赫尔曼·范·弗利杰曼
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2020年–今天
2023 [公元34年] 刘旭涵 , Kai Ye公司 , 赫尔曼·W·T·范·弗里曼 , 阿德里安·P·伊杰曼 , 杰拉德·范·韦斯顿 :
DrugEx v3:基于图形变换的强化学习的支架约束药物设计。 化学信息学杂志 15 ( 1 ) : 24 ( 2023 ) 2022 [公元33年] 弗朗西斯科·萨班内斯·扎里基 , 埃德加·雅各比 , 安·沃斯 , 赫尔曼·W·T·范·弗利杰曼(Herman W.T.van Vlijmen) , 加里·特雷萨登 , 杰里米·哈维 :
分而治之。 从对接虚拟筛选应用程序用于药物发现的角度来看,口袋式混合溶剂模拟。 化学杂志。 信息模型。 62 ( 三 ) : 533-543 ( 2022 ) [公元32年] 加里·特雷萨登 , 卡纳卡·塔提科拉 , 哈维尔·卡布雷拉 , 王玲玲(Lingle Wang) , 埃布尔 , 赫尔曼·范·弗利杰曼 , 海伦娜·盖斯 :
实验和计算误差对相似性预测性能的影响。 化学杂志。 信息模型。 62 ( 三 ) : 703-717 ( 2022 ) [i1] 萨瓦斯·瓦萨莫普洛斯 , 埃文·菲利普 , 赫尔曼·W·T·范·弗利杰曼(Herman W.T.van Vlijmen) , 赛拉姆·梅农 , 安·沃斯 , 娜塔莉亚·迪乌班科娃 , 伯特·托夫斯 , 安东尼·罗 , 文森特·埃尔夫文 :
量子极限学习。 CoRR公司 腹肌/2205.02807 ( 2022 ) 2021 [公元31年] 刘旭涵 , Kai Ye公司 , 赫尔曼·W·T·范·弗利杰曼(Herman W.T.van Vlijmen) , 迈克尔·T·M·埃默里奇 , 阿德里安·P·伊杰曼 , 杰拉德·范·韦斯顿 :
DrugEx v2:通过基于Pareto的多学科多目标强化学习对药物分子进行从头设计。 化学信息学杂志 13 ( 1 ) : 85 ( 2021 ) 2020 【j30】 赫尔曼·范·弗利杰曼 , 阿尔伯特·蒙斯 , 阿恩·瓦尔肯斯 , 沃特·弗兰克 , 阿里·巴克 , 格布兰德·鲁伊特 , 克里斯汀·柯克帕特里克 , 路易斯·奥拉沃·博尼诺·达席尔瓦·桑托斯 , 伯特·梅尔曼 , 伦格·杰利马 , 德克·L·艺术 , Martijn G.Kersloot公司 , 塞巴斯蒂安·克尼恩伯格 , 斯科特·卢瑟 , 鲁迪·维尔贝克 , Jean-Marc Neefs女士 :
工业需要公平。 数据智能。 2 ( 1-2 ) : 276-284 ( 2020 ) [公元29年] 林赛·伯格拉夫 , 赫尔曼·W·T·范·弗利杰曼(Herman W.T.van Vlijmen) , 阿德里安·P·伊杰曼 , 杰拉德·范·韦斯顿 :
A之间选择性的定量预测 1 和A 2安培 腺苷受体。 化学信息学杂志 12 ( 1 ) : 33 ( 2020 ) [公元28年] 林赛·伯格拉夫 , 艾克·B·伦塞林克 , 威廉·杰斯佩斯 , 杰斯珀·范·恩格伦 , 布兰登·邦格斯 , 玛丽娜·戈洛斯蒂奥拉·冈萨雷斯 , 刘荣芳 , 霍尔格·H·胡斯 , 赫尔曼·W·T·范·弗利杰曼(Herman W.T.van Vlijmen) , 阿德里安·P·伊杰曼 , 杰拉德·范·韦斯顿 :
