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植物
第13卷
第11期
10.3390/工厂13111433
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审查

爆发十年后苛求木霉第（b）小节。帕卡在阿普里亚（意大利南部）：研究策略的方法论文献分析

通过
弗朗西丝卡·斯里奥
1，
乔瓦尼·伊姆布里亚尼
1，
奇亚拉·罗伯塔·吉雷利
1，
Paolo Miglietta码头
1，
马尔科·斯科蒂奇尼
2和
弗朗西斯科·保罗·法尼兹
1,*
1
意大利莱切73100 Salento大学生物与环境科学与技术系
2
农业研究和经济委员会（CREA）-橄榄、水果和柑橘作物研究中心，Via di Fioranello，52，00134 Roma，Italy
*
信件应寄给的作者。
植物 2024，13(11), 1433;https://doi.org/10.3390/plants13111433
收到的提交文件：2024年4月12日/修订日期：2024年5月17日/接受日期：2024年5月20日/出版时间：2024年5月22日
（本文属于植物保护和生物相互作用)
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版本注释

摘要

:
2013年苛求木霉（Xf）首次在意大利最南端的欧洲（阿普里亚，萨兰托地区）发现。当地确定的亚种帕卡事实证明，这对橄榄树来说是致命的，这对地中海地区最具标志性的栽培方式之一引发了前所未有的植物检疫紧急情况。Xf公司帕卡橄榄快速衰退综合征（OQDS）是一种严重的疾病，在该地区蔓延，对农业、景观、旅游业和文化遗产产生了巨大影响。这种细菌是由以木质部汁液为食的昆虫传播的，由于生物膜的形成，阻塞了植物木质部导管，导致橄榄树迅速萎蔫。本次审查的目的是进行彻底分析，对2013年至2023年12月期间与阿普里亚Xfp疫情有关的已发表工作进行总体概述。后者杀死了数以百万计的橄榄树，留下了一片幽灵般的景观，有8000多平方公里的受感染领土，占该地区的40%。本综述列出了迄今为止为防治橄榄植物中的Xfp所做的大多数研究工作，从早期识别细菌的尝试、查明并可能控制载体的调查、特定诊断技术的评估和开创性的治疗方法开始。有趣的是，根据初步审查与阿普里亚橄榄树上爆发的Xfp疫情有关的可获得科学文献的通用标准，在过去十年中可以找到的论文不到300篇。其中大多数基本上强调了开发诊断工具的重要性，这些工具可以早期识别疾病，即使在受感染的植物仍然没有症状的情况下，也可以降低周围植物的感染风险。另一方面，在已发表的研究中，诊断重点（57%）压倒性地涵盖了所有其他可能的调查目标，如病媒、影响和可能的治疗。值得注意的是，在2013年至2023年间，只有6.3%的文献报道涉及阿普里亚Xfp主题，涉及针对细菌的特定治疗应用。其中，报告受感染植物的田间试验，包括简单的修剪指示，进一步受到限制（6%）。

1.简介

与农业和环境有关的四个主要国际组织（即世卫组织世界卫生组织、粮农组织粮食及农业组织、联合国环境规划署-联合国环境规划署和世界动物卫生组织-世界动物卫生组织）已启动2022–2026年“同一健康”行动计划[1]保护人类、动物、植物和环境的健康。这是为了对卫生政策在未来几年将面临的新的重大问题作出协调一致的回应。流行病学研究长期以来所表明的，即人类健康、环境质量和动植物生命之间的密切关系，在新冠肺炎疫情和气候危机的背景下表现得最为明显。
“一个健康”方法承认，人、家畜和野生动物、植物以及整个生态系统的健康是相互关联和紧密相关的。这种平衡尤其体现在今天昆虫的共存上，尽管事实上它们曾经是未知的。人们可以考虑由入侵物种传播的所谓“外来疾病”，由于气候变化，这些疾病现在出现在以前不存在的地方。入侵物种是真正的植物检疫危机，正在摧毁农业和食品生产行业。它们对许多农场产生严重的经济后果，并对生产活动所依赖地区的管理产生重大影响。它们每年造成的经济损失是自然灾害造成的损失的十倍，而且由于贸易全球化和全球平均气温变暖，它们的数量只会增加，这助长了它们的侵略性。由于与气候变化有关的生态问题的多样性和复杂性使我们面临前所未有的挑战，因此必须根据经济和环境可持续性原则评估和管理这些问题。意大利南部的阿普利亚地区，特别是莱切省，第一次不得不应对一场疫情，这场疫情使该地区措手不及，并影响了橄榄树，距今已近十年(欧洲木犀) [2，三]. 因此，在此次疫情的早期阶段，对该疾病的病因缺乏普遍共识。因此，有必要进行科学调查，并要求欧盟委员会向欧洲食品安全局（EFSA）进行初步分析，以期对本案中的植物病原菌提供紧急科技援助[4]. 在EFSA的PLH小组发表科学意见后，该小组评估了Xf在欧盟境内对植物健康造成的风险，并评估了风险降低方案[5]2015年，欧洲食品安全局收到了一份请求，要求对一家意大利非政府组织提供的科学和技术信息作出紧急回应，该组织声称苛求木霉（Xf）不是意大利南部莱切省橄榄树衰退的原因。EFSA植物健康小组随后评估了Xf作为有害生物带来的风险，并审查了潜在的风险缓解策略[5]. 根据EFSA，Xf的寄主范围很广，包括许多常见的栽培和野生植物[4]. 以木质部液体为食的昆虫被认为是整个欧洲的潜在媒介。
在Elbeaino等人的注释中[6]报道了在Auchenorrhynchha物种（射手叶蝉和蛙或小蠊）的成虫中检测到Xf。特别是，发现Xf存在于水蚤Philaenus spumarius（Ps）和首次野营新蝇（Nc）和线虫大戟（El）（与其他昆虫不同，它是韧皮部食草动物），表明这些昆虫对细菌在阿普里亚地区传播的潜在媒介作用。其中，在阿普里亚有一种被明确识别的媒介是多食性随地小蠊Ps（半翅目：蚜科），它在整个风险评估区域内普遍存在[7，8，9]. 这一令人信服的证据导致官方承认疫情的起因是对阿普里亚橄榄树的威胁。
宣布紧急状态，这不仅在欧洲，而且在全世界都是前所未有的[10]. 促成这一发展的一些因素包括阿普里亚橄榄树的丰富（约6500万棵，其中11棵位于萨兰托半岛）、橄榄树的大小、媒介的广泛存在Ps公司气候温和，冬季温和，尤其是萨兰托[11]. 细菌在寄主植物的木质部通道内繁殖和生活。它们通过媒介昆虫传播，媒介昆虫可以传播到各种野生和栽培植物。通过吸吮生病植物的汁液，载体将细菌带到健康植物上[12]. 多种植物宿主的疾病是由木质部限制细菌Xf引起的[13]. EFSA的Xf寄主植物数据库，最初记录了359种植物（包括杂交种）[4]现已包括423种公认的寄主植物，194属，68科[14]. 如果将所有植物物种、属和科都考虑在内，数字将增至679种植物，304属，88科[14]. 据报道，意大利，特别是阿普里亚地区的南部，是该地区的门户二甲苯属进入欧洲。然后，它连同各种亚种一起传到邻近地区，如法国、西班牙和葡萄牙[15]. 意大利的寄主植物多样性包括许多常见的栽培和野生植物。2015年7月22日，科西嘉岛于桃叶远志，一种广泛生长且有吸引力的观赏灌木。从那时起已经在20多种不同的植物物种上发现了Xf（例如。，桃叶远志，诺贝尔劳伦斯，桃金娘属，岛状肌孔菌和粘胶Dodonaea“Purpurea”）位于科西嘉岛和法国东南地中海沿岸[13].
本文的目的是对文献报告进行彻底分析，对2013年至今阿普里亚Xfp疫情的具体研究领域进行总体概述。因此，这项工作将包括对考虑的研究策略进行系统分析，包括以下内容：早期和进一步尝试鉴定细菌；识别和控制传播媒介的研究；用于跟踪疾病进展的地理方法；新诊断技术的发展；使用的各种治疗方法；对环境、人类和社会的影响以及橄榄种质对Xfp的敏感性。分析结果应全面反映所做的科学工作，包括它们在理解和可能控制疾病所需的多目标方面的分布。因此，回顾过去十年的科学文献和数据分析，除了早期发现外，还可以为制定监测计划和向风险管理者建议管理和控制策略提供有用的信息。本文还旨在强调综合方法（一个健康）的重要性，以解决Xfp危机，将植物检疫监测、科学研究和利益相关者之间的合作结合起来。

2.结果和讨论

流程图中报告了选择过程的详细信息(图1). 电子文献中的搜索从Scopus数据库返回了150条记录，从WOS数据库返回了164条记录。在删除重复后，从可访问科学文献的初步审查中选出174篇参考文献，其中115篇符合基于标题、摘要和全文筛选的纳入标准。根据上述研究策略，本文选择了这些数据进行分析，并将在下文进行简要总结和进一步讨论。应该指出，目前的工作主要侧重于对用于处理阿普里亚地区Xfp疫情的研究策略的文献分析，该研究策略已经在其他一般方面进行了广泛审查[16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30].

2.1. 苛求木霉，细菌

2013年10月，我们开始在莱切的第一片橄榄林中看到植物干燥的现象，即60–70年或以上的世俗橄榄树[32]位于阿普里亚东南端的萨兰托半岛的大部分地区（塔兰托湾的加里波利、塔维亚诺、阿利斯特、费林等城市）[33]. 这是欧盟首次在田间条件下爆发Xf，表示为CoDiRO（意大利名称“Complesso del Desiccamento Rapido dell‘Olivo”的缩写），因为存在一种对该综合征“负责”的隔离细菌Xf，该综合征影响并继续影响大多数成熟植物[2，34]. 1981年至2017年，Xf是EPPO A1中包含的检疫性病原体[35]建议作为检疫性有害生物进行监管的有害生物清单，但在EPPO地区引入后，于2017年转移至EPPO A2清单[36]. 在EPPO区域，存在不同的细菌种群和亚种，可能会出现不同亚种间杂交产生的重组菌株。Xf是一种革兰氏阴性菌[37]属于黄单胞菌科科，影响草本和观赏重要树木作物的多种疾病的病原体[12]；它侵入多种寄主的木质部，由以木质部为食的昆虫媒介从中获得并转移到其他植物。
在Cariddi等人的工作中[38]试图从有症状的、自然感染的橄榄和夹竹桃植物以及接触过Xf阳性小蠊并受其感染的长春花幼苗中分离纯培养的Xf菌株。从受感染的长春花和夹竹桃菌落产生的测序PCR产物彼此100%相似，并与从受感染的橄榄树获得的等效序列相似，它们与数据库中已知的Xf菌株具有97–99%的序列同一性。这些序列在一个分支上形成了一个独特的集群，其中包括Xf亚种的分离株帕卡（Xfp）。因此，Apulian Xf分离物被确定为帕卡亚种和命名为CoDiRO[38]. 橄榄树的快速干燥，其首字母缩写OQDS来源于英语翻译的橄榄快速衰退综合征，在接下来的几年里Xfp的关键致病作用被揭示后，现在成为该现象的名称[39]. 根据阿普里亚地区植物检疫局[40]该病的主要症状包括小枝、树枝或整棵树枯萎；小枝、树枝和树干的木材褐变；树叶烧焦。叶子从顶端和边缘开始部分干燥，类似于橄榄树寄生和非寄生的“灌木”，这是另一个典型的症状二甲苯属疾病。由于存在由细菌菌落和植物为抵抗自身和隔离病原体而产生的化合物形成的粘液，干燥枝条的木质导管显得较暗。相反，“brusca”（枯叶或边缘叶灼伤）是一种影响橄榄的疾病(欧洲橄榄). 通常通过叶尖和/或叶片边缘组织的干燥和死亡来确定，随后可能会落叶[39]. 进行了研究，以鉴定和评估阿普利安Xf菌株的多样性，了解其生物学、遗传学和系统发育，并最终应用所有这些知识来更有效地控制这种疾病。虽然Xf被认为是一个单一物种，但有四个亚种可以根据DNA差异来区分。这些亚种具有不同的地理起源和部分不同的寄主范围。CoDiRO菌株遗传均一，属于亚种帕卡，但根据对来自无菌培养物的细菌分离物进行的多位点序列分型，代表了一个与哥斯达黎加菌株似乎相同的品种[41，42].
Giampetruzzi等人测定了Xf-CoDiRO菌株的基因组草图序列，该菌株具有2460000 bp的DNA分子，其基因编码重要的毒力因子（rpf簇基因、多聚半乳糖醛酸酶-pglA基因）[43]确认这种分类分配。
为了分析Apulia地区的Xf菌株，Mang等人[44]研究了16S rDNA基因，该基因编码DNA聚合酶的B亚基多肽（gyrB）和推定的蛋白HL基因[45]. 为了检测Xf阿普利安株的核苷酸多样性及其与其他Xf物种的联系，进行了16S rDNA、gyrB和HL基因序列比较以及系统发育分析。可以区分亚种帕卡和苛求使用HL核苷酸序列的Xf。然而，gyrB基因的核苷酸改变有助于研究人员将Xfp与这两个多重亚种和苛求根据三个基因的系统发育分析，来自阿普里亚地区的Xf菌株被归类为亚种帕卡基于多焦点序列类型，Loconsole等人[46]和Martelli等人[47]据报道，在意大利截获了三种新的细菌序列类型，它们与各种Xf亚种聚集在一起，突显了将更多病原体遗传多样性引入欧洲的危险。他们特别指出，莱切省和布林迪西省受感染的植物与一个单一基因型（ST53）有关，意大利和哥斯达黎加已经确定了该基因型[41，42]. 此外，ST53（CoDiRO菌株），即从感染区采集的其他五种植物物种中该细菌的相同序列类型，被发现存在于所有Xf阳性的新寄主植物物种中，包括樱桃、桃金娘叶和迷迭香。这一证据进一步支持了这样一种理论，即从中美洲进口的感染了Xf的咖啡植物是疫情的起因。
马塞莱蒂和斯科蒂奇尼[48]在他们的研究中，评估了27个Xf菌株的完整基因组和草图基因组以及十、台湾他们证明了属于亚种的四个Xf菌株的遗传克隆复合体的出现帕卡在中美洲演变而来。这种克隆复合物包括CoDiRO菌株，该菌株与“橄榄快速衰退综合征”有关，并在意大利南部发现。它由两株从夹竹桃中分离出来的菌株和一株来自夹竹桃的菌株组成咖啡这项研究强烈支持通过中美洲种植的咖啡植物在意大利南部引入Xf的可能性。
经过这项研究，Cella等人[49]使用BEAST（贝叶斯进化分析采样树），利用系统发育和进化分析确定两种细菌菌株的潜在来源和引入途径(十、苛求子公司。帕卡和十、苛求第（b）小节。三一). 根据系统发育研究，这两种细菌菌株可能有两种不同的大流行引入。哥斯达黎加Xfp的两条独立来源路线（后验概率100%）和Xf-subsp。三一来自加利福尼亚州的（Xfs）（后验概率为100%）也被披露并通过系统地理学研究验证[50]. Xfp起源的当前假设[50]X的地理起源也得到了系统发育学的支持和验证。此外，Giampetruzzi等人[50]在从OQDS影响的橄榄树获得的ST53培养分离株中选择并表征了Xfp菌株De Donno（CFBP 8402）的全基因组序列。在实验条件下，人工将这种细菌植入不同品种的橄榄中，引起的症状与污染橄榄园中的症状相同。此外，Saponari等人[51]通过无菌培养中的细菌分离确定Xf-OQDS关系。然后，为了测试培养细菌定植这些特定宿主的潜力，并模拟田间症状，桃金娘叶益母草的植株(桃叶远志)、夹竹桃(夹竹桃)和橄榄(欧洲橄榄)本研究首次实验证明了OQDS、夹竹桃和桃金娘叶益母草病害与Xfp菌株De Donno之间的关系，这也表明该菌株可以在宿主中引起与现场观察报告的相同的症状。事实上，不含Xf的橄榄植物接受了机械和移植物接种，导致植物枯萎、枯萎并最终死亡。
多基因座VNTR分析分析（MLVA分析），由Mazzaglia等人[52]是一种鉴定各种病原体种群的分子方法。特别是，该方法在电子版中检查了“De Donno”菌株完全编辑的基因组中文献中报告的VNTR位点的存在。MLVA分析还证明了其能够产生关于该亚种遗传多样性的新的更深入的数据，特别是关于意大利阿普里亚疫情的数据。该分析明确区分了亚种或甚至序列类型（ST），但也确定了同一ST内的变异，以提供有关病原体传播动力学和途径的更具体细节。由于它能有效地应用于从各种寄主植物的受感染组织中提取的整个DNA，因此它特别有助于大规模筛选感染和加强遏制措施。
此外，在D’Atoma等人的研究中[53]，亚种的参考菌株苛求利用从加州葡萄中分离得到的Xf Temecula1菌株对Xfp菌株De Donno的体外性能进行了比较[54，55]. 利用转化方案，评估橄榄菌株的天然能力和遗传改造的适宜性。这些信息将有助于细菌突变体的开发，该突变体是研究菌株与其宿主植物以及载体之间相互作用的有用工具。试验明确表明，De Donno菌株比Temecula1菌株更具聚集性，形成了更多的生物膜，并且在琼脂平板上没有边缘。
要了解适应特征是如何随着时间发生变化的，需要对这种入侵病原体的遗传变异进行密切和持续的观察。还强调了采取所有实际安全措施的重要性，以减少可能导致病原体多样性增加的即将引入的可能性。2018年，Ramazzotti等人[56]使用针对整个病原体基因组的DNA分型技术，首次研究了从不同地区采集的14个“ST53”Xf分离物中的亚变异发生情况。来自Salento（意大利阿普里亚）的三个Xf分离物，即Salento-1、Salento-2和De Donno，其完整基因组序列已发布，它们共享一个最近的共同祖先。所有测试的菌株都具有相同的基因组指纹，支持阿普里亚存在一种主要流行菌株。
2019年之前，阿普里亚OQDS和Xfp的流行病学特征主要不清楚，尽管正在进行大量研究，以澄清与该细菌有关的几个因素，例如其分类、起源和宿主范围。阿普里亚地区的Agenzia Regionale per le attivitáIrrigue e Forestali（ARIF）检查员于2017年9月至2018年3月期间监测了塔兰托省和布林迪西省的控制区和缓冲区。
Scala等人[57]采用液相色谱-飞行时间质谱（LC-TOF）和液相色谱串联质谱（LC-MS/MS）研究了Xfp菌株De Donno在纯培养条件下的脂质组成。他们使用烟草测试Xfp在宿主体内产生特定脂质（例如鸟氨酸脂质和oxylipin 7,10-diHOME）的能力。与未感染的植物组织相比，不同的脂质化合物在感染的植物组织中表现出分布模式。
蝎子和塞萨里[58]分析并讨论了220279棵橄榄树的官方数据。在本研究中，橄榄树OQDS和Xfp最常见的症状是叶片烧焦和枝条枯萎。这些症状被认为出现在严重的树冠坍塌和植物死亡之前。在这些地区监测的220279棵橄榄树中，8.06%的橄榄树发生了枯叶、枯枝和小枝病；一些主要种植在受检地区的品种似乎比其他品种有更多的症状。事实上，品种“Nociara”、“Cima di Melfi”和“Cellina di Nardó”的衰退症状出现频率最高，树龄似乎与衰退症状的发生率有关。
2020年，Scala等人[59]首次探讨自然感染苛求木霉他们通过非目标分析检测了在病原体压力下发生变化的所有脂质，并将受感染的树木与未受感染的树区分开来。OQDS阴性和OQDS阳性样本之间的聚类差异表明，Xfp的存在可以影响脂质实体的差异形成。尽管已经对Xfp感染的生物学进行了研究，但仍然缺乏关于决定细菌基因型和寄主植物物种之间特异性的因素的知识，鉴于Xfp的传播，这一点现在尤为重要。Firrao等人[60]扫描Xf-pan-genome以确定与其在黄单胞菌目中的系统发育位置不一致的基因。分析结果表明，对于该基因的很大一部分，在属于远缘相关分类群的细菌中发现了最接近的同源物。虽然Xf菌株重组自身的能力是众所周知的，但泛基因组分析的结果强调了环境DNA在塑造其基因组方面的额外相关性，并可能对其植物病理学特征产生影响。在意大利受影响地区，Sicard等人[61]检查了从病橄榄树上采集的79个Xf样本的基因组(欧洲橄榄cv.“Cellina di Nardó”或“Ogliarola Salentina”）。通过将群体基因组方法与进化基因组技术相结合，他们证明了阿普里亚疫情是最近从中美洲引入单一病原体（2008年）的结果，并确定了一小部分可能对Xf的环境适应至关重要的基因。有关其鉴定、表型和基因型特征的主要结果总结如下表1。

