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原发性人类癌症的染色质可及性。
Corces MR、Granja JM、Shams S、Louie BH、Seoane JA、Zhou W、Silva TC、Groeneveld C、Wong CK、Cho SW、Satpathy AT、Mumbach MR、Hoadley KA、Robertson AG、Sheffield NC、Felau I、Castro MAA,伯曼BPStaudt LM、Zenklusen JC、Laird PW、Curtis C;癌症基因组图谱分析网络;Greenleaf WJ,Chang HY。 Corces MR等。作者:伯曼bp. 科学。2018年10月26日;362(6413):eaav1898。doi:10.1126/science.aav1898。 科学。2018 PMID:30361341 免费PMC文章。
黑腹果蝇基因组序列。
Adams MD、Celniker SE、Holt RA、Evans CA、Gocayne JD、Amanatides PG、Scherer SE、Li PW、Hoskins RA、Galle RF、George RA、Lewis SE、Richards S、Ashburner M、Henderson SN、Sutton GG、Wortman JR、Yandell MD、Zhang Q、Chen LX、Brandon RC、Rogers YH、Blazej RG、Champe M、Pfeiffer BD、Wan KH、Doyle C、Baxter EG、Helt G、Nelson CR、Gabor GL、Abril JF、,Agbayani A、An HJ、Andrews Pfannkoch C、Baldwin D、Ballew RM、Basu A、Baxendale J、Bayraktaroglu L、Beasley EM、Beeson KY、Benos PV、,伯曼BP、班达里·D、博尔沙科夫·S、博尔科娃·D、波彻姆·MR、布克·J、布罗克斯坦·P、布罗蒂尔·P、伯蒂斯·KC、布萨姆·DA、巴特勒·H、卡迪厄·E、中心A、钱德拉·I、樱桃·JM、考利·S、达尔克·C、达文波特·LB、戴维斯·P、德巴勃罗斯·B、德尔彻·A、邓·Z、梅斯·AD、杜威·I、迪茨·SM、多德森·K、杜普·LE、唐斯·M、杜加·罗查·S、邓肯·BC、邓恩·P、杜宾·KJ、埃文杰利斯塔·CC、,Ferraz C、Ferriera S、Fleischmann W、Fosler C、Gabrielian AE、Garg NS、Gelbart WM、Glasser K、Glodek A、Gong F、Gorrell JH、Gu Z、Guan P、Harris M、哈里斯NL、Harvey D、Heiman TJ、Hernandez JR、Houck J、Hostin D、Houston KA、Howland TJ、Wei MH、Ibegwam C、Jalali M、Kalush F、Karpen GH、Ke Z、Kenison JA、Ketchum KA、Kimmel BE、Kodira CD、Kraft C、,克拉维… 完整作者列表参见摘要 Adams MD等。作者:伯曼bp. 科学。2000年3月24日;287(5461):2185-95. doi:10.1126/science.287.5461.2185。 科学。2000 PMID:10731132
从纳米孔测序中检测无细胞DNA的细胞源性和癌症特异性甲基化特征。
Katsman E、Orlanski S、Martignano F、Fox-Fisher I、Shemer R、Dor Y、Zick A、Eden A、Petrini I、Conticello SG、,伯曼英国石油公司。 Katsman E等人,作者:伯曼bp. 基因组生物学。2022年7月15日;23(1):158. doi:10.1186/s13059-022-02710-1。 基因组生物学。2022 PMID:35841107 免费PMC文章。
PsychENCODE项目。
