使用MUSCLE 2时应引用以下出版物：

J.Borgdorff、M.Mamonski、B.Bosak、K.Kurowski、M.Ben Belgacem、B.Chopard、D.Groen、P.V.Coveney和A.G.Hoekstra，“使用MUSCLE 2的分布式多尺度计算，多尺度耦合库与环境”，计算科学杂志。5 (2014) 719–731. 数字对象标识：10.1016/j.工作.2014.04.004.

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上一篇会议文章是：

J.Borgdorff、M.Mamonski、B.Bosak、D.Groen、M.Ben Belgacem、K.Kurowski等人，《利用多尺度建模库和运行时环境进行多尺度计算》，《Procedia Computer Science》。18 (2013) 1097–1105. 数字对象标识：10.1016/j.procs.2013.05.275.

它基于肌肉1（以前称为DSCL）：

J.Hegewald，M.Krafczyk，J.Tölke，A.G.Hoekstra，复杂自动机基于代理的耦合平台，收录于：Iccs 2008，Lncs 51022008：第227-233页。数字对象标识：10.1007/978-3-540-69387-1_25.

它在更大的基础设施环境中的使用如下所述：

S.J.Zasada、M.Mamonski、D.Groen、J.Borgdorff、I.Saverchenko、T.Piontek等人，《多尺度计算的分布式基础设施》，2012年IEEE/ACM第16届分布式仿真和实时应用国际研讨会，IEEE，2012年：第65–74页。数字对象标识：10.1109/DS-RT.2012.17.

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基于MUSCLE的理论和形式化是由多尺度建模与仿真框架形成的。其解释如下：

J.Borgdorff、J.-L.Falcone、E.Lorenz、C.Bona-Casas、B.Chopard、A.G.Hoekstra，《分布式多尺度计算的基础：形式化、规范和分析》，《并行与分布式计算杂志》。73 (2013) 465–483. 数字对象标识：2016年10月10日/j.jpdc.2012.12.011.

B.Chopard，J.Borgdorff，A.G.Hoekstra，《多尺度建模框架》，《皇家学会哲学学报A：数学、物理和工程科学》。372 (2014). 数字对象标识：1998年10月10日/2013年3月78日.

M.Ben Belgacem、B.Chopard、J.Borgdorff、M.Mamonski、K.Rycerz、D.Harezlak，《使用MAPPER框架的分布式多尺度计算》，《Procedia计算机科学》。18 (2013) 1106–1115. 数字对象标识：10.1016/j.procs.2013.05.276.

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已知以下应用程序使用MUSCLE 2（如果您也在使用MUSCRE，请告知我们，我们可以将您添加到列表中）：

使用分布式多尺度计算的应用程序概述：

J.Borgdorff、M.Ben Belgacem、C.Bona-Casas、L.Fazendeiro、D.Groen、O.Hoenen等人，《分布式多尺度模拟的性能》，《皇家学会哲学学报A：数学、物理和工程科学》。372 (2014). 数字对象标识：10.1098/rsta.2013.0407.

原位再狭窄（ISR2D/ISR3D）：

J.Borgdorff，C.Bona-Casas，M.Mamonski，K.Kurowski，T.Piontek，B.Bosak等人，《使用多尺度建模语言对紧耦合模型进行分布式多尺度计算》，《计算机科学》。9 (2012) 596–605. 数字对象标识：dx.doi.org/10.1016/j.procs.2012.04.064.

D.Groen、J.Borgdorff、C.Bona-Casas、J.Hetherington、R.W.Nash、S.J.Zasada等人，《高性能、高保真度多尺度生物医学模拟的灵活组合和执行》，《界面焦点》。3 (2013) 20120087. 数字对象标识：10.1098/rsfs.2012.0087.

H.Tahir，C.Bona-Casas，A.J.Narracott，J.Iqbal，J.Gunn，P.V.Lawford等人，《内皮修复过程及其与纵向新生内膜组织模式的相关性：组织学与电子建模的比较》，《皇家学会界面杂志》。11 (2014) 20140022–20140022. 数字对象标识：10.1161/循环AHA.107.720730.

渠道系统模拟：

M.Ben Belgacem，B.Chopard，A.Parmigiani，《在分布式计算环境中构建灌溉渠网络的耦合方法》，收录于：G.C.Sirakoulis，S.Bandini（编辑），7495 ed.，Springer-Verlag Berlin Heidelberg，2012年：第309-318页。数字对象标识：10.1007/978-3-642-33350-7_32.

托卡马克反应堆湍流传输：

O.Hoenen，L.Fazendeiro，B.D.Scott，J.Borgdorff，A.G.Hoekstra，P.Strand，et al.，《使用分布式多尺度计算方法设计和运行湍流输送模拟》，载于：EPS 2013，欧洲物理会议摘要，37D，芬兰埃斯波，2013：P.P4.155。

基因调控网络的逆向工程：

A.Mizeranschi，N.Kennedy，P.Thompson，H.Zheng，W.Dubitzky，《网络拓扑对基因调控网络逆向工程的影响》，《计算机科学》。29 (2014) 410–421. 数字对象标识：10.1016/j.procs.2014.05.037.

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肌肉2亮点：

J.Borgdorff，D.Groen，M.Mamonski，《将肌肉添加到多尺度模拟》，HPCWire。(2013). 网址：http://www.hpcwire.com/2013/12/11/adding-muscle-multiscale-simulations网站/

J.Borgdorff、D.Groen、S.Ferlin、I.Saverchenko、J.L.Suter、A.G.Hoekstra等，《分布式欧洲电子基础设施的多尺度模拟》，SIDE。10 (2012). 网址：http://inside.hlrs.de/htm/Edition_01_12/article_24.html