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ncss-tech/土壤分类学

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R-CMD-检查 Codecov测试覆盖率 CRAN状态 runiverse-Soil分类 土壤分类手册

{土壤分类}

分类词典、构成元素列表和相关函数维护、开发和应用美国土壤分类学。

  • 数据和功能基于美国官方部门农业资源,包括最新版本的土壤钥匙分类学。描述和元数据从国家土壤信息系统或土壤调查地理数据库。其他数据文档中引用了来源。

  • 提供用于理解和与中的概念交互的工具美国土壤分类系统。当前的大多数实用程序是在“高级”分类学中使用分类学概念水平:订单,子订单,伟大的团队、和子组.

安装

从CRAN获取稳定版本。

安装.包("土壤分类学")

从GitHub获取开发版本。

遥控器::安装github("ncss-tech/土壤分类学")
图书馆(土壤分类学)

土壤分类词典

#层次:顺序到子组数据('装货单',包裹 = '土壤分类学')#唯一分类群:只有分类单元名称(以便它们在键中“键入”)数据('ST_唯一列表',包裹 = '土壤分类学')#构成要素词典数据('ST_格式_元素',包裹 = '土壤分类学')#表示较高分类亲子关系的代码(第12版土壤分类学要点)数据('ST_higher_taxa_codes_12',包裹 = '土壤分类学')#诊断特征和特征的定义(第12版土壤分类学要点)数据('ST_功能',包裹 = '土壤分类学')#族级分类和差异的定义(第12版土壤分类学要点)数据('ST系列类',包裹 = '土壤分类学')

渐晕

软件包中包含了几个小插曲来演示基本的功能:

特色功能

使用内部查找表的两个有用函数是在级别()上获取税收,分类树()、和解释ST()

在级别()上获取税收:获得较高分类组中的分类级别

HHCH公司=Acrudoxi柱基Kandiudults
在级别上获取税收('苦毒柱基kandiudults')#level=“order”#默认
#>苦毒柱基kandiudults
#>“终极目标”获取分类级别('苦毒柱基kandiudults',水平 = "子目")#>苦毒柱基kandiudults
#>“udults”在级别上获取税收('高毒性多药性感冒',水平 = "大集团")#>苦毒柱基kandiudults
#>“kandiudults”在级别上获取税收('苦毒柱基kandiudults',水平 = "子组")#>苦毒柱基kandiudults
#>“剧毒柱基kandiudults”
文学学士=叶利斯特
在级别上获取税收('对开本主义者')#>对开本主义者
#>“组织溶胶”在级别上获取税收('对开本主义者',水平 = "子目")#>对开本主义者
#>“对开本主义者”在级别上获取税收('对开本主义者',水平 = "大集团")#>对开本主义者
#>纳在级别上获取税收('对开本主义者',水平 = "子组")#>对开本主义者
#>不适用

分类树():创建数据树土壤分类等级的表示

#所有单倍体和单倍体(至亚组水平)分类树(c("倒霉蛋","单叶"))#>正在加载所需的命名空间:data.tree
#>土壤分类学
#>|--多索
#>||--结果
#>| |--单倍体
#>||--锂致破裂单倍体
#>| |--石器单倍体
#>| |--垂直单倍体
#>||--fragiaquic单倍体
#>||--水砂质单倍体
#>||--水生单倍体
#>||--片段单倍体
#>||--含氧单倍体
#>||--拉米利奇单倍体
#>| |--诗篇单倍体
#>||--砂性单倍体
#>||--格罗萨利尼单倍体
#>||--不连续单倍体
#>| |--腐殖质单倍体
#>||--典型的单倍体
#>|--淋溶土
#>|--乌达尔夫
#>|--单倍体
#>|——石器单叶
#>|--水溶性铬单倍体
#>|--含水单叶
#>|--含氧垂直单倍体
#>|--铬垂直单叶
#>|--垂直单叶
#>|--andic单倍体
#>|--玻璃体单倍体
#>|--fragiaquic单倍体
#>|--片状含氧单叶藻
#>|--水成砂单叶
#>|--芳香族含氧单倍体
#>|--蒽醌单倍体
#>|--白质单倍体
#>|--白蛋白单倍体
#>|--舌水单倍体
#>|--含水单倍体
#>|--水性单叶叶
#>|--水生单倍体
#>|——软体动物含氧单倍体叶片
#>|--含氧单叶藻
#>|--片状单叶
#>|--跛行单倍体
#>|--砂粒单倍体
#>|--砂状单叶
#>|--舌单叶
#>|--易燃单叶
#>|--最终单倍体
#>|--软体动物单倍体
#>|--典型单倍体
#淋溶土的亚目和大类群分类树("淋溶土", = "淋溶土",水平 =c(c)("子目","大集团"))#>阿尔法索尔
#>|--浅绿色
#>||--结晶
#>| |--柱基质量
#>||--杜拉夸尔夫
#>||--钠水剂
#>||--fragiaqualfs
#>||--假名
#>||--vermaqualfs
#>||--白水银
#>||--舌水
#>||--表层水
#>||--内水
#>|--水晶
#>||--苍白的
#>||--词汇分类
#>||--单倍体
#>|--自定义
#>| |--杜鲁斯特尔夫
#>||--柱脚
#>||--钠
#>||--坎迪乌斯塔尔夫
#>||--坎普卢斯塔夫斯
#>||--巴勒斯坦
#>| |--杜鹃花
#>||--单倍体
#>|--旱生
#>| |--durixeralfs
#>||--钠
#>||--片段
#>| |--柱基旱生植物
#>| |--罗得西罗夫
#>| |--淡紫色
#>| |--单倍体
#>|--乌达尔夫
#>|--钠醛
#>|--法拉第
#>|--fraglossudalfs(法语)
#>|--片段
#>|--坎迪乌达尔夫
#>|--坎普卢达尔夫
#>|--帕卢达尔夫
#>|--红景天
#>|--舌苔
#>|--单倍体

