大卫·S·古德塞尔
人员信息
附属: 斯克里普斯研究所,美国加利福尼亚州拉荷亚
优化列表
2020年–今天
2024 [j35] 大卫·S·古德塞尔 , 舒奇米塔·杜塔 , 布莱恩·哈德森 , 玛丽亚·沃伊格特 , 史蒂芬·K·伯里 , 克里斯汀·扎尔德基 :
用于外展和教育的生物结构折叠纸模型。 模式 5 ( 2 ) : 100931 ( 2024 ) 2023 [公元34年] 劳拉·加里森 , 大卫·S·古德塞尔 , 斯特凡·布鲁克纳 :
生物分子图形中的变化美学。 IEEE计算机图形和应用 43 ( 三 ) : 94-101 ( 2023 ) [公元33年] 史蒂芬·K·伯里 , 查米·比卡迪亚 , 春晓碧 , 塞巴斯蒂安·比特里奇 , 亨利·赵 , 李晨 , 保罗·克雷格 , Gregg V.克里奇洛 , 肯尼思·戴伦伯格 , 何塞·M·杜阿尔特 , 舒奇米塔·杜塔 , 玛丽亚姆·法亚齐 , 祖康峰 , 贾斯汀·弗拉特 , 赛加尼桑 , 苏塔帕·戈什 , 大卫·S·古德塞尔 , 雷切尔·克莱默·格林 , 弗拉基米尔·古拉诺维奇 , 杰里米·亨利 , 布莱恩·哈德森 , 伊戈尔·科赫里亚科夫 , 凯瑟琳·劳森 , 梁玉禾 , 罗伯特·洛 , 埃兹拉·佩萨赫 , 伊琳娜·佩西科娃 , 丹尼斯·W·皮尔 , 亚纳玫瑰 , 安德烈·萨利 , 琼·塞古拉 , 莫妮卡·塞哈兰 , 邵成华 , 布林达·瓦拉特 , 玛丽亚·沃伊格特 , 本·M·韦伯 , 约翰·韦斯特布鲁克 , 沙马拉磨石 , 茉莉花 , 亚瑟·O·扎列夫斯基 , 克里斯汀·扎尔德基 :
RCSB蛋白质数据库(RCSB.org):提供实验确定的PDB结构以及来自人工智能/机器学习的100万个蛋白质计算结构模型。 核酸研究。 51 ( 第1页 ) : 488-508 ( 2023 ) 2022 [公元32年] 大卫·S·古德塞尔 :
JCVI-syn3A最小单元的集成图示。 J.整合。 生物信息。 19 ( 2 ) ( 2022 ) 2021 [公元31年] 亚当·加德纳 , 卢多维克·奥廷 , 丹尼尔·富恩特斯 , 玛蒂娜·马里坦 , 本杰明·巴拉德 , 迈克拉·麦地那 , 亚瑟·J·奥尔森 , 丹妮尔·格罗特扬 , 大卫·S·古德塞尔 :
CellPAINT:分子细胞生物学的交钥匙插图。 边境生物信息。 1 ( 2021 ) 【j30】 史蒂芬·K·伯里 , 查米·比卡迪亚 , 春晓碧 , 塞巴斯蒂安·比特里奇 , 李晨 , Gregg V.克里奇洛 , 科尔·H·克里斯蒂 , 肯尼思·戴伦伯格 , 路易吉·迪·科斯坦佐 , 何塞·M·杜阿尔特 , 舒奇米塔·杜塔 , 祖康峰 , 赛加尼桑 , 大卫·S·古德塞尔 , 苏塔帕·戈什 , 雷切尔·克莱默·格林 , 弗拉基米尔·古拉诺维奇 , 德米特罗·古赞科 , 布莱恩·哈德森 , 凯瑟琳·劳森 , 梁玉禾 , 罗伯特·洛 , 哈里·南孔 , 埃兹拉·佩萨赫 , 伊琳娜·佩西科娃 , 克里斯托弗·兰德尔 , 亚历山大·罗斯 , 亚纳玫瑰 , 安德烈·萨利 , 琼·塞古拉 , 莫妮卡·塞哈兰 , 邵成华 , 伊平涛 , 玛丽亚·沃伊格特 , 约翰·韦斯特布鲁克 , 茉莉花 , 克里斯汀·扎尔德基 , 玛丽娜·朱拉夫列娃 :
