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成人新发急性髓细胞白血病的基因组和表观基因组景观。
癌症基因组图谱研究网络；Ley TJ、Miller C、Ding L、Raphael BJ、Mungall AJ、Robertson A、Hoadley K、Triche TJ Jr、Laird PW、Baty JD、Fulton LL、FultonR、Heath SE、Kalicki-Veizer J、Kandoth C、Klco JM、Kobolt DC、Kanchi KL、Kulkarni S、Lamprecht TL、Larson DE、Lin L、Lu C、McLellan MD、McMichael JF、Payton J、Schmidt H、Spencer DH、Tomasson MH、Wallis JW、Wartman LD、，Watson MA、Welch J、Wendl MC、Ally A、Balasundaram M、Birol I、，巴特菲尔德YChiu R、Chu A、Chuah E、Chun HJ、Corbett R、Dhalla N、Guin R、He A、Hirst C、Hirst M、Holt RA、Jones S、Karsan A、Lee D、Li HI、Marra MA、Mayo M、Moore RA、Mungall K、Parker J、Pleasance E、Plettner P、Schein J、Stoll D、Swanson L、Tam A、Thiessen N、Varhol R、Wye N、Zhao Y、Gabriel S、Getz G、Sougnez C、Zou L、Leiserson MD、Vandin F、Wu HT、，Applebaum F、Baylin SB、Akbani R、Broom BM、Chen K、Motter TC、Nguyen K、Weinstein JN、Zhang N、Ferguson ML、Adams C、Black A、Bowen J、Gastier-Foster J、Grossman T、Lichtenberg T、Wise L、Davidsen T、Demchok JA、Shaw KR、Sheth M、Sofia HJ、Yang L、Downing JR、Eley G。 癌症基因组图谱研究网络等。作者：巴特菲尔德y. 《新英格兰医学杂志》，2013年5月30日；368(22):2059-74. doi:10.1056/NEJMoa1301689。Epub 2013年5月1日。 《新英格兰医学杂志》，2013年。 PMID：23634996 免费PMC文章。
15000多条人类和小鼠全长cDNA序列的生成和初步分析。
Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、Derge JG、Klausner RD、Collins FS、Wagner L、Shenmen CM、Schuler GD、Altschul SF、Zeeberg B、Buetow KH、Schaefer CF、Bhat NK、Hopkins RF、Jordan H、Moore T、Max SI、Wang J、Hsieh F、Diatchenko L、Marusina K、Farmer AA、Rubin GM、Hong L、Stapleton M、Soares MB、Bonaldo MF、Casavant TL、Scheetz TE、，Brownstein MJ、Usdin TB、Toshiyuki S、Carninci P、Prange C、Raha SS、Loquellano NA、Peters GJ、Abramson RD、Mullahy SJ、Bosak SA、McEwan PJ、McKernan KJ、Malek JA、Gunaratne PH、Richards S、Worley KC、Hale S、Garcia AM、Gay LJ、Hulyk SW、Villalon DK、Muzny DM、Sodergren EJ、Lu X、Gibbs RA、Fahey J、Helton E、Ketteman M、Madan A、Rodrigues S、，Sanchez A、Whiting M、Madan A、Young AC、Shevchenko Y、Bouffard GG、Blakesley RW、Touchman JW、Green ED、Dickson MC、Rodriguez AC、Grimwood J、Schmutz J、Myers RM、，巴特菲尔德YS密歇根州Krzywinski、斯卡斯卡U、德国Smailus、Schnerch A、Schein JE、Jones SJ、马萨诸塞州Marra；哺乳动物基因采集项目团队。 Strausberg RL等人。作者：巴特菲尔德. 美国国家科学院院刊2002年12月24日；99(26):16899-903. doi:10.1073/pnas.242603899。Epub 2002年12月11日。 美国国家科学院院刊，2002年。 PMID：12477932 免费PMC文章。
