詹姆·韦尔塔-塞帕斯
人员信息
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2020年–今天
2023 [公元29年] Ana Hernández广场 , 达米安·什克拉茨克 , 豪尔赫·博塔斯 , 卡洛斯·坎塔拉皮德拉 , 约阿昆·金纳·拉米亚 , 丹尼尔·门德 , 丽贝卡·基尔希 , 托马斯·拉特伊 , Ivica Letunic公司 , 拉尔斯·朱尔·詹森 , 而参与研究的伯克 , 克里斯蒂安·冯·梅林 , 詹姆·韦尔塔-塞帕斯 :
eggNOG 6.0:实现12 535个生物体的比较基因组学。 核酸研究。 51 ( 第1页 ) : 389-394 ( 2023 ) [公元28年] 安东尼·富勒姆 , Ivica Letunic公司 , 托马斯·施密特 , 昆滕·杜卡蒙 , 尼古拉·卡彻 , Supriya Khedkar公司 , 迈克尔库恩 , 马丁·拉拉尔德 , 奥列克桑德·梅斯特里科 , 卢卡斯·马尔弗海纳 , 阿莱西奥·米兰尼斯 , 乔·马蒂亚斯·罗德里格斯 , 克劳迪娅·桑奇斯·洛佩斯 , 克里斯蒂安·舒多马 , 达米安·什克拉茨克 , Sunagawa新一 , 乔治·泽勒 , 詹姆·韦尔塔-塞帕斯 , 克里斯蒂安·冯·梅林 , 而参与研究的伯克 , 丹尼尔·门德 :
原基因组3:接近100万个准确且一致注释的高质量原核基因组。 核酸研究。 51 ( 第1页 ) : 760-766 ( 2023 ) 2022 [公元27年] 豪尔赫·博塔斯 , 阿尔瓦罗·罗德里格斯·德尔·里奥 , 约阿昆·金纳·拉米亚 , 詹姆·韦尔塔-塞帕斯 :
GeCoViz:从功能和进化角度对原核基因的基因组背景可视化。 核酸研究。 50 ( 第1周 ) : 352-357 ( 2022 ) [公元26年] 子棋灯 , 豪尔赫·博塔斯 , 卡洛斯·坎塔拉皮德拉 , Ana Hernández广场 , 乔迪·布尔盖特·卡斯特尔 , 詹姆·韦尔塔-塞帕斯 :
PhyloCloud:一个用于理解系统发育数据的在线平台。 核酸研究。 50 ( 第1周 ) : 577-582 ( 2022 ) 2020 [公元25年] 丹尼尔·门德 , Ivica Letunic公司 , 奥列克桑德·梅斯特里科 , 托马斯·施密特 , 阿莱西奥·米兰尼斯 , 卢卡斯·保利 , Ana Hernández广场 , 阿斯卡贝克N.奥拉科夫 , 索菲亚·福斯伦德 , 胜川信一 , 乔治·泽勒 , 詹姆·韦尔塔-塞帕斯 , 路易斯·佩德罗·科埃略 , 而参与研究的伯克 :
原基因组2:原核基因组准确一致的栖息地、分类和功能注释的改进数据库。 核酸研究。 48 ( 发布数据库 ) : D621-D625型 ( 2020 ) [公元24年] 阿德里安·奥尔登霍夫 , 哈维尔·加雷奥·文塔斯 , 萨尔瓦托尔·科森蒂诺 , 大卫·埃姆斯 , 娜塔莎·M·格洛弗 , Ana Hernández广场 , 亚尼斯·内弗斯 , Vicky Sundesha女士 , 达米安·什克拉茨克 , 何塞·玛丽亚·费尔南德斯 , 莱亚·科多 , 正交测井联盟之旅 , Josep Lluis Gelpí , 詹姆·韦尔塔-塞帕斯 , 岩崎和太郎 , 史蒂文·凯利 , 奥迪尔·勒孔普特 , 马蒂厄·穆法托 , 玛丽亚·耶稣·马丁 , 萨尔瓦多·卡佩拉·古蒂雷兹 , 保罗·D·托马斯 , 埃里克·L·L·桑纳默 , 克里斯托夫·德斯莫斯 :