2.2.苛求木霉矢量

Xf需要昆虫载体从受感染的植物传播到健康的植物；特别是，它是由以木质部液体为食的半翅目动物传播的，如蝉类和无食蚜类（cercopids）[62，63，64]. 由于它是一种生活在木质部的细菌，因此只有木质部流食性昆虫才能作为Xf的载体。昆虫媒介前肠中的食物管（precibaba）和抽吸室（cibali）是细菌被昆虫摄入后粘附和生长的地方[65]. 细菌不存在跨径向或跨变异传代。传播只需要少量细菌细胞，没有潜伏期。尽管以木质部液体为食的许多种类的痰盂和狙击手已知会在全球传播细菌，但意大利的病媒尚不清楚。但2013年9月在意大利南部发现的Xf引发了对该细菌昆虫载体的快速搜索。Saponari等人[7]利用从加利波利（萨伦托，阿普里亚地区）采集的草地臭鼬进行了第一次传播试验，将每株8–10只臭鼬关在五株长春花和七株橄榄上(欧洲橄榄)接种植物。作者报告了首次现场收集的结果欧洲橄榄通过对成年Ps进行聚合酶链式反应（PCR）实验，发现每五个长春花中就有两个的Xf检测呈阳性，但没有传播给橄榄。该属众所周知的颜色多态性菲拉埃努斯使区分变体成为可能，并让不熟练的从业人员参与物种鉴定。Lahbib等人的研究[66]表明Ps有23个变形，然后是8个变形P.签名，第七个P.tesselatus公司，第六个伊塔洛西格纳斯，马格里希格斯P.maghresignus和塔里法P.tarifa，第二个P.loukasi先生和其中一个P.arslani公司.Ps变形也称为Spitterbugs。这是因为蛹被包裹在由腹部腺体分泌的唾液样液体中。这种唾液与空气发生反应，产生泡沫，帮助若虫保持凉爽，躲避捕食者。尽管这些初步发现应被视为最重要的，但作者自己建议，有必要进行额外的研究，特别是考虑到Xf不是从Ps传播到橄榄，并且候选病媒调查仅在一年中最冷的三个月进行，当大多数物种的生物周期应该被视为已经完成时。Cornara等人[8]进行了一些研究和现场采样，以了解更多有关潜在病媒对该地区Xf流行病学的潜在贡献。Ps是调查期间唯一持续检测出Xf阳性的物种，也是橄榄园非橄榄植被以及橄榄叶上最常见的物种。然而，测试表明，在橄榄树冠上发现第一个感染Xf的Ps后，Ps会将Xf从受感染的橄榄植株传播到未受感染的植株。此外，Ps从多种寄主植物中提取Xf，橄榄、远志和相思树的获取率最高。
不幸的是，这种媒介物种分布极广，多食性；若虫可以吞噬多种草本植物，成虫传播到更广泛的植物种类，包括大量树木和灌木[67，68]. 虽然还发现了其他多年生寄主，主要是在花园和自然景观等非栽培场所，但橄榄是污染地区最常见的寄主。然而，由于Xf和Ps都有广泛的寄主范围和植物群落组成，因此它们在Xf相关疾病的流行病学中具有重要作用。Cornara等人[9]进行了研究，以评估受Xf感染的橄榄园中Ps的自然感染性，并评估Ps对不同寄主植物物种和品种的Xf传播。此外，这些数据表明，现场采集的Ps感染Xf的比率很高，因为在整个调查期间，感染Xf Ps的比例在25%到71%之间，Ps头部检测到的Xf细胞数量在3.5×10到4.0×10之间2（CFU当量）。除葡萄外，昆虫进入植物后，在所有寄主植物中都检测到Xf。在橄榄园，Moussa等人[69]描述各种隐齿类昆虫的季节丰度和昆虫Xf感染的时间动态。在两年的时间里，每月在五个橄榄园中观察到Ps、Nc和El物种的成年种群。优势种Ps在夏季具有最大的成虫丰度（占所有Auchenorhryncha捕获量的39.8%）。在这两年的3月和5月之间，成人Ps和N.campestris公司最初被发现，在这段时间里，通过PCR检测的每一种昆虫都对Xf产生了负面反应。在阿普里亚沿海和内陆地区的四个橄榄园中，Bodino等人[70]研究了不同臭鼬种群若虫期和成虫期的结构种群物候、丰度和作物与野生植物物种间的季节动态。Ps也是本研究中最常见的物种；晚春时，橄榄树和草本植物上有大量Ps成虫。
夏季，它们分散到野生木本寄主处，然后在秋季返回橄榄林，在草本植物覆盖层中寻找产卵地点。多年来，人们进行了更多的实验，以评估其季节变化，并了解其对橄榄上疾病流行病学的潜在影响。更具体地说，臭鼬的成虫意大利隐球菌（Pi）Drosopolous和Remane，Nc（堕落）和稻飞虱拉蒂利卡·图内塔纳松鼠科（Issidae）已进行了传播试验，以评估它们从受感染的橄榄中获取细菌的能力，以及感染不同易感寄主（橄榄、杏仁、桃金娘叶益母草、长春花）的能力。另外两种臭鼬物种Nc和伊塔洛西格纳斯Cavalieri等人[71]. 在定量PCR分析中对单个昆虫进行测试，以评估捕获率，其范围为Nc中的5.6%到Pi中的22.2%，尽管没有发现捕获图内塔纳乳杆菌为了掌握草地臭鼬与Xfp之间存在的密切联系，深入了解Ps的食性可能会有所帮助。由于在探针过程中，将触针插入植物组织，因此不可能直接观察昆虫的活动；截至2018年，所有关于Ps喂食行为的公开数据都是使用只提供完整过程快照和间接证据的技术生成的。在他们的工作中，Cornara等人[26]使用电穿透图（EPG）方法实时表征Ps。男性患者接受额外的EPG记录，以检查任何潜在的性别相关变异。构成Ps摄食行为的五种不同关键波形是木质部阶段的路径、木质部接触/预摄取、木质部汁液摄取、休眠和破坏。雌性消耗木质部汁液的时间要比雄性长得多，尽管开始第一次探测所需的时间更少。Cornara等人在另一项研究中研究了Ps对Xf的传输动力学[72]在测试中使用EPG来调查病媒喂食行为和传播之间的联系。事实证明，EPG的使用对于识别与多种媒介传播植物疾病的获取和免疫相关的行为至关重要。当Ps消耗木质部或参与与木质部摄取穿插的活动时（木质部被消耗时休息），细菌细胞以低速（约15分钟）结合到昆虫的前肠。因此，对于Ps传输Xf，需要相对较短的时间。根据它们的饮食习惯，蝉包括蝉L.（1758）（半翅目：蝉科），生活在这些农业生态系统中最常见的半翅目之一[73]也可能是细菌的潜在载体。Cornara等人[74]发现没有一株接受橄榄的植物，无论它们是被三人一组关在笼子里C.奥尔尼每株植物的个体被关在套筒笼中（55株植物），或放置在介观体内，蝉可以在受体植物（30株植物）之间自由移动，当C.奥尔尼从受感染的橄榄树上采集样本，观察它们是否能将细菌传播到健康的橄榄上。此外，在314个现场采集的数据中，只有4个（1.27%）C.奥尔尼经qPCR检测的细菌为阳性。因此，蝉在Xf的自然分布中的作用要么不存在，要么很小。Fierro等人的研究[75]提出了橄榄园病原体入侵的格子模型，目的是确定阻止感染的适当策略。这一策略基于在病媒的整个生命周期中对其进行管理，以探索即使在不利条件下也能在多大程度上减轻感染。
这项研究充分表明，试图调节病媒种群规模的简单病媒管理（针对卵子、青少年和成年人）不同于传播管理，后者试图减少成年人传播引发对青少年控制的事件的可能性。Xf入侵的控制尤其困难，因为由于感染症状的延迟，感染区域先于症状区域许多公里。由于Xf感染的最终诊断和对其的搜索依赖于症状，因此警报状态宣布得太迟，而且离入侵线太远，因此没有用处。Xf疾病的传播是复杂的生物和非生物相互作用的结果，很难预测。然而，传播速度受到许多变量的影响，包括有能力的媒介的种群规模。地被植物的存在和地被植物种类的构成是控制橄榄园病媒种群水平的关键因素，这些因素或多或少对臭鼬有益或有吸引力。尽管有大量文献记录了Ps女神的主人，如Weaver和King的名单[67]在1954年以来的200多种植物中，关于地中海地区该物种的首选寄主的信息很少。类似结果表明新菲拉埃努斯spp.若虫与禾本科植物有联系[76]尽管没有关于后者寄主植物偏好的信息。为了识别橄榄园内部和附近的植物，这些植物可以作为病媒的贮存者，Dongiovanni等人[77]描述了Xf感染区内外阿普里亚橄榄园田间条件下小蠊若虫的寄主植物选择。研究结果表明，与巴里省（非感染区）的橄榄林相比，2016年莱切省（感染区）小蠊若虫对植物的侵染率要高得多。紫菀科、豆科和豌豆科是受Ps若虫侵染的植物比例最大的植物学类群。三种臭鼬的若虫种群（Ps，N.campestris公司和阿芙罗普拉·阿尔尼)Bodino等人估算了草本覆盖层[78]. 主要物种为Ps。此外，他们注意到若虫期是极为多食性的，并且有利于菊科豆科植物家族中的一些物种，如Picris、Crepis、Sonchus、Bellis、Cichorium和Medicago。尽管媒介传播在Xf传播中具有重要意义，但关于Ps或其他Aphrophoidae物种扩散能力的信息很少。成虫经常跳跃或行走而不是飞行，这就是为什么它们被认为飞行能力差的原因[26，67]. 尽管是预测细菌传播的关键因素，但人们对Ps的扩散能力知之甚少。Bodino等人于2021年对阿普里亚（意大利南部）橄榄园中Ps成虫的运动进行了研究[79]. Ps一年中一次只能移动几百米；在橄榄林中，一天扩散到释放地点的中位距离为26米。他们计算出，在橄榄病媒丰度达到峰值时，50%的小飞虫种群持续存在于200米以内，98%的小飞虫种群持续存在于400米以内。这种细菌从橄榄到橄榄的二次传播发生在阿普利亚橄榄园，在那里，Ps成虫在地被植物上出现后很快向橄榄植物传播[8]. 橄榄既是Xf的来源植物，也是贮存植物。在阿普里亚，在5月和6月开花的物候期，橄榄树冠上有许多成虫。之后，当橄榄不再适合种植时，Ps向橄榄园周围合适的野生树木和灌木扩散，这可能是由于严酷的夏季气候条件（高温和干旱胁迫）导致植物生理和化学变化所致[26，78]. Cornara等人在Xf感染区前方西北60至100 km的研究区域内[80]描述了一年中野生树木和灌木上的大量臭鼬。蜘蛛虫成虫数量在6月至9月期间，在松林和湖岸一带达到高峰，后者以榆树为主，榆树上的蜘蛛虫数量在7月至8月达到高峰。Nc、Ps和Pi Drosopoulos et Remane这三种臭鼬在松树上分布均匀，而后者在榆树上更为普遍。在榆树上，全年都会采集到一些个体，但松树上的臭鼬只在夏季采集。为了更好地了解夏天和秋天橄榄树中细菌持久性、传播效率和Xf传播率的动力学，Bodino等人[81]进行了两组实验来研究Ps对Xf的传播生物学。他们的发现表明，Ps是橄榄成年后的一种有效的Xf载体。在获得后的前2-3周，载体前肠中的细菌负荷增加，然后稳定下来。在不同的气候条件下，全年的传输率可能会有很大差异。对其昆虫媒介的持续监测和监测对于有效管理这种生物入侵至关重要。因此，Bozzo等人的研究[82]确定了影响该载体数量和动态的入侵因素（即景观和植被变量），并因此影响该细菌在该意大利地区的空间扩展。为此，考虑了空间模式聚类分析方法。研究结果表明，在同一入侵区域内，不同地区的地域差异和地理差异可能不同，这需要有效的管理和监测规划。对目标昆虫及其近缘天敌觅食行为的调节是害虫控制创新技术的一个例子。香精油（EO）已被证明在植物对食草动物和病原体的直接和间接防御中发挥作用[83]. EOs是生物活性挥发性化合物的重要来源[84]在各种植物器官中生物合成，并能干扰昆虫的基本代谢、生化、生理和行为功能[85]. 在他们的研究中，Ganassi等人[86]调查了小蠊Ps对各种精油（EOs）和芳香植物的行为反应。所选EO在雄性和雌性Ps中引起触角反应，表明两性的外周嗅觉系统都能检测到这些EO中存在的挥发性化合物。这一发现支持了EO挥发物可能作为Ps成虫远距离线索的假设。在这种情况下，确定寄主植物释放的挥发性有机化合物（VOCs）的准确混合物也是有利的，以便将害虫引向其他目标（植物、陷阱）。当草被干涸时，Xf的主要载体Ps转移到橄榄树上。迄今为止，化学信号在控制这一过程中的潜在作用尚不清楚。在嗅觉仪生物测定中，Cascone等人[87]描述了Ps对两种抗药性橄榄树（Leccino，FS-17）和三种广泛生长的易感橄榄树（Ogliarola，Frantoio和Rotondella）的行为反应。P对雄性和雌性的反应不同，这取决于不同的橄榄品种。雌性被吸引到Ogliarola、Rotondella和Frantoio，但被FS-17击退。受试橄榄品种释放的挥发性有机化合物的表征和量化支持了行为观察，这为讨论它们对制定橄榄树长期防御Xf致命传播的综合方案的潜在贡献打开了大门。
病媒鉴定、生物学、感染管理和诱发疾病二甲苯属入侵已被广泛审查[18，88]. 与Xf载体相关的主要发现，包括其识别、表征、生命周期、控制和管理策略，总结于表2。

