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用于处理系统发育树的shell工具

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tjunier/newick_utils公司

Newick Utilities是一套用于使用Newick-formatted的程序系统发育树。文档=============请参阅子目录“doc”中的。正在安装==========二进制文件--------如果您有一个二进制文件分发版(也就是说,名称如下newick-utils-x.y.z-linux-x86-64.tar.gz),无需编译。这个二进制文件在/src;它们的名称都以nw开头,所以您可以这样做$sudo cp src/nw_*/usr/local/bin#或您想要的任何位置你可以通过cd'ing测试程序/测试,并执行以下操作:$ ./测试_项目.sh来源------如果您有一个仅源代码的发行版,或者如果您想构建二进制文件你自己,这是熟悉的$autoreconf-fi$ ./配置$制造$make check#可选,但建议使用$sudo make安装除了C编译器(我使用GCC)之外,您还需要Flex和Bison(可能已经在您的系统上);您可以选择使用LibXML、GNU-Guile和Lua。有关详细信息,请参阅手册(doc/nwutils_tutorial.pdf)。