亚历山大·罗斯
人员信息
附属: Mol*Consortium,美国加利福尼亚州圣地亚哥
其他同名人员
亚历山大·罗斯 0001 -汉诺威应用科学与艺术大学,IKME-高级控制,德国汉诺威 亚历山大·罗斯 0002 -德国达姆施塔特技术大学控制与网络物理系统实验室 亚历山大·罗斯 0003 -德国汉诺威莱布尼茨大学 亚历山大·罗斯 0004 -乔治·梅森大学,费尔法克斯,弗吉尼亚州,美国
优化列表
2020年–今天
2023 [公元21年] Aliaksei Chareshneu公司 , 亚当·米德利克 , Crina-Maria Ionescu公司 , 亚历山大·罗斯 , 弗拉迪米尔·霍斯克 , 阿莱西奥·坎塔拉 , Radka SvobodováVareková , 卡雷尔·贝卡 , 大卫·塞纳尔 :
分子体积和分割:细胞成像数据以及大分子结构数据和生物注释的可视化和解释。 核酸研究。 51 ( 第1周 ) : 326-330 ( 2023 ) 2022 [j20] 米歇尔·坎普弗拉斯 , 雷内·斯塔里茨比克勒 , 吉列尔莫·佩雷斯·埃尔南德斯 , 亚历山大·罗斯 , 约翰娜·K·S·蒂曼 , 杰里克·谢尔曼 , 丹尼尔·威格列夫 , 彼得·希尔德布兰德 :
MDsrv:分子动力学模拟的可视化共享和分析。 核酸研究。 50 ( 第1周 ) : 483-489 ( 2022 ) [i1] 米歇尔·坎普弗拉斯 , 雷内·斯塔里茨比克勒 , 吉列尔莫·佩雷斯·埃尔南德斯 , 亚历山大·罗斯 , 约翰娜·K·S·蒂曼 , 杰里克·谢尔曼 , 丹尼尔·威格列夫 , 彼得·希尔德布兰德 :
MDsrv-分子动力学模拟的可视化共享和分析。 CoRR公司 abs/2203.13658 ( 2022 ) 2021 [公元19年] 卡斯滕·沙茨(Karsten Schatz) , 胡安·何塞·弗兰科·莫雷诺 , 马可·施费尔 , 亚历山大·罗斯 , 瓦莱里奥·费拉里奥 , 尤尔根褶皱 , 佩雷·鲍·瓦兹奎斯 , 托马斯·埃特尔 , 迈克尔·克朗 :
大规模蛋白质-配体相互作用数据的可视化分析。 计算。 图表。 论坛 40 ( 6 ) : 394-408 ( 2021 ) [公元18年] 史蒂芬·K·伯里 , 查米·比卡迪亚 , 春晓碧 , 塞巴斯蒂安·比特里奇 , 李晨 , 格雷格·克莱克洛(Gregg V.Crichlow) , 科尔·H·克里斯蒂 , 肯尼思·戴伦伯格 , 路易吉·迪·科斯坦佐 , 何塞·M·杜阿尔特 , 舒奇米塔·杜塔 , 祖康峰 , 赛加尼桑 , 大卫·S·古德塞尔 , 苏塔帕·戈什 , 雷切尔·克莱默·格林 , 弗拉基米尔·古拉诺维奇 , 德米特罗·古赞科 , 布莱恩·哈德森 , 凯瑟琳·劳森 , 梁玉禾 , 罗伯特·洛 , 哈里·南孔 , 以斯拉·佩萨 , 伊琳娜·佩西科娃 , 克里斯托弗·兰德尔 , 亚历山大·罗斯 , 亚纳玫瑰 , 安德烈·萨利 , 琼·塞古拉 , 莫妮卡·塞哈兰 , 邵成华 , 伊平涛 , 玛丽亚·沃伊特 , 约翰·韦斯特布鲁克 , 茉莉花 , 克里斯汀·扎尔德基 , 玛丽娜·朱拉夫列娃 :
RCSB蛋白质数据库:用于探索生物大分子三维结构的强大新工具,用于基础生物学、生物医学、生物技术、生物工程和能源科学的基础和应用研究和教育。 核酸研究。 49 ( 发布数据库 ) : D437-D451号 ( 2021 ) [公元17年] 大卫·塞纳尔 , 塞巴斯蒂安·比特里奇 , 曼达尔·德什潘德 , Radka SvobodováVareková , 卡雷尔·贝卡 , 瓦克拉夫·巴兹吉尔 , 萨米尔·维兰卡 , 史蒂芬·K·伯里 , 雅罗斯拉夫·科卡 , 亚历山大·罗斯 :