2.3. 地理方法

物种扩散模型可能为生物气候因素如何影响新发展的植物疾病提供了合理的解释。Xfp ST 53，橄榄快速衰退综合征的病因[2]是一种新的侵袭性菌株，以前仅限于美洲。自2013年10月在意大利南部加里波里附近发现以来[41]它已经蔓延了100多公里，杀死了大约400万棵橄榄树，而且还在生长。据估计，2013年，即疫情最初报告的那一年，这种细菌感染了8000公顷橄榄园[2，89]但一年后的2014年12月，已知的感染面积几乎增加了两倍[90].
在阿普里亚，追踪疾病进展并阻止新发、晚期病灶出现的战略自2013年11月起生效。为了确定是否存在Xf，收集了橄榄树和其他已知敏感寄主物种的样本。采样策略基于三个所谓的“划定区域”的划定：感染区，即包含所有已知感染树木的区域；控制区，即感染区北部20公里宽的区域，经常发现感染，需要采取具体的控制行动；缓冲区，即紧邻隔离区外10公里宽的无病区域，在那里采取了严格的预防措施。
Xf是过去十年来对阿普里亚地区景观产生重大影响的细菌，其感染动态简要总结如下：表3Bosso等人对病原体可能的地理分布进行了初步检查[91]他确定了除阿普里亚以外的意大利地区有利于该病发生的生态地理因素。研究表明，Xf很可能（>0.8）出现以低海拔（0–150 m a.s.l.）为特征的定居区，最潮湿月份的降雨量在80至110 mm之间，一年中最热季度的降雨量限制在60 mm，最冷季度的平均温度为8°C。
土地覆盖分析还表明，Xf可能主要发生在以下地区：（i）农业区（75.5%），具有集约农业、复杂的种植模式、橄榄园、与永久作物相关的一年生作物、果园和葡萄园；（ii）森林（12.8%），主要是橡树林地；和（iii）地中海灌木地（11.8%）。此外，在地中海盆地最重要的橄榄种植区，气候变化似乎引发了特别有利于细菌传播的环境条件[91]. 该流行病的Apulian监测项目收集了数万份实验室测试的数据，以寻找细菌的存在以及地理参考样本信息。布奇[92]以这些数据为起点，证明了Xf是如何通过产生新的密集的受感染植物簇来传播的，98%的受感染树木与另一棵受感染树木之间的距离小于100公吨。由于四分之三以上新检测到的疫情热点距离任何已知的受感染植物都超过1公里，因此也可能低估了细菌的远距离传播或需要修改监测策略。
创建了几个模型来分析和预测Xf的传播。怀特等人[93]创建了Xf的空间显式模拟模型，以指导管理技术，并为预测入侵早期的传播提供帮助。该模型对扩散模式进行了定性和定量预测。根据数据，发现增加缓冲区宽度会降低控制区外感染的可能性。然而，由于矢量传播带来的随机长距离跳跃，传播可能不会完全停止。2020年，White等人[94]采用贝叶斯方法，通过拟合和比较分区流行病学模型来推断流行病学参数，以简要了解在许多现场图中看到的疾病进展情况。此外，还报告了对每棵受感染树木每年感染约19棵以上树木的可能性的估计，以及症状首次出现后约4.3年发生的干燥现象。另一方面，无症状期的感染性预计较低或不明显，平均持续1.2年。
卡斯特里格南等人的主要研究目标[95]定义了数据融合的地质统计学方法。他们结合了目视检查、工厂诊断测试以及远程（辐射）和近端（地球物理）数据，生成了Xfp感染风险的概率图。无人机数据支持的方法允许识别潜在感染进入现场的点，以及标记感染风险较高的区域。视觉证据支持无人机数据的发现；枯萎过程几乎是随机繁殖的，甚至在同一植株内，这使得确定疾病传播的有利途径变得非常困难。另一方面，无人机监测表明，橄榄树表现出高度的多样性，同一棵树上存在不同的叶片活力。在Cendoya等人的研究中[96]，利用贝叶斯地质统计模型确定了气候变量对病原菌地理分布的影响以及每个区域阳性位置之间的空间关联。大多数积极因素出现在莱切的西南地区，这些因素与年平均温度和最湿润季度的平均温度较高以及平均日较差、最干旱季度的平均气温、年降雨量和最干旱月份的降雨量较低的值相吻合。有趣的是，Xf目前存在于各种气候条件的地区[19]. 虽然这种感染在热带和亚热带气候地区最为普遍，但也可以在较冷和/或较干燥的地区发现。Kottelenberg等人[97]分析了阿普利亚地区数十万份疾病发生监测数据记录，以确定入侵前线的性质及其移动速度。所获得的估计的稳健性也通过具体的模拟进行了检验。结果表明，疾病锋以每年10.0公里的速度移动，在每年7.5至12.5公里的95%置信区间内。根据拟合模型，疾病的传播可能始于2008年左右。有效管理新病灶需要了解Xf感染的动态。Gilioli等人最新的生态流行病学模型（XEM）[98]建议描述Xf疫情中的感染动态。XEM是Xf短程传播的空间显式机制模型，其模拟结果表明，载体的丰度是病原体传播速度的主要决定因素。因此，成功根除战略的重要因素被确定为病媒控制效果和检测和干预的时间。使用生态位模型，Bajocco等人[99]研究了2015年至2021年期间阿普里亚地区受Xf感染的橄榄树的分布如何变化，以不同的土地利用作为人类压力指数的代表[100]. 道路系统是扩散的主要引擎，而自然和非自然区域限制了Xf在景观尺度上的传播。结果支持了这样一种假设，即该流行病的人为因素发挥了关键作用。获得的数据还表明，应制定景观监测措施，以阻止Xf在阿普里亚和其他地中海国家的传播。调查还强调了在建模Xf扩散时明确考虑人为景观影响的重要性。然而，从所进行的分析中可以明显看出，需要对正在研究的生态流行病学系统中的主要不确定性来源进行更多研究。特别是，应考虑寄主植物的敏感性、病媒携带细菌的速度、病媒的移动范围和疾病检测的延迟。
表3总结了Xf感染动力学的关键发现，这是成功管理新病灶的关键组成部分。
表3。涉及地理分布动态的研究苛求木霉感染。
表3。涉及地理分布动态的研究苛求木霉感染。
作者和年份研究区域方法主要发现
Bosso等人，2016年[91]意大利领土，位于北纬45°至36°、东经6°至18°之间最大版本3.3.3k，用于模拟Xf在意大利的潜在分布物种分布模型显示，在阿普里亚、卡拉布里亚、巴西利卡塔、西西里岛、撒丁岛以及坎帕尼亚、拉齐奥和托斯卡纳南部沿海地区，Xf发生的概率很高
怀特等人，2017年[93]阿普里亚Gompertz方程该模型强调了非橄榄宿主的重要性，非橄榄宿主会增加疾病的传播速度，并可能导致风险增加一个数量级
布奇，2019年[92]阿普利亚橄榄园阿普利亚地区政府可用的感染监测数据集分析每年疫情从标记为感染的橄榄树传播1至15公里
怀特等人，2020年[94]阿普利亚橄榄园流行病学模型通过贝叶斯方法，估计树木干燥大约发生在症状出现后4.3年
Cendoya等人，2020年[96]阿普利亚通过集成嵌套拉普拉斯近似（INLA）方法的贝叶斯层次模型模型中空间效应的这种实质性贡献可能表明，研究区域目前的Xf范围来自于一个或多个病灶，这些病灶已合并
卡斯特里格南等人，2021年[95]位于奥里亚（意大利南部布林迪西省）的橄榄园基于非参数多元地质统计学的数据融合程序远程和近端传感器数据以及目视检查和植物诊断测试提供了Xf感染风险的概率图
Kottelenberg等人，2021年[97]阿普利亚橄榄园确定性模型（负指数函数、逻辑函数或CNE函数）该模型表明，疾病大约从2008年开始传播，估计疾病的传播速度为每年10.0公里
Gilioli等人，2023年[98]阿普利亚橄榄园生态流行病学模型（XEM）所获得的模型描述了Xf疫情的感染动力学，并表明载体的丰度是决定病原体传播速度的关键因素
Bajocco等人，2023年[99]阿普利亚橄榄园生态位模型人为因素对疫情起了重要作用，道路系统是传播的主要驱动力，自然/非自然区域阻碍了Xf在景观范围内的传播