弥漫性低级别胶质瘤的综合、综合基因组分析。
癌症基因组图谱研究网络；Brat DJ、Verhaak RG、Aldape KD、Yung WK、Salama SR、Cooper LA、Rheinbay E、Miller CR、Vitucci M、Morozova O、Robertson AG、Noushmehr H、Laird PW、Cherniack AD、Akbani R、Huse JT、Ciriello G、Poisson LM、Barnholtz-Sloan JS、Berger MS、Brennan C、Colen RR、Colman H、Flanders AE、Giannii C、Grifford M、Iavarone A、Jain R、Joseph I、Kim J、Kasaian K、，Mikkelsen T、Murray BA、O'Neill BP、Pachter L、Parsons DW、Sougnez C、Sulman EP、Vandenberg SR、Van Meir EG、von Deimling A、Zhang H、Crain D、Lau K、Mallery D、Morris S、Paulauskis J、Penny R、Shelton T、Sherman M、Yena P、Black A、Bowen J、Dicostanzo K、Gastier-Foster J、Leraas KM、Lichtenberg TM、Pierson CR、Ramirez NC、Taylor C、Weaver S、，Wise L、Zmuda E、Davidsen T、Demchok JA、Eley G、Ferguson ML、Hutter CM、Mills Shaw KR、Ozenberger BA、Sheth M、Sofia HJ、Tarnuzzer R、Wang Z、Yang L、Zenklusen JC、Ayala B、Baboud J、Chudamani S、Jensen MA、Liu J、Pihl T、Raman R、Wan Y、Wu Y、Ally A、Auman JT、Balasundaram M、Balu S、Baylin SB、Beroukhim R、Bootwalla MS、Bowlby R、Bristow CA、，布鲁克斯·D，巴特菲尔德YCarlsen R、Carter S、Chin L、Chu A、Chuah E、Cibulskis K、Clarke A、Coetzee SG、Dhalla… 完整作者列表参见摘要 癌症基因组图谱研究网络等。作者：巴特菲尔德y. N Engl J Med.2015年6月25日；372(26):2481-98. doi:10.1056/NEJMoa1402121。Epub 2015年6月10日。 《新英格兰医学杂志》，2015年。 PMID：26061751 免费PMC文章。
乳头状肾细胞癌的综合分子特征。
癌症基因组图谱研究网络；Linehan WM、Spellman PT、Ricketts CJ、Creighton CJ、Fei SS、Davis C、Wheeler DA、Murray BA、Schmidt L、Vocke CD、Peto M、Al Mamun AA、Shinbrot E、Sethi A、Brooks S、Rathmell WK、Brooks-AN、Hoadley KA、Robertson AG、BrooksD、Bowlby R、Sadeghi S、Shen H、Weisenberger DJ、Bootwalla M、Baylin SB、Laird PW、Cherniack AD、Saksena G、Haake S、Li J、，Liang H、Lu Y、Mills GB、Akbani R、Leiserson MD、Raphael BJ、Anur P、Bottaro D、Albiges L、Barnabas N、Choueiri TK、Czerniak B、Godwin AK、Hakimi AA、Ho TH、Hsieh J、Ittmann M、Kim WY、Krishnan B、Merino MJ、Mills Shaw KR、Reuter VE、Reznik E、Shelley CS、Shuch B、Signoreti S、Srinivasan R、Tamboli P、Thomas G、Tickoo S、Burnett K、Crain D、，Gardner J、Lau K、Mallery D、Morris S、Paulauskis JD、Penny RJ、Shelton C、Shelton WT、Sherman