2020年,Orthologs基准服务和共识呼吁的探索。 核酸研究。 48 ( Web服务器-发布 ) : W538-W545型 ( 2020 )
2010 – 2019
2019 [公元23年] 詹姆·韦尔塔-塞帕斯 , 达米安·什克拉茨克 , 戴维德·海勒 , Ana Hernández广场 , 索菲亚·福斯伦德 , 海伦·库克 , 丹尼尔·门德 , Ivica Letunic公司 , 托马斯·拉特伊 , 拉尔斯·朱尔·延森 , 克里斯蒂安·冯·梅林 , 而参与研究的伯克 :
eggNOG 5.0:一个基于5090种生物和2502种病毒的分级、功能和系统发育注释的直系同源资源。 核酸研究。 47 ( 发布数据库 ) : D309至D314 ( 2019 ) [公元22年] 达米安·什克拉茨克 , 安妮卡·L·盖博 , 大卫·莱昂 , 亚历山大·荣格 , 斯特凡·怀德 , 詹姆·韦尔塔-塞帕斯 , 米兰·西蒙诺维奇 , 纳德扎达·顿切娃(Nadezhda T.Doncheva) , 约翰·莫里斯 , 而参与研究的伯克 , 拉尔斯·朱尔·延森 , 克里斯蒂安·冯·梅林 :
STRING v11:具有更高覆盖率的蛋白质-蛋白质关联网络,支持全基因组实验数据集的功能发现。 核酸研究。 47 ( 发布数据库 ) : D607-D613型 ( 2019 ) 2018 [公元21年] 克里斯托弗·福斯伦德 , 塞西尔·佩雷拉 , 萨尔瓦多·卡佩拉·古蒂雷兹 , 阿兰·苏萨·达席尔瓦 , 阿德里安·奥尔登霍夫 , 詹姆·韦尔塔-塞帕斯 , 马蒂厄·穆法托 , 马特乌斯·帕特里西奥 , 克拉斯·范德佩莱 , 英戈·埃伯斯伯格 , 朱迪思·布莱克 , 杰苏亚尔多·托马斯·费尔南德斯·布雷斯 , 正交测井联盟之旅 , 布里吉特·博克曼 , 托尼·加巴顿 , 埃里克·L·L·桑纳默 , 克里斯托夫·德斯莫斯 , 苏珊娜·刘易斯 :
在寻找直系木的过程中,准备好处理生命的马赛克性质。 生物信息。 34 ( 2 ) : 323-329 ( 2018 ) 2017 [j20] 丹尼尔·门德 , Ivica Letunic公司 , 詹姆·韦尔塔-塞帕斯 , 西蒙·S·李 , 克里斯托弗·福斯伦德 , 胜川信一 , 而参与研究的伯克 :
原基因组:对原核基因组进行一致的功能和分类注释的资源。 核酸研究。 45 ( 发布数据库 ) : D529至D534 ( 2017 ) 2016 [公元19年] 帕特里斯·巴·普约莱 , 尼古拉斯·帕里索 , 杰拉德2月 , 詹姆·韦尔塔-塞帕斯 , 奥古斯托·维洛佐 , 托尼·加巴顿 , 费德里卡·卡列夫罗 , 休伯特·查尔斯 , 斯特凡诺·科尔拉 :
节肢动物Cyc:CycADS支持的BioCyc数据库集合,用于分析和比较节肢动物的代谢。 数据库J.Biol。 数据库管理 2016 ( 2016 ) [公元18年] Jens Roat Kultima公司 , 路易斯·佩德罗·科埃略 , 克里斯托弗·福斯伦德 , 詹姆·韦尔塔-塞帕斯 , 西蒙·S·李 , 玛丽亚·德里森 , 安妮塔·伊冯·沃伊格特 , 乔治·泽勒 , 胜川信一 , 而参与研究的伯克 :
MOCAT2:一个宏基因组组装、注释和分析框架。 生物信息。 32 ( 16 ) : 2520-2523 ( 2016 ) [公元17年] 詹姆·韦尔塔-塞帕斯 , 达米安·什克拉茨克 , 克里斯托弗·福斯伦德 , 海伦·库克 , 戴维德·海勒 , 马蒂亚斯·沃尔特 , 托马斯·拉特伊 , 丹尼尔·门德 , 胜川信一 , 迈克尔库恩 , 拉尔斯·朱尔·延森 , 克里斯蒂安·冯·梅林 , 而参与研究的伯克 :