2.4. 诊断方法

在萨兰托地区（意大利东南部阿普里亚地区），百岁和千年植物代表着重要的农艺、经济和景观特征，以及重要的文化遗产Xf，尤其是亚种帕卡据报道，Xfp是橄榄树上一种毁灭性疾病的致病因子。为了降低附近植物受到感染的危险，至关重要的是要建立诊断方法，能够尽早识别疾病，即使受感染的植物仍然没有症状。找到疾病的来源需要诊断，而症状的调查是诊断的基础。如果改变（症状）可归因于多种疾病或环境因素，则症状可能是非特异性的；如果改变（现象）是特定病原体的典型特征，则症状也可能是特异性的。血清学和分子生物学方法是植物病理学诊断的基础。特别是，在培养基上的经典分离以及血清学和分子技术被用于Xf的诊断。Xf检测所用各种诊断技术的主要发现概述见表4在血清学检测中，最敏感的检测是分子检测，没有结果不清楚，而直接组织印迹免疫检测（DTBIA）比双抗体夹心-酶联免疫吸附检测（DAS-ELISA）更敏感。环介导等温放大（LAMP）技术[101]Yaseen等人在研究中考虑将其作为PCR的可行替代品[102]由于其简单性和高可靠性。在这项调查中，首次使用这项技术在橄榄树中发现了Xf。由于微生物感染了多种野生和驯化植物，在不同的时间段内没有任何症状，因此诊断Xf具有挑战性。据估计，橄榄树的无症状期持续约1.2年[51，94，103]. 受害枝条的末端叶尖显示出疾病的第一个迹象，这种疾病向内发展，导致完全干燥，由深黄色变为棕色。然而，这些症状标志着感染进入了晚期，这种感染是不可逆转的，会导致植物死亡[12].
对于每个由细菌基因型、寄主植物物种、昆虫媒介和环境因素定义的病理系统，Xf流行病学和动力学各不相同[104]. 不同的植物物种可能会被Xf感染，已知易感宿主的感染会导致木质部动脉闭塞，限制水流，从而导致典型的干燥迹象。De Benedictis等人[105]检查健康和自然感染者的木质部血管闭塞欧罗巴酢浆草通过调查三种常见的橄榄品种对该病表现出不同程度的敏感性，研究了生长在开阔地的植物。这些品种包括易感品种“Ogliarola salentina”和“Cellina di Nardó”以及耐性品种“Leccino”。受感染后，最易感病的品种Ogliarola salentina和Cellina di Nardó表现出比耐性更强的品种Leccino更大的闭塞增加。此外，发现阻塞是由tylose和牙龈/果胶凝胶引起的，而不是直接由细菌细胞聚集物引起的。此外，正如在Leccino植物中观察到的那样，简单的闭塞现象并不代表Xf耐受性/抗性的直接标志，这可能与更好地调节这种反应的能力有关。在Luvisi等人的研究中，“Cellina di Nardó”和“Ogliarola salentina”也表现出对Xf的高度敏感性[27]而在不太常见的品种“Leccino”中发现了显著的抗性[27，47，106]. 与对Xf敏感的品种“Cellina di Nardó”中出现的严重失调现象相反，他们的发现突出了受Xf感染的“Leccino”品种叶片中内生细菌微生物群的稳定性。这可能意味着，保持微生物群的平衡以及特定品种特有微生物的存在可能导致“Leccino”对Xf感染的抗性。木质素沉积是为解释某些寄主对Xf的假定耐受性而提出的理论的关键组成部分。通过对健康和受感染Leccino和Cellina di Nardón叶片中酚类化合物的分析，Sabella等人[107]发现只有在莱奇诺，木质素的前体奎尼酸的含量才增加。另一方面，在两个研究品种中都观察到羟基酪醇葡萄糖苷的减少，这通常与干旱和低温胁迫有关。此外，茎切片的组织化学检查显示，与健康植株的切片相比，受感染Leccino植株的厚壁组织和木质部组织中的木质素分布不同，这表明木质素在Leccina品种的Xf耐受性中起着关键作用。
Rey等人的研究[108]旨在通过专门设计用于检测Xf并适合部署和现场测试的近端传感工具实现基于机器人的灵活策略。因此，一个名为十、苛求-创建了感染监测远程操作车辆（XF-ROVIM），用于早期识别各种作物（主要是橄榄树）中的XF。事实证明，XF-ROVIM是一种通用工具，价格实惠，操作简单，能够携带遥感或近距离遥感设备，用于检查树木作物。它可以采集和存储高分辨率野外数据和地理定位数据，并可以在不到6小时的时间内对4公顷的野外进行彻底调查。获得的数据使我们能够从四个方向收集田间每棵树的照片，并创建田间地图，显示树木的三维结构以及几个植被指数。由于使用包含结构、地理和光谱数据的多元模型对进行准确预测至关重要，因此XF-ROVIM可能在实地一级有效收集数据可以构成一项相关成就。
此外，Xf对橄榄树的感染可能与土壤和寄主叶片中元素的可用性和含量有关。在Scortichini等人的研究中[109]从加利波利（Lecce）的23个橄榄园以及表现出该病症状的周边地区采集了土壤和叶片样本。利用电感耦合等离子体原子发射光谱法，检测每个样品中镁和其他微量营养素的含量。根据实时PCR的结果，每棵树都被发现感染了Xfp。与其他地方相比，该地区的土壤和叶片样品的微量营养素浓度更低，多元数据分析也证明了这一点。在受感染的叶片中发现广泛的铜缺乏是不寻常的，以前在意大利从未观察到过，这表明橄榄叶中铜缺乏可能具有诊断意义。为了支持受感染地区的橄榄生产，意大利地区和国家机构鼓励采取一系列行动，用新的抗Xf品种替换受Xf影响的老橄榄园。这些需要进一步的诊断评估和重点。如前所述，在许多当地橄榄品种中发现了对Xf的显著耐受/抗性水平[20]. 在这方面，为了最佳选择可能的替代品，Manici等人[110]开展了一项专门的研究，重点研究了土壤物理特性与土壤驻留真菌之间的相互作用，真菌是最参与土壤保水和物理特性的微生物。Vergine等人[111]此外，还调查和比较了与“Leccino”树（耐Xf）和未感染树（未感染Xf）相关的本地真菌和细菌微生物群，以Xf敏感的“Cellina di Nardó”树为对照，以确定可能涉及抗性机制的微生物类群和参数。结果还表明，维持一个具有更高多样性的健康微生物群以及存在品种特异性微生物可能支持“Leccino”对Xf的抗性。
为了快速识别橄榄树中的Xf症状，大规模监测技术是根除和遏制有害病原体的成功策略所必需的。为了检测受感染的宿主，即使它们没有显示视觉症状，Zarco-Tejada等人[112]两年来，我们使用高分辨率高光谱和热成像技术对7000多棵橄榄树进行了评估，在肉眼可见症状之前的几个月，就发现了Xf感染。2020年，Poblete等人[113]使用在Xf感染地区为期两年的空中作战期间收集的高光谱和热图像，评估光谱约束机器学习算法在该任务中的性能。他们的研究表明，携带多光谱和热像仪的机载平台可以支持大规模Xf监测。Di Nisio等人[114]对多旋翼无人机（UAV）拍摄的高分辨率可见光和多光谱图像进行图像分析。应用统计数据表明，分割的平均Srensen-Dice相似系数约为70%，对受影响的树进行分类的敏感性为98%，精确度为93%。卡斯特里格南等人[115]还使用无人机和多光谱辐射计早期识别感染。2017年至2019年期间，在意大利阿普里亚地区的三个橄榄园进行了四次无人机飞行，以便在早期阶段对橄榄树中的Xfp严重程度进行分类。交叉验证表明，非参数分类方法的总准确度为0.69，平均错误率为0.31，而早期检测类的准确度为0.77，误分类概率为0.23。
为了监测橄榄园中Xf感染的发生率，Hornero等人[116]调查Sentinel-2卫星图像监测Xf感染橄榄园疾病症状的适用性。他们的研究结果表明，使用现场观测和多时间遥感数据，Sentinel-2时间序列图像可以提供有用的时空指标，以监测Xf感染在大范围内造成的损害。
利用受感染橄榄树的代谢谱知识，人们广泛探讨了Xf定植引起的化学变化。代谢组学研究是一种生物分析工具，用于探索与生物体对生理或病理事件的反应相关的复杂代谢模式（代谢组学），可用于获取此类数据。Girelli等人介绍了第一种基于NMR的代谢组学方法，用于研究CoDiRO对当地橄榄品种（如Ogliarola salentina和Cellina di Nardó）的代谢影响[117]. 最近，在仔细监测的情况下进行的一项调查有助于描述一组可能作为橄榄Xf感染指标的化合物[118]. 感病品种“Cellina di Nardó”的2年生植株在温室条件下接种Xfp ST53和一些木质部抑制真菌后，其代谢产物发生了变化，核磁共振波谱和质谱证明了这一点。统计分析表明二甲苯属-受感染植物的苹果酸、甲酸、甘露醇和蔗糖水平高于对照二甲苯属-未受影响的，但橄榄苦苷含量略低。甘露醇作为一种可能的标记物受到关注，它是橄榄树抵抗细菌感染的能力的原因。在Di Masi等人的研究中[119]采用非靶向代谢组学方法，利用高效液相色谱法结合四极杆飞行时间高分辨质谱（HPLC-ESI-Q-TOF-MS），检测健康橄榄树和受感染橄榄树样品（叶片提取物）之间的差异。
2021年，Faino等人[120]使用OXford Nanopore Technologies（ONT）MinION平台在物种、亚种和序列类型（ST）水平上检测和识别Xf。他们的联合方法（“鸟枪”策略和纳米孔扩增子测序）只需几个小时，就可以在细菌感染率低的植物材料中检测和鉴定ST水平的Xf。
一些代谢物被强调为该疾病的潜在特异性生物标记物。特别是，类黄酮家族中几种化合物的严重失调导致了这样一种假设，即Xf感染后宿主的自我防御能力下降。Astegiano等人的研究[121]旨在创建一种全球代谢组学质谱分析方法，用于选择能够区分健康（HP）和感染（OP）橄榄树叶片的OQDS分子标记。基于HPLC-ESI HRMS平台的多元分析结果清楚地证明了区分HP和OP样本的能力。有趣的是，在阿普里亚地区完成了许多探索任务后，Pavan等人[122]还报道了在橄榄园中发现的30种pauca有症状或无症状植物，这些植物受到OQDS的严重影响。这项研究虽然也必然与所进行的疾病诊断有关，但本质上强调了寻找耐OQDS品种的持续任务。特别是，通过选择10个简单序列重复序列（SSR）标记，对所调查的假定抗性植物（PRP）的遗传图谱与141个地中海品种的遗传图谱进行了比较。有趣的是，大多数被调查的PRP与22个意大利品种形成了一个遗传簇，其中包括“Leccino”和“FS17”，之前报道称它们对Xf具有抗性。快速可靠地监测感染区域，以便及早诊断疾病，即使症状尚不明显，这也是OQDS研究的一个持续重点。为了利用高光谱数据以足够的准确度区分未感染和感染但无症状的橄榄叶，Riefolo等人[123]选择适合特定统计分析的特定波长。
根据橄榄叶的高光谱数据调查，该方法可以预先选择有用的样品，用于进一步的qPCR分析。D'Onghia等人[124]随后进行了三项研究，旨在进一步改进Xf感染无症状橄榄植物的采样和测试。特别是，三项研究中有两项侧重于耐（Leccino）和敏感（Cellina di Nardó和Ogliarola salentina）品种无症状或轻微症状橄榄树树冠中Xf感染的时间和空间进展。一年中，除了最热和最冷的月份外，在树冠上半部分的中部取样最成功。通过血清学和分子检测，具有叶柄的成熟叶片下部对病原的检测效果不如茎木质部组织。以茎木质部组织为最合适的检测基质，根据这些结果进行了第三项研究，以比较分子和血清学检测（qPCR、实时LAMP、DAS-ELISA、DTBIA）在感染“Leccino”的无症状枝条中上部的Xf检测在适当的采集时间内采样的树木。
同时使用光学和透射电子显微镜（TEM），Montilon等人[125]研究了健康或人工感染的Cellina di Nardó（敏感）和Leccino（抗性）橄榄茎次生木质部血管闭塞的频率和分布[126]. Greco等人的研究[127]包含Xf subsp的第一份全球报告。帕卡关于锥栗和该物种Xf感染的首次特征。无症状性Xf宿主物种在新暴发的出现或现有暴发的扩大中可以发挥相当大的作用。
Belmonte等人的工作目标[128]是为了检验无人机照片在对抗Xf的战斗中的实用性。考虑到的信息是一幅多波段无人机图像，拍摄于受X射线影响的橄榄林中。近年来，无人驾驶飞行器越来越受欢迎，尤其是在防治植物害虫方面。该研究证明了无人机数据在二甲苯属尽管在疾病植物的早期自动检测成为可能之前，仍有许多问题需要解决。为了进一步改进疾病进展的监测和控制，容易获得的诊断方法也是一个重点。Amoia等人的工作[129]设计了一种比色LAMP技术，将50-60 mg橄榄枝薄片在含NaOH的缓冲液中培养产生的粗碱性汁液（而非纯化的植物总DNA）作为模板。这种快速分子分析从样品制备到结果需要40分钟，不需要实验室或任何特殊工具，只需使用便携式等温块即可直接在现场进行。远程成像数据不仅用于简单诊断，还用于随访目的，与可能的Xf现场治疗有关。Blonda等人最近在研究中使用了多分辨率卫星数据分析[130]以评估该技术的诊断效率以及在田间和树木尺度上的特定处理的结果。为了评估处理后的田间条件，可以使用高分辨率Sentinel-2图像数据，而VHR成像可以用于优化每个品种的处理剂量。根据调查，Ogliarola Salentina对处理的反应比Leccino和Cellina品种更好，田间PCR和其他结果也表明了这一点。他们的发现表明，Sentinel-2时间序列图像可以提供有用的时空指标，以监测Xf感染在大范围内造成的损害。Savoia等人[131]在一组100个本地阿普利亚橄榄基因型中检测了Xf感染反应的变异，包括参考品种、小变异和F1基因型。这项研究有可能确定九种被认为对该病具有耐药性的基因型。这些基因型构成了橄榄种质资源的初始群体，可用于受影响地区的再植以及研究病原菌的机制。
西尔沃和斯科蒂奇尼[132]系统地检查了10年内Xfp检测呈阳性的被根除植物，包括100或50米半径范围内的所有无症状植物。数据表明，“遏制”和“缓冲”区的Xfp发病率很低，尤其是在2020年至2021年至2022年至2023年的最后三次活动期间，在采样植物中检测到的细菌范围为0.06至0.70%。根据这些数据，并根据流行病学模型，验证了无症状橄榄树在OQDS传播中的微不足道的作用，它可以消除要求根除一棵半径为50 m的Xfp阳性树周围的所有寄主植物的规则，以挽救许多健康的百年生和纪念性橄榄树。
表4概述了与各种诊断技术相关的关键发现。
表4。基于应用各种技术的诊断系统的研究。
表4。基于应用各种技术的诊断系统的研究。
作者和年份方法诊断工具的目的主要发现
Yaseen等人，2015年[102]实时LAMP（实时环介导等温放大）寄主植物和昆虫体内Xf的现场实时检测实时LAMP程序显示了现场检测方法的优点，该方法易于操作、快速执行和低成本
De Benedictis等人，2017年[105]基因型鉴定和显微镜分析确定可用于延长受感染地区橄榄园生产力的抗性机制他们已经表明Xf和欧罗巴酢浆草木质部导管支持病原体在闭塞过程中发挥次要作用的指示，在闭塞过程中，症状与植物的生理反应相关
Luvisi等人，2017年[27]分子分析选择标记以确定是否有症状进展四个橄榄品种（Cellina di Nardó、Ogliarola di Lecce、Frantoio和Leccino）间奎宁酸诱导反应的差异表明，它们在橄榄树对Xf感染的反应中起防御作用
Girelli等人，2017年[117]核磁共振波谱代谢组学研究与生物体对生理或病理事件的反应相关的复杂代谢模式DENTAMET上报告了从Ogliarola salentina和Cellina di Nardó中获得的代谢组学特征的变化®治疗
Sabella等人，2018年[107]分子和酚类分析了解Leccino橄榄树Xf耐受性的推定过程结果表明，木质素在Leccino对Xf的耐受性中起着关键作用，因为两个品种的健康和受感染枝条中木质素的定量显示，与敏感品种相比，受感染Leccino的总木质素显著增加
Rey等人，2018[108]传感技术和现场测试绘制植物病害分布图，以便从植物到叶片水平早期检测橄榄园中的Xf他们开发了一种低成本的小型野外机器人，能够连续监测整个野外，捕获地理定位的光谱信息和树木结构，以便稍后与现场观测结果进行比较
Scortichini等人，2019年[109]实时PCR和电感耦合等离子体原子发射光谱（ICP-AES）通过研究土壤和寄主叶片中的元素含量和有效性来减少细菌传播的管理策略他们表示Xf。第（b）小节。帕卡感染导致橄榄叶中铜的消耗
Sabella等人，2019年[103]SEM-EDX分析和分子分析评估受Xf感染的橄榄植物的空化敏感性和再生机制的激活以恢复其导水率他们指出，由此产生的基因表达模式表明，品种Leccino的受感染植物强烈调节与栓塞感知和再填充有关的基因
Manici等人，2019年[110]分子分析（DGGE分析）改进决策工具，以选择将被新橄榄树取代的病死林多重相关和典型对应分析确定了一系列土壤物理和真菌指标，这些指标与Xf感染区域呈线性相关
Vergine等人，2019年[111]分子和序列分析改进OQDS的生物处理维持一个具有更高多样性的健康微生物群，以及品种特异性微生物的存在，可能支持“Leccino”对Xf的抗性
卡斯特里格南等人，2020年[115]配备多光谱辐射计的无人机感染的早期检测结果鼓励无人机技术应用于Xf感染的早期检测
Di Nisio等人，2020[114]多光谱成像无人机感染的早期检测为了快速检测橄榄树的Xf症状，提出了一种对特意装备的多旋翼无人机（UAV）获取的高分辨率可见光和多光谱图像进行图像处理的方法
Hornero等人，2020年[116]3D辐射传输建模（3D-RTM）和Sentinel-2卫星数据感染的早期检测本研究强调了通过解释模型反演中的时间变化来检测植被健康异常的价值
Poblete等人，2020年[113]高光谱和热成像早期检测受感染的宿主这项研究的结果表明，多光谱和热像仪可以用于大规模监测Xf感染地区
Astegiano等人，2021[121]液相色谱分离和高分辨率质谱检测鉴别健康和受感染橄榄树叶片的分子标记通过HPLC-ESI HRMS平台进行多元分析得出的结果表明，健康和感染样本之间存在明显的分离
Faino等人，2021年[120]OXford Nanopore Technologies（ONT）MinION平台检测和识别
来自受感染植物材料的Xf		这些结果为纳米孔测序作为早期检测Xf的有效监测工具提供了新的机会
Jlilat等人，2021年[118]非靶向核磁共振波谱和质谱描述一组代谢物在橄榄中Xf感染中可能起到的标记作用这项研究表明二甲苯属-与未感染Xf的植株相比，受感染植株的苹果酸、甲酸、甘露醇和蔗糖含量较高
Riefolo等人，2021年[123]实时PCR、高光谱分析和偏最小二乘回归（PLSR）改进植物诊断评估和植物检疫状况评估仅使用光谱数据，就可以在感染的早期阶段鉴别受感染的植物，从而节省时间和财力
Pavan等人，2021年[122]分子分析确定可能对Xf产生抗性的基因型本研究中确定的一些假定抗性植物（Leccino）可能在栽培中或作为育种项目的亲本克隆进行开发
D'Onghia等人，2022年[124]分子和血清学检测（qPCR、实时LAMP、DAS-ELISA、DTBIA）感染的早期检测本研究旨在比较利用茎木质部组织作为最合适的检测基质检测Xf的分子和血清学检测
Di Masi等人，2022年[119]高效液相色谱和四极杆飞行时间高分辨率质谱（HPLCESI-Q-TOF-MS）在植物中发现与疾病相关的生物标记这项研究表明，Xf感染后，由于类黄酮类代谢产物的严重失调，宿主的防御能力降低
Montilon等人，2022年[125]电子显微镜分析感染的早期检测他们的研究表明，小孔膜的开发是Xf亚种感染过程中的一个关键事件。帕卡易感橄榄品种中的ST53
Amoia等人，2023[129]等温扩增和比色LAMP改进疾病传播的监测和控制开发了一种便携式、敏感和针对特定目标的Xf现场测试，该测试具有40分钟的样本回答时间，不需要任何DNA分离程序或实验室设备
Belmonte等人，2023年[128]无人机（UAV）实现早期感染植物的自动检测这项工作显示了无人机数据在二甲苯属但在早期自动检测受感染植物方面仍有许多问题需要解决
布隆达等人，2023年[130]高分辨率（HR）Sentinel-2图像和超高分辨率（VHR）Plieades图像实现早期感染植物的自动检测HR图像数据可用于评估处理后田间水平的植物状况，而VHR图像可用于优化每个品种的处理剂量
Greco等人，2023年[127]分子测试（MLST）和系统发育分析、FISH（荧光原位杂交）和CLSM分析（共焦激光扫描显微镜）对萨兰托的几小群栗树进行了Xf诊断调查，并观察到任何明显的症状这项工作表明，要使遏制措施真正有效，了解所有宿主物种，包括缺乏症状和无症状的宿主物种，以及给定区域中存在的病媒是至关重要的
Savoia等人，2023年[131]分子检测（qPCR，基因分型）寻找对Xf具有耐受性或抗性的新基因型代表第一批橄榄种质资源的九个假定抗性基因型的鉴定
Ciervo和Scortichini，2023年[132]分子和血清学检测（PCR、ELISA）消除要求根除50米半径内一棵Xfp阳性树木周围所有寄主植物的规定他们建议，可以取消要求将一棵Xfp阳性树木周围半径为50米的“隔离区”和“缓冲区”内所有寄主植物连根拔起的规定