RCSB蛋白质数据库:用于探索生物大分子三维结构的强大新工具,用于基础生物学、生物医学、生物技术、生物工程和能源科学的基础和应用研究和教育。 核酸研究。 49 ( 发布数据库 ) : D437-D451号 ( 2021 ) [公元29年] Ngan V.T.阮 , Ondrej街 , 托比亚斯·克莱恩 , 邓罗 , 鲁韦达·阿尔哈比 , 彼得·旺卡 , 玛蒂娜·玛丽坦 , 彼得·明德克 , 卢多维克·奥廷 , 大卫·S·古德塞尔 , 伊凡·维奥拉 :
新冠肺炎期间的建模:统计和基于规则的中尺度模型。 IEEE传输。 视觉。 计算。 图表。 27 ( 2 ) : 722-732 ( 2021 ) 2020 [公元28年] 祖康峰 , 娜塔莉·威尔迪格尔 , 路易吉·迪·科斯坦佐 , 大卫·S·古德塞尔 , 约翰·韦斯特布鲁克 , 史蒂芬·K·伯里 , 克里斯汀·扎尔德基 :
蛋白质数据库对科学学科的影响。 数据科学。 J。 19 : 25 ( 2020 ) 【c7】 卢多维克·奥廷 , 玛蒂娜·马里坦 , 布雷特·巴巴拉 , 亚当·加德纳 , 亚瑟·J·奥尔森 , 米歇尔·桑纳 , 大卫·S·古德塞尔 :
中尺度仪:一种基于网络的中尺度数据集成和处理工具。 MolVa@Eurographics公司 /欧洲签证 2020 : 23-31
2010 – 2019
2019 [公元27年] 尼古拉斯·沃尔丁 , 曼纽拉·瓦尔德纳 , 马修·勒·穆齐克 , M.Eduard Gröller先生 , 大卫·S·古德塞尔 , 卢多维克·奥廷 , 亚瑟·J·奥尔森 , 伊凡·维奥拉 :
墨鱼:动态多尺度可视化的颜色映射。 计算。 图表。 论坛 38 ( 6 ) : 150-164 ( 2019 ) [公元26年] 托比亚斯·克莱因 , 彼得·明德克 , 卢多维克·奥廷 , 大卫·S·古德塞尔 , 亚瑟·J·奥尔森 , 爱德华·格罗勒先生 , 伊万·维奥拉 :
细菌基因组结构的并行生成和可视化。 计算。 图表。 论坛 38 ( 7 ) : 57-68 ( 2019 ) [公元25年] 史蒂芬·K·伯里 , 海伦·M·伯曼 , 查米·比卡迪亚 , 春晓碧 , 李晨 , 路易吉·迪·科斯坦佐 , 科尔·H·克里斯蒂 , 肯尼思·戴伦伯格 , 何塞·M·杜阿尔特 , 舒奇米塔·杜塔 , 祖康峰 , 苏塔帕·戈什 , 大卫·S·古德塞尔 , 雷切尔·克莱默·格林 , 弗拉基米尔·古拉诺维奇 , 德米特罗·古赞科 , 布莱恩·哈德森 , 塔拉·卡尔罗 , 梁玉禾 , 罗伯特·洛 , 哈里·南孔 , 埃兹拉·佩萨赫 , 伊琳娜·佩里斯科娃 , 安德烈亚斯·普里奇 , 克里斯托弗·兰德尔 , 亚历山大·罗斯 , 彼得·罗斯 , 劳尔·萨拉 , 莫妮卡·塞哈兰 , 邵成华 , 李华坦 , 伊平涛 , 亚娜·瓦拉萨塔娃 , 玛丽亚·沃伊格特 , 约翰·韦斯特布鲁克 , 杰西·吴 , 杨焕旺 , 茉莉花 , 玛丽娜·朱拉夫列娃 , 克里斯汀·扎尔德基 :
RCSB蛋白质数据库:支持基础生物学、生物医学、生物技术和能源研究和教育的生物大分子结构。 核酸研究。 47 ( 发布数据库 ) : D464-D474号 ( 2019 ) [公元24年] 大卫·S·古德塞尔 , 安德鲁·杰维特 , 亚瑟·J·奥尔森 , 斯特凡诺·福尔利 :
HIV-1核糖核蛋白复合物的集成建模。 公共科学图书馆计算。 生物。 15 ( 6 ) ( 2019 ) [公元23年] 大卫·S·古德塞尔 :
