杰拉德·J·P·范·韦斯顿
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2020年–今天
2023 [公元39年] 奥利维尔·J·M·Béquignon , 布兰登·邦格斯 , 威廉·杰斯佩斯 , 阿德里安·P·伊杰曼 , B.范德沃特 , 杰拉德·J·P·范·韦斯顿 :
纸莎草:旨在预测生物活性的大规模精选数据集。 化学信息学杂志 15 ( 1 ) : 三 ( 2023 ) [公元38年] 林德·肖恩梅克 , 奥利维尔·J·M·Béquignon , 威廉·杰斯佩斯 , 杰拉德·J·P·范·韦斯顿 :
廉洁笑容:全新设计的新方法。 化学信息学杂志 15 ( 1 ) : 22 ( 2023 ) [公元37年] 刘旭涵 , Kai Ye公司 , 赫尔曼·W·T·范·弗利杰曼(Herman W.T.van Vlijmen) , 阿德里安·P·伊杰曼 , 杰拉德·J·P·范·韦斯顿 :
DrugEx v3:基于图形变换的强化学习的支架约束药物设计。 化学信息学杂志 15 ( 1 ) : 24 ( 2023 ) [公元36年] 玛丽娜·戈洛斯蒂奥拉·冈萨雷斯 , 雷姆科·L·范登·布鲁克 , 托马斯·布劳恩 , Magdalini Chatzopoulou公司 , 威廉·杰斯佩斯 , 阿德里安·P·伊杰曼 , 劳拉·海特曼 , 杰拉德·J·P·范·韦斯顿 :
3DDPDs:描述用于蛋白化学计量生物活性预测的蛋白质动力学。 (突变)G蛋白偶联受体的病例。 化学信息学杂志 15 ( 1 ) : 74 ( 2023 ) [j35] 布兰登·邦格斯 , 休布·西杰本(Huub J.Sijben) , 彼得·B·R·哈特戈 , 安德烈·塔诺夫斯基 , 阿德里安·P·伊杰曼 , 劳拉·海特曼 , 杰拉德·J·P·范·韦斯顿 :
蛋白质化学建模确定化学多样的去甲肾上腺素转运蛋白抑制剂。 化学杂志。 信息模型。 63 ( 6 ) : 1745-1755 ( 2023 ) [公元34年] 马丁·西乔 , Sohvi Luukkonen公司 , 海勒·W·范登·马格登贝格 , 林德·肖恩梅克 , 奥利维尔·J·M·Béquignon , 杰拉德·J·P·范·韦斯顿 :
DrugEx:探索类Drug化学空间的深度学习模型和工具。 化学杂志。 信息模型。 63 ( 12 ) : 3629-3636 ( 2023 ) [j33] Sohvi Luukkonen公司 , 梅耶尔 , 乔瓦尼·特里卡里科 , 约翰·霍夫曼 , 彼得·斯托滕(Pieter F.W.Stouten) , 杰拉德·J·P·范·韦斯顿 , 艾尔克·B·伦塞林克 :
稀疏蛋白激酶活性数据的大尺度建模。 化学杂志。 信息模型。 63 ( 12 ) : 3688-3696 ( 2023 ) [公元32年] 奥利维尔·J·M·Béquignon , 何塞·戈梅斯·塔马约 , 艾尔克·B·伦塞林克 , 史蒂文·温克 , 史蒂文·希姆斯特拉 , 林志忠 , 多梅尼科·加达列塔 , 亚历山德拉·伦卡格利奥尼 , 乌尔夫·诺林德 , 鲍勃·范德沃特 , 帕斯特 , 杰拉德·J·P·范·韦斯顿 :
人类HepG2细胞氧化应激激活的协同SAR建模和前瞻性体外验证。 化学杂志。 信息模型。 63 ( 17 ) : 5433-5445 ( 2023 ) 2022 [公元31年] 土耳其阿尔兹贝塔 , 布兰登·邦格斯 , 乌尔夫·诺林德 , 奥索利亚·翁瓦里 , 维拉格·塞克利 , 安德烈·塔诺夫斯基 , Gergely Szakács公司 , CsillaØzvegy-Laczka公司 , 杰拉德·J·P·范·韦斯顿 , 芭芭拉·兹德拉齐尔 :
基于机器学习的虚拟筛选法鉴定肝脏有机阴离子转运多肽的新型抑制剂。 化学杂志。 信息模型。 62 ( 24 ) : 6323-6335 ( 2022 ) 2021 【j30】 马丁·西乔 , 刘旭涵 , 丹尼尔·斯沃齐尔 , 杰拉德·范·韦斯顿 :
