.├── 变体服务#使用SPDI变体服务的教程├── eUtils.ipynb#示例dbSNP eUtils查询├── extract_侧翼.sh#使用eUtils获取rs侧翼序列的脚本├── MafGraph.ipynb#eUtils查询和MAF解析和绘图├── hadoop_json_annotation.py#解析dbSNP RS json对象并使用hadoop提取RS注释├── hadoop_json_clinical.py#解析dbSNP RS json对象并使用hadoop提取临床RS数据├── hadoop_json_merge.py#解析dbSNP RS json对象并使用hadoop提取RS合并历史├── hadoop_json_placement.py#解析dbSNP RS json对象并提取RS映射信息(即位置)├── refsnp-sample.json.gz#包含一个用于测试rsjson_demo.py的rs268 refsnp json示例的示例数据├── rsjson_demo.py#解析RefSNP(rs)JSON对象的示例Python脚本。脚本|生成包含程序集版本、序列ID、,|位置、参考等位基因、变异等位基因和ClinVar临床意义,|如果可用。注意:此脚本使用Python 2.7.12进行了测试。├── rsjson_allele_info_demo.py#提取等位基因信息位置、mrna和蛋白质SPDI参考等位基因(插入)和变体(删除)序列├── rsjson_getss_info_demo.py#提取提交信息(ss、local_snp_id等)└── 自述.md