ClustIRR:免疫受体库的聚类 概述 ClustIRR是一种定量方法,用于群集免疫受体的剧目(IRR)。该算法识别T或B细胞组可能具有相同抗原特异性的受体(TCR或BCR)。这是通过比较实现的全球的和地方的的序列特征TCR和BCR的互补性决定区域(CDR)。一旦特异性组在一组IRR中确定,算法确定聚类并对聚类丰度进行定量比较在生物条件之间。 如何使用ClustIRR ClustIRR是Bioconductor提供的R包: https://bioconductor.org/packages/ClustIRR/ 要安装此软件包,请启动R并输入: 如果(!要求("生物技术经理",安静地 = 真的))安装.包("生物管理器")生物技术经理::安装("俱乐部内部收益率") 要使用ClustIRR的开发版本,您可以从Github安装它。为此,启动R并输入: 图书馆(开发工具)安装github("snaketron/ClustIRR公司") 案例研究在目录/vignettes中提供 工作流和输出