# install.packages（“devtools”）
开发工具 :: 安装github( " Yangcq-Ivy/生态位条形码 " ) 安装.包( " 生态位条形码 " ) 氮硼硅 和 NBSI2公司 函数执行主标识 整合DNA条形码和生态位建模。 提取SpeInfo , 利基。 模型。 生成 , 伪当前点 和 伪.absent.points 函数是可提取的中间产物 步骤，共步 国家统计局 和 NBSI2公司 执行信息提取， 生态位建模和伪点生成。 单系prop , spe.mantel.test测试 和 利基。 主成分分析 功能 执行引用或/和查询的特征分析 数据集，包括系统发育单系比例、 种间成对遗传距离与 生态距离与生态的主成分分析 数据集之间的小生境。
rm（毫米）( 列表 = ls（）） 图书馆( 生态位条形码 ) 数据( 环境病毒 ) 数据( bak.vir公司 ) 嫉妒 <- 光栅 :: 获取数据( " 世界气候 " , 下载 = 错误的 , 无功功率，无功功率 = " 生物 " , 物件 = 2.5 ) 环境病毒 <- 光栅 :: 砖( 嫉妒 ) # 生成随机背景点
后面 <- 肢解 :: 随机点数( 面具 = 环境病毒 , n个 = 5000 , 提取 = 无效的 , 外部 = 1.1 , 排除 = 真的 , 问题 = 错误的 , 手机号码 = 错误的 , 尝试 = 三 , 警告 = 2 , lonlat校正 = 真的 ) bak.vir公司 <- 光栅 :: 提取物( 环境病毒 , 后面 ) # ################################################################
# ##场景0
# ##NBSI DNA条形码+物种分布坐标
# ##可用（使用在线气候数据）
# ################################################################ 图书馆( 猿 ) 数据( 笔记本电脑虫 ) 参考seq <- 笔记本电脑虫 $ 参考seq
魁塞克 <- 笔记本电脑虫 $ 魁塞克
NBSI.输出 <- 氮硼硅( 参考seq , 魁塞克 , 参考添加 = 无效的 , 独立 = 真的 , 模型 = " 射频 " , 变量 = " 所有 " , 环境病毒 = 环境病毒 , 巴卡韦 = bak.vir公司 ) NBSI.输出 参考添加 <- 笔记本电脑虫 $ 参考添加
NBSI输出2 <- 国家统计局( 参考seq , 魁塞克 , 参考添加 = 参考添加 , 独立 = 真的 , 模型 = " 射频 " , 变量 = " 选择 " , 环境病毒 = 环境病毒 , bak.vir公司 = bak.vir公司 ) NBSI输出2 # ################################################################
# ##场景1
# ##通过其他方法或条形码识别的NBSI2物种+
# ##可用物种分布坐标
# ##（用于使用在线气候数据）
# ################################################################ 数据( 笔记本电脑虫 ) 条形码标识结果 <- 笔记本电脑虫 $ 条形码标识结果
参考文件 <- 笔记本电脑虫 $ ref.in用于
que.infor（队列输入） <- 笔记本电脑虫 $ que.infor（队列输入）
NBSI2.输出 <- NBSI2公司( ref.in用于 = ref.in用于 , que.infor（队列输入） = que.infor（队列输入） , 条形码标识结果 = 条形码标识结果 , 模型 = " 射频 " , 变量 = " 选择 " , 环境病毒 = 环境病毒 , bak.vir公司 = 巴卡韦 ) NBSI2.输出 # ################################################################
# ##场景2
# ##通过其他方法或条形码识别的NBSI2物种+
# ##拥有自己环境数据的用户
# ################################################################ 数据( 笔记本电脑虫 ) 条形码标识结果 <- 笔记本电脑虫 $ 条形码识别结果
参考env <- 笔记本电脑虫 $ 参考env
队列env <- 笔记本电脑虫 $ 队列env
NBSI2.输出2 <- NBSI2公司( 参考env = 参考env , 队列env = 队列env , 条形码标识结果 = 条形码标识结果 , 模型 = " 射频 " , 变量 = " 所有 " , 环境病毒 = 环境病毒 , bak.vir公司 = bak.vir公司 ) NBSI2.out2
Yang，C.Q.，X.H.Li，M.C.Orr，A.B.Zhang（2021）。 NicheBarcoding:R包 利用DNA条形码和环境生态位模型进行物种识别。 R包版本1.0。 https://github.com/Yangcq-Ivy/NicheBarcode