用于识别化学新型激酶抑制剂的连续统计和基于结构的建模。 化学杂志。 信息模型。 60 ( 9 ) : 4283-4295 ( 2020 ) [公元27年] 林赛·伯格拉夫 , Amber van Veen先生 , 林志忠 , 赫尔曼·W·T·范·弗利杰曼(Herman W.T.van Vlijmen) , 阿德里安·P·伊杰曼 , 杰拉德·范·韦斯顿 :
对变构化合物的注释,以增强A类GPCR的生物活性建模。 化学杂志。 信息模型。 60 ( 10 ) : 4664-4672 ( 2020 ) [公元26年] 肯尼思·古森 , 伯托尔·沃洛夫斯基 , 卡西亚诺·兰吉尼 , 赫尔曼·范·弗利杰曼 , Amedeo Caflisch公司 , 汉斯·德温特 :
碎片对接程序SEED的评估。 化学杂志。 信息模型。 60 ( 10 ) : 4881-4893 ( 2020 ) [公元25年] 弗朗西丝卡·德弗里安 , 劳拉·佩雷斯·贝尼托 , 艾克·B·伦塞林克 , 迈尔斯·康格里夫 , 赫尔曼·W·T·范·弗利杰曼(Herman W.T.van Vlijmen) , 乔纳森·梅森 , 克里斯·德·格拉夫 , 加里·特雷萨登 :
自由能微扰下GPCR配体结合亲和力的精确预测。 化学杂志。 信息模型。 60 ( 11 ) : 5563-5579 ( 2020 )
2010 – 2019
2019 [j24] 林赛·伯格拉夫 , 保罗·奥兰杰 , 罗宾·古卡 , 彼得·范德皮耶 , 玛丽安·盖尔多夫 , 赫尔曼·W·T·范·弗利杰曼(Herman W.T.van Vlijmen) , 阿德里安·P·伊杰曼 , 杰拉德·范·韦斯顿 :
利用蛋白质化学模型鉴定溶质载体SGLT1的新型小分子抑制剂。 化学信息学杂志 11 ( 1 ) : 15:1-15:10 ( 2019 ) [公元23年] 刘旭涵 , 叶凯 , 赫尔曼·W·T·范·弗利杰曼(Herman W.T.van Vlijmen) , 阿德里安·P·伊杰曼 , 杰拉德·范·韦斯顿 :
探索策略使用深度强化学习改善从头配体的多样性:腺苷A2A受体的案例。 化学信息学杂志 11 ( 1 ) : 35:1-35:16 ( 2019 ) [j22] 多米尼克·西多 , 林赛·伯格拉夫 , 安吉丽卡·森格尔 , 赫尔曼·W·T·范·弗利杰曼(Herman W.T.van Vlijmen) , 阿德里安·P·伊杰曼 , 杰拉德·范·韦斯顿 , 安德烈亚·沃卡默 :
计算目标预测的进展和挑战。 化学杂志。 信息模型。 59 ( 5 ) : 1728-1742 ( 2019 ) [公元21年] 安格斯之声 , 加里·特雷萨登 , 赫尔曼·范·弗利杰曼 , 阿德里安·穆霍兰德 :
预测共价抑制剂反应性的仅配体方法的局限性。 化学杂志。 信息模型。 59 ( 10 ) : 4220-4227 ( 2019 ) 2018 [j20] 法尼·加纳科塔 , 赫尔曼·范·弗利杰曼 , 伍迪·谢尔曼 , Thijs Beuming公司 :
混合溶剂模拟的大规模验证,以评估蛋白质-蛋白质相互作用界面的热点。 化学杂志。 信息模型。 58 ( 4 ) : 784-793 ( 2018 ) 2017 [公元19年] 赫尔曼·范·弗利杰曼 , 蕾妮·L·德斯贾利斯 , 塔拉·米尔扎德甘 :
詹森的计算化学。 J.计算。 辅助分子设计。 31 ( 三 ) : 267-273 ( 2017 ) [公元18年] 艾尔克·B·伦塞林克 , 尼尔斯·丁·迪克 , 布兰登·邦格斯 , 乔治·帕帕达托斯 , 赫尔曼·W·T·范·弗利杰曼(Herman W.T.van Vlijmen) , 沃伊特克·科瓦尔奇克 , 阿德里安·P·伊杰曼 , 杰拉德·范·韦斯顿 :
