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2020年–今天
2024 [i10] 卡齐·萨吉德·梅赫拉布 , M.马鲁夫 , 阿卡道 , 哈里什·巴布·马诺加兰 , 阿比拉什·尼奥 , 姆里杜尔·库拉纳 , 巴哈迪尔·阿尔提塔斯 , 亚辛·巴基斯 , 伊丽莎白·坎波隆戈 , 马修·汤普森 , 王晓军 , 希尔马尔·拉普 , 赵伟伦 , 保拉·马比 , 小亨利·L·巴特。 , 瓦西拉·达杜尔 , Anuj Karpatne公司 :
Fish-Vista:用于理解和识别图像特征的多用途数据集。 CoRR公司 abs/2407.08027 ( 2024 ) 2023 [第12条] Mohanad Elhamod公司 , 姆里杜尔·库拉纳 , 哈里什·巴布·马诺加兰 , 约瑟夫·尤耶达 , 梅根·A·巴尔克 , 瓦西拉·达杜尔 , 亚辛烘焙 , 小亨利·L·巴特。 , 保拉·马比 , 希尔马尔·拉普 , 詹姆斯·巴尔霍夫 , Caleb Charpentier公司 , 大卫·卡林 , 赵伟伦 , 查尔斯·斯图尔特 , 丹尼尔·鲁宾斯坦 , 塔尼亚·伯格·沃尔夫 , Anuj Karpatne公司 :
使用系统发育引导神经网络从图像中发现新的生物特征。 KDD公司 2023 : 3966-3978 [第九章] 莫汉娜德·埃尔哈蒙德 , 姆里杜尔·库拉纳 , 哈里什·巴布·马诺加兰 , 约瑟夫·尤耶达 , 梅根·A·巴尔克 , 瓦西拉·达杜尔 , 亚辛·巴基斯 , 小亨利·L·巴特。 , 保拉·马比 , 希尔马尔·拉普 , 詹姆斯·巴尔霍夫 , Caleb Charpentier公司 , 大卫·卡林 , 赵伟伦 , 查尔斯·斯图尔特 , 丹尼尔·鲁宾斯坦 , 塔尼亚·伯格·沃尔夫 , Anuj Karpatne公司 :
使用系统发育引导神经网络从图像中发现新的生物特征。 CoRR公司 abs/2306.03228 ( 2023 ) 2021 [公元15年] 高拉夫·维迪亚 , 尼科·塞利内斯 , 希尔马尔·拉普 :
JPhyloRef:一个用于测试和解析phyloreferences的工具。 J.开源软件。 6 ( 64 ) : 3374 ( 2021 ) [第11条] 亚伦·埃伯哈特 , 大卫·卡拉尔 , 帕斯卡·希茨勒 , 希尔马尔·拉普 , 塞巴斯蒂安·鲁道夫 :
树建模的种子模式。 WOP(书本) 2021 : 48-67 2020 [公元14年] 史蒂芬·K·伍迪 , 大卫·伯迪克 , 希尔马尔·拉普 , 埃里希·S·黄 :
生命科学和医疗保健领域知识转移和生成的应用程序编程接口。 npj数字。 医学 三 ( 2020 ) [j13] 史蒂芬·K·伍迪 , 大卫·伯迪克 , 希尔马尔·拉普 , 埃里希·S·黄 :
出版商更正:生命科学和医疗保健领域知识转移和生成的应用程序编程接口。 npj数字。 医学 三 ( 2020 )
2010 – 2019
2018 [公元12年] 瓦西拉·达杜尔 , Prashanti曼达 , 洪翠(音) , 詹姆斯·巴尔霍夫 , 亚历山大·德切奇 , 尼扎尔·伊伯拉希姆 , 希尔马尔·拉普 , 托德·J·Vision , 保拉·马比 :
使用本体论注释表型:自然语言处理系统训练和评估的黄金标准。 数据库J.Biol。 数据库管理 2018 : 海湾110 ( 2018 ) [第10条] 保拉·马比 , 詹姆斯·巴尔霍夫 , 瓦西拉·达杜尔 , 希尔马尔·拉普 , 克里斯托弗·蒙格尔 , 托德·J·Vision :
Phenoscape知识库中解剖同源性推理。 国际商业银行 2018 [第2页] 伊恩·布劳恩 , 詹姆斯·巴尔霍夫 , 塔尼亚·贝拉迪尼 , 劳雷尔·库珀 , 乔治奥斯·格库托斯 , 丽莎·哈珀 , 伊娃·华拉 , 潘卡杰·贾斯瓦尔 , 托尼·卡齐克 , 希尔马尔·拉普 , 詹姆斯·麦克林 , 切尔西·D·斯佩克特 , 托德·J·Vision , 雷蒙娜·沃尔斯 , 卡罗琳·劳伦西·迪尔 :
