树状的

概述

包裹树状的是多项式的应用独特地描述树木。它提供了用于树分析和基于多项式的比较。核心功能包括：

有关树定义多项式的数学描述，请参见：

install.packages（“treenomial”）

对于开发版本：

库（devtools）安装github（“mattgou1d/treenomial”）

考虑一棵三叶树：

图书馆(猿)图书馆(树状的)三个TipTree <-rtree树(三,扎根的 = T型)plot.phylo语言(三个TipTree,使用.edge.length = F类,显示.tip.label = F类,方向 = "向下")

它的多项式是x^3+xy+y，可以用系数矩阵，其中第i行、第j列中的元素表示y^（i-1）*x^（j-1）系数：

树到多边形(三个TipTree,var标签 = T型)#>x^0 x ^1 x ^2 x ^3
#>y^0 0 0 1
#>y^1 1 1 0 0
#>y^2 0 0 0

使用多项式的系数，树之间的距离可以比较一下，下面两个与随机目标树最接近的树是从随机样本中发现：

#随机12点目标树
目标 <-rtree树(12)#100棵树的随机抽样
样品 <-RM树(100,12)minInfo（最小信息） <-绘制极端树(目标,样品,n个 = 2,比较 = "最小值",类型 = "d日")