2.5. 治疗

由于阿普里亚一直是意大利第一个橄榄油生产区，因此阿普利亚和萨兰托橄榄油行业尤其受到了Xf细菌广泛分布的严重影响。自2013年发现这种病原体以来，植物检疫控制和金融干预措施已逐步到位，以对抗这种病原体，并支持该行业和受影响地区的企业主。行动计划中针对发现隔离细菌而提出的优先事项包括建立和部署一个监测计划，该计划可以准确界定Xf感染的影响区域。在美国和巴西获得的流行病学专门知识，以其他一段时间内已经确定的Xf细菌菌株为特征，以及在阿普里亚地区针对其他检疫性病原体取得的经验，对实现这一目标至关重要。除了经济重要性外，阿普里亚的橄榄树（其中许多树龄甚至超过1000年）也作为当地遗产保存下来，并因其广泛分布而被视为该地区特征的象征。有趣的是，阿普里亚地区的盾徽上也有一棵橄榄树。
上述情况本应建议，在阻止疾病传播时，应特别考虑所有可能的保守方法，尽管法定处方预期用于检疫病原体。另一方面，Xf试验性治疗尝试在受控条件下（温室和体外）和野外条件下（只要可能）仍然非常有限，基本上由以下文献报道和总结表5Girelli等人[117]使用基于NMR的代谢组学方法研究了CoDiRO对症状橄榄树的影响。在本研究中，Dentamet的作用®[133]一种经CE-批准的化肥喷洒在有症状的Salento橄榄树上进行了检测。Dentamet公司®含有锌和铜络合物与柠檬酸的水合物的组合。这种专利叶面肥的比重为1.280 g/L，锌和铜含量分别为4%和2%，可以视为具有双重作用配方的产品。根据其技术说明书，这种生物复合物可以快速纠正锌和铜的缺乏，也可以诱导对化学结构的抵抗力，这种抵抗力与植物在各种胁迫下释放的几种抗菌物质的抵抗力相似。牙医®由于其对环境几乎没有负面影响，并且几乎没有使用限制，它被批准用于有机农业，据报道在全球30多个国家销售。Dentamet之后，两个橄榄品种Ogliarola Salentina和Cellina di Nardó的叶片水提取物的代谢组学特征发生了变化®治疗。特别是，在处理后观察到两个品种中不同且相反的多酚和糖模式，在处理前表现出不同的发病率和严重程度。
代谢组学通常基于质谱（MS）和/或核磁共振（NMR）和多元数据分析，概述了表征特定底物的所有可检测小代谢物。代谢组学是一种可用于破译植物与微生物相互作用分子的分析方法，可以进行特定有用的比较（感染与未感染、治疗与未治疗等）。因此，作为核磁共振和化学计量学的关键组合，代谢组学方法可能有助于确定植物在胁迫条件下的生物过程，例如病原体感染[134]. 对植物生理学的理解对于疾病预防和治疗监测应用的发展至关重要。植物微量营养素和次生代谢物，如酚类化合物，似乎在许多作物中Xf诱导的疾病感染过程中发挥着重要作用。
Scortichini等人[135]进一步测试了基于锌-铜-柠檬酸的生物复合体Dentamet®在萨伦塔奥利亚罗拉（Ogliarola salentina）果园和纳尔多（Cellina di Nardó）果园进行了为期三年的田间试验，自然感染了这种细菌。此外，还研究了体外和体内杀菌活性。
2016年6月至2017年9月，根据欧洲和地中海植物保护组织制定的标准协议进行了定量实时PCR实验。结果表明，处理过的树木叶片中的Xfp细胞密度显著降低，具有统计学意义。Dentamet的六种喷雾治疗®0.5% (v（v）:v（v）)每年4月初至10月（7月和8月除外）对橄榄树冠进行施用。在这两个品种中，该化合物减轻了症状的严重程度。研究结束时，大多数未经处理的树木已经死亡，但所有经过处理的树木都茁壮成长，这是由归一化差异植被指数确定的。这些令人鼓舞的发现表明，综合管理可以降低Xfp的严重程度，包括频繁的土壤耙耕和修剪，以及春季和夏季的Dentamet®喷雾治疗可能成功控制疾病。Girelli等人于2019年[136]，使用1基于H NMR的代谢组学方法，对Xfp感染的Ogliarola Salentina和Cellina di Nardò与经过一年多处理的锌-铜-柠檬酸生物复合物的树木进行了比较。通过比较两个橄榄品种未经处理和处理的叶片样品的代谢组学模式，也发现了该病的潜在生物标志物。一些代谢物，包括奎宁酸、醛类橄榄苦苷、利己甾苷和酚类化合物，在这两个品种中都被一致鉴定为对牙本质美具有鉴别作用®-治疗与未治疗的受感染橄榄树。Bleve等人[137]首次进行体外试验，筛选出的细菌Xf Salento-1（NCCPB No.4595 LMG 29352）[138]代表阿普里亚OQDS暴发菌株。该研究旨在确定其对各种抗生素、酚类、真菌毒素和粗培养提取物的敏感性/耐药性。根据基于琼脂盘扩散法的生物检测，在32种受试抗生素中，有17种在5μg/盘的剂量下对细菌生长没有影响。本研究的结果首次描述了导致阿普里亚OQDS的Xfp暴发菌株（藻型ST53）的某些化学型特征。土壤和树叶中发现的营养物质可能与OQDS流行病学的其他方面有关。评估植物与病原体感染有关的生理状态也可以受益于对矿物营养素和微量元素的全面分析。Del Coco等人[139]评估了阿普里亚不同地区和邻近Basilicata地区橄榄园土壤和叶片中的微量营养素含量以及钙、钠和镁，以评估阿普利亚“受感染”和“无感染”地区橄榄园之间的土壤和叶离子组分差异。生长在Salento Barletta-Andria-Trani（BAT，Apulia）和Potenza（PZ，Basilicata，Apulia-bercing region）省北部的橄榄园的土壤和叶片离子组成与Salento地区（LE，BR，TA省）受感染橄榄园的差异显著。此外，Dentamet®在受影响的Salento地区，生物复合处理的树木与未经处理的植物具有明显不同的叶片离子特征。与未经处理的树木相比，经过处理的树木的叶片锌浓度更高。有趣的是，莱奇诺二甲苯属-抗性树的特征是锰浓度高于未感染树中对病原菌更敏感的Ogliarola salentina和Cellina di Nardó。Zicca等人的研究[140]试图通过使用基本上的拮抗活性测试方法来鉴定可能用作Xf生物防治剂的拮抗微生物。
所调查的两种拮抗微生物是内生细菌，它们来自受该病影响但仅表现出轻微症状的橄榄树，以及芽孢杆菌菌株，以前被认为是生防菌。研究还发现，大多数内生细菌分离物属于不同种类的属鞘脂单胞菌属，甲基杆菌，微球菌和短小杆菌属然而，在体外对Xf-ST53进行测试时，它们均未表现出拮抗活性。相反，当从芽孢杆菌属的几种菌株中分离出来的菌株被纳入这些分析中时，发现了显著的拮抗活性。少许天鹅绒双歧杆菌菌株还产生具有抗Xf-ST53抑制活性的培养滤液。Liccardo等人[141]在他们的研究中，提出了一种化学控制行动的生物替代方案，建议可能使用雷纳迪泽卢斯是Ps的天敌，用于成虫媒介种群和感染生物防治。他们证明了雷纳迪Z淹没策略有可能为Xf入侵提供有效和“绿色”的解决方案，将病原体发病率降低到10%以下。
为了开展可持续的植物病原菌控制研究，以提供针对Xf的靶向解决方案，减少对环境和人类健康的副作用，Baldassarre等人[142]提出了一种纳米技术方法。他们获得了一种新的全身杀菌剂配方，Fosetyl-Al纳米晶体，利用超声波辅助生产可水分散的纳米晶体。这种以壳聚糖为包衣剂的配方随着时间的推移非常稳定，与传统配方相比毒性较小，并且对两个Xf亚种具有有趣的抗菌活性。
Tatulli等人[143]进一步评估了Dentamet的体外和体内中期疗效®针对一种Xfp菌株，以提供一种控制策略，旨在保持感染地区树木的生产力。该物质具有体外杀菌作用，并阻止了Xf亚种的一些典型菌株中生物膜的生长，包括从阿普里亚橄榄树中分离出的阿普利亚菌株Xfp（ST53）。根据对“受感染”地区两个橄榄园41棵树的实时定量PCR控制方法进行的现场中期评估，连续三年或四年定期喷洒生物复合体导致Xfp在各个季节的浓度较低。在连续六次治疗后，尤其是从三月到七月到十月，细菌浓度下降了。在一个1H NMR代谢组学研究，Girelli等人[144]还重点对Dentamet进行了中期比较®治疗效果包括Leccino品种，已知其对疾病进展具有耐受性。耐性品种Leccino与感病品种Ogliarola salentina和Cellina di Nardó在定期中期Dentamet下的整体代谢比较®在为期多年的现场使用计划期间（暂停6个月后的4月至9月的6个月治疗）对给药情况进行了调查。对每个品种的代谢谱进行了检查，重点是两次取样（3月，在开始治疗之前，10月，在得出结论之后）。结果表明，耐性Leccino品种比敏感品种具有更具针对性的代谢反应。特别是，Leccino在第一次采样中显示出处理过的和未处理过的样品之间的显著差异，这表明前几年的处理对记忆的潜在影响是该品种特有的。在他们的研究中，Bruno等人[145]首先记录了NuovOlivo的作用®莱切省两个受到OQDS严重影响的橄榄园。天然洗涤剂NuovOlivo®（Ministro dello Sviluppo Economico专利号：102017000109094，意大利）是由植物油和多种植物提取物以及氢氧化钠和氢氧化钙、硫和碳酸氢钠制成的，它们可以起到活化剂的作用。使用定量实时PCR比较处理和未处理的橄榄植株的Xfp密度。在最初的研究中，使用的橄榄树来自蒙特萨诺·萨伦蒂诺（Montesano Salentino）的Cellina di Nardó，树龄在70-75岁之间。在这里，经过七次处理后，植物开始结核果，麦金尼病指数百分比下降到2.5%。每年3月至10月，橄榄树接受两次处理，冬季也进行修剪。第二个实验以生长在斯特纳提亚（莱切省）的60至65岁橄榄树为研究对象，疾病得分为90.88%，经过两年多的三次喷雾处理后，该得分降至4.0%。根据qRT-PCR，两个橄榄品种的处理树都降低了Xfp DNA浓度，也表明NuovOlivo®作为一种可能的治疗产品，可以限制和/或阻止这种具有破坏性的流行病。还建议对橄榄园进行具体的可持续管理，以改善生态平衡和植物对环境冲击的抵抗力。虽然没有特别关注Xf感染的植物，Fausto等人[146]在Salento感染地区的两个橄榄园中进行了试验，一个采用有机农业做法，另一个采用传统管理（对照），随后这两个橄榄林都改为可持续管理（即定期进行轻度修剪、土壤和叶面施肥以及覆盖作物）。使用非目标气相色谱-质谱（GC-MS）对木质部汁液的主要代谢物进行代谢组学分析表明，采用可持续的农艺措施可以提高这一重要树种对生物和非生物胁迫的抗性和恢复力。随后，Scala等人[147]使用监督学习算法，使用基于高效液相色谱-质谱-质谱的靶向脂质组学，对来自Ogliarola salentina和Leccino栽培品种的受感染Salento橄榄树样本进行分类，这些样本均经过Dentamet©处理或未经处理。以木质部组织脂质提取物分析为重点，进一步评估了Cu-Zn生物复合物处理对该病的控制效果。也有人假设，特定的脂质物质，如oxylipins，可以用作生化诊断标志物，以区分受损和健康的植物。Ambrico等人[148]研究了低温等离子体和等离子体活化水作为潜在药物杀死细菌细胞的有效性。进行了体外试验，以确定直接将表面介质阻挡放电（SDBD）血浆应用于细菌细胞和血浆活化水（PAW）是否会产生杀菌效果。根据研究结果，即使Xfp细胞埋在固体培养基上培养的生物膜中，也能获得很高的净化率，液体培养基使细胞完全失去活性。Girelli等人在研究中检查了Dentamet©对经内切治疗的植物的影响[149]这是首次报道对经内切治疗的Xfp感染橄榄树进行代谢组学研究。在本研究中，研究人员使用一种组合方法，在使用新型注射系统进行精确的血管内生物复合物输送后，检查Dentamet©对感染的Ogliarola salentina和Cima di Melfi橄榄树的影响。研究人员注意到某些代谢物的叶片含量存在特殊差异，这些代谢物在经过内服治疗后的进化过程中可能会发生变化，从而可以对植物内Dentamet©效应进行详细的时间过程分析。特别是，该方法显示，注射后奎宁酸（一种疾病生物标志物）和甘露醇显著降低，而多酚和橄榄苦苷的相关分子增加。在使用的剂量下，从注射到两周后缓慢完全平缓的2天后，整体内治疗效果达到最大值，为可能的治疗计划优化提供了有用的指示。
还研究了新的基于纳米载体的农用化学工具，以有效保护植物免受检疫感染。其中包括杀生物剂，如天然存在于植物提取物、精油和凝胶中的芳香次级代谢产物。Baldassarre等人[150]同时使用荧光分析和体外抑制分析，发表了第一篇关于胸腺醇对Xfp影响的研究。这项研究表明，由于百里酚和碳酸钙之间的协同作用，具有强大的抗菌性能三纳米载体，表明可能使用这些农药制剂作为有效的杀生物剂来控制Xfp感染。
Hussain等人[151]报道了使用不同剂量的Dentamet进行叶面喷雾剂和内热疗法的中期效果®在150年生Ogliarola salentina和Cellina di Nardó品种的Xfp感染橄榄树中1基于NMR的代谢组学。研究人员将60天、120天和180天的结果与常规叶面喷雾剂治疗和水注射作为对照进行了比较。代谢谱分析揭示了与疾病发展有关的植物代谢产物的变化，如与甘露醇、奎宁酸和橄榄苦苷有关的化学物质。每月一次的内部治疗在分离与水注射有关的代谢特征方面产生了最佳结果。与血管内治疗相比，Dentamet®叶面喷施表现出更精确的时间相关渐进效应。因此，除了内服治疗比叶面治疗更成功的可能性外，还评估了额外剂量/频率调整以实现长期疗效的要求。总之，当前的实地调查支持了一些农用化学品（如Dentamet）的研究结果®可能有助于诱导代谢变异，这可能与减少与Xfp相关的橄榄快速衰退综合征（OQDS）的症状发作有关。另一方面，目前有严格的根除和遏制要求，因为对这种感染没有具体的治疗指征，并且因为Xfp在世界许多国家被归类为受管制的检疫病原体。根据当前的欧盟法律，遏制程序在该细菌广泛存在的地区（如阿普里亚地区）有效，需要采用严格的遏制技术来减少和管理感染。为了确定修剪干预措施是否可以减少细菌的系统传播和干燥现象的严重程度，Camposeo等人[152]进行现场试验。对高感品种（如Cellina di Nardó树）移除所有有症状的枝条并进行显著或轻微的修剪操作，并没有导致细菌定植减少或症状发展减少。经过两年的集中修剪处理后，未发现受感染橄榄树的健康状况有明显改善，这表明单独使用它们不足以减轻细菌对敏感橄榄树的影响。另一方面，根据Vizzari et al[153]. 与基于大蒜粉和亚磷酸钾的类似处理相比，使用酚类提取物也能取得更好的效果。在两年的种植试验中，极性酚被证明在促进处理树木的营养生长方面具有统计学上的益处，这很可能是两种处理的体外抑菌作用的结果。然而，根据作者的说法，他们在研究中进行的实验被证明不适合百年树龄。Orfei等人的研究[154]目的评估使用电化学合成的名为ARGIRIUM-SUNCs的银超纳米簇保护植物免受革兰氏阴性和革兰氏阳性植物病原菌攻击的可行性®该化合物抑制了苛求木霉第（b）小节。帕卡，丁香假单胞菌光伏。番茄，膀胱黄单胞菌和米其根枝杆菌第（b）小节。密歇根因此，ARGIRIUM-SUNCs治疗是一种可能的替代控制措施。
表5总结了与Xf感染管理治疗尝试相关的关键发现。
表5。基于受感染植物处理的体外试验和研究。
表5。基于受感染植物处理的体外试验和研究。
作者和年份方法治疗类型主要发现
Girelli等人，2017年[117]核磁共振波谱具有积极原则的现场——基本要求®，一种经CE批准的含锌、铜和柠檬酸的肥料在这项研究中，我们报道了从Ogliarola salentina和Cellina di Nardó的叶片中获得的代谢组学特征的变化
Scortichini等人，2018年[135]分子分析（定量实时PCR）、共焦激光扫描显微镜、荧光定量和原子发射光谱具有积极原则的现场——基本要求®，一种经CE批准的含锌、铜和柠檬酸的肥料在本研究中，使用Dentamet进行了为期3年的现场试验®在一个包含Cellina di Nardó和Ogliarola salentina橄榄树的橄榄园中进行。数据显示，经过处理的树木叶片中的Xf细胞密度在统计学上显著降低
Bleve等人，2018年[137]HPLC-DAD分析和琼脂扩散法琼脂盘扩散法体外本研究评估了不同类别化合物对ST53的体外抗菌活性
Girelli等人，2019年[136]核磁共振波谱具有积极原则的现场——基本要求®，一种经CE批准的含锌、铜和柠檬酸的肥料在Ogliarola salentina树中观察到苹果酸持续增加，而在Cellina di Nardó树中，这些处理减弱了对感染的代谢反应
Baldassarre等人，2020年[142]毒理学研究和抗菌活性Fosetyl-Al纳米晶的体外表征与分析体外试验结果（剂量和给药方式）表明，这种新型纳米制剂可能用于现场控制Xfp的综合害虫管理策略
Del Coco等人，2020[139]电感耦合等离子体原子发射光谱（ICP-AES）和分子分析（实时PCR）具有积极原则的现场——基本要求®，一种经CE批准的含锌、铜和柠檬酸的肥料他们观察到，生长在萨伦托省和波坦察省北部无病原体地区的橄榄园的土壤和叶片离子组成与萨伦托地区受感染橄榄园的表现有显著差异
利卡多等人，2020年[141]数值模拟体外他们提出了一个可能的天敌水蚤Philaenus spumarius即。，雷纳迪（Zelus renardii），对于成体病媒种群和感染生物防治，病原体发病率降低到10%以下
Zicca等人，2020[140]分子分析体外潜在部署作为Xf生防剂的拮抗细菌的鉴定
Tatulli等人，2021年[143]体外抗菌试验和分子分析（实时PCR和qRT-PCR）具有积极原则的现场——基本要求®，一种经CE批准的含锌、铜和柠檬酸的肥料该化合物具有体外杀菌活性，并抑制了田间典型菌株、Xf敏感品种Ogliarola salentina和Cellina di Nardó或Xfp抗性Leccino的生物膜形成
布鲁诺等人，2021年[145]分子分析（PCR和定量实时PCR）积极主动的原则——诺夫·奥利沃®，一种天然清洁剂，由植物油和多种植物提取物以及氢氧化钠、氢氧化钙和硫磺制成，用碳酸氢钠活化处理后的植株叶片总酚含量较低，没有与脂质过氧化和电解质渗漏相关的细胞膜损伤；因此，诺夫奥利沃®作为一种治疗产品，可以限制和/或阻止这种细菌引起的破坏性流行病
Fausto等人，2021年[146]气相色谱-质谱法在两个橄榄园中进行了体外试验，一个是有机的，另一个是常规管理的（对照），先后都转化为可持续管理许多在可持续管理下含量增加的化合物具有众所周知的渗透防护作用或参与植物防御
Girelli等人，2021年[144]核磁共振波谱具有积极原则的现场——基本要求®，一种经CE批准的含锌、铜和柠檬酸的肥料他们强调了与易感品种相比，耐性Leccino的代谢反应具有特异性
Scala等人，2022年[147]高效液相色谱-质谱-基于MS的靶向脂质组学和监督学习算法具有主动原则的现场——DENTAMET®，一种经CE批准的含锌、铜和柠檬酸的肥料他们利用脂质种类的相对差异建立了分类器，能够区分橄榄树样本，感染和未感染，属于不同的品种，以及用DENTAMET处理或未处理®
Camposeo等人，2022年[152]分子分析（定量实时PCR）现场物理处理-调整他们进行了一项现场试验，以评估修剪干预措施是否可以通过减少细菌的系统传播来限制和/或恢复Xf感染的树木，但没有记录到受感染橄榄树的卫生状况有显著改善
Ambrico等人，2022年[148]表面介质阻挡放电（SDBD）等离子体在细菌细胞和等离子体活化水（PAW）上的发射光谱和直接应用体外试验直接应用SDBD血浆对细菌细胞和PAW的杀生效果他们研究了低温等离子体和等离子体活化水对细菌细胞的杀灭效果，结果表明，即使是生物膜中嵌入的Xf细胞，其去污率也很高
Girelli等人，2022年[149]农业活性内疗和核磁共振波谱现场有源Dentamet®，一种CE批准的含有锌、铜和柠檬酸的肥料代谢组学方法显示，在Ogliarola salentina和Cima di Melfi橄榄树中，疾病生物标志物显著降低，多酚和橄榄苦苷同时增加
Baldassarre等人，2023年[150]体外抑制试验体外他们报道了百里酚对Xf的巨大抗菌作用，表明百里酚纳米颗粒作为有效的杀菌剂在控制Xf感染方面具有潜在的应用前景
Hussain等人，2023年[151]受感染橄榄树的树干注射和叶面喷雾处理及核磁共振波谱具有积极原则的现场——基本要求®，一种经CE批准的含锌、铜和柠檬酸的肥料他们报告了使用不同剂量的Dentamet进行叶面喷雾和内疗治疗的中期效果®在Xf感染的橄榄树cvs Ogliarola salentina和Cellina di Nardó中，每月的内服治疗效果最好
Vizzari等人，2023年[153]酚类提取物与大蒜粉和亚磷酸钾溶液的比较用大蒜粉和亚磷酸钾溶液进行体外培养与基于大蒜粉和亚磷酸钾的类似处理相比，使用酚类提取物也能取得更好的效果
Orfei等人，2023年[154]体外抗菌活性及其对细菌生物膜形成和破坏的影响体外电化学合成银超纳米团簇ARGIRIUM-SUNCs®ARGIRIUM-SUNC对植物病原菌具有较强的抗菌活性，并在低剂量下抑制生物膜的形成

