乔纳森·李斯
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2020年–今天
2021 [公元24年] 伊恩·西利托 , 尼古拉·博丁 , 娜塔莉·道森 , 瓦什利·P·瓦曼 , 保罗·阿什福德 , 哈里·斯科尔斯 , 卡米拉·S.M.庞 , 劳雷尔·伍德里奇 , 克莱门斯·劳尔 , 内拉德里·森 , 马赫纳斯·阿巴斯(Mahnaz Abbasian) , 肖恩·勒·科努 , 苏达特·林 , 卡雷尔·贝卡 , Ivana HutarováVareková , Radka SvobodováVareková , 乔纳森·李斯 , 克里斯汀·奥伦戈 :
CATH:增加功能空间的结构覆盖率。 核酸研究。 49 ( 发布数据库 ) : D266-D273型 ( 2021 ) [公元23年] 苏达特·林 , M.Madan巴布 , 乔纳森·李斯 , 克里斯汀·奥伦戈 :
互斥外显子转换的生物学影响。 公共科学图书馆计算。 生物。 17 ( 三 ) ( 2021 )
2010 – 2019
2019 [公元22年] 托尼·E·刘易斯 , 伊恩·西利托 , 乔纳森·李斯 :
cath-resolve-hits:一种快速解析可疑域匹配的新工具。 生物信息。 35 ( 10 ) : 1766-1767 ( 2019 ) [公元21年] 伊恩·西利托 , 娜塔莉·道森 , 托尼·E·刘易斯 , 萨约尼·达斯 , 乔纳森·李斯 , 保罗·阿什福德 , 阿德耶卢·托卢洛普 , 哈里·斯科尔斯 , 伊利亚·塞纳托罗夫 , 安德拉·布扬 , Fatima Ceballos Rodriguez-Conde公司 , 本杰明·道林 , 珍妮特·桑顿 , 克里斯汀·奥伦戈 :
CATH:拓展基因组序列基于结构的功能注释的视野。 核酸研究。 47 ( 发布数据库 ) : D280-D284型 ( 2019 ) 【r1】 娜塔莉·道森 , 萨约尼·达斯 , 乔纳森·李斯 , 克里斯汀·奥伦戈 :
蛋白质结构分类。 生物信息学和计算生物学百科全书(2) 2019 : 472-487 2018 [公元20年] 托尼·E·刘易斯 , 伊恩·西利托 , 娜塔莉·道森 , 苏达特·林 , 特里斯坦·克拉克 , 大卫·A·李 , 克里斯汀·奥伦戈 , 乔纳森·李斯 :
Gene3D:蛋白质中球状结构域的广泛预测。 核酸研究。 46 ( 发布数据库 ) : D1282号 ( 2018 ) [公元19年] 托尼·E·刘易斯 , 伊恩·西利托 , 娜塔莉·道森 , 苏达特·林 , 特里斯坦·克拉克 , 大卫·A·李 , 克里斯汀·奥伦戈 , 乔纳森·李斯 :
Gene3D:对蛋白质中球状结构域的广泛预测。 核酸研究。 46 ( 发布数据库 ) : D435-D439号 ( 2018 ) 2017 [公元18年] 娜塔莉·道森 , 托尼·E·刘易斯 , 萨约尼·达斯 , 乔纳森·李斯 , 大卫·A·李 , 保罗·阿什福德 , 克里斯汀·奥伦戈 , 伊恩·西利托 :
CATH:通过结构和序列预测蛋白质功能的扩展资源。 核酸研究。 45 ( 发布数据库 ) : D289至D295 ( 2017 ) [公元17年] 岑湾 , 乔纳森·李斯 , 费德里科·米内基 , 克里斯汀·奥伦戈 , 大卫·T·琼斯 :
时间转录表达谱分析揭示了黑腹果蝇蛋白质功能和发育阶段之间的联系。 公共科学图书馆计算。 生物。 13 ( 10 ) ( 2017 ) 2016 [公元16年] 萨约尼·达斯 , 大卫·A·李 , 伊恩·西利托 , 娜塔莉·道森 , 乔纳森·李斯 , 克里斯汀·奥伦戈 :
CATH超家族的功能分类:基于结构域的蛋白质功能注释方法。 生物信息。 32 ( 18 ) : 2889 ( 2016 ) [公元15年] 苏达特·林 , 娜塔莉·道森 , 萨约尼·达斯 , 伊恩·西利托 , 保罗·阿什福德 , 大卫·A·李 , 索尼娅·莱蒂宁 , 克里斯汀·奥伦戈 , 乔纳森·李斯 :
Gene3D:扩展域分配的实用程序。 核酸研究。 44 ( 发布数据库 ) : 404-409 ( 2016 ) 2015 [公元14年] 乔纳森·李斯 , Jean-Karim Hériché , 伊恩·莫里拉 , 何塞·玛丽亚·费尔南德斯 , 普里特·阿德勒 , 马丁·克莱林格 , 贾克·维洛 , 阿方索·巴伦西亚 , 简·埃伦伯格 , 胡安·拉内亚 , 克里斯汀·奥伦戈 :