细胞中尺度的对称性。 对称 11 ( 9 ) : 1170 ( 2019 ) [公元22年] 大卫·库里尔 , 拉迪斯拉夫·科莫利克 , 巴博拉·科兹利科娃 , 吴湘云 , 格雷厄姆·约翰逊 , 大卫·S·古德塞尔 , 阿瑟·J·奥尔森 , M.Eduard Gröller先生 , 伊凡·维奥拉 :
水平标签:多尺度多实体和拥挤三维生物环境的标签。 IEEE传输。 视觉。 计算。 图表。 25 ( 1 ) : 977-986 ( 2019 ) 2018 [公元21年] 亚当·加德纳 , 卢多维克·奥廷 , 布雷特·巴巴拉 , 亚瑟·J·奥尔森 , 大卫·S·古德塞尔 :
CellPAINT:动态中尺度细胞环境的交互式图解。 IEEE计算机图形和应用 38 ( 6 ) : 51-66 ( 2018 ) [公元20年] 托比亚斯·克莱恩 , 卢多维克·奥廷 , 巴博拉·科兹利科娃 , 大卫·S·古德塞尔 , 亚瑟·J·奥尔森 , M.Eduard Gröller先生 , 伊凡·维奥拉 :
拥挤生物环境的即时构建和可视化。 IEEE传输。 视觉。 计算。 图表。 24 ( 1 ) : 862-872 ( 2018 ) 2017 [公元19年] 彼得·罗斯 , 安德烈亚斯·普里奇 , 阿里·阿尔图卡亚 , 春晓碧 , 安东尼·布拉德利 , 科尔·H·克里斯蒂 , 路易吉·迪·科斯坦佐 , 何塞·M·杜阿尔特 , 舒奇米塔·杜塔 , 祖康峰 , 雷切尔·克莱默·格林 , 大卫·S·古德塞尔 , 布莱恩·哈德森 , 塔拉·卡尔罗 , 罗伯特·洛 , 埃兹拉·佩萨赫 , 克里斯托弗·兰德尔 , 亚历山大·罗斯 , 邵成华 , 伊平涛 , 亚娜·瓦拉萨塔娃 , 玛丽亚·沃伊格特 , 约翰·韦斯特布鲁克 , 杰西·吴 , 杨焕旺 , 茉莉花 , 克里斯汀·扎尔德基 , 海伦·M·伯曼 , 史蒂芬·K·伯里 :
RCSB蛋白质数据库:蛋白质、基因和3D结构信息的综合视图。 核酸研究。 45 ( 发布数据库 ) : 第271页至第281页 ( 2017 ) 2016 [公元18年] 马修·勒·穆齐克 , 彼得·明德克 , 约翰内斯·索格 , 卢多维克·奥廷 , 大卫·S·古德塞尔 , 伊凡·维奥拉 :
介观生物模型的可见度均衡器剖切可视化。 计算。 图表。 论坛 35 ( 三 ) : 161-170 ( 2016 ) [公元17年] 理查德·贝勒 , 斯特凡诺·福尔利 , 大卫·S·古德塞尔 , T·J·奥唐纳 , 亚瑟·J·奥尔森 :
基于片段的配体对接分析改进了活性物质的分类。 化学杂志。 信息模型。 56 ( 8 ) : 1597-1607 ( 2016 ) 【c6】 尼古拉斯·沃尔丁 , 马修·勒·穆齐克 , 曼纽拉·瓦尔德纳 , M.Eduard Gröller先生 , 大卫·S·古德塞尔 , 卢多维克·奥廷 , 伊凡·维奥拉 :
变色龙-多尺度结构生物学模型的动态颜色映射。 VCBM/MedViz公司 2016 : 11-20 2015 [公元16年] 彼得·罗斯 , 安德烈亚斯·普里奇 , 春晓碧 , 沃尔夫冈·布卢姆 , 科尔·H·克里斯蒂 , 舒奇米塔·杜塔 , 雷切尔·克莱默·格林 , 大卫·S·古德塞尔 , 约翰·韦斯特布鲁克 , 杰西·吴 , 茉莉花 , 克里斯汀·扎尔德基 , 海伦·M·伯曼 , 菲利普·伯恩 , 史蒂芬·K·伯里 :