2.6. 对环境、人类和社会的影响

阿普利亚农业最富有成果的地区之一是橄榄产业。阿普里亚的年平均橄榄油产量约为31.5万吨，是该国排名第一的地区[155]. 根据橄榄油生产的统计信息，Xf出现后的几年尤其有害。根据国家农业信息系统（SIAN）的数据分析，莱切的石油产量在2019年至2020年期间呈下降趋势，下降了80%，产量创历史新低，为3979吨。ISMEA标准[156]生产数据显示，2023/24年的产量恢复了20%，尽管这是一个艰难的年份，其特点是冬季干旱，随后春雨阻碍了几个地方的果园。据统计，产量超过29万吨，比去年增长了20%。阿普里亚地区将首次生产全国60%以上的橄榄油。在他们的研究中，Schneider等人[157]基于气候适应性建模和入侵区域的径向扩展，模拟了疾病的未来传播。对于意大利来说，在考虑的径向范围扩张速度中，在经济最坏的情况下，50年内的潜在经济影响从19亿欧元到52亿欧元不等，在这种情况下，果园死亡后，生产就会停止。
植物检疫紧急情况除了对典型的经济和生产方面产生影响外，还对环境、社会和当地居民的福祉产生影响[25，29].
人类的高生活水平取决于生态系统的健康和其中发生的过程。尤其是环境因素在决定健康方面发挥着重要作用，人类福祉与生态系统功能及其良好的保护条件相关。生态系统为人类提供的所谓“生态系统服务”是指直接或间接满足人类需求的所有产品和服务。Xf疫情对橄榄林提供的许多生态系统功能产生了影响[158].
由于橄榄树的死亡、退化和生长缓慢，以及难以迅速更换易感品种，食用橄榄和橄榄油的产量在数量和质量上都出现了大幅下降。如前所述，在该细菌目前流行的地区，减轻长期损害的最有前途的方法之一是重新种植部分抗性的橄榄品种（如Leccino和Favolosa）。然而，由于新种植的树木需要几年时间才能生产（集约和传统耕作方法分别需要5到20年），因此重新种植并不能解决短期供应问题。
另一方面，两个当地品种Ogliarola salentina和Cellina di Nardo也是PDO产品（Terra d'Otranto EVOO）的主要成分[159，160]而且非常著名，这要归功于该地区的旅游重要性。由于其易受二甲苯属，失去这些品种以及与之相关的健康和经济优势的风险非常大。数学模型是一种重要的工具，可以对流行病系统进行定量检查，并随后确定潜在的控制甚至预防技术。布鲁内蒂等人开发的模型[161]揭示了作为综合虫害管理框架内控制措施的可能目标的阈值参数。这不会损失橄榄树所代表的生产资源。数学分析的结果得到了数值模拟的支持，表明清除适量的杂草生物量是防止OQDS传播的最有效方法，这将在橄榄园和周边地区形成Xf的蓄水池。此外，尽管不太经济，但分析表明，使用抗性更强的品种是一种成功的病原体控制技术。具体工作表明，Xf感染也会影响当地气候。在夏季，当气温达到最高时，橄榄园在缓解气候方面特别有用。因此，没有橄榄树会提高土壤温度，导致更多蒸发，减少CO2扣押。然而，从长远来看，通过重新种植替代树种可以减少这些有害影响。该病最严重的形式可能导致温度比前升高约2°C-二甲苯属评价。根据Semeraro等人的研究[162]评估橄榄树损失后的地面温度，这种影响将橄榄林的有益小气候降低到与可耕地类似的水平。研究表明，橄榄林是降低地表温度最不有效的森林类型，但它们比农田更有效，尤其是在气温最高的夏季。同一作者[163]还调查了Xf对橄榄城市森林的影响，尤其是对小气候和热舒适性的影响。分析表明，对生态系统服务的直接影响主要与监管功能和文化方面有关，因为纪念性橄榄林的文化意义也发生了重大损失。此外，树木的损失对光合作用有不利影响，导致氧气生成和总CO减少2吸收，吸收[164]. 更多CO2木块分解后释放到大气中，在火灾中释放速度更快，而干燥的橄榄林尤其容易受到火灾的影响。
此外，橄榄树的灭绝降低了生态系统过滤空气的能力。授粉调控也受到Xf引起的环境变化的影响。地中海灌木和其他物种的授粉受到植被丧失后其数量减少的影响。橄榄树和其他植物物种的消失间接影响了授粉，因为这些植物和其他植物的花是授粉昆虫群落的重要食物来源，尽管橄榄树的花不需要昆虫授粉，但因为许多品种是自交和风媒授粉的。Petrosillo等人[165]在区域尺度上具体研究了景观异质性如何影响授粉服务，使用两个有用的景观指标同时量化多尺度景观的组成和配置。他们还评估了Xf对授粉服务的影响。多时相分析表明，从2013年到2021年，受Xf感染影响的省份（莱切省、布林迪西省和塔兰托省）的景观功能发生了明显变化，突显了永久土地覆盖（橄榄林）的丧失如何彻底改变了景观的稳定性。
此外，自2013年以来，Xf疫情也导致了对阿普利亚装饰业务的监管要求和贸易限制。使用成本效益分析（CBA）和生命周期评估（LCA），Frem等人[166]与八种观赏植物的传统生产方案（CMs）相比，评估了这些流行相关方案的环境影响和经济可行性。研究结果表明，创新和可持续的观赏生产对农业土地利用、气候变化、化石燃料和苗圃水资源消耗的负面影响相对较小。它还以可持续的经济方式适度提高了当地苗圃企业的盈利能力。根据本研究，苗圃种植者可以采取可持续的观赏生产策略，有利于获得高质量的当地观赏和景观植物。苗圃种植者面临着特殊的压力，必须这样做，因为像Xf这样的检疫性害虫是一种潜在的威胁。这些方面还与可能推广一些未充分利用的果树品种有关，这些果树品种具有很强的商业潜力，可作为Xfp传播的控制和预防策略。这将涉及用经济上可行的果树品种取代Xfp感染的橄榄种植区。Alhajj Ali等人[167]杏仁的适宜性评价(扁桃B），图(无花果L.）、榛子(榛子L.）、猕猴桃(猕猴桃开心果(开心果L.）和石榴(石榴L.）作为对Xfp免疫/抗Xfp的果树品种，种植在阿普里亚地区Xfp感染的橄榄种植区内，以补偿可能的经济和环境损失。调查表明，Xfp感染的橄榄种植区适合大多数建议的果树作物，根据特定的土壤气候条件，适宜程度不同。石榴（268886公顷）、无花果（103975公顷）和杏仁（70537公顷）是大型橄榄种植区生长良好的三种水果，其次是猕猴桃（43018公顷）和开心果（40583公顷）。然而，由于不同的社会群体并不都以相同的方式看待计划中的解决方案，因此，与Xf影响地区的再生相关的所有可能的环境变化都需要具体的研究[168].
弗雷姆等人的研究[169]分析了当地居民对橄榄景观的各种改善以及与Xf相关的进一步研究的偏好。一项社会学实地调查发现，文化遗产和美学品质是最有价值的橄榄景观服务，该调查包括来自阿普里亚地区三个主要城市的683名受访者：福贾省、巴里省和莱切省。结果表明，尽管市民支持恢复受损的橄榄园，但他们不准备在研究上花费更多。有趣的是，Tipaldo等人[170]这项工作调查了围绕阿普里亚地区Xf疫情的在线叙事，以6年时间内从Facebook、YouTube和Reddit获得的用户生成内容为代表（超过16000条评论）。根据在线意大利用户的讨论分析，Xf outbreak相关内容出现了严重分歧，主要围绕两个冲突：“专业与政治”和“科学与替代”解决方案。
表6提供了Xf疫情如何影响社会、经济和人类福祉的主要调查结果摘要。

2.7. 橄榄种质对Xf的敏感性

目前缺乏从受感染植物中根除Xf的治疗方法，再加上上述对环境、人类和社会的强烈影响，需要采取更具体的遏制措施，例如寻找橄榄树的抗药性来源。因此，与橄榄种质对Xf敏感性相关的研究也被认为完成了这一综述。在加利福尼亚州和巴西，鉴定抗Xf种质是使用抗Xf品种和适当卫生文化方法的管理战略的一部分。在Giampetruzzi等人的研究之后，在阿普利亚地区采取类似战略的可能性出现了[106]，世卫组织证明，受感染的Leccino品种的细菌浓度显著低于在Ogliarola salentina中发现的细菌浓度，并且在存在感染的情况下具有差异基因表达。另一方面，Ogliarola品种的细菌数量要大得多，如果受到感染，由于Xfp施加的水分胁迫情况，基因表达会发生显著变化。Luvisi等人[27]发现Ogliarola和Cellina di Nardó对Xfp非常敏感。已经确定了几种可能导致这种抵抗的机制；橄榄品种对感染的脆弱性被认为与品种的遗传、生化和生物物理特性以及木质部的形态和生理学有关。这种细菌在植物木质部的导管中繁殖，扰乱了水的运输系统，导致了这种疾病的快速减少。De Benedictis等人[105]这表明，对Xfp感染的耐受性取决于橄榄通过花柱形成过程阻断木质部管腔来控制木质部管径的能力，因为在这些Ogliarola Salentina的野生橄榄中发现了高百分比的闭塞血管，从16%到53%不等。根据Sabella等人[107]自田间初步观察以来，Leccino品种表现出明显的Xfp抗性，与其他品种相比，该病的病程较慢。对Leccino和Cellina di Nardó的健康和受感染叶片中的酚类化合物的分析表明，羟基酪醇葡萄糖苷的含量减少，只有Leccinos中奎宁酸的含量增加，奎宁酸是木质素的前体，起着重要作用。Leccino cv抗药性的进一步证据来自Sabella等人的研究[103]这表明，与感病品种Cellina di Nardó相比，Leccino对空化（木质部中气泡的形成）的敏感性较低，因为它具有更好的抵抗细菌引起的导水率下降的能力。除了与莱奇诺抗性相关的木质素的存在外，其他研究[107]，发现了该品种的遗传以及木质部的离子和生物化学特性的变化，这可能有助于提高其抗性[171]. 尤其是D'Atoma等人[171]测定了对Xf感染反应不同的两个橄榄品种（Ogliarola salentina和Leccino）有症状和无症状叶片的离子分布。研究发现，Leccino cv的锰含量高于Ogliarola salentina，并且在感染无症状和感染有症状的叶片中，锰含量都较高。他们还显示了电离层的差异，尤其是两个品种Leccino cv和钠（Na）中较高浓度的钙（Ca）和锰水平。敏感的Cellina di Nardócv由于Xfp感染而经历了严重的失调，而抗性Leccino cv的微生物群落更为多样[111]. 随后的研究也证实了内生微生物群随着感染进展而屈服于Xfp占据整个生态位的趋势，发现这种趋势在易感卡拉马塔品种中比在抗性FS-17中更为明显®[172]. Pavan等人[122]证明了在受到细菌严重影响的橄榄园进行探索性调查后，他们如何找到具有令人放心的症状的个别植物。遗传-分子分析表明，萨兰托地区已经存在的几种以及地中海地区发现的其他种类具有抗性。还假设木质部结构和生理影响抗病性。Petit等人[173]发现木质部导管的直径可能影响Leccino cv的弹性。
Leccino血管的直径比Cellina di Nardócv小。这些作者认为，由于流速较慢，狭窄的血管限制了病原体在植物中的传播，并且它们对空气栓塞的敏感性降低导致气穴减少，这对细菌的有氧代谢不利。苏拉诺等人[174]研究了Xfp感染橄榄树对感病品种和抗性品种的生理反应。这两个抗性橄榄品种在Xfp感染期间表现出比敏感橄榄品种更少的水分胁迫，这意味着气孔导度和茎水势测量可用于区分橄榄对Xfp的抗性基因型。
利用显微镜研究了Xfp感染后敏感的Cellina di Nardó和抗性Leccino橄榄品种的血管闭塞分布。电子显微镜研究[125]揭示了Xf亚种帕卡“De Donno”ST53菌株通过感病品种Cellina di Nardó的纹孔膜（PM）传播。Savoia等人的研究[131]研究了100种当地阿普利亚橄榄基因型对Xfp感染的差异反应，从而鉴定了9种推定的抗性基因型。这一证据代表了第一组橄榄种质资源，并剖析了植物对Xfp感染的反应机制。然而，人们对抵抗背后的过程仍知之甚少。X射线计算机断层扫描是填补这些知识空白的一种选择。Walker等人[175]通过扫描四个橄榄品种的茎来验证这一理论，使用的技术是分割导管，以便进行直径测量。研究结果表明，血管较大比例较高的易感品种更容易受到空气栓塞的影响，并且在特定压力水平下，易感品种的功能性血管系统可能比抗性品种受到更大的压力。
总之，针对橄榄种质对Xf的敏感性，可以对拯救树木免受该病的可能性进行一些一般性考虑。
总的来说，最重要的预防技术是避免将细菌引入生产。当细菌已经存在于某一特定区域时，疾病管理需要一种综合方法，通过使用含有接种物的抗性或耐性植物、处理可能的载体和实施适当的培养做法来限制其传播。阿普里亚地区（意大利农村发展计划措施5.2）正在资助重新种植耐Xfp橄榄树品种，包括Leccino和FS-17。“Coratina”、“Pendolino”、“Bella di Cerignola”和“Cipressino”也值得注意，因为尽管存在橄榄杀手细菌，但迄今为止它们没有出现干燥症状。
表7概述了橄榄种质对苛求木霉第（b）小节。帕卡。