M、Thompson E、Yena P、Avedon MT、Bowen J、Gastier-Foster JM、Gerken M、Leraas KM、Lichtenberg TM、Ramirez NC、Santos T、Wise L、Zmuda E、Demchok JA、Felau I、Hutter CM、Sheth M、Sofia HJ、Tarnuzzer R、Wang Z、Yang L、Zenklusen JC、Zhang J、Ayala B、，Baboud J、Chudamani S、Liu J、Lolla L、Naresh R、Pihl T、Sun Q、Wan Y、Wu Y、Ally A、Balasundram M、Balu S、Beroukhim R、Boden… 完整作者列表参见摘要 癌症基因组图谱研究网络等。作者：巴特菲尔德. 《新英格兰医学杂志》2016年1月14日；374(2):135-45. doi:10.1056/NEJMoa1505917。Epub 2015年11月4日。 《英国医学杂志》，2016年。 PMID：26536169 免费PMC文章。
非霍奇金淋巴瘤组蛋白修饰基因的频繁突变。
Morin RD、Mendez-Lago M、Mungall AJ、Goya R、Mungall-KL、Corbett RD、Johnson NA、Severson TM、Chiu R、Field M、Jackman S、Krzywinski M、Scott DW、Trinh DL、Tamura-Wells J、Li S、Firme MR、Rogic S、Griffith M、Chan S、Yakovenko O、Meyer IM、Zhao EY、Smailus D、Moksa M、Chittaranjan S、Rimsza L、Brooks-Wilson A、Spinelli JJ、Ben-Neriah S、Meissner B、，Woolcock B、Boyle M、McDonald H、Tam A、Zhao Y、Delaney A、Zeng T、Tse K、，巴特菲尔德YBirol I、Holt R、Schein J、Horsman DE、Moore R、Jones SJ、Connors JM、Hirst M、Gascoyne RD、Marra MA。 Morin RD等人。作者：巴特菲尔德y. 自然。2011年7月27日；476(7360):298-303. doi:10.1038/nature10351。 自然。2011 PMID：21796119 免费PMC文章。
NIH全长cDNA项目的现状、质量和扩展：哺乳动物基因收集（MGC）。
Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、Shenmen CM、Grouse LH、Schuler G、Klein SL、Old S、Rasooly R、Good P、Guyer M、Peck AM、Derge JG、Lipman D、Collins FS、Jang W、Sherry S、Feolo M、Misquitta L、Lee E、Rotmistrovsky K、Greenhut SF、Schaefer CF、Buetow K、Bonner TI、Hausler D、Kent J、Kiekhaus M、Furey T、Brent M、Prange C、Schreiber K、Shapiro N，Bhat NK、Hopkins RF、Hsie F、Driscoll T、Soares MB、Casavant TL、Scheetz TE、Brown-stein MJ、Usdin TB、Toshiyuki S、Carnich P、Piao Y、Dudekula DB、Ko MS、Kawakami K、Suzuki Y、Sugano S、Gruber CE、Smith MR、Simmons B、Moore T、Waterman R、Johnson SL、Ruan Y、Wei CL、Mathavan S、Gunaratne PH、Wu J、Garcia AM、Hulyk SW、Fuh E、Yuan、Sneed A、，Kowis C、Hodgson A、Muzny DM、McPherson J、Gibbs RA、Fahey J、Helton E、Ketteman M、Madan A、Rodrigues S、Sanchez A、Whiting M、Madri A、Young AC、Wetherby KD、Granite SJ、Kwong PN、Brinkley CP、Pearson RL、Bouffard GG、Blakesly RW、Green ED、Dickson MC、Rodriggez AC、Grimwood J、Schmutz J、Myers RM、，巴特菲尔德YS、格里菲斯·M、格里菲思·OL、科兹温斯基·MI、廖·N、莫林·R、帕尔奎斯特·D、彼得雷斯库·AS、斯卡尔斯卡·U、斯迈卢斯·DE、斯托特·JM、施奈奇·A、谢恩·JE、琼斯·SJ、霍尔特·RA、巴罗斯·A、马拉·MA，… 完整作者列表参见摘要 Gerhard DS等人。作者：巴特菲尔德. 基因组研究，2004年10月；14（10B）：2121-7。doi:10.1101/gr.2596504。 基因组研究，2004年。 PMID：15489334 免费PMC文章。