RCSB蛋白质数据库:基础和应用研究及教育的结构生物学观点。 核酸研究。 43 ( 发布数据库 ) : 345-356 ( 2015 ) [公元15年] Pradeep Anand Ravindranath公司 , 斯特凡诺·福尔利 , 大卫·S·古德塞尔 , 亚瑟·J·奥尔森 , 米歇尔·桑纳 :
自动停靠FR :具有明确指定结合位点灵活性的蛋白质-配体对接进展。 公共科学图书馆计算。 生物。 11 ( 12 ) ( 2015 ) 2013 [公元14年] 彼得·罗斯 , 春晓碧 , 沃尔夫冈·布卢姆 , 科尔·H·克里斯蒂 , 迪米特里斯·迪米特罗普洛斯 , 舒奇米塔·杜塔 , 雷切尔·克莱默·格林 , 大卫·S·古德塞尔 , 安德烈亚斯·普里奇 , 玛莎·奎萨达 , 格雷格·奎因 , 亚历山大·拉莫斯 , 约翰·韦斯特布鲁克 , 茉莉花 , 克里斯汀·扎尔德基 , 海伦·M·伯曼 , 菲利普·伯恩 :
RCSB蛋白质数据库:研究和教育的新资源。 核酸研究。 41 ( 发布数据库 ) : 475-482 ( 2013 ) 2012 [j13] 桑德罗·科斯科纳蒂 , 卢西亚娜·马里内利 , 弗朗西斯科·萨维里奥·迪莱瓦 , 瓦莱丽亚·拉皮埃特拉 , 安吉拉·德西蒙 , 弗朗西斯卡·曼奇尼 , 文森萨·安德里萨诺 , 埃托雷·诺维利诺 , 大卫·S·古德塞尔 , 亚瑟·J·奥尔森 :
虚拟筛选中的蛋白质灵活性:BACE-1案例研究。 化学杂志。 信息模型。 52 ( 10 ) : 2697-2704 ( 2012 ) 2011 [公元12年] 彼得·罗斯 , 博扬·贝兰 , 春晓碧 , 沃尔夫冈·布卢姆 , 迪米特里斯·迪米特罗普洛斯 , 大卫·S·古德塞尔 , 安德烈亚斯·普里奇 , 玛莎·奎萨达 , 格雷格·奎因 , 约翰·韦斯特布鲁克 , 茉莉花 , 本杰明·尤基奇 , 克里斯汀·扎尔德基 , 海伦·M·伯曼 , 菲利普·E·伯恩 :
RCSB蛋白质数据库:重新设计网站和web服务。 核酸研究。 39 ( 发布数据库 ) : 392-401 ( 2011 )
2000 – 2009
2009 [公元11年] 加勒特·M·莫里斯 , 露丝·休伊 , 威廉·林德斯特罗姆 , 米歇尔·桑纳 , 理查德·贝勒 , 大卫·S·古德塞尔 , 亚瑟·J·奥尔森 :
AutoDock4和AutoDockTools4:具有选择性受体灵活性的自动对接。 J.计算。 化学。 30 ( 16 ) : 2785-2791 ( 2009 ) 2008 [j10] Max W.Chang(马克斯·W·张) , 理查德·贝勒 , 凯特·S·卡罗尔 , 亚瑟·J·奥尔森 , 大卫·S·古德塞尔 :
计算对接中的经验熵贡献:APS还原酶复合物的评估。 J.计算。 化学。 29 ( 11 ) : 1753-1761 ( 2008 ) 2007 [公元9年] 露丝·休伊 , 加勒特·M·莫里斯 , 亚瑟·J·奥尔森 , 大卫·S·古德塞尔 :
基于电荷脱溶的半经验自由能力场。 J.计算。 化学。 28 ( 6 ) : 1145-1152 ( 2007 ) 2004 【c5】 亚历山大·吉列 , 苏珊·韦格霍斯特 , 威廉·温恩 , 丹尼尔·斯托夫勒 , 米歇尔·桑纳 , 大卫·S·古德塞尔 , 亚瑟·J·奥尔森 :