eggNOG 4.5:一个改进了真核、原核生物和病毒序列功能注释的层次结构正形框架。 核酸研究。 44 ( 发布数据库 ) : 286-293 ( 2016 ) 2015 [公元16年] 达米安·什克拉茨克 , 安德烈亚·弗朗西斯科尼 , 斯特凡·怀德 , 克里斯托弗·福斯伦德 , 戴维德·海勒 , 詹姆·韦尔塔-塞帕斯 , 米兰·西蒙诺维奇 , 亚历山大·罗斯 , 阿尔贝托·桑托斯 , Kalliopi Tsafou公司 , 迈克尔库恩 , 而参与研究的伯克 , 拉尔斯·朱尔·延森 , 克里斯蒂安·冯·梅林 :
STRING v10:蛋白质相互作用网络,集成在生命树上。 核酸研究。 43 ( 发布数据库 ) : 447-452 ( 2015 ) [公元15年] 巴勃罗·明格斯 , Ivica Letunic公司 , 卢卡·帕尔卡 , Luz Garcia-Alonso公司 , 约阿金·多帕佐 , 詹姆·韦尔塔-塞帕斯 , 而参与研究的伯克 :
PTM编码v2:蛋白质内部和之间翻译后修饰功能关联的资源。 核酸研究。 43 ( 发布数据库 ) : 494-502 ( 2015 ) 2014 [公元14年] 肖恩·鲍威尔 , 克里斯托弗·福斯伦德 , 达米安·什克拉奇克 , Kalliopi Trachana公司 , 亚历山大·罗斯 , 詹姆·韦尔塔-塞帕斯 , 托尼·加巴顿 , 托马斯·拉特伊 , 克里斯托弗·克里维 , 迈克尔库恩 , 拉尔斯·朱尔·延森 , 克里斯蒂安·冯·梅林 , 而参与研究的伯克 :
eggNOG v4.0:3686种生物的嵌套正形推断。 核酸研究。 42 ( 发布数据库 ) : 231-239 ( 2014 ) [j13] 詹姆·韦尔塔-塞帕斯 , 萨尔瓦多·卡佩拉·古蒂雷兹 , 莱斯泽克·P·普雷斯兹茨(Leszek P.Pryszcz) , 玛丽娜·马塞特·胡本 , 托尼·加巴顿 :
PhylomeDB v4:放大基因组的多种进化历史。 核酸研究。 42 ( 发布数据库 ) : 897-902 ( 2014 ) 2011 [公元12年] 詹姆·韦尔塔-塞帕斯 , 约阿金·多帕佐 , Martijn A.Huynen公司 , 托尼·加巴顿 :
基因复制后组织特异性表达的短期差异和长期保存的证据。 生物信息简报。 12 ( 5 ) : 442-448 ( 2011 ) [公元11年] 奥古斯托·维洛佐 , Amélie S.Véron公司 , 帕特里斯·巴·普约莱 , 詹姆·韦尔塔-塞帕斯 , 卢多维克·科特雷特 , 杰拉德2月 , 费德里卡·卡列夫罗 , 伊万·拉赫贝 , 安吉拉·道格拉斯 , 托尼·加巴顿 , 玛丽-法国Sagot , 休伯特·查尔斯 , 斯特凡诺·科尔拉 :
CycADS:一个注释数据库系统,用于简化BioCyc数据库的开发和更新。 数据库J.Biol。 数据库管理 2011 ( 2011 ) [公元10年] 詹姆·韦尔塔-塞帕斯 , 托尼·加巴顿 :
在全基因组研究中,将重复事件分配到相对时间尺度。 生物信息。 27 ( 1 ) : 38-45 ( 2011 ) [公元9年] 詹姆·韦尔塔-塞帕斯 , 萨尔瓦多·卡佩拉·古蒂雷兹 , 莱斯泽克·P·普雷斯兹茨(Leszek P.Pryszcz) , 伊万·安德列维奇·杰尼索夫 , 迭戈·科姆斯 , 玛丽娜·马塞特·胡本 , 托尼·加巴顿 :