“可计算”表型使植物物种之间和生命领域之间的比较和预测表型成为可能。 语义技术在生物多样性科学中的应用 2018 : 187-205 [第1页] 保拉·马比 , 瓦西拉·达杜尔 , 詹姆斯·巴尔霍夫 , 希尔马尔·拉普 , Prashanti曼达 , 约瑟夫·尤耶达 , 托德·J·Vision , 蒙特·韦斯特菲尔德 :
现象:对生物体特征和基因的语义分析产生了进化生物学的见解。 语义技术在生物多样性科学中的应用 2018 : 207-224 [i8] 诺米·哈里斯 , 希瑟·维恩科 , 布拉德·查普曼 , 彼得·J·A·科克 , 卡斯滕·霍坎普 , 希尔马尔·拉普 , 克里斯托弗·菲尔兹 , 巴斯蒂安·格雷沙克·茨瓦拉斯(Bastian Greshake Tzovaras) :
2018年生物信息学开放源码会议(GCCBOSC 2018)。 F1000研究 7 : 1309 ( 2018 ) 2017 【c9】 大卫·卡拉尔 , 帕斯卡·希茨勒 , 希尔马尔·拉普 , 塞巴斯蒂安·鲁道夫 :
关于树的本体建模。 在ISWC的WOP 2017 [i7] 大卫·卡拉尔 , 帕斯卡·希茨勒 , 希尔马尔·拉普 , 塞巴斯蒂安·鲁道夫 :
关于树的本体建模。 CoRR公司 abs/1710.05096 ( 2017 ) [i6] 阿林·斯托尔茨福斯 , 迈克尔·罗森博格 , 希尔马尔·拉普 , 艾丹巴德 , 凯伦·克兰斯顿 , 恩里科·蓬泰利 , 香恩·奥利弗 , 罗格斯A.沃斯 :
社区与准则:九场NESCent黑客马拉松的九个教训。 F1000研究 6 : 786- ( 2017 ) [i5] 诺米·哈里斯 , 彼得·J·A·科克 , 布拉德·查普曼 , 克里斯托弗·菲尔兹 , 卡斯滕·霍坎普 , 希尔马尔·拉普 , 莫妮卡·穆诺兹·托雷斯 , 巴斯蒂安·格雷沙克·茨瓦拉斯(Bastian Greshake Tzovaras) , 希瑟·维恩科 :
2017年生物信息学开放源码会议(BOSC)。 F1000研究 6 : 1858- ( 2017 ) 2016 [公元11年] 诺米·哈里斯 , 彼得·J·A·科克 , 希尔马尔·拉普 , 布拉德·查普曼 , 罗布·戴维 , 克里斯托弗·菲尔兹 , 卡斯滕·霍坎普 , 莫妮卡·穆诺兹·托雷斯 :
2015年生物信息学开放源码会议(BOSC 2015)。 公共科学图书馆计算。 生物。 12 ( 2 ) ( 2016 ) 【c8】 Prashanti曼达 , 克里斯托弗·蒙格尔 , 詹姆斯·巴尔霍夫 , 希尔马尔·拉普 , 托德·J·Vision :
利用语义相似性研究解剖同源性在跨物种表型比较中的重要性。 PSB公司 2016 : 132-143 [i4] 诺米·哈里斯 , 彼得·J·A·科克 , 布拉德·查普曼 , 克里斯托弗·菲尔兹 , 卡斯滕·霍坎普 , 希尔马尔·拉普 , 莫妮卡·穆诺兹·托雷斯 , 希瑟·维恩科 :
2016年生物信息学开放源码会议(BOSC)。 F1000研究 5 : 2464 ( 2016 ) 2015 [公元10年] 瓦西拉·达杜尔 , 亚历山大·德切奇 , 尼扎尔·伊伯拉希姆 , 希尔马尔·拉普 , 保拉·马比 :
移山:分析将比较解剖学转换为可计算解剖学所需的工作。 数据库J.Biol。 数据库管理 2015 ( 2015 ) [公元9年] 诺米·哈里斯 , 彼得·J·A·科克 , 布拉德·查普曼 , 杰里米·戈克斯 , 汉斯·鲁道夫·霍茨 , 希尔马尔·拉普 :
2013年生物信息学开放源码会议(BOSC)。 生物信息。 31 ( 2 ) : 299-300 ( 2015 ) 2