解释ST():用简短的解释标注构成元素

解释ST()提供形成性的简单叙述性解释目、子目、大类群或子类群级别的分类单元。

猫(解释ST('叶状体'))#>福利斯特尔
#> |  |  |
#>树叶的质量
#>    |  |
#>有机土壤材料的存在
#>       |
#>100cm内永久冻土或凝胶材料的土壤猫(解释ST('典型内水'))#>典型内水
#> |     |   |  |
#>子群概念的中心主题
#>       |   |  |
#>地下水位
#>           |  |
#>与湿度相关的特征
#>              |
#>粘土层、钾质层或钠质层的土壤猫(解释ST('分裂单倍体杜蕾克勒斯'))#>分裂单倍体杜蕾克勒斯
#> |        |      |   |  |
#>结构突变
#>          |      |   |  |
#>子群概念的中心主题
#>                 |   |  |
#>出现榴莲
#>                     |  |
#>xeric SMR公司
#>                        |
#>粘土层、钾质层或钠质层的土壤

#将“分类单元代码”转换为分类单元名称(子组)猫(解释ST(taxon_code_to_taxon("biao ji")))#ABCD=吉普赛人
#>吉普赛人
#> |      |   |   |
#>存在石膏层
#>        |   |   |
#>非常干燥
#>            |   |
#>存在低温扰动
#>                |
#>100cm内永久冻土或凝胶材料的土壤

#所有土壤目(字母[1:12];分类单元代码A至L)
物件 <-重叠地(字母[1:12],功能()猫(解释ST(taxon_code_to_taxon()),"\\n\n"))#>凝胶剂
#>  |
#>100cm内永久冻土或凝胶材料的土壤
#>
#>组织溶胶
#>  |
#>有机质含量超过30%至40cm或以上的土壤
#>
#>山梨醇
#>   |
#>200cm深度范围内有辐射层的土壤
#>
#>安迪索尔
#> |
#>上部60cm中1/2或更多安第奇土壤性质的土壤
#>
#>环氧树脂
#> |
#>含有毒层的土壤,或表面18cm粘土含量>40%的土壤,以及含<10%耐候矿物的kandic层土壤
#>
#>变性土
#>  |
#>所有土层中粘土含量大于30%的土壤以及周期性打开和关闭的裂缝
#>
#>阿里迪索尔
#>   |
#>具有某些诊断层位和干旱SMR的土壤
#>
#>最终土壤
#> |
#>泥质层或kandic层土壤,在180cm深处,pH值8.2<35%时的基底饱和度
#>
#>软土
#>  |
#>在180cm以上的所有深度中,pH值大于等于50%时具有软体动物表层和基底饱和度的土壤
#>
#>淋溶土
#> |
#>具有泥质、堪萨斯或钠质地层的土壤
#>
#>吸尘剂
#>    |
#>具有伞形、软体动物或斑纹表层或寒武层的土壤
#>
#>全硫醇
#> |
#>其他土壤

静态数据库

这个./inst/extdata文件夹(以前是./数据库)GitHub的存储库以前包含与分类和映射相关的数据表美国土壤调查地理数据库(SSURGO)中的单位概念。

这些数据库包括:

  • 分类亚群、科级成分和土壤的统计系列。

  • 系列、国家地图单位符号和地图的MLRA重叠表单位键。

  • 每个系列的KSSL记录汇总以及地貌位置,母材来源和种类。

这些表已移动到名为土壤网络数据.