Mol*Viewer:用于大型生物分子结构的3D可视化和分析的现代网络应用程序。 核酸研究。 49 ( Web服务器-发布 ) : 431-437 ( 2021 ) 2020 [公元16年] 大卫·塞纳尔 , 塞巴斯蒂安·比特里奇 , 萨米尔·维兰卡 , 雅罗斯拉夫·科卡 , Radka SvobodováVareková , 史蒂芬·K·伯里 , 亚历山大·罗斯 :
BinaryCIF和CIFTools-轻量级、高效和可扩展的高分子数据管理。 公共科学图书馆计算。 生物。 16 ( 10 ) ( 2020 ) [公元15年] 塞巴斯蒂安·比特里奇 , 史蒂芬·K·伯里 , 亚历山大·罗斯 :
使用反向索引策略在蛋白质中实时搜索结构基序。 公共科学图书馆计算。 生物。 16 ( 12 ) ( 2020 )
2010 – 2019
2019 [公元14年] 史蒂芬·K·伯里 , 海伦·M·伯曼 , 查米·比卡迪亚 , 春晓碧 , 李晨 , 路易吉·迪·科斯坦佐 , 科尔·H·克里斯蒂 , 肯尼思·戴伦伯格 , 何塞·M·杜阿尔特 , 舒奇米塔·杜塔 , 祖康峰 , 苏塔帕·戈什 , 大卫·S·古德塞尔 , 雷切尔·克莱默·格林 , 弗拉基米尔·古拉诺维奇 , 德米特罗·古赞科 , 布莱恩·哈德森 , 塔拉·卡尔罗 , 梁玉禾 , 罗伯特·洛 , 哈里·南孔 , 以斯拉·佩萨 , 伊琳娜·佩里斯科娃 , 安德烈亚斯·普里奇 , 克里斯托弗·兰德尔 , 亚历山大·罗斯 , 彼得·W·罗斯 , 劳尔·萨拉 , 莫妮卡·塞哈兰 , 邵成华 , 李华坦 , 伊平涛 , 亚娜·瓦拉萨塔娃 , 玛丽亚·沃伊特 , 约翰·韦斯特布鲁克 , 杰西·吴 , 杨焕旺 , 茉莉花 , 玛丽娜·朱拉夫列娃 , 克里斯汀·扎尔德基 :
RCSB蛋白质数据库:支持基础生物学、生物医学、生物技术和能源研究和教育的生物大分子结构。 核酸研究。 47 ( 发布数据库 ) : D464-D474号 ( 2019 ) 2018 [j13] 海阮 , 大卫·A·凯斯 , 亚历山大·罗斯 :
用于Jupyter笔记本电脑的NGLview交互式分子图形。 生物信息。 34 ( 7 ) : 1241-1242 ( 2018 ) [公元12年] 亚历山大·罗斯 , 安东尼·布拉德利 , 亚娜·瓦拉萨塔娃 , 何塞·M·杜阿尔特 , 安德烈亚斯·普里奇 , 彼得·W·罗斯 :
NGL查看器:基于网络的大型复合物分子图形。 生物信息。 34 ( 21 ) : 3755-3758 ( 2018 ) [公元11年] 约翰娜·K·S·蒂曼 , 亚历山大·罗斯 , Jochen Ismer公司 , 密特拉·D·达维什 , 塔里克·希拉尔 , 克里斯蒂安·M·T·斯潘 , 彼得·希尔德布兰德 :
FragFit:一个网络应用程序,用于将蛋白质片段交互式建模到低温电子显微镜密度图中。 核酸研究。 46 ( Web服务器-发布 ) : W310-W314型 ( 2018 ) 【c3】 大卫·塞纳尔 , 亚历山大·罗斯 , 雅罗斯拉夫·科卡 , 史蒂芬·K·伯里 , 萨米尔·维兰卡 :
Mol*:面向Web分子图形的通用库和工具。 EuroVis的MolVa 2018 : 29-33 2017 [公元10年] 何塞·吉梅内斯 , 斯特凡·多尔 , 杰拉德·马丁内斯·罗塞尔 , 亚历山大·罗斯 , 吉安尼·德·法布里蒂斯 :
DeepSite:使用三维卷积神经网络的蛋白质结合位点预测器。 生物信息。 33 ( 19 ) : 3036-3042 ( 2017 ) [公元9年] Jochen Ismer公司 , 亚历山大·罗斯 , 约翰娜·K·S·蒂曼 , 彼得·希尔德布兰德 :
