索菲亚·佐卡
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2020年–今天
2024 [公元23年] 李宇通 , 乔纳森·卡多索·西尔瓦 , 约翰·凯利 , 迈克尔·德尔夫斯 , 尼古拉斯·弗纳姆 , 拉扎罗斯·G·帕帕乔治奥 , 索菲亚·佐卡 :
疟疾中可解释铅发现的优化模型。 Artif公司。 智力。 医学 147 : 102700 ( 2024 ) 2023 [公元22年] E.阿米里·苏里 , A.切诺维思 , S.N.卡拉吉安尼 , 索菲亚·佐卡 :
通过图嵌入实现药物的再利用和多种相互作用类型的预测。 BMC生物信息。 24 ( 1 ) : 202 ( 2023 ) [i2] 佩德罗·恩里克·达科斯塔·艾夫拉尔 , 吴敏(音) , 索菲亚·佐卡 :
通过路径活动自动编码器将先验知识纳入深度学习模型。 CoRR公司 abs/2306.05813 ( 2023 ) 2022 [公元21年] E.阿米里·苏里 , 罗曼·拉达克 , S.N.卡拉吉安尼 , 拉扎罗斯·G·帕帕乔治奥 , 索菲亚·佐卡 :
通过链接预测和网络嵌入实现新型药物-靶点相互作用。 BMC生物信息。 23 ( 1 ) : 121 ( 2022 ) 【c5】 李宇通 , 徐晓瑞 , 索菲亚·佐卡 :
一种基于矩阵分解的SARS-CoV-2药物优先级的药物-病毒链预测方法。 检测限(1) 2022 : 35-47 【c4】 佩德罗·恩里克·达科斯塔·艾夫拉尔 , 罗马阶梯 , 索菲亚·卡拉吉安尼斯 , 吴敏(音) , 索菲亚·佐卡 :
通过监督混凝土自动编码器实现基于生存的患者分层的多组数据集成和特征选择。 检测限(2) 2022 : 47-61 [i1] 佩德罗·恩里克·达科斯塔·艾夫拉尔 , 罗曼·拉达克 , 索菲亚·卡拉吉安尼斯 , 吴敏(音) , 索菲亚·佐卡 :
通过受监控的混凝土自动编码器实现基于存活率的患者分层的多目标数据集成和特征选择。 CoRR公司 abs/2206.10699 ( 2022 ) 2020 【c3】 陈永南 , 康斯坦蒂诺斯·西奥菲拉托斯 , 拉扎罗斯·G·帕帕乔治奥 , 索菲亚·佐卡 :
通过数学规划优化模型DIGS识别缺血性中风预测的重要生物途径。 ICBBT公司 2020 : 25-31
2010 – 2019
2019 [公元20年] 乔纳森·卡多索·西尔瓦 , 拉扎罗斯·G·帕帕乔治奥 , 索菲亚·佐卡 :
用于QSAR建模的基于网络的分段线性回归。 J.计算。 辅助分子设计。 33 ( 9 ) : 831-844 ( 2019 ) 2018 [公元19年] 塞缪尔·尼维斯 , 索菲亚·佐卡 , 路易丝·米勒德 :
Reactome Pengine:智人反应时间的网络逻辑API。 生物信息。 34 ( 16 ) : 2856-2858 ( 2018 ) 2017 [公元18年] 杨凌剑 , 刘松松(Songsong Liu) , 索菲亚·佐卡 , 拉扎罗斯·G·帕帕乔治奥 :
使用数学编程的回归树方法。 专家系统。 申请。 78 : 347-357 ( 2017 ) 2016 [公元17年] 杨凌剑 , 乔纳森·卡多索·西尔瓦 , 拉扎罗斯·G·帕帕乔治奥 , 索菲亚·佐卡 :
通过模块化优化的定向网络社区结构检测。 算法 9 ( 4 ) : 73 ( 2016 ) [公元16年] 亚里士多德利斯·基塔斯 , 劳拉-班尼特 , 亨宁·赫姆贾科布 , 索菲亚·佐卡 :
使用图论方法的Reactome人类BioPAX模型的组织原理。 J.复杂网络 4 ( 4 ) : 604-615 ( 2016 ) [公元15年] 杨凌剑 , 刘松松(Songsong Liu) , 索菲亚·佐卡 , 拉扎罗斯·G·帕帕乔治奥 :
分段线性回归分析的数学规划。 专家系统。 申请。 44 : 156-167 ( 2016 ) 2015 [公元14年] 亚里士多德利斯·基塔斯 , 阿梅利·巴罗泽特 , 叶卡捷琳娜·塞雷什蒂 , 尼尔斯·格拉贝 , 索菲亚·佐卡 :
CytoASP:用于生物网络中定性一致性推理、预测和修复的Cytoscape应用程序。 BMC系统。 生物。 9 : 34 ( 2015 ) [j13] 杨凌剑 , 刘松松(Songsong Liu) , 索菲亚·佐卡 , 拉扎罗斯·G·帕帕乔治奥 :
样本重加权超盒分类器用于多类数据分类。 计算。 工业工程师。 85 : 44-56 ( 2015 ) [公元12年] 费高 , 波兰钢琴家穆夏勒 , 科林·库珀 , 索菲亚·佐卡 :
不同社交网络和网络度量的链接预测方法及其准确性。 科学。 程序。 2015 : 172879:1-172879:13 ( 2015 ) 【c2】 塞缪尔·尼维斯 , 路易丝·A·C·米勒德 , 索菲亚·佐卡 :
使用ILP识别系统生物学中的通路激活模式。 ILP公司 2015 : 137-151 2014 [公元11年] 杨凌剑 , Chrysanthi Ainali公司 , 索菲亚·佐卡 , 拉扎罗斯·G·帕帕乔治奥 :