使用独特序列控制进行样本跟踪。
Moore RA、Zeng T、Docking TR、Bosdet I、，巴特菲尔德YS、蒙罗·S、李一世、斯旺森·L、斯塔克斯·ER、谢·K、蒙加尔·AJ、霍尔特·RA、卡珊·A。 Moore RA等人。作者：巴特菲尔德. 分子诊断杂志。2020年2月；22(2):141-146. doi:10.1016/j.jmoldx.2019.10.011。Epub 2019年12月16日。 分子诊断杂志。2020 PMID：31837431 免费文章。
分化的克隆选择在复发的髓母细胞瘤中占主导地位。
Morrissy AS、Garzia L、Shih DJ、Zuyderduyn S、Huang X、Skowron P、Remke M、Cavalli FM、Ramaswamy V、Lindsay PE、Jelveh S、Donovan LK、Wang X、Luu B、Zayne K、Li Y、Mayoh C、Thiessen N、Mercier E、Mungall KL、Ma Y、Tse K、Zeng T、Shumansky K、Roth AJ、Shah S、Farooq H、Kijima N、Holgado BL、Lee JJ、Matan-Lithwick S、Liu J、Mack SC、曼诺A，Michealraj KA、Nor C、Peacock J、Qin L、Reimand J、Rolider A、Thompson YY、Wu X、Pugh T、Ally A、Bilenky M、，巴特菲尔德YSCarlsen R、Cheng Y、Chuah E、Corbett RD、Dhalla N、He A、Lee D、Li HI、Long W、Mayo M、Plettner P、Qian JQ、Schein JE、Tam A、Wong T、Birol I、Zhao Y、Faria CC、Pimentel J、Nunes S、Shalaby T、Grotzer M、Pollack IF、Hamilton RL、Li XN、Bendel AE、Fults DW、Walter AW、Kumabe T、Tominaga T、Collins VP、Cho YJ、Hoffman C、Lyden D、Wisoff JH、，小加文·JH、斯坦恩斯DS、马西米·L、舒勒·U、斯特巴·J、齐特巴特·K、普吉特·S、艾劳特·O、邓恩·SE、蒂拉佩利·DP、卡洛蒂CG、惠勒·H、哈拉汉·AR、英格拉姆·W、麦克唐纳·TJ、奥尔森·JJ、范·迈尔EG、李·JY、王·KC、金·SK、赵·BK、皮埃奇·T、弗利什哈克·G、蒂佩尔特·S、拉·YS、贝利·S、林赛·JC、克利福德SC、埃伯哈特CG、库珀·MK、帕克·RJ、，Massimino M、Garre ML、Bartels U、Tabo… 完整作者列表参见摘要 Morrissy AS等。作者：巴特菲尔德. 自然。2016年1月21日；529(7586):351-7. doi:10.1038/nature16478。Epub 2016年1月13日。 自然。2016 PMID：26760213 免费PMC文章。
JAGuaR：RNA-seq读取与基因组的连接比对。
巴特菲尔德YS，Kreizman M，Thiessen N，Corbett RD，Li Y，Pang J，Ma YP，Jones SJ，比罗尔。 巴特菲尔德YS等。 公共科学图书馆一号。2014年7月25日；9（7）：e102398。doi:10.1371/journal.pone.0102398。2014年电子收集。 公共科学图书馆一号。2014 PMID：25062255 免费PMC文章。
秀丽隐杆线虫突变的全基因组分析。
Flibotte S、Edgley ML、Chaudhry I、Taylor J、Neil SE、Rogula A、Zapf R、Hirst M、，巴特菲尔德YJones SJ、Marra MA、Barstead RJ、Moerman DG。 Flibotte S等人。作者：巴特菲尔德y. 遗传学。2010年6月；185(2):431-41. doi:10.1534/genetics.110.116616。Epub 2010年5月3日。 遗传学。2010 PMID：20439774 免费PMC文章。
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