除了炒作:深度神经网络优于使用ChEMBL生物活性基准集的既定方法。 化学信息学杂志 9 ( 1 ) : 45 ( 2017 ) [公元17年] 加里·特雷萨登 , 安德烈斯·特拉班科 , 劳拉·佩雷斯·贝尼托 , 约翰·奥弗林顿 , 赫尔曼·W·T·范·弗利杰曼(Herman W.T.van Vlijmen) , 杰拉德·范·韦斯顿 :
利用蛋白质化学模型鉴定代谢性谷氨酸7受体的变构调节剂。 化学杂志。 信息模型。 57 ( 12 ) : 2976-2985 ( 2017 ) 2016 [公元16年] 艾克·B·伦塞林克 , Thijs Beuming公司 , 科琳·范维恩 , 阿尔诺·马西克 , 伍迪·谢尔曼 , 赫尔曼·W·T·范·弗利杰曼(Herman W.T.van Vlijmen) , 阿德里安·P·伊杰曼 :
使用基于结构的方法寻找新配体:腺苷A2A受体的个案研究。 J.计算。 辅助分子设计。 30 ( 10 ) : 863-874 ( 2016 ) [j15] 布拉德利·谢伯恩 , Veerabahu Shanmugasundaram公司 , 艾伦·C·程 , 克拉拉·D·基督 , 蕾妮·L·德斯贾利斯 , 何塞·S·杜卡 , 理查德·A·刘易斯 , 黛博拉·拉格尼 , 埃里克·S·马纳斯 , 乔治亚·B·麦考基 , 凯瑟琳·佩肖夫 , 赫尔曼·范·弗利杰曼 :
合作改进自由能和其他定量方法在药物发现中的使用。 J.计算。 辅助分子设计。 30 ( 12 ) : 1139-1141 ( 2016 ) [公元14年] 艾尔克·B·伦塞林克 , 威廉·杰斯佩斯 , 赫尔曼·W·T·范·弗利杰曼(Herman W.T.van Vlijmen) , 阿德里安·P·伊杰曼 , 杰拉德·范·韦斯顿 :
与GPCR交互:使用交互指纹进行虚拟筛选。 化学杂志。 信息模型。 56 ( 10 ) : 2053-2060 ( 2016 ) 2015 [j13] 科恩·范德博特 , 金·蒂斯 , 伊夫·韦策尔 , 列文·克莱门特 , Bie M.P.动词 , 开玩笑的雷默斯 , 赫尔曼·范·弗利杰曼 , 杰伦·阿尔森斯 :
QQ-SNV:通过比较质量分位数进行低频单核苷酸变异检测。 BMC生物信息。 16 : 379:1-379:14 ( 2015 ) 2014 [公元12年] 科恩·范德博特 , 吉尔特·韦贝克 , 赫尔曼·范·弗利杰曼 :
使用基于线性回归的遗传算法的混合效应进行多模型推理。 BMC生物信息。 15 : 88 ( 2014 ) [公元11年] 艾尔克·B·伦塞林克 , Thijs Beuming公司 , 伍迪·谢尔曼 , 赫尔曼·W·T·范·弗利杰曼(Herman W.T.van Vlijmen) , 阿德里安·P·伊杰曼 :
选择最佳数量的结合位点水以提高对腺苷A的虚拟筛选富集 2安培 受体。 化学杂志。 信息模型。 54 ( 6 ) : 1737-1746 ( 2014 ) 2013 [j10] 杰拉德·范·韦斯顿 , Remco F.瑞士 , 约格·韦格纳 , 阿德里安·P·伊杰曼 , 赫尔曼·W·T·范·弗利杰曼(Herman W.T.van Vlijmen) , 安德烈亚斯·本德 :
蛋白质化学建模中蛋白质描述符集的基准(第1部分):13个氨基酸描述符集的比较研究。 化学信息学杂志 5 : 41 ( 2013 ) [公元9年] 杰拉德·范·韦斯顿 , 雷姆科·F·斯维尔 , 伊西德罗·科尔特斯·西里亚诺 , 约尔格·韦格纳 , 约翰·奥弗林顿 , 阿德里安·P·伊杰曼 , 赫尔曼·W·T·范·弗利杰曼(Herman W.T.van Vlijmen) , 安德烈亚斯·本德 :