GenUI:用于从头开始分子生成和化学信息学的交互式可扩展开源软件平台。 化学信息学杂志 13 ( 1 ) : 73 ( 2021 ) [公元29年] 刘旭涵 , Kai Ye公司 , 赫尔曼·W·T·范·弗利杰曼(Herman W.T.van Vlijmen) , 迈克尔·T·M·埃默里奇 , 阿德里安·P·伊杰曼 , 杰拉德·J·P·范·韦斯顿 :
DrugEx v2:通过基于Pareto的多学科多目标强化学习对药物分子进行从头设计。 化学信息学杂志 13 ( 1 ) : 85 ( 2021 ) [公元28年] 威廉·杰斯佩斯 , 劳拉·海特曼 , 阿德里安·P·伊杰曼 , 埃迪·索特洛 , 杰拉德·J·P·范·韦斯顿 , 约翰·奥奎斯特 , 雨果·古铁雷斯(Hugo Gutiérrez de Terán) :
通过自由能模拟破译A2A腺苷G蛋白偶联受体的构象选择性。 公共科学图书馆计算。 生物。 17 ( 11 ) ( 2021 ) [第1页] 刘旭涵 , 阿德里安·P·伊杰曼 , 杰拉德·J·P·范·韦斯顿 :
新药设计的计算方法:过去、现在和未来。 人工神经网络,第3版 2021 : 139-165 2020 [公元27年] 林赛·伯格拉夫 , 赫尔曼·W·T·范·弗里曼 , 阿德里安·P·伊杰曼 , 杰拉德·J·P·范·韦斯顿 :
A之间选择性的定量预测 1 和A 2安培 腺苷受体。 化学信息学杂志 12 ( 1 ) : 33 ( 2020 ) [公元26年] Ctibor Skuta公司 , 伊西德罗·科尔特斯·西里亚诺 , 维姆·德哈恩 , 帕维尔·克里兹 , 杰拉德·J·P·范·韦斯顿 , 伊戈尔·特特科 , 安德烈亚斯·本德 , 丹尼尔·斯沃齐尔 :
QSAR衍生亲和指纹(第1部分):用于相似性搜索、生物活性分类和支架跳跃的指纹构建和建模性能。 化学信息学杂志 12 ( 1 ) : 39 ( 2020 ) [公元25年] 林赛·伯格拉夫 , 艾尔克·B·伦塞林克 , 威廉·杰斯佩斯 , 杰斯珀·范·恩格伦 , 布兰登·邦格斯 , 玛丽娜·戈洛斯蒂奥拉·冈萨雷斯 , 刘荣芳 , 霍尔格·H·胡斯 , 赫尔曼·W·T·范·弗利杰曼(Herman W.T.van Vlijmen) , 阿德里安·P·伊杰曼 , 杰拉德·J·P·范·韦斯顿 :
用于识别化学新型激酶抑制剂的连续统计和基于结构的建模。 化学杂志。 信息模型。 60 ( 9 ) : 4283-4295 ( 2020 ) [公元24年] 林赛·伯格拉夫 , Amber van Veen先生 , 林志忠 , 赫尔曼·W·T·范·弗里曼 , 阿德里安·P·伊杰曼 , 杰拉德·J·P·范·韦斯顿 :
变构化合物注释以增强A类GPCR的生物活性建模。 化学杂志。 信息模型。 60 ( 10 ) : 4664-4672 ( 2020 )
2010 – 2019
2019 [公元23年] 林赛·伯格拉夫 , 保罗·奥兰杰 , 罗宾·古卡 , 彼得·范德皮耶 , 玛丽安·盖尔多夫 , 赫尔曼·W·T·范·弗利杰曼(Herman W.T.van Vlijmen) , 阿德里安·P·伊杰曼 , 杰拉德·J·P·范·韦斯顿 :
利用蛋白质化学模型鉴定溶质载体SGLT1的新型小分子抑制剂。 化学信息学杂志 11 ( 1 ) : 15:1-15:10 ( 2019 ) [公元22年] 刘旭汉 , Kai Ye公司 , 赫尔曼·W·T·范·弗利杰曼(Herman W.T.van Vlijmen) , 阿德里安·P·伊杰曼 , 杰拉德·J·P·范·韦斯顿 :
探索策略使用深度强化学习改善从头配体的多样性:腺苷A2A受体的案例。 化学信息学杂志 11 ( 1 ) : 35:1-35:16 ( 2019 ) [公元21年] 大卫·鲁安诺·奥达斯 , 林赛·伯格拉夫 , 刘荣芳 , 范德霍斯特卡斯 , 劳拉·海特曼 , 迈克尔·T·M·埃默里奇 , 何塞·拉蒙·门德斯 , 伊琳娜·叶夫谢耶娃 , 杰拉德·J·P·范·韦斯顿 :