用于结构生物学教学的计算机连接自动构建3D模型。 SIGGRAPH草图 2004 : 28 【c4】 亚历山大·吉列 , 米歇尔·桑纳 , 丹尼尔·斯托夫勒 , 大卫·S·古德塞尔 , 阿瑟·J·奥尔森 :
用于分子生物学应用的具有有形自动构建模型的增强现实。 可视化大会 2004 : 235-242 2003 [j8] 彭阳 , 保罗·克雷格 , 大卫·S·古德塞尔 , 菲利普·伯恩 :
BioEditor-简化高分子结构注释。 生物信息。 19 ( 7 ) : 897-898 ( 2003 ) [j7] 罗宾·罗森菲尔德 , 大卫·S·古德塞尔 , 拉比·A·穆萨 , 加勒特·M·莫里斯 , 大卫·B·古丁 , 亚瑟·J·奥尔森 :
配体与人工活性位点的自动对接:利用计算机建模增强晶体分析。 J.计算。 辅助分子设计。 17 ( 8 ) : 525-536 ( 2003 )
1990 – 1999
1999 【c3】 特蕾莎·拉森 , 大卫·S·古德塞尔 , 德鲁·克拉克 , 欧内斯特·斯图尔特 :
HIV建模。 SIGGRAPH摘要和应用 1999 : 256 [第1页] 大卫·S·古德塞尔 :
分子生物学中原子与连续表征。 视觉表现和解释 1999 : 146-155 1998 [j6] 克里斯托弗·罗辛 , 理查德·K·贝劳 , 加勒特·M·莫里斯 , 亚瑟·J·奥尔森 , 大卫·S·古德塞尔 :
抗病毒药物耐药性的计算协同进化。 Artif公司。 生命 4 ( 1 ) : 41-59 ( 1998 ) [j5] 韦恩·L·沃克 , 玛丽·科普卡 , 理查德·迪克森 , 大卫·S·古德塞尔 :
用可变原子模拟退火方法设计钉合DNA-小沟槽结合分子。 J.计算。 辅助分子设计。 12 ( 6 ) : 539-546 ( 1998 ) 【j4】 韦恩·L·沃克 , 大卫·S·古德塞尔 , 埃利奥特·兰道 :
一类DNA序列阅读分子的分析。 J.计算。 生物。 5 ( 三 ) : 571-583 ( 1998 ) [j3] 加勒特·M·莫里斯 , 大卫·S·古德塞尔 , 罗伯特·S·哈利迪 , 露丝·休伊 , 威廉·哈特 , 理查德·贝勒 , 亚瑟·J·奥尔森 :
使用拉马克遗传算法和经验结合自由能函数实现自动对接。 J.计算。 化学。 19 ( 14 ) : 1639-1662 ( 1998 ) 【c2】 韦恩·L·沃克 , 大卫·S·古德塞尔 , 埃利奥特·兰道 :
聚酰胺DNA序列鉴别的理论极限。 重组 1998 : 270-275 1997 [注2] 韦恩·L·沃克 , 玛丽·科普卡 , 理查德·迪克森 , 大卫·S·古德塞尔 :
用可变原子模拟退火方法设计钉合DNA-小沟槽结合分子。 J.计算。 辅助分子设计。 11 ( 6 ) : 539-546 ( 1997 ) 1996 [j1] 加勒特·M·莫里斯 , 大卫·S·古德塞尔 , 露丝·休伊 , 阿瑟·J·奥尔森 :
柔性配体与蛋白质的分布式自动对接:AutoDock 2.4的并行应用。 J.计算。 辅助分子设计。 10 ( 4 ) : 293-304 ( 1996 )
1980 – 1989
1989 【c1】 大卫·S·古德塞尔 , 亚瑟·J·奥尔森 :
体绘制和三维纹理贴图的分子应用。 VVS公司 1989 : 27-31