PhylomeDB v3.0:一个扩展的全基因组树木、比对和基于系统发育的同源性和寄生虫学预测集合库。 核酸研究。 39 ( 发布数据库 ) : 556-560 ( 2011 ) [j8] 鲁宾·桑切斯 , 弗朗索瓦·塞拉 , 约阿金·塔拉加 , 伊格纳西奥·麦地那 , 何塞·卡博内尔 , 路易斯·普利多 , 亚历杭德罗·德·玛丽亚 , 萨尔瓦多·卡佩拉·古蒂雷兹 , 詹姆·韦尔塔-塞帕斯 , 托尼·加巴顿 , 约阿金·多帕佐 , 埃尔南·多帕佐 :
Phylemon 2.0:一套用于分子进化、系统发育学、系统发育学和假设测试的网络工具。 核酸研究。 39 ( Web服务器问题 ) : 470-474 ( 2011 ) 2010 [j7] 詹姆·韦尔塔-塞帕斯 , 约阿金·多帕佐 , 托尼·加巴顿 :
ETE:用于树探索的python环境。 BMC生物信息。 11 : 24 ( 2010 )
2000 – 2009
2009 【c1】 马特乌斯·帕特里西奥 , 詹姆·韦尔塔-塞帕斯 , 托尼·加巴顿 , 拉斐尔·扎尔多亚 , 大卫·波萨达 :
遗传密码的自动预测。 IWANN(2) 2009 : 1125-1129 2008 [j6] 詹姆·韦尔塔-塞帕斯 , 阿尼巴尔·布埃诺 , 约阿金·多帕佐 , 托尼·加巴顿 :
系统发育数据库:一个全基因组的基因系统发育数据库。 核酸研究。 36 ( 发布数据库 ) : 491-496 ( 2008 ) [j5] 若阿金·塔拉加 , 伊格纳西奥·麦地那 , 何塞·卡博内尔 , 詹姆·韦尔塔-塞帕斯 , 巴勃罗·明格斯 , 伊娃·阿洛扎 , 法蒂玛·阿尔·沙鲁尔 , 苏珊娜·维盖斯·阿扎拉特 , 斯特凡·戈茨 , 帕布洛·艾斯科巴 , 弗朗西斯科·加西亚 , 安娜·科内萨 , 大卫·蒙塔纳 , 若阿金·多帕佐 :
GEPAS是一种基于网络的微阵列数据分析和解释工具。 核酸研究。 36 ( Web服务器问题 ) : 308-314 ( 2008 ) 2007 [j4] 法蒂玛·阿尔·沙鲁尔 , 莱昂纳多·阿尔比萨 , 埃尔南·多帕佐 , 詹姆·韦尔塔-塞帕斯 , 巴勃罗·明格斯 , 大卫·蒙塔纳 , 约阿金·多帕佐 :
从基因到生物系统研究中的功能类。 BMC生物信息。 8 ( 2007 ) [j3] 阿加莎·施吕特 , 圣埃芬·福卡德(Stéphane Fourcade) , 恩里克·多梅内奇·埃斯特韦斯 , 托尼·加巴顿 , 詹姆·韦尔塔-塞帕斯 , 纪尧姆·贝索米尔 , 雷蒙德·里普 , 罗纳德·J·A·流浪者 , Olivier Poch公司 , 奥罗拉·普约尔 :
过氧化物酶体数据库:过氧化物酶体蛋白质组、功能基因组学和疾病的数据库。 核酸研究。 35 ( 发布数据库 ) : 815-822 ( 2007 ) [注2] 约阿金·塔拉加 , 伊格纳西奥·麦地那 , 莱昂纳多·阿尔比萨 , 詹姆·韦尔塔-塞帕斯 , 托尼·加巴顿 , 约阿金·多帕佐 , 埃尔南·多帕佐 :
Phylemon:一套用于分子进化、系统发育学和系统发育学的网络工具。 核酸研究。 35 ( Web服务器问题 ) : 38-42 ( 2007 ) 2006 [j1] 大卫·蒙塔纳 , 约阿金·塔拉加 , 詹姆·韦尔塔-塞帕斯 , 乔迪·布尔盖特·卡斯特尔 , 胡安·瓦奎里萨斯 , 露西娅·康德 , 巴勃罗·明格斯 , 哈维尔·维拉 , 萨克·穆克吉 , 琼·瓦尔斯 , 米格尔·A·G·普贾纳 , 伊娃·阿洛扎 , 哈维尔·埃雷罗 , 法蒂玛·阿尔·沙鲁尔 , 约阿金·多帕佐 :
微阵列数据分析的下一站:GEPAS。 核酸研究。 34 ( Web服务器问题 ) : 486-491 ( 2006 )