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1981 1
1982 三
1983 三
1985 2
1986 1
1987 2
1988 1
1989 2
1990 7
1991 2
1994 2
1995 1
1996 1
1998 2
1999 三
2000 4
2001 4
2002 2
2003 2
2004 三
2005 6
2006 11
2007 10
2008 5
2009 4
2010 5
2011 6
2012 10
2013 5
2014 9
2015 三
2016 2
2017 三
2018 1
2019 三
2020 5
2021 三
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按年度列出的结果

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第1页
STAR：超快通用RNA-seq对准器。
Dobin A、Davis CA、Schlesinger F、Drenkow J、Zaleski C、Jha S、Batut P、Chaisson M、，金格拉斯TR。 Dobin A等人。作者：银杏tr. 生物信息学。2013年1月1日；29(1):15-21. doi:10.1093/bioinformatics/bts635。Epub 2012年10月25日。 生物信息学。2013 PMID：23104886 免费PMC文章。
长非编码RNA：定义、功能、挑战和建议。
Mattick JS、Amaral PP、Carninci P、Carpenter S、Chang HY、Chen LL、Chen R、Dean C、Dinger ME、Fitzgerald KA、，Gingeras TR公司Guttman M、Hirose T、Huarte M、Johnson R、Kanduri C、Kapranov P、Lawrence JB、Lee JT、Mendell JT、Mercer TR、Moore KJ、Nakagawa S、Rinn JL、Spector DL、Ulitsky I、Wan Y、Wilusz JE、Wu M。 Mattick JS等人。作者：银杏tr. Nat Rev Mol细胞生物学。2023年6月；24(6):430-447. doi:10.1038/s41580-022-00566-8。Epub 2023年1月3日。 Nat Rev Mol细胞生物学。2023 PMID：36596869 审查。
小鼠基因组中DNA元素的比较百科全书。
Yue F、Cheng Y、Breschi A、Vierstra J、Wu W、Ryba T、Sandstrom R、Ma Z、Davis C、Pope BD、Shen Y、Pervouchine DD、Djebali S、Thurman RE、Kaul R、Rynes E、Kirilusha A、Marinov GK、Williams BA、Trout D、Amrhein H、Fisher-Aylor K、Antoshechkin I、DeSalvo G、See LH、Fastuca M、Drenkow J、Zaleski C、Dobin A、Prieto P、Lagarde J、Bussotti G、Tanzer A、，Denas O、Li K、Bender MA、Zhang M、Byron R、Groudine MT、McCleary D、Pham L、Ye Z、Kuan S、Edsall L、Wu YC、Rasmussen MD、Bansal MS、Kellis M、Keller CA、Morrisey CS、Mishra T、Jain D、Dogan N、Harris RS、Cayting P、Kawli T、Boyle AP、Eukilchen G、Kundaje A、Lin S、Lin Y、Jansen C、Malladi VS、Cline MS、Erickson DT、Kirkup VM、Learnd K、，Sloan CA、Rosenbloom KR、Lacerda de Sousa B、Beal K、Pignatelli M、Flicek P、Lian J、Kahveci T、Lee D、Kent WJ、Ramalho Santos M、Herrero J、Notredame C、Johnson A、Vong S、Lee K、Bates D、Neri F、Diegel M、Canfield T、Sabo PJ、Wilken MS、Reh TA、Giste E、Shafer A、Kutyavin T、Haugen E、Dunn D、Reynolds AP、Neph S、Humbert R、Hansen RS、，De Bruijn M、Selleri L、Rudensky A、Josefowicz S、Samstein R、Eichler EE、Orkin SH、Levasseur D、Papayannopoulou T、Chang KH、Skoultchi A、Gosh S、Disteche C、Treuting P，… 完整作者列表见摘要➔ Yue F等。作者：银杏tr. 自然。2014年11月20日；515(7527):355-64. doi:10.1038/nature13992。 自然。2014 PMID：25409824 免费PMC文章。
