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abodein/netOmics

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[生成状态](https://travis-ci.com/abodein/netOmics网站)

[许可证:GPL v3](https://www.gnu.org/licenses/gpl-3.0)

网络Omics

使用netOmics,我们通过引入解释工具超越了集成。netOmics是一个用于创建和探索多元经济网络的软件包。

根据提供的数据集,它允许从表达数据以及来自知识数据库的交互网络。在合并子网络以获得全球多经济网络后,我们提出了使用传播技术进行网络探索的方法分子机制的功能预测或识别。

此外,还为纵向多组分数据开发了该软件包和可以与我们以前发布的包timeOmics结合使用。

有关更多示例,请访问https://github.com/abodein/netOmics-案例研究

安装

最新的生物导体发布

要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace(必需命名空间)("生物技术经理",安静地 = 真的))安装.包("生物技术经理")生物技术经理::安装("网络Omics")

最新的github版本

在R中安装devtools包,然后加载它并安装最新的stable的版本网络Omicsgithub

##如果未安装,请安装devtools
如果(!requireNamespace(必需命名空间)("开发工具",安静地 = 真的))安装.包("开发工具")##安装netOmics
开发工具::安装github("abodein/netOmics")

引用

“Bodein,A.、Scott-Boyer,M.P.、Perin,O.、Le Cao,K.A.和Droit,A.(2020年)。从多组学纵向数据解释基于网络的整合。生物Rxiv。"

维护人员

安托万·博登(antoine.bodein.1@ulaval.ca)

错误/功能请求

如果您有任何错误或功能请求,让我们知道.谢谢!

关于

多麦克风多层网络集成和解释

资源

许可证

星星

观察者

叉子

发布

未发布版本

包装

未发布包

贡献者

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