PsychENCODE联盟;Akbarian S、Liu C、Knowles JA、Vaccarino FM、Farnham PJ、Crawford GE、Jaffe AE、Pinto D、Dracheva S、Geschwind DH、Mill J、Nairn AC、Abyzov A、Pocharedy S、Prabhakar S、Weissman S、Sullivan PF、State MW、Weng Z、Peters MA、White KP、Gerstein MB、Amiri A、Armoskus C、Ashley Koch AE、Bae T、Beckel-Mitchener A、,伯曼BP乔治亚州库切、科波拉G、弗朗索瓦N、弗罗默M、高R、格伦南K、赫斯坦J、卡瓦纳DH、伊万诺夫NA、蒋Y、厨房RR、科兹连科夫A、昆达科维奇M、李M、李Z、刘S、芒果LM、马泰E、马肯斯科夫·帕帕迪米特里奥E、纳瓦罗FC、北N、奥姆伯格L、潘奇辛D、帕里克沙克N、波希曼J、普莱斯AJ、普卡罗M、雷迪TE、罗索斯P、施莱纳S、,Scuderi S、Sebra R、Shibata M、Shieh AW、Skarica M、Sun W、Swarup V、Thomas A、Tsuji J、van Bakel H、Wang D、Wang Y、Wang K、Werling DM、Willsey AJ、Witt H、Won H、Wong CC、Wray GA、Wu EY、Xu X、Yao L、Senthil G、Lehner T、Sklar P、Sestan N。 PsychENCODE Consortium等。作者:伯曼bp. 自然神经科学。2015年12月;18(12):1707-12. doi:10.1038/nn.4156。 自然神经科学。2015 PMID:26605881 免费PMC文章。 审查。
肌肉损伤导致干细胞DNA甲基化的长期变化。
Falick Michaeli T、Sabag O、Fok R、Azria B、Monin J、Nevo Y、Gielchinsky Y、,伯曼BP、Cedar H、Bergman Y。 Falick Michaeli T等人。作者:伯曼bp. 美国国家科学院院刊2022年12月27日;119(52):e2212306119。doi:10.1073/pnas.2212306119。Epub 2022年12月19日。 美国国家科学院院刊,2022年。 PMID:36534800 免费PMC文章。
基因组信号的多尺度表示。
Knijnenburg TA、Ramsey SA、,伯曼BPKennedy KA、Smit AF、Wessels LF、Laird PW、Aderem A、Shmulevich I。 Knijnenburg TA等人。作者:伯曼bp. 自然方法。2014年6月;11(6):689-94. doi:10.1038/nmeth.2924。Epub 2014年4月13日。 自然方法。2014 PMID:24727652 免费PMC文章。
支持全基因组序列注释的集成计算管道和数据库。
Mungall CJ、Misra S、,伯曼英国石油公司Carlson J、Frise E、Harris N、Marshall B、Shu S、Kaminker JS、Prochnik SE、Smith CD、Smiths E、Tupy JL、Wiel C、Rubin GM、Lewis SE。 Mungall CJ等。作者:伯曼bp. 基因组生物学。2002;3(12):研究0081。doi:10.1186/gb-2002-3-12-research0081。Epub 2002年12月23日。 基因组生物学。2002 PMID:12537570 免费PMC文章。 审查。
缺乏RTK/RAS/RAF通路的肺腺癌的全基因组特征。
Carrot Zhang J、Yao X、Devarakonda S、Deshpande A、Damrauer JS、Silva TC、Wong CK、Choi HY、Felau I、Robertson AG、Castro MAA、Bao L、Rheinbay E、Liu EM、Trieu T、Haan D、Yau C、Hinoue T、Liu Y、Shapira O、Kumar K、Mungall KL、Zhang H、Lee JJ、Berger A、Gao GF、Zhitomirsky B、Liang WW、Zhou M、Moorthi S、Berger AH、Collisson EA、Zody MC、Ding L,Cherniack AD、Getz G、Elemento O、Benz CC、Stuart J、Zenklusen JC、Beroukhim R、Chang JC、Campbell JD、Hayes DN、Yang L、Laird PW、Weinstein JN、Kwiatkowski DJ、Tsao MS、Travis WD、Khurana E、,伯曼BPHoadley KA、Robine N;TCGA研究网络;Meyerson M、Govindan R、Imielinski M。 Carrot-Zhang J等人。作者:伯曼bp. Cell Rep.2021年2月2日;34(5):108707. doi:10.1016/j.celrep.2021.108707。 细胞报告2021。 PMID:33535033 免费PMC文章。
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