.1261359。 科学。2015 PMID：25999513 免费文章。
粪便微生物群在结直肠癌早期检测中的潜力。
Zeller G、Tap J、Voigt AY、Sunagawa S、Kultima JR、Costea PI、Amiot A、Böhm J、Brunetti F、Habermann N、Hercog R、Koch M、Luciani A、，门德DR，Schneider MA、Schrotz King P、Tournigand C、Tran Van Nhieu J、Yamada T、Zimmermann J、Benes V、Kloor M、Ulrich CM、von Knebel Doeberitz M、Sobhani I、Bork P。 Zeller G等人。作者：门德医生. 分子系统生物学。2014年11月28日；10(11):766. doi:10.15252/msb.20145645。 分子系统生物学。2014 PMID：25432777 免费PMC文章。
原核基因的生物地理学。
Coelho LP、Alves R、Del RíoáR、Myers PN、Cantalapiedra CP、Giner-Lamia J、Schmidt TS、，门德DR、Orakov A、Letunic I、Hildebrand F、Van Rossum T、Forslund SK、Khedkar S、Maistergo OM、Pan S、Jia L、Ferretti P、Sunagawa S、Zhao XM、Nielsen HB、Huerta-Cepas J、Bork P。 Coelho LP等人。作者：mende博士. 自然。2022年1月；601(7892):252-256. doi:10.1038/s41586-021-04233-4。Epub 2021年12月15日。 自然。2022 PMID：34912116 免费PMC文章。
元基因组解释的关键评估：第二轮挑战。
Meyer F、Fritz A、Deng ZL、Koslicki D、Lesker TR、Gurevich A、Robertson G、Alser M、Antipov D、Beghini F、Bertrand D、Brito JJ、Brown CT、Buchmann J、BuluçA、Chen B、Chikhi R、Clausen PTLC、Cristian A、Dabrowski PW、Darling AE、Egan R、Eskin E、Georganas E、Goltsman E、Gray MA、Hansen LH、Hofmeyr S、Huang P、Irber L、Jia H、Jörgensen TS、，Kieser SD、Klemetsen T、Kola A、Kolmogorov M、Koreateminikov A、Kwan J、LaPierre N、Lemaitre C、Li C、Limasset A、Malcher-Miranda F、Mangul S、Marcelino VR、Marchet C、Marijon P、Meleshko D、，门德DR，Milanese A、Nagarajan N、Nissen J、Nurk S、Oliker L、Paoli L、Peterlongo P、Piro VC、Porter JS、Rasmussen S、Rees ER、Reinert K、Renard B、Robertsen EM、Rosen GL、Ruscheveyh HJ、Sarwal V、Segata N、Seiler E、Shi L、Sun F、Sunagawa S、Sørensen SJ、Thomas A、Tong C、Trajkovski M、Tremblay J、Uritskiy G、Vicedomini R、Wang Z、Wang Z，Warren A、Willassen NP、Yelick K、You R、Zeller G、Zhao Z、朱S、朱J、Garrido-Oter R、Gastmeier P、Hacquard S、Häußler S、Khaledi A、Maechler F、Mesny F、Radutoiu S、Schulze-Lefert P、Smit N、Strowig T、Bremges A、Sczyrba A、McHardy AC。 Meyer F等人。作者：门德医生. 自然方法。2022年4月；19(4):429-440. doi:10.1038/s41592-022-01431-4。Epub 2022年4月8日。 自然方法。2022 PMID：35396482 免费PMC文章。
SPIRE：一种可搜索的、行星级的微生物资源。
Schmidt TSB、Fullam A、Ferretti P、Orakov A、Maistrenko OM、Ruscheweyh HJ、Letunic I、Duan Y、Van Rossum T、Sunagawa S、，门德DR、Finn RD、Kuhn M、Pedro Coelho L、Bork P。 Schmidt TSB等人，作者：门德医生. 《核酸研究》2024年1月5日；52（D1）：D777-D783。doi:10.1093/nar/gkad943。 核酸研究2024。 PMID：37897342 免费PMC文章。
抗生素对中低收入国家婴儿出生后第一年肠道微生物组分和耐药性的影响：一项系统综述。
Luchen CC、Chibuee M、Spijker R、Simuyandi M、Chisenga C、Bosomprah S、Chilengi R、Schultsz C、，门德DR哈里斯VC。 Luchen CC等。作者：门德医生. 《公共科学图书馆·医学》，2023年6月27日；20（6）：e1004235。doi:10.1371/journal.pmed.1004235。eCollection 2023年6月。 《公共科学图书馆·医学》，2023年。 PMID：37368871 免费PMC文章。
eggNOG 6.0：支持12535种生物的比较基因组学。
Hernández-Plaza A、Szklarczyk D、Botas J、Cantalapiedra CP、Giner-Lamia J、，门德DRKirsch R、Rattei T、Letunic I、Jensen LJ、Bork P、von Mering C、Huerta-Cepas J。 Hernández Plaza A等人，作者：门德医生. 《核酸研究》2023年1月6日；51（D1）：D389-D394。doi:10.1093/nar/gkac1022。 核酸研究2023。 PMID：36399505 免费PMC文章。
GUNC：检测原核基因组中的嵌合体和污染。
Orakov A、Fullam A、Coelho LP、Khedkar S、Szklarczyk D、，门德DR施密特TSB、博克P。 Orakov A等人。作者：门德医生. 基因组生物学。2021年6月13日；22(1):178. doi:10.1186/s13059-021-02393-0。 基因组生物学。2021 PMID：34120611 免费PMC文章。
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