多分类器系统识别新型大麻素CB2受体配体。 化学信息学杂志 11 ( 1 ) : 66:1-66:14 ( 2019 ) [公元20年] 安东尼乌斯·杨森 , 塞巴斯蒂安·H·格林 , 鲁·H·M·威德偶 , 艾尔克·B·伦塞林克 , 雅克·内夫杰斯 , 常数A.A.van Boeckel , 杰拉德·J·P·范·韦斯顿 , 马里奥·范德斯特尔特 :
药物发现图,一种机器学习模型,用于可视化和预测Kinome-Inhibitor交互环境。 化学杂志。 信息模型。 59 ( 三 ) : 1221-1229 ( 2019 ) [公元19年] 多米尼克·西多 , 林赛·伯格拉夫 , 安吉丽卡·森格尔 , 赫尔曼·W·T·范·弗利杰曼(Herman W.T.van Vlijmen) , 阿德里安·P·伊杰曼 , 杰拉德·J·P·范·韦斯顿 , 安德烈亚·沃卡默 :
计算目标预测的进展和挑战。 化学杂志。 信息模型。 59 ( 5 ) : 1728-1742 ( 2019 ) 2018 [公元18年] 沙杜尔·帕里查拉克 , 奥斯卡·曼德斯·卢西奥 , 阿卡什·查万·拉文德拉纳特 , 安德烈亚斯·本德 , 阿德里安·P·伊杰曼 , 杰拉德·J·P·范·韦斯顿 :
用于高通量筛选中化合物库设计、命中分类和生物活性建模的数据驱动方法。 生物信息简报。 19 ( 2 ) : 277-285 ( 2018 ) 2017 [公元17年] 艾尔克·B·伦塞林克 , 尼尔斯·丁·迪克 , 布兰登·邦格斯 , 乔治·帕帕达托斯 , 赫尔曼·W·T·范·弗利杰曼(Herman W.T.van Vlijmen) , 沃伊特克·科瓦尔奇克 , 阿德里安·P·伊杰曼 , 杰拉德·J·P·范·韦斯顿 :
除了炒作:深度神经网络优于使用ChEMBL生物活性基准集的既定方法。 化学信息学杂志 9 ( 1 ) : 45 ( 2017 ) [公元16年] 加里·特雷萨登 , 安德烈斯·特拉班科 , 劳拉·佩雷斯·贝尼托 , 约翰·P·奥弗林顿 , 赫尔曼·W·T·范·弗利杰曼(Herman W.T.van Vlijmen) , 杰拉德·J·P·范·韦斯顿 :
利用蛋白质化学模型鉴定代谢性谷氨酸7受体的变构调节剂。 化学杂志。 信息模型。 57 ( 12 ) : 2976-2985 ( 2017 ) 2016 [公元15年] 伊西德罗·科尔特斯·西里亚诺 , 杰拉德·范·韦斯顿 , 纪尧姆·鲍维尔 , 迈克尔·尼尔斯 , 约翰·奥弗林顿 , 安德烈亚斯·本德 , 塞雷斯·马利亚文 :
使用NCI60癌细胞株面板改进了对生长抑制模式的大规模预测。 生物信息。 32 ( 1 ) : 85-95 ( 2016 ) [公元14年] 谢尔盖·克里斯曼·弗兰克 , 杰拉德·J·P·范·韦斯顿 , 乔治·帕帕达托斯 , 范妮·贝尔特兰·埃斯库迪 , 亚历山大·罗伯茨 , 约翰·奥弗林顿 , 丹尼尔·多明 :
史无前例的大规模激酶抑制剂组能够准确预测复合激酶活性:一种通过设计实现选择性错配的方法? 化学杂志。 信息模型。 56 ( 9 ) : 1654-1675 ( 2016 ) [j13] 艾尔克·B·伦塞林克 , 威廉·杰斯佩斯 , 赫尔曼·W·T·范·弗利杰曼(Herman W.T.van Vlijmen) , 阿德里安·P·伊杰曼 , 杰拉德·J·P·范·韦斯顿 :
与GPCR交互:使用交互指纹进行虚拟筛选。 化学杂志。 信息模型。 56 ( 10 ) : 2053-2060 ( 2016 ) 2015 [公元12年] 伊西德罗·科尔特斯·西里亚诺 , 杰拉德·J·P·范·韦斯顿 , 丹尼尔·穆雷尔 , 艾尔克·B·伦塞林克 , 安德烈亚斯·本德 , 特蕾莎·E·马利亚文 :