人类细胞中转录的景观。
Djebali S、Davis CA、Merkel A、Dobin A、Lassmann T、Mortazavi A、Tanzer A、Ragarde J、Lin W、Schlesinger F、Xue C、Marinov GK、Khatun J、Williams BA、Zaleski C、Rozowsky J、Röder M、Kokocinski F、Abdelhamid RF、Alioto T、Antoshechkin I、Baer MT、Bar NS、Batut P、Bell K、Bell I、Chakrabortty S、Chen X、Chrast J、Curado J、Derrien T、Drenkow J、，Dumais E、Dumais J、Duttagupta R、Falconnet E、Fastuca M、Fejes-Toth K、Ferreira P、Foissac S、Fullwood MJ、Gao H、Gonzalez D、Gordon A、Gunawardena H、Howald C、Jha S、Johnson R、Kapranov P、King B、Kingswood C、Luo OJ、Park E、Persaud K、Preall JB、Ribeca P、Risk B、Robyr D、Sammeth M、Schaffer L、See LH、Shahab A、Skancke J、Suzuki AM、，Takahashi H、Tilgner H、Trot D、Walters N、Wang H、Wrobel J、Yu Y、Ruan X、Hayashizaki Y、Harrow J、Gerstein M、Hubbard T、Reymond A、Antonarakis SE、Hannon G、Giddings MC、Ruan Y、Wold B、Carninci P、GuigóR、，金格拉斯TR。 Djebali S等人。作者：银杏tr. 自然。2012年9月6日；489（7414）：101-8。doi:10.1038/nature11233。 自然。2012 PMID：22955620 免费PMC文章。
哺乳动物基因组的转录图谱。
Carninci P、Kasukawa T、Katayama S、Gough J、Frith MC、Maeda N、Oyama R、Ravasi T、Lenhard B、Wells C、Kodzius R、Shimokawa K、Bajic VB、Brenner SE、Batalov S、Forrest AR、Zavolan M、Davis MJ、Wilming LG、Aidinis V、Allen JE、Ambesi-Impiombato A、Apweiler R、Aturaliya RN、Bailey TL、Bansal M、Baxter L、Beisel KW、Bersano T、Bono H、Chalk AM、，Chiu KP、Choudhary V、Christoffels A、Clutterbuck DR、Crowe ML、Dalla E、Dalrymple BP、de Bono B、Della Gatta G、di Bernardo D、Down T、Engstrom P、Fagiolini M、Faulkner G、Fletcher CF、Fukushima T、Furuno M、Futaki S、Gariboldi M、Georgii-Hemming P、，Gingeras TR公司Gojobori T、Green RE、Gustinich S、Harbers M、Hayashi Y、Hensch TK、Hirokawa N、Hill D、Huminiecki L、Iacono M、Ikeo K、Iwama A、Ishikawa T、Jakt M、Kanapin A、Katoh M、Kawasawa Y、Kelso J、Kitamura H、Kitano H、Kollias G、Krishnan SP、Kruger A、Kummerfeld SK、Kurochin IV、Lareau LF、Lazarevic D、Lipovich L、Liu J、Liuni S、McWilliam S、，Madan Babu M、Madera M、Marchioni L、Matsuda H、Matsuzawa S、Miki H、Mignone F、Miyake S、Morris K、Mottagui-Tabar S、Mulder N、Nakano N、Nakouchi H、Ng P、Nilsson R、Nishiguchi S、Nishikawa S，Nori F、Ohara O、Okazaki Y、Orlando V、Pang KC… 完整作者列表见摘要➔ Carninci P等人。作者：银杏tr. 科学。2005年9月2日；309(5740):1559-63. doi:10.1126/science.1112014。 科学。2005 PMID：16141072
地面组织回路调节玉米和玉米的器官复杂性塞塔利亚.