蛋白质化学建模中蛋白质描述符集的基准测试(第2部分):13个氨基酸描述符集的建模性能。 化学信息学杂志 5 : 42 ( 2013 ) [j8] 杰拉德·范·韦斯顿 , 阿尔文·亨德里克斯 , 约格·韦格纳 , 阿德里安·P·伊杰曼 , 赫尔曼·W·T·范·弗利杰曼(Herman W.T.van Vlijmen) , 安德烈亚斯·本德 :
利用抗病毒谱数据生成的蛋白质化学模型显著提高HIV抑制剂疗效预测。 公共科学图书馆计算。 生物。 9 ( 2 ) ( 2013 ) 2012 [j7] 约格·韦格纳 , 亚伦·D·斯特林 , 拉贾什·古哈 , 安德烈亚斯·本德 , Jean-Loup Falon公司 , 詹娜·黑斯廷斯 , 诺埃尔·M·奥博伊尔 , 约翰·奥弗林顿 , 赫尔曼·范·弗利杰曼 , 埃贡·L·威利根 :
化学信息学。 Commun公司。 ACM公司 55 ( 11 ) : 65-75 ( 2012 ) [c1] 埃尔南多·桑切斯·法德耶夫 , 迈克尔·T·M·埃默里奇 , 弗恩斯·韦贝克(J.Verbeek) , 安德鲁·亨利 , 西蒙·格里姆肖 , 赫尔曼·P·斯潘克 , 赫尔曼·W·T·范·弗利杰曼(Herman W.T.van Vlijmen) , 安德烈亚斯·本德 :
利用多目标优化和能量最小化设计14-3-3蛋白的异构选择性配体。 ISoLA(2) 2012 : 12-24 2011 [j6] 科恩·范德博特 , 埃尔克·范·克雷恩布洛克 , 皮埃尔·勒科克 , 玛格丽特·范·霍特 , 芭芭拉·范·克霍夫 , 李·巴切勒 , 吉特·韦贝克 , 赫尔曼·范·弗利杰曼 :
交叉验证逐步回归用于鉴定新的非核苷逆转录酶抑制剂耐药相关突变。 BMC生物信息。 12 : 386 ( 2011 ) 2010 [j5] 埃尔克·范德霍斯特 , 胡里奥·E·佩伦塞利 , 阿德里安·P·伊杰曼 , 玛格特·沃克·拜克斯(Margot W.Beukers) , 乔纳森·罗伯特·莱恩 , 赫尔曼·W·T·范·弗利杰曼(Herman W.T.van Vlijmen) , 迈克尔·T·M·埃默里奇 , 大野雅史 , 安德烈亚斯·本德 :
G蛋白偶联受体(GPCR)及其配体的新化学基因组学分析:一种潜在的受体去分化策略。 BMC生物信息。 11 : 316 ( 2010 ) 【j4】 杰拉德·范·韦斯顿 , 约格·韦格纳 , 阿德里安·P·伊杰曼 , 赫尔曼·W·T·范·弗利杰曼(Herman W.T.van Vlijmen) , 安德烈亚斯·本德 :
利用支持向量机对新靶点进行分子生物活性外推。 化学信息学杂志 2 ( S-1号机组 ) : 三 ( 2010 )
2000 – 2009
1980 – 1989
1989 [注2] 赫尔曼·W·T·范·弗利杰曼(Herman W.T.van Vlijmen) , 阿德里安·P·伊杰曼 :
β-肾上腺素受体螺旋III上假定拮抗剂结合位点的分子模型。 J.计算。 辅助分子设计。 三 ( 2 ) : 165-174 ( 1989 ) 1988 [j1] 阿德里安·P·伊杰曼 , 赫尔曼·W·T·范·弗利杰曼(Herman W.T.van Vlijmen) :
一项分子图形学研究,探索一个假定的配体结合位点 β -肾上腺素受体。 J.计算。 辅助分子设计。 2 ( 1 ) : 43-53 ( 1988 )
合著者索引
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