蛋白化学计量学的应用——从物种推断到细胞系敏感性建模。 BMC生物信息。 16 ( S-3系列 ) : A4(A4) ( 2015 ) [公元11年] 伊西德罗·科尔特斯·西里亚诺 , 丹尼尔·穆雷尔 , 杰拉德·J·P·范·韦斯顿 , 安德烈亚斯·本德 , 泰瑞斯·马利亚文 :
利用集成蛋白质化学模型预测哺乳动物环氧合酶抑制剂的效力。 化学信息学杂志 7 : 1 ( 2015 ) [公元10年] 丹尼尔·穆雷尔 , 伊西德罗·科尔特斯·西里亚诺 , 杰拉德·J·P·范·韦斯顿 , 伊恩·斯托特 , 安德烈亚斯·本德 , 塞雷斯·马利亚文 , 罗伯特·C·格伦 :
化学感知模型生成器(camb):一个用于小分子特性和生物活性建模的R包。 化学信息学杂志 7 : 45:1-45:10 ( 2015 ) 2014 [公元9年] 伊西德罗·科尔特斯·西里亚诺 , 杰拉德·J·P·范·韦斯顿 , 艾尔克·B·伦塞林克 , 丹尼尔·穆雷尔 , 安德烈亚斯·本德 , 塞雷斯·马利亚文 :
贝叶斯框架中的蛋白质化学建模。 化学信息学杂志 6 ( 1 ) : 35 ( 2014 ) [j8] 乔治·帕帕达托斯 , 杰拉德·J·P·范·韦斯顿 , 塞缪尔·克罗塞特 , 丽塔·桑托斯 , 西蒙·特鲁比安 , 约翰·奥弗林顿 :
在ChEMBL语料库上训练的药物化学出版物的文档分类器。 化学信息学杂志 6 ( 1 ) : 40 ( 2014 ) [j7] 杰拉德·J·P·范·韦斯顿 , 安娜·高顿 , 约翰·奥弗林顿 :
变构调节的化学、靶向和生物活性。 公共科学图书馆计算。 生物。 10 ( 4 ) ( 2014 ) 2013 [j6] 杰拉德·范·韦斯顿 , 雷姆科·F·斯维尔 , 约格·韦格纳 , 阿德里安·P·伊杰曼 , 赫尔曼·W·T·范·弗利杰曼(Herman W.T.van Vlijmen) , 安德烈亚斯·本德 :
蛋白质化学建模中蛋白质描述符集的基准(第1部分):13个氨基酸描述符集的比较研究。 化学信息学杂志 5 : 41 ( 2013 ) [j5] 杰拉德·J·P·范·韦斯顿 , 雷姆科·F·斯维尔 , 伊西德罗·科尔特斯·西里亚诺 , 约格·韦格纳 , 约翰·奥弗林顿 , 阿德里安·P·伊泽曼 , 赫尔曼·W·T·范·弗利杰曼(Herman W.T.van Vlijmen) , 安德烈亚斯·本德 :
蛋白质化学建模中蛋白质描述符集的基准测试(第2部分):13个氨基酸描述符集的建模性能。 化学信息学杂志 5 : 42 ( 2013 ) 【j4】 杰拉德·J·P·范·韦斯顿 , 阿尔文·亨德里克斯 , 约格·韦格纳 , 阿德里安·P·伊杰曼 , 赫尔曼·W·T·范·弗利杰曼(Herman W.T.van Vlijmen) , 安德烈亚斯·本德 :
利用抗病毒谱数据生成的蛋白质化学模型显著提高HIV抑制剂疗效预测。 公共科学图书馆计算。 生物。 9 ( 2 ) ( 2013 ) 2010 [j3] 杰拉德·J·P·范·韦斯顿 , 约格·韦格纳 , 阿德里安·P·伊杰曼 , 赫尔曼·W·T·范·弗利杰曼(Herman W.T.van Vlijmen) , 安德烈亚斯·本德 :
利用支持向量机对新靶点进行分子生物活性外推。 化学信息学杂志 2 ( S-1号机组 ) : 三 ( 2010 ) [注2] 奥拉夫·范登·霍文 , 杰拉德·J·P·范·韦斯顿 , 安德烈亚斯·本德 :
使用蛋白质化学模型预测化合物在4个腺苷受体上的结合类型。 化学信息学杂志 2 ( S-1号机组 ) : 16 ( 2010 )
2000 – 2009
2009 [j1] 穆尼库马尔·多达雷迪 , 杰拉德·J·P·范·韦斯顿 , 埃尔克·范德霍斯特 , 胡里奥·佩罗塞利(Julio E.Peironcely) , 弗兰斯·科尔塔尔斯 , 阿德里安·P·伊杰曼 , 迈克尔·埃默里奇 , 杰里米·詹金斯 , 安德烈亚斯·本德 :
化学组学:从化学的角度看生物学。 统计分析。 数据最小值。 2 ( 三 ) : 149-160 ( 2009 )