Ortiz-Ramírez C、Guillotin B、Xu X、Rahni R、Zhang S、Yan Z、Coqueiro Dias Araujo P、Demesa-Arevalo E、Lee L、Van Eck J、，Gingeras TR公司Jackson D、Gallagher KL、Birnbaum KD。 Ortiz-Ramírez C等人。作者：姜饼tr. 科学。2021年12月3日；374(6572):1247-1252. doi:10.1126/science.abj2327。Epub 2021年12月2日。 科学。2021 PMID：34855479 免费PMC文章。
多组织个人表观基因组和差异影响模型的EN-TEx资源。
Rozowsky J、Gao J、Borsari B、Yang YT、Galeev T、Gürsoy G、Epstein CB、Xiong K、Xu J、Li T、Liu J、Yu K、Berthel A、Chen Z、Navarro F、Sun MS、Wright J、Chang J、Cameron CJF、Shoresh N、Gaskell E、Drenkow J、Adrian J、Aganezov S、Aguet F、Balderrama-Guterrez G、Banskota S、Corona GB、Chee S、Chhetri SB、Cortez Martins GC、Danyko C、Davis CA、，Farid D、Farrell NP、Gabdank I、Gofin Y、Gorkin DU、Gu M、Hecht V、Hitz BC、Issner R、Jiang Y、Kirsche M、Kong X、Lam BR、Li S、Li B、Li X、Lin KZ、Luo R、Mackiewicz M、Meng R、Moore JE、Mudge J、Nelson N、Nusbaum C、Popov I、Pratt HE、Qiu Y、Ramakrishnan S、Raymond J、Salichos L、Scavelli A、Schreiber JM、Sedlazeck FJ、See LH、Sherman RM、Shi X、，Shi M、Sloan CA、Stratan JS、Tan Z、Tanaka FY、Vlasova A、Wang J、Werner J、Williams B、Xu M、Yan C、Yu L、Zaleski C、Zhang J、Ardlie K、Cherry JM、Mendenhall EM、Noble WS、Weng Z、Levine ME、Dobin A、Wold B、Mortazavi A、Ren B、Gillis J、Myers RM、Snyder MP、Choudhary J、Milosavljevic A、Schatz MC、Bernstein BE、GuigóR、，Gingeras TR公司，Gerstein M。 Rozowsky J等人。作者：银杏tr. 单元格。2023年3月30日；186（7）：1493-1511.e40。doi:10.1016/j.cell.2023.02.018。 单元格。2023 PMID：37001506 免费PMC文章。
发育中玉米穗的单细胞RNA测序有助于功能分析和性状候选基因的发现。
Xu X、Crow M、Rice BR、Li F、Harris B、Liu L、Demesa-Arevalo E、Lu Z、Wang L、Fox N、Wang X、Drenkow J、Luo A、Char SN、Yang B、Sylvester AW、，Gingeras TR公司、Schmitz RJ、Ware D、Lipka AE、Gillis J、Jackson D。 Xu X，et al.作者：银杏tr. 开发单元。2021年2月22日；56（4）：557-568.e6。doi:10.1016/j.devcel.2020.12.015。Epub 2021年1月4日。 开发单元。2021 PMID：33400914 免费PMC文章。
人类和小鼠基因组中DNA元素的扩展百科全书。
ENCODE项目联盟；Moore JE、Purcaro MJ、Pratt HE、Epstein CB、Shoresh N、Adrian J、Kawli T、Davis CA、Dobin A、Kaul R、Halow J、Van Nostrand EL、Freese P、Gorkin DU、Shen Y、HE Y、Mackiewicz M、Pauli-Behn F、Williams BA、Mortazavi A、Keller CA、Zhang XO、Elhajjajy SI、Huey J、Dickel DE、Snetkova V、Wei X、Wang X、Rivera-Mulia JC、Rozowsky J、ZhangJ、Chhetri SB、，Zhang J、Victorsen A、White KP、Visel A、Yeo GW、Burge CB、Lécuyer E、Gilbert DM、Dekker J、Rinn J、Mendenhall EM、Ecker JR、Kellis M、Klein RJ、Noble WS、Kundaje A、GuigóR、Farnham PJ、Cherry JM、Myers RM、Ren B、Graveley BR、Gerstein MB、Pennacchio LA、Snyder MP、Bernstein BE、Wold B、Hardison RC、，Gingeras TR公司、Stamatoyannopoulos JA、Weng Z。 ENCODE项目联盟等。作者：银杏tr. 自然。2020年7月；583（7818）：699-710。doi:10.1038/s41586-020-2493-4。Epub 2020年7月29日。 自然。2020 PMID：32728249 免费PMC文章。
关于ENCODE的观点。
ENCODE项目联盟；斯奈德议员，Gingeras TR公司Moore JE、Weng Z、Gerstein MB、Ren B、Hardison RC、Stamatoyannopoulos JA、Graveley BR、Feingold EA、Pazin MJ、Pagan M、Gilchrist DA、Hitz BC、Cherry JM、Bernstein BE、Mendenhall EM、Zerbino DR、Frankish A、Flicek P、Myers RM。 ENCODE项目联盟等。作者：姜饼tr. 自然。2020年7月；583(7818):693-698. doi:10.1038/s41586-020-2449-8。Epub 2020年7月29日。 自然。2020 PMID：32728248 免费PMC文章。
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