jSDM R包 用于在中拟合联合物种分布模型(JSDM)的软件包层次贝叶斯框架(沃顿等。2015). 吉布斯采样器是用C++编写的。它使用卢比,犰狳和GSL公司最大化计算效率。 系统要求 确保GNU科学图书馆(GSL公司)已安装在您的系统上。 安装 CRAN的稳定版本 安装最新稳定版本的jSDM公司从CRAN(起重机)具有: 安装.包("jSDM公司") 开发版本 或安装的开发版本jSDM公司从github具有: 开发工具::安装github("ghislainv/jSDM公司") 或二进制版本jSDM公司的开发版本用R编译4.3.0版可在此处找到: jSDM_windows. 可用功能 该软件包包括以下功能,以适应不同的物种分销模式: 功能 数据类型 数据格式 jSDM_二项式逻辑() 存在-缺席 宽的 jSDM_二项式循环() 在场不在场 宽的 jSDM_二项式_probit_sp_constrained() 在场不在场 宽的 jSDM_binomial_probit_long_format() 存在-缺席 长的 jSDM_poisson_log() 丰度 宽的 jSDM_gaussian() 连续的 宽的 贡献 这个jSDM公司R包是开源的,根据GNU通用公共许可证版本3许可证。任何感兴趣的人都可以为软件包开发做出贡献跟随我们的社区指导方针.每个贡献者必须同意遵循项目的的代码行为. 工具书类 D.I.沃顿、F.G.布兰切特、R.B.奥哈拉、Ovaskainen、O.塔西宁,S.、Walker、S.C.和Hui、F.K.C.(2015)这么多变量:关节建模在群落生态学中.生态与进化趋势,30, 766–779.