2.8. 研究策略分析

以下人员的在场苛求木霉2013年10月，阿普里亚地区莱切省的一些橄榄树中首次出现这种情况。这是第一次爆发十、苛求在欧盟记录的现场环境中。自那时以来，出现了各种主题，包括病原体的生物学和遗传学、与病媒和寄主植物的相互作用、诊断和早期检测、感染传播动力学建模、风险评估、植物疾病管理策略和社会经济影响分析。这些科学文献是根据本研究中概述的纳入和排除标准挑选出来的，重点放在研究文章上，在十年的时间里发表了115篇科学论文(图2)被分为与调查主题相关的各种类别。Xf疫情也被索引期刊上相关数量的评论报道过，这些期刊之前已经列出[16，17，18，19，20，21，22，23，24，25，26，27，28，29，30]但在这项工作中却被排除在研究策略分析之外。
选择了七种“研究策略”进行分类，重点放在以下方面：（a）苛求木霉(细菌Xf); （b） Xf昆虫媒介(Xf向量); （c） 疾病动力学、建模和有害生物风险评估(地理方法); （d） 疾病诊断与早期检测(诊断方法); （e） 疾病控制治疗(治疗); （f） 人-环境-社会影响(影响); （g）橄榄种质对苛求木霉第（b）小节。帕卡(橄榄对Xf的敏感性).
图3，描述了按研究策略划分的科学文章，表明在过去十年中，科学研究主要集中在诊断方法，包括应用可能的技术进行早期疾病诊断。其中包括新鲜症状组织的细菌分离、生物检测和生化方法、血清学方法、电子显微镜和分子生物学，28篇文献占所有文献的24.35%。研究主题的进一步关注点Xf向量调查（16.52%）；虽然所有文章都在治疗包括不到总科学产量的1/5（17.39%）。致病微生物的特征细菌Xf在13.91%的文献中发现，而与研究橄榄种质对苛求木霉的敏感性第（b）小节。帕卡占11.30%，其余论文涉及地理方法和影响分别占涵盖文献的7.83%和8.70%。还应考虑到，根据本综述中的“研究策略”，我们的分类安排通常是指在特定的单一“策略”中对被审查论文进行单一分配。然而，在同一出版的科学著作中，也有一些“研究策略”重叠的情况。这涉及到最少数量的文章，基本上仅限于诊断方法和橄榄种质对Xf的敏感性，分享了8篇论文[27，103，105，106，107，122，125，129]. 因此，表示不同“研究策略”（编号107）中定义的总体研究的项目数量与已审查论文的总数（编号115）相比只增加了八个单位。
图4说明了关于综述主题的文章数量是如何随着时间的推移而增加的，还显示了根据确定的研究策略进行的具体分解。科学调查，最初侧重于细菌和载体的知识(细菌Xf和Xf向量)，从2015年初开始研究早期检测和诊断的先进技术，包括图像分析技术(诊断方法). 从这些年来出版物数量的不断增加可以看出，研究方向主要集中在寻求疾病诊断和/或植物病原鉴定方法上(诊断方法和细菌Xf). 自2015年以来，还开展了有关使用抗病品种的研究(橄榄对Xf的敏感性). 用于控制疾病进一步传播的特定控制策略的第一个结果(治疗)在2016年第一种地理方法在第一次调查之前影响-相关研究（2019）。有趣的是，2017年之后治疗-相关论文的出版一直持续到2023年，但与包括其他联合研究策略在内的调查相比，数量要少得多诊断方法，细菌Xf和Xf向量。
根据不同研究策略在已发表文献中的出现情况，检查此处确定的不同研究策略的时间特征，以及与微生物表征相关的工作(细菌Xf)首先发生。
研究与流行病或感染暴发相关的细菌群体的遗传特征对于理解疾病流行病学，包括Xf等植物病理学至关重要。事实上，遗传知识有助于确定病原体传播的特征因素，以及获取有关适应特定气候条件、时空演变、确定潜在引入途径和各种菌株生物学的数据和信息。
在这个主题上，科学著作（总共16份文件）一直在扩展，使我们能够在全球范围内大大提高对Xf基因多样性的理解，并为探索这种多样性的工具的发展做出贡献(图5). 2013年开始的细菌特性鉴定工作[32]在接下来的几年中，几乎稳定地继续着，在2016年达到最大值，当时还进行了系统发育分析[44，46，47，48].
通过继续对研究策略进行时间分析，发现了载体在细菌传播中的相关性和作用(Xf向量). Xf需要昆虫载体将细菌从受感染的植物转移到健康的植物。
在阿普利亚橄榄树上发现了三种作为媒介的臭鼬（Aphrophoridae科），其中最常见的是中型臭鼬(水蚤Philaenus spumarius). 载体在细菌传播中的相关性和作用不仅取决于传播病原体的能力和效率，还取决于生态和行为学特征、优先寄主的范围、栽培和杂草植物种群的波动和动态，与疾病其他流行病学成分的相互作用、宿主的致病动力学、Xf基因型和环境条件。文献中的研究（总共19份文件）旨在收集关于这些病媒物种在引进和传播Xf时可能带来的风险的数据。关于媒介昆虫在植物木质部运输Xf细菌的第一篇论文可追溯到2014年[7]. 随着时间的推移，研究使我们能够更深入地研究生物循环的进展以及我们对寄主植物的理解。这项研究的结果表明，控制病媒是限制细菌传播计划的一部分(图6). 2019年，与调查Xf媒介昆虫生物周期各个发展阶段有关的科学生产有所增加，达到峰值。这些研究为监测干预措施的实施时间提供了有用的指示，但最重要的是对青少年和成人的控制[70，71，72，75，77]. 此后，与2019年相比，出现了少量但稳定的媒介相关研究。
了解橄榄园Xf感染相关感染和疾病的时空动态对于制定有效的管理策略也至关重要(地理方法). 2016年开始的一段时间内，通过实地调查，在阿普里亚地区首次了解了Xf感染的时空传播[92]采用各种有效的风险评估和预防方法和工具(图7). 关于地理方法持续到2023年，2020年至2021年达到最大值[94，95，96，97]. 使用科学著作（总共九份文件）中发现的提供生态和流行病学模型的模拟模型，可以更准确地预测细菌的建立和扩散潜力，为更有针对性的干预措施提供关键要素（监测战略、调查和采样区域/宿主的优先次序、根除、区域划定标准等）。
如前所述，在整个十年（2013年至2023年）中，最相关的出版物数量（n=28）是关于诊断协议和早期诊断的(诊断方法)，因为各个研究小组已经开发出了在宿主植物和载体中非常灵敏地检测Xf的诊断过程。
在诊断的总体背景下，早期检测Xf感染（即在出现明显症状之前）是该研究的关键目标之一，2015年首次发表[102]自2017年以来一直保持一致[27，105，107，108，109，110，111，113，114，115，116，118，119，121，122，123，124，125] (图8). 与用于Xf检测的各种诊断技术相关的已发表文件几乎不断增加，2023年达到最大值[127，128，129，130，131，132].
上述诊断策略研究在科学文献中有很好的报道，但似乎与对可能的微生物抑制作用的研究并不平行(治疗). 后者本可以与流行病相关法规规定的严厉强制植树程序一起考虑，并从中获益[176，177，178]. 有关治疗（总共20份文件）(图9a） 2017年开始[117]从2020年到2023年保持不变。图9b显示，20份文件中有19份涉及各种化学制剂/分子和生物防治剂（化学品）的研究，只有一份涉及Xf控制的机械操作（物理）[152].
旨在减少感染影响的治疗溶液和综合控制策略的研究所进行的实验和目前正在进行的实验涉及体外和现场经验，旨在使用化学-矿物制剂和化合物杀死植物中的细菌，来自植物和微生物拮抗剂的天然产物。特别地，图10a描述了干预领域对治疗的细分，强调了现场评估（现场）是如何作为控制Xf（42.11%）的首选方法略胜一筹的，共有19份文件，其中8份文件。在各种现场处理中，包括使用矿物溶液[153]以及植物油和各种植物提取物[145]柠檬酸盐生物复合物盛行时，给予锌和铜[117，135，136，139，143，144，147，149，151]. 此外，42.11%的科学著作（8份文件）涉及体外试验，目的是选择用于受感染植物的潜在抗菌化合物[137，142，148，150，154]或确定可能部署为Xf生物防治剂的拮抗生物[140，141]. 这两个干预领域（现场和体外）在三份文件中联合报道（15.79%），其中研究包括相同化合物体外效力测试后的现场测试[135，143，152].
图10b说明了治疗子主题的文章数量是如何随着时间的推移而增加的；这些研究最初侧重于现场技术的应用，从2017年开始转向同时使用体外技术和两个干预领域（现场和体外）的研究。特别是，与现场测试相关的已发布文件数量平均不断增加，2021年达到最大值[143，144，145，146]. 此外，表明体外技术应用的文件在2023年达到了最高水平[150，153，154].
通过研究Xf对人类和环境的影响，继续对研究策略进行时间分析(影响). 实际上，Xf的扩张对农业生产力和景观产生了广泛的影响，给社会、人类和环境造成了巨大的经济损失。关于这个主题，科学文件（总共10份文件）随着时间的推移不断扩展，试图描述与橄榄种植者关于阿普利亚地区Xf控制的信念和意图相关的心理和社会人口学方面(图11). 分析影响-相关出版作品，于2019年刚刚开始[163]在接下来的4年中持续，在2021年达到最大值，当时研究了农民对禽流感大流行的看法[166].
最后考虑的研究策略子主题(橄榄对Xf的敏感性)重点是鉴定对病原菌表现出耐受性/抗性的品种。关于这个主题，已经发表了13份科学文献。从2016年开始，首次尝试对两个橄榄品种Ogliarola salentina和Leccino的转录组分析进行表征，这两个品种对Xfp感染的反应不同[106] (图12). 在接下来的几年中，直到2023年，关于该子主题的已发表论文的产量有限，但仍在持续，这表明人们对该特定研究领域仍有兴趣。后者仍然是正在进行的研究的一个主要焦点，考虑到目前只有两个品种被官方指示适合在受感染地区重新种植橄榄园。
总之，对本综述中包含的文献进行的研究策略分析表明，大多数科学努力都指向与诊断而非治疗植物疾病相关的领域。事实上，在通过定性综合选择的115篇研究文献中，有53篇涉及直接或间接诊断相关的子主题。这些包括诊断方法，以28篇论文领导小组，随后是涉及细菌Xf（16条）和地理方法应用于疾病调查（9篇文章）。病媒鉴定和研究是另一个相对有代表性的科学领域(矢量Xf)，115项调查中有19项侧重于特定主题。只有10项研究关注环境、人类和社会影响，13项研究涉及橄榄种质对Xfp的敏感性。
值得注意的是，在所研究文献的115篇论文中，在具体的定性综述中，只有20篇（17.39%）报告了对细菌的治疗(图13). 考虑到与本综述中定性选择的主题相关的综合文献的比较，这一结果更加引人注目。总的来说，在2013年至2023年间发表的314篇论文中，关于使用治疗方法治疗受感染植物的20篇论文仅占6.36%苛求木霉在阿普里亚。另一方面，考虑到上述20篇论文中只有12篇直接与现场处理相关或包含现场处理内容，将比较限制在定性选择的论文中是非常有趣的。此外，还应考虑到，除物理治疗（1）外，只有11项研究（12%）直接涉及田间治疗，涉及使用建议用于可能的植物治疗的特定物质。在后者中，有两种是指使用天然物质衍生物，另一种是指锌和铜柠檬酸生物复合物。

3.方法

数据收集和数据细化

对截至2023年12月31日发表的文章进行了搜索，以评估涵盖2013年阿普里亚Xf疫情所有方面的文献。评估是根据2009年PRISMA清单中列出的主要组成部分进行的。我们使用以下关键字在Scopus和科学网（WOS）上搜索2013年1月至2023年12月发表的文章“二甲苯属“和”Olive“或”Olea“和”Apulia“或”Puglia“在不同的组合中。分别在每个数据库中，根据研究的标题或摘要选择研究进行书目搜索，然后检查整篇文章。首先，删除了数据库之间的重复项。将单独研究的结果加载到Rayyan筛选工具中(网址：http://www.rayyan.ai（于2024年1月3日访问），用于进一步分析，删除数据库之间的重复项。随后，按文章类型筛选记录，只包括英文原版全文论文，不包括系统性和叙述性评论，以及元分析、会议和会议论文、笔记、书籍章节、简短调查和编辑材料。
随后，排除了Xf与Apulian橄榄树无关的文章、Xf不是主要主题的研究、在Apulia地区以外的地理区域进行的文章、政治/政府性质的文章、信件、观点和简短交流。此外，欧洲食品安全局（EFSA）的声明也被排除在外。对于每项研究工作，我们研究了原始论文，并推断出以下信息：
-
作者；
-
出版年份；
-
出版国；
-
研究策略；
-
关键结论。
特别是，根据以下子主题确定了“研究策略”：
-
涉及基因和基因组特征的研究苛求木霉第（b）小节。保卡;
-
涉及媒介生物和传播的研究P.斯普马利乌斯;
-
基于地理和流行病学方法的研究；
-
基于诊断技术使用的研究；
-
基于体外检测和治疗感染植物的研究；
-
关于苛求木霉第（b）小节。保卡对环境和社会的影响；
-
橄榄种质易感性研究苛求木霉第（b）小节。帕卡。

4.结论

2013年二甲苯属已鉴定的菌株被引入阿普里亚地区。农民、植物检疫官员和研究界面临着一个巨大的问题，需要立即认识到其严重性和复杂性，并及时进行干预。过去十年来，这种细菌对该地区造成了无法弥补的损害。毫无疑问，在这场灾难之后重建该地区需要很长时间，但与此同时，各橄榄种植者的研究和奉献正在为橄榄产业的复兴和未来奠定基础。这篇对科学文献的综述强调了寻找有效方法治疗受感染橄榄树的困难，与对诊断方法的重视相比，近年来这种方法很少。后者的流行可能与植物检疫当局及时实施植物检疫措施的必要性密切相关。另一方面，这篇综述清楚地表明了治疗性研究策略所起的次要作用。尽管如此，对橄榄树有效治疗的有限研究结果也表明，有积极迹象表明可能控制这种疾病。这表明有必要将科学努力指向增加对目前情况下和一般处理类似情况时可能的细菌治疗方法的研究。事实上，更广泛的以治疗为中心的研究和及时考虑可能的积极结果是防治该病的关键步骤。这些基本承诺还要求对与新的特定流行病有关的立法进行适应性管理，这可能会限制根除橄榄树和病树周围的所有寄主植物。因此，许多百年纪念和纪念性的橄榄树，以及它们为之贡献的壮丽风景，都可以被保存下来。打击Xfp的传播，保护阿普里亚的橄榄生产和景观遗产，需要不懈的努力和综合战略。通过促进生物多样性的模式实现生态系统的可持续再生，将在未来重建人与环境之间的平衡方面发挥重要作用。它需要一种多学科的方法来理解环境变化如何影响人类健康，并针对这些影响实施遏制和初级预防行动，这些行动可以转移到公共卫生方案和政策中。从“一种健康”的角度来看，有必要放弃通常的人类中心主义观点。相反，重要的是要提高人们的意识，即人类的福祉与生态系统的健康密切相关；如果要创造一个可持续的、有弹性的和持久的环境，所有居民都必须具有同等的勇气。总之，本文的目的是对与2013年至今阿普里亚Xfp疫情不同研究策略的使用相关的文献报告进行全面系统的分析。特别是，这篇综述强调了在执行不同的研究策略时可能出现的不平衡努力。在所有考虑的方法中（鉴定细菌的尝试；识别和控制媒介的研究；地理方法；诊断技术；治疗程序；对环境、人类和社会的影响以及橄榄种质敏感性调查），强烈建议增加针对该细菌的可能治疗方法的研究，同时将重点放在保持植物生产力上。在这方面，报告中对科学文献结果的审查可以为制定改进的监测计划和控制策略以及早期检测提供进一步的有用信息。因此，在未来的潜在方向中，有必要继续探索新的Xfp管理策略，包括Xfp抗性遗传研究和载体控制方法，但最重要的是，加强以治疗为中心的调查，也旨在保持植物生产力，似乎至关重要。

作者贡献

概念化、F.S.、M.S.和F.P.F。；调查、联邦调查局和联邦调查局。；数据管理、F.S.和G.I。；书面原稿编制、F.S.和G.I。；写作审查和编辑、F.S.、F.P.F.、C.R.G.、M.S.和P.P.M。；可视化、F.S.和F.P.F.所有作者都已阅读并同意手稿的出版版本。

基金

这项研究由意大利农业部长、食品部长、前农业部长（Avviso n.10900/2020-Contratti di Distretto Xylella）资助。Xylella DAJS《Sostenible Rigenerazione》-MIPAAF第053128号Provvedimento。