FUN-L:RNAi筛选的基因优先排序。 生物信息。 31 ( 12 ) : 2052-2053 ( 2015 ) [j13] 萨约尼·达斯 , 大卫·A·李 , 伊恩·西利托 , 娜塔莉·道森 , 乔纳森·李斯 , 克里斯汀·奥伦戈 :
CATH超家族的功能分类:基于结构域的蛋白质功能注释方法。 生物信息。 31 ( 21 ) : 3460-3467 ( 2015 ) [公元12年] 伊恩·西利托 , 托尼·E·刘易斯 , 艾莉森·L·卡夫 , 萨约尼·达斯 , 保罗·阿什福德 , 娜塔莉·道森 , 尼古拉斯·弗纳姆 , 罗曼·拉斯科夫斯基 , 大卫·A·李 , 乔纳森·李斯 , 索尼娅·莱蒂宁 , 罗曼·斯塔德 , 珍妮特·桑顿 , 克里斯汀·奥伦戈 :
CATH:基因组序列的综合结构和功能注释。 核酸研究。 43 ( 发布数据库 ) : 376-381 ( 2015 ) [公元11年] 萨约尼·达斯 , 伊恩·西利托 , 大卫·A·李 , 乔纳森·利斯 , 娜塔莉·道森 , 约翰·沃德 , 克里斯汀·奥伦戈 :
CATH FunFHMMer网络服务器:使用功能家族分配的蛋白质功能注释。 核酸研究。 43 ( Web服务器-发布 ) : W148-W153型 ( 2015 ) 2014 [公元10年] 乔纳森·李斯 , 大卫·A·李 , 罗曼·斯塔德 , 娜塔莉·道森 , 伊恩·西利托 , 萨约尼·达斯 , 科林·叶芝 , 伯努瓦·德塞利 , 罗伯特·伦茨(Robert Rentzsch) , 克里斯汀·奥伦戈 :
Gene3D:蛋白质序列和比较基因组分析的多域注释。 核酸研究。 42 ( 发布数据库 ) : 240-245 ( 2014 ) 2013 [公元9年] 伊恩·西利托 , 艾莉森·L·卡夫 , 贝诺伊特·德塞利 , 娜塔莉·道森 , 尼古拉斯·弗纳姆 , 大卫·A·李 , 乔纳森·李斯 , 托尼·E·刘易斯 , 罗曼·斯塔德 , 罗伯特·伦茨施 , 科林·叶芝 , 珍妮特·桑顿 , 克里斯汀·奥伦戈 :
CATH中的新功能家族(FunFams)改进了保守功能位点到3D结构的映射。 核酸研究。 41 ( 发布数据库 ) : 490-498 ( 2013 ) 2012 [j8] 乔纳森·李斯 , 科林·叶芝 , 詹姆斯·理查德·珀金斯 , 伊恩·西利托 , 罗伯特·伦茨(Robert Rentzsch) , 贝诺伊特·德塞利 , 克里斯汀·奥伦戈 :
Gene3D:用于比较基因组学、功能注释和蛋白质网络分析的基于域的资源。 核酸研究。 40 ( 发布数据库 ) : 465-471 ( 2012 ) 2011 [j7] 科林·叶芝 , 乔纳森·李斯 , 菲尔·卡特 , 伊恩·西利托 , 克里斯汀·奥伦戈 :
Gene3D网络服务:一个用于识别、注释和比较蛋白质序列结构域的平台。 核酸研究。 39 ( Web服务器发布 ) : 546-550 ( 2011 ) 2010 [j6] 乔纳森·李斯 , 科林·叶芝 , 奥利弗·雷德弗恩 , 安德鲁·克莱格 , 克里斯汀·奥伦戈 :
Gene3D:融合一千个基因组的结构和功能。 核酸研究。 38 ( 发布数据库 ) : 296-300 ( 2010 ) [j5] 胡安·拉内亚 , 伊恩·莫里拉 , 乔纳森·李斯 , 亚当·詹姆斯·里德 , 科林·叶芝 , 安德鲁·克莱格 , 弗朗西斯卡·桑切斯·吉梅内斯 , 克里斯汀·奥伦戈 :
在人类和酵母蛋白质网络预测和建模中发现“暗物质”。 公共科学图书馆计算。 生物。 6 ( 9 ) ( 2010 )
2000 – 2009
2008 【j4】 乔纳森·李斯 , 罗伯特·W·珍妮斯 :
将基于序列的预测方法与圆二色性和红外光谱数据相结合,以改进蛋白质二级结构测定。 BMC生物信息。 9 ( 2008 ) [j3] 科林·叶芝 , 乔纳森·李斯 , 亚当·詹姆斯·里德 , 保罗·凯勒姆 , 奈杰尔·马丁 , 刘新辉 , 克里斯汀·奥伦戈 :
Gene3D:基因组的全面结构和功能注释。 核酸研究。 36 ( 发布数据库 ) : 414-418 ( 2008 ) 2006 [注2] 乔纳森·李斯 , 安德鲁·迈尔斯 , 弗兰克·维恩 , B.A.华莱士 :
覆盖褶皱和二级结构空间的圆二色光谱参考数据库。 生物信息。 22 ( 16 ) : 1955-1962 ( 2006 ) [j1] 乔纳森·李斯 , 安德鲁·迈尔斯 , 罗伯特·W·珍妮斯 , B.A.华莱士 :
利用低波长(VUV)圆二色光谱数据确定二级结构的新方法。 BMC生物信息。 7 : 507 ( 2006 )
合著者索引
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