一种基于片段的方法,用于将蛋白质片段建模为低温电子显微镜密度图。 BMC生物信息。 18 ( 1 ) : 475 ( 2017 ) [j8] 彼得·W·罗斯 , 安德烈亚斯·普里奇 , 阿里·阿尔图卡亚 , 春晓碧 , 安东尼·布拉德利 , 科尔·H·克里斯蒂 , 路易吉·迪·科斯坦佐 , 何塞·M·杜阿尔特 , 舒奇米塔·杜塔 , 祖康峰 , 雷切尔·克莱默·格林 , 大卫·S·古德塞尔 , 布莱恩·哈德森 , 塔拉·卡尔罗 , 罗伯特·洛 , 以斯拉·佩萨 , 克里斯托弗·兰德尔 , 亚历山大·罗斯 , 邵成华 , 伊平涛 , 亚娜·瓦拉萨塔娃 , 玛丽亚·沃伊特 , 约翰·韦斯特布鲁克 , 杰西·吴 , 杨焕旺 , 茉莉花 , 克里斯汀·扎尔德基 , 海伦·M·伯曼 , 史蒂芬·K·伯里 :
RCSB蛋白质数据库:蛋白质、基因和3D结构信息的综合视图。 核酸研究。 45 ( 发布数据库 ) : D271-D281型 ( 2017 ) [j7] 安东尼·布拉德利 , 亚历山大·罗斯 , 安东·帕维尔卡 , 亚娜·瓦拉萨塔娃 , 何塞·M·杜阿尔特 , 安德烈亚斯·普里奇 , 彼得·W·罗斯 :
MMTF-用于传输、可视化和分析大分子结构的有效文件格式。 公共科学图书馆计算。 生物。 13 ( 6 ) ( 2017 ) 【c2】 奈夫·阿尔哈比 , 穆罕默德·阿尔哈比 , 泽维尔·马丁内斯 , 迈克尔·克朗 , 亚历山大·罗斯 , 马克·巴登 , 罗伯特·拉雷米 , Matthieu Chavent公司 :
计算生物学数据的分子可视化:调查综述。 EuroVis(短文) 2017 : 133-137 2016 [j6] Jochen Ismer公司 , 亚历山大·罗斯 , 约翰娜·K·S·蒂曼 , 安德烈·戈德 , 罗伯特·普雷斯纳 , 彼得·希尔德布兰德 :
SL2:一个交互式网络工具,用于建模蛋白质中缺失的片段。 核酸研究。 44 ( Web服务器-发布 ) : W390-W394型 ( 2016 ) 【c1】 亚历山大·罗斯 , 安东尼·布拉德利 , 亚娜·瓦拉萨塔娃 , 何塞·M·杜阿尔特 , 安德烈亚斯·普里奇 , 彼得·W·罗斯 :
基于Web的大型复合物分子图形。 网络三维 2016 : 185-186 2015 [j5] 亚历山大·罗斯 , 彼得·希尔德布兰德 :
NGL Viewer:一个用于分子可视化的web应用程序。 核酸研究。 43 ( Web服务器-发布 ) : W576-W579型 ( 2015 ) 2014 【j4】 亚历山大·罗斯 , 多米尼克·休恩 , 安德烈安·戈伊德 , 彼得·沃纳·希尔德布兰德 :
MP:PD-螺旋膜蛋白质内部堆积密度、内部堆积缺陷和内部水分的数据库。 核酸研究。 42 ( 发布数据库 ) : 347-351 ( 2014 ) 2013 [j3] Jochen Ismer公司 , 亚历山大·罗斯 , 约翰娜·K·S·蒂曼 , 安德烈·戈德 , 克里斯蒂安·罗瑟 , 彼得·沃纳·希尔德布兰德 :
Voronoia4RNA——RNA结构及其复合物的原子堆积密度数据库。 核酸研究。 41 ( 发布数据库 ) : 280-284 ( 2013 ) 2010 [注2] 亚历山大·罗斯 , 安德烈·戈德 , 彼得·沃纳·希尔德布兰德 :
MPlot-分析和可视化螺旋膜蛋白质的三级结构接触和几何特征的服务器。 核酸研究。 38 ( Web服务器问题 ) : 602-608 ( 2010 )
2000 – 2009
2009 [j1] 亚历山大·罗斯 , 斯蒂芬·洛伦岑 , 安德烈·戈德 , 比约恩·格吕宁 , 彼得·沃纳·希尔德布兰德 :
RHYTHM——预测通道和膜芯跨膜螺旋方向的服务器。 核酸研究。 37 ( Web服务器问题 ) : 575-580 ( 2009 )