数据可用性声明

不适用。

利益冲突

作者声明没有利益冲突。

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  178. 欧洲委员会。2020年8月14日欧盟委员会实施条例（EU）2020/1201，关于防止苛求木霉（Wells等人）。Off.J.欧盟 2020，269，2–39。[谷歌学者]
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图1。根据PRISMA 2020声明，与本综述中包含的研究相关的不同方法阶段的流程图[31].
图1。根据《2020年PRISMA声明》，与本次审查中的研究相关的不同方法阶段的流程图[31].
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图2。按出版年份列出的文件。报告115篇文章。
图2。按出版年份列出的文件。报告115篇文章。
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图3。按研究策略子主题列出的文档。报道了16篇与细菌Xf副主题，19至Xf向量副主题，9篇相关文章地理方法，28篇文章诊断方法，20篇相关文章治疗副主题，10代表影响关于环境与社会的13篇文章橄榄种质对Xf的敏感性副主题。
图3。按研究策略子主题列出的文档。报告16篇与细菌Xf副主题，19至Xf向量副主题，9篇相关文章地理方法，28篇文章诊断方法，20篇相关文章治疗副主题，10代表影响关于环境与社会的13篇文章橄榄种质对Xf的敏感性副主题。
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图4。与研究策略子主题相关的年度文件。
图4。与研究策略子主题相关的年度文件。
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图5。每年涉及细菌的文件苛求木霉(细菌Xf). 报道16篇文章。
图5。每年涉及细菌的文件苛求木霉(细菌Xf). 报道了16篇文章。
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图6。每年涉及向量（Xf向量）的文档。报告19篇文章。
图6。每年涉及向量（Xf向量）的文档。报告19篇文章。
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图7。每年基于地理方法的文件。报道9篇文章。
图7。每年基于地理方法的文件。报道9篇文章。
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图8。基于诊断系统使用情况的每年文档数。报道28篇文章。
图8。基于诊断系统使用情况的每年文档数。报道28篇文章。
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图9。(一)每年基于受感染植物治疗的文件。报道20篇文章。(b条)与研究子主题相关的文档总数（n=20）“治疗“描述化学（n=19）和物理（n=1）处理的应用。
图9。(一)每年基于对受感染植物的治疗的文件。报道20篇文章。(b条)与研究子主题相关的文档总数（n=20）“治疗“描述化学（n=19）和物理（n=1）处理的应用。
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图10。(一)描述化学处理应用的文件（n=19），以及现场、体外和两种技术的应用；(b条)与化学处理应用地点（现场、体外、现场和体外）相关的年度文件。
图10。(一)描述化学处理应用的文件（n=19），以及现场、体外和两种技术的应用；(b条)与化学处理应用地点（现场、体外、现场和体外）相关的年度文件。
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图11。每年对环境和社会影响的文件。报道10篇文章。
图11。每年对环境和社会影响的文件。报道10篇文章。
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图12。每年关于橄榄芽原体对Xfp敏感性的文件。报道13篇文章。
图12。每年关于橄榄芽原体对Xfp敏感性的文件。报道13篇文章。
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图13。2013年至2023年的科学文献报告。95篇关于流行病学和诊断的文章（细菌、病媒、地理分布、影响、诊断方法和橄榄芽原体对Xf的敏感性），以及20篇针对受感染植物的治疗文章。
图13。2013年至2023年的科学文献报告。95篇关于流行病学和诊断的文章（细菌、病媒、地理分布、影响、诊断方法和橄榄芽原体对Xf的敏感性）重点，20篇关于治疗受感染植物的文章。
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表1。小叶菌的鉴定和特性研究苛求(细菌Xf).
表1。小叶菌的鉴定和特性研究苛求(细菌Xf).
作者和年份方法主要发现
Carlucci等人，2013年[32]植物检疫紧急情况的定义地中海地区橄榄植物中的Xf
Giampetruzzi等人，2015年[43]基因组DNA调查他们确定了Xf-CoDiRO菌株的基因组草图序列；它与橄榄快速衰退综合征（OQDS）有关，其特征是叶片和枝条广泛烧焦和干燥
Mang等人，2016年[44]PCR检测gyrB基因上的核苷酸变异允许分离Xf亚型。帕卡来自其他亚种的多重和法氏鞭毛虫来自Apulia地区的Xf菌株包含在亚种中帕卡基于三种基因系统发育分析
Loconsole等人，2016年[46]MLST和系统发育分析他们报告了新的疫源地以及Xf阳性的寄主植物物种，包括樱桃、桃金娘叶和迷迭香；所有人都被发现感染了相同序列类型的这种细菌（ST53或CoDiRO菌株）
Marcelletti和Scortichini，2016年[48]全基因组方法这项研究强烈支持通过中美洲种植的咖啡植物将Xf引入意大利南部的可能性
Martelli等人，2016年[47]植物检疫紧急情况的定义在培养基中分离出该细菌，并鉴定为Xf亚种的基因型。帕卡与哥斯达黎加的一个分离物在分子上完全相同。水蚤Philaenus spumarius（草甸臭鼬）是一种在萨兰托地区十分常见的蛙食性昆虫，在那里以橄榄为生，被确定为主要媒介
Saponari等人，2017年[51]PCR分析不同环境条件下的针接种实验证明，Salentinian分离株De Donno属于该亚种帕卡能够繁殖并系统性入侵人工接种的宿主，重现田间观察到的症状
Cella等人，2018年[49]系统发育和进化分析属于Xf亚种的Xf菌株。波卡和subsp。三一据报道分别感染了橄榄树和咖啡树。系统地理学分析也揭示并证实了这两种不同的起源方式
Ramazzotti等人，2018年[56]VNTR、RAPD和rep-PCR（ERIC和BOX基序）分析全基因组指数ANIm和dDDH表明，来自Salento（意大利阿普里亚）的三个Xf分离物，即Salento-1、Salento-2和De Donno，其完整基因组序列最近已发布，它们共享一个最近的共同祖先
Scala等人，2018年[57]LC-TOF和LC-MS/MS技术与未受感染的植物组织相比，不同的脂质化合物在受感染植物组织中呈现出明确的分布模式
Scortichini和Cesari，2019年[58]血清学和分子技术品种“Nociara”、“Cima di Melfi”和“Cellina di Nardó”的衰退症状发生率最高
D'Atoma等人，2020年[53]菌株的体外行为，并与Temecula1菌株的相关生物学特性进行比较研究表明，与Temecula1菌株相比，De Donno菌株在琼脂平板上没有边缘，产生了更多的生物膜，并且具有更强的聚集性
Mazzaglia等人，2020年[52]分子技术（多位点VNTR分析分析）在来自Xf亚种代表的Apulian菌株的基因组DNA和直接从受感染植物提取的DNA上共扩增了37个TR位点
Scala等人，2020年[59]LC-MS/MS和多重反应监测（MRM）方法这项研究为OQDS脂质标志和可能调节Xf亚群生物膜相的分子提供了新的见解。帕卡
Firrao等人，2021年[60]BLASTP分析泛基因组分析的结果强调了环境DNA在形成基因组方面的额外相关性
Sicard等人，2021年[61]基因组和系统发育分析他们首先表明，阿普里亚的疫情是由于2008年从中美洲传入的一次疫情所致
表2。涉及表征和控制的研究苛求木霉第（b）小节。帕卡矢量。
表2。涉及表征和控制的研究苛求木霉第（b）小节。帕卡矢量。
作者和年份方法测试的昆虫主要发现
Saponari等人，2014年[7]PCR分析Ps和ElPs被鉴定为萨兰托半岛橄榄树感染Xf的载体
Moussa等人，2016年[69]PCR分析Ps、Nc和ElPs是夏季成虫丰度最高的优势种
Cornara等人，2016年[8]传播试验和PCR分析Ps公司每株植物上PCR-阳性Ps的数量与植物感染状态呈正相关。这些数据表明，现场收集的Ps具有较高的Xf感染率，并且是合格的载体
Cornara等人，2017年[9]实时PCRPs和Nc数据表明，Ps从田间的几种寄主植物物种获得并传播Xf，其中橄榄、远志和金合欢的获得率最高
Cornara等人，2018年[26]EPG辅助鉴定spumarius雌性摄食行为Ps公司Ps的摄食行为可以用五种不同的波形来描述，包括途径、木质部接触/预摄取、木质部汁液摄取、休眠、木质部相内的中断
Bodino等人，2019年[70]实地调查Ps、Nc和阿芙罗普拉·阿尔尼橄榄农业生态系统中臭鼬生命周期的数据，晚春时草被和橄榄树上有大量的Ps成虫，然后在夏季扩散到野生木本寄主，秋季返回橄榄林
Fierro等人，2019年[75]网格模型提案，包括数值模拟和实地调查Ps、Pi和Nc为了解释即使在恶劣条件下也能在多大程度上减轻感染，构建了一个格子模型来模拟不同控制措施下细菌/媒介/树木感染的相互作用
Cavalieri等人，2019年[71]定量PCR分析圆周率Drosopolous公司和雷曼，Nc和拉蒂利卡·图内塔纳（松村）（Issidae）为期两年的矢量介导传播实验表明，除Ps外，另外两种臭鼬是Xf亚种菌株的有效载体。帕卡ST53型
Dongiovanni等人，2019年[77]现场调查（随机植物采样和样方采样）Ps和Nc受Ps若虫感染的植物数量最多的植物科是菊科、豆科和Apiaceae，在4月初达到峰值
Cornara等人，2019年[74]现场调查、定量PCR分析和EPG程序Ps公司通过Ps首次深入了解细菌Xf的传播动力学：昆虫在摄取木质部汁液的最初几分钟内，以非常低的速度获取细菌
Bodino等人，2020年[78]实地调查Ps、Nc和阿芙罗普拉·阿尔尼（法律）Ps是阿普利亚橄榄林中的主要物种，但主要的替代木质宿主是克尔库斯spp.和黄连木属特殊目的地。
Ganassi等人，2020[86]现场调查和触角电图记录（EAG）Ps公司报道了成虫Ps对某些精油及相关植物的电生理和行为反应
Cornara等人，2020年[72]传播试验和定量PCR分析小扁形虫，蝉数据表明，蝉类在Xf的自然传播中没有或可以忽略不计的作用
Bodino等人，2021年[79]实地调查（MRR实验）Ps公司Ps在全年中的扩散仅限于数百米左右，尽管它在很大程度上受农业生态系统结构（橄榄林和草地）的影响
Cornara等人，2021年[80]实地调查Nc、Ps和Pi德罗索普洛斯et再制造报告的数据表明，在阿普里亚自然区内，四个不同生境中散布着栽培果园，一年中存在和丰富的小蠊
Bodino等人，2021年[81]定量PCR分析Ps公司Ps是橄榄整个成年期的合格Xf载体；采集后的前2-3周内，载体前肠中的细菌负荷增加
Lahbib等人，2022年[66]实地调查、光学显微镜和扫描电镜观察菲拉埃努斯物种这项研究揭示了菲拉埃努斯物种个体，允许对模糊个体进行分类
Bozzo等人，2022[82]空间模式聚类方法Ps公司同一入侵区域内不同区域的空间变化和地域分异可能不同
Cascone等人，2022年[87]实地调查和嗅觉计生物测定Ps公司Ps对橄榄品种的反应具有性别依赖性：雄性完全没有反应，而雌性则被Ogliarola、Rotondella和Frantoio吸引
表6。关于苛求木霉第（b）小节。帕卡对环境和社会的影响。
表6。关于苛求木霉第（b）小节。波卡对环境和社会的影响。
作者和年份方法影响主要发现
Semeraro等人，2019年[162]使用环境影响评估（EIA）和地理信息系统软件QGIS进行方法分析
（qgis.org，2019年5月20日访问）		受Xf影响的橄榄城市森林变化对生态系统服务的影响研究表明，对生态系统服务的直接影响主要与调控功能和文化服务有关
Brunetti等人，2020年[161]数学模型和数值模拟在虫害综合管理框架内改进控制策略实施的数学模型表明，从橄榄园和周边地区清除适量的杂草生物量（Xf水库）是控制OQDS传播的最有效策略
Semeraro等人，2021年[163]陆地卫星数据和中等分辨率成像光谱仪（MODIS）图像
(https://lpdaac.usgs.gov/dataset_discovery/modis/modis_products_table，2020年10月12日查阅）。		Xf对橄榄园的破坏对当地气候变化的影响这项研究分析了Xf对橄榄园的破坏如何影响当地气候变化
弗雷姆等人，2021年[166]选择实验对橄榄景观服务提供的影响，使公众福祉的组成部分发生变化研究表明，对于接受采访的当地居民来说，最受欢迎的橄榄景观服务是文化遗产和美学价值
Ali等人，2021年[158]环境风险评估该病的短期和长期影响及其对生态系统服务的控制措施该研究首次对Xf subsp的更广泛环境影响进行了评估。波卡
Tipaldo等人，2021年[170]计算机辅助文本分析对社交媒体的影响他们发现，关于Xf的讨论存在强烈的两极分化，围绕着两个冲突展开：一方面是“专业知识与政治”，另一方面则是“科学与替代”解决方案
Petrosillo等人，2022年[165]多尺度时空分析景观功能恢复规划多时间分析使作者能够显示2013年至2021年受Xf感染感兴趣的省份的景观功能的明显变化
弗雷姆等人，2022年[169]环境影响评估（LCA）影响评估这项研究提供了有用的决策支持，通过一项研究来评估新型和可持续装饰生产与传统生产方案的环境影响和经济可行性
施耐德等人，2022年[157]气候适宜性图、经济模型影响评估他们开发了一个空间生物经济模型来计算Xfp菌株的潜在未来经济影响。对于意大利来说，在经济最坏情况下，50年内的潜在经济影响从19亿欧元到52亿欧元不等
Alhajj Ali等人，2023年[167]土地适宜性分析和GIS防止Xfp扩散的实际遏制措施他们的研究结果有助于选择合适的免疫/抗性树种，以便在Xfp感染区重新种植
表7。橄榄种质易感性研究苛求木霉第（b）小节。帕卡。
表7。橄榄种质易感性研究苛求木霉第（b）小节。帕卡。
作者和年份方法橄榄品种测试主要发现
Giampetruzzi等人，2016年[106]分子分析奥利亚罗拉·萨伦蒂亚和莱奇诺Xfp在两个品种中引发不同的转录组反应，这决定了Leccino品种中的病原菌浓度较低
De Benedictis等人，2017年[105]基因型鉴定和显微镜分析奥利亚罗拉·萨伦蒂娜、塞利娜·迪纳多和莱奇诺阻塞是由tylose引起的，正如在Leccino植物中观察到的那样，它们不是对该病的耐受性/抗性的标志
Luvisi等人，2017年[27]分子分析Cellina di Nardå、Ogliarola salentina、Frantoio和Leccino不同品种酚类化合物（羟基酪醇葡萄糖苷和奎尼酸）诱导反应的差异表明，它们在橄榄树对Xf感染的反应中起防御作用
Sabella等人，2018年[107]分子和酚类分析塞利娜·迪纳多和莱奇诺结果表明木质素在十、苛求Leccino cv公差
D'Atoma等人，2019年[171]电感耦合等离子体发射光谱（ICP-OES）奥利亚罗拉·萨伦蒂亚和莱奇诺他们的分析表明，这两个品种的电离层差异，特别是莱奇诺品种中较高浓度的钙（Ca）和锰水平，有助于防止由十、苛求感染
Sabella等人，2019[103]SEM-EDX分析和分子分析塞利娜·迪纳多和莱奇诺Leccino cv在解剖学上不太容易发生气蚀，它也可能能够激活更有效的填充机制，恢复容器的水力传导性
Giampetruzzi等人，2020年[172]分子和宏基因组鸟枪测序（WMSS）卡拉马塔和FS17在两个品种中检测到的感染进展表明，Xf往往占据整个生态位，抑制内生微生物群的多样性，但在抗病品种FS17中这种趋势有所缓解
Pavan等人，2021年[122]分子分析Nocellar Messinese、Frantoio、Bella di Spagna、Pendolino、Cellina di Nardó、Ogliarola Salentina和Leccino他们的结果表明，有可能表征与假定抗性植物遗传相关的品种对Xf的抗性
Petit等人，2021年[173]功能性木质部解剖的表征和测量塞利娜·迪纳多和莱奇诺与Leccino相比，Cellina di Nardó中较大血管的更高空气栓塞易感性可能促进Xf感染
苏拉诺等人，2022年[174]气孔导度和茎水势的测量Cellina di Nardó、Leccino和FS17在这项研究中，与感病橄榄相比，这两个抗病橄榄品种在Xfp感染时表现出较低的水分胁迫
Montilon等人，2022年[125]电子显微镜分析奥利亚罗拉·萨伦蒂娜、塞利娜·迪纳多和莱奇诺他们的结果表明，Xfp ST53利用感病品种Cellina di Nardó的纹孔膜进行系统传播。在Leccino，闭塞的血管主要由胼胝样颗粒填充，这些颗粒紧紧包裹XfDD细胞
Savoia等人，2023年[131]分子检测（qPCR，基因分型）Leccino和Cellina di Nardå他们确定了九种可能的抗药性基因型，代表了第一批橄榄种质资源
Walker等人，2023年[175]分子分析和X射线计算机断层扫描Ogliarola、Koroneiki、Leccino和FS17他们的结果表明，易感品种具有较大比例的大血管，更容易受到空气栓塞的影响
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塞里奥，F。；英布里亚尼，G。；Girelli，C.R。；米利埃塔，P.P。；斯科蒂奇尼，M。；法尼兹，F.P。爆发十年后苛求木霉第（b）小节。帕卡在Apulia（意大利南部）：研究策略的方法论文献分析。植物 2024，13, 1433.https://doi.org/10.3390/plants13111433

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Serio F、Imbriani G、Girelli CR、Miglietta PP、Scortichini M、Fanizzi FP。爆发十年后苛求木霉第（b）小节。帕卡在Apulia（意大利南部）：研究策略的方法论文献分析。植物. 2024; 13(11):1433.https://doi.org/10.3390/plants13111433

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塞里奥、弗朗西丝卡、乔瓦尼·伊姆布里亚尼、奇亚拉·罗伯塔·吉雷利、皮尔·保罗·米利埃塔、马可·斯科蒂奇尼和弗朗西斯科·保罗·法尼兹。2024.“苛求木霉第（b）小节。波卡在阿普里亚（意大利南部）：研究策略的方法论文献分析”植物13，编号11:1433。https://doi.org/10.3390/plants13111433

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