通过数学规划优化框架进行多类疾病分类的路径活动推理。 BMC生物信息。 15 : 390 ( 2014 ) 2012 [公元10年] 劳拉-班尼特 , 刘松松(Songsong Liu) , 拉扎罗斯·G·帕帕乔治奥 , 索菲亚·佐卡 :
加权复杂网络中不相交和重叠模的检测。 高级复杂系统。 15 ( 5 ) ( 2012 ) 【c1】 劳拉-班尼特 , 阿特姆·利森科 , 拉扎罗斯·G·帕帕乔治奥 , 马丁·厄本 , 金·哈蒙德·科萨克 , 克里斯托弗·罗林斯 , 曼苏尔·A·S·萨奇 , 索菲亚·佐卡 :
植物病原真菌禾谷镰刀菌多簇基因和群落结构的检测。 CMSB公司 2012 : 69-86 2010 [公元9年] 徐刚(音译) , 劳拉-班尼特 , 拉扎罗斯·G·帕帕乔治奥 , 索菲亚·措卡 :
使用整数优化的复杂网络中的模块检测。 算法分子生物学。 5 : 36 ( 2010 ) [j8] 克莱萨·潘扎尔茨(Chrysa Pantzartzi) , 埃琳娜·德罗索普鲁 , 米纳斯·扬古 , 伊格纳特·德罗兹多夫 , 索菲亚·佐卡 , 克里斯托斯·奥佐乌尼斯(Christos A.Ouzounis) , 扎卡里亚斯·G·斯科拉斯 :
应激反应成分的启动子复杂性和组织特异性表达 加洛氏贻贝(Mytilus galloprovincialis) ,一个稳定的海洋无脊椎动物物种。 公共科学图书馆计算。 生物。 6 ( 7 ) ( 2010 ) [j7] 纳吉尔·V·瓦列耶夫 , 克里斯蒂安·亨德豪森 , Umezawa吉诺里 , 尼古拉·柯托夫 , 加雷思·威廉斯 , 亚历克斯·克洛普 , 克里斯坦提·艾纳利 , 克里斯托斯·奥佐乌尼斯(Christos A.Ouzounis) , 索菲亚·佐卡 , 弗兰克·O·雀巢 :
免疫细胞相互作用的系统模型揭示了人类皮肤的炎症机制。 公共科学图书馆计算。 生物。 6 ( 12 ) ( 2010 )
2000 – 2009
2009 [j6] Shiri Freilich公司 , 利昂·戈多夫斯基 , 阿萨夫·戈特利卜 , 埃里克·布朗克 , 索菲亚·佐卡 , 克里斯托斯·奥佐乌尼斯(Christos A.Ouzounis) :
使用排序的系统发育谱对共同进化的基因组群进行分层。 BMC生物信息。 10 : 355 ( 2009 ) 2007 [j5] 索菲亚·佐卡 :
基因组进化和功能关联的计算方法。 计算。 化学。 工程师。 31 ( 8 ) : 943-949 ( 2007 ) 2005 【j4】 利昂·戈多夫斯基 , 保罗·詹森 , 达格·阿赫伦 , 本杰明审计 , 伊尔德丰索病例 , Nikos Darzentas公司 , 安东·恩赖特 , 努里亚·洛佩斯·比加斯 , 何塞·佩雷格里恩·阿尔瓦雷斯 , 迈克·史密斯 , 索菲亚·佐卡 , 维克托·库宁 , 克里斯托斯·奥佐乌尼斯(Christos A.Ouzounis) :
CoGenT++:用于计算基因组学的广泛和可扩展的数据环境。 生物信息。 21 ( 19 ) : 3806-3810 ( 2005 ) 2003 [j3] 伊奥安尼斯·伊利奥普洛斯 , 索菲亚·佐卡 , 米盖尔·安德拉德 , 安东·恩赖特 , 马克·卡罗尔 , 帕特里克·鲍莱 , Vasilis J.Promponas公司 , 西奥多·利亚科普洛斯 , Giorgos Palaios公司 , 克劳德·帕斯基尔 , 斯塔夫罗斯·哈莫德拉卡斯 , 哈维尔·塔梅斯 , Asutosh T.Yagnik公司 , 安娜·特拉蒙塔诺 , 达米安·德沃斯 , 克里斯蒂安·布拉施克 , 阿方索·巴伦西亚 , 大卫·布莱特 , 大卫·M·A·马丁 , 克里斯托夫·勒罗伊 , 伊西多尔·里戈索斯 , 克里斯·桑德 , 克里斯托斯·奥佐乌尼斯(Christos A.Ouzounis) :
使用整个基因组序列评估注释策略。 生物信息。 19 ( 6 ) : 717-726 ( 2003 ) 2002 [注2] 沃尔特·吉尔克斯 , 本杰明审计 , 丹妮拉·德·安吉利斯 , 索菲亚·佐卡 , 克里斯托斯·奥佐乌尼斯(Christos A.Ouzounis) :
对蛋白质序列数据库中注释错误的渗透进行建模。 生物信息。 18 ( 12 ) : 1641-1649 ( 2002 ) 2000 [j1] Vasilis J.Promponas公司 , 安东·恩赖特 , 索菲亚·佐卡 , 大卫·P·克里尔 , 克里斯托夫·勒罗伊 , 斯塔夫罗斯·哈莫德拉卡斯 , 克里斯·桑德 , 克里斯托斯·奥佐乌尼斯(Christos A.Ouzounis) :
CAST:序列域复杂性分析的迭代算法。 生物信息。 16 ( 10 ) : 915-922 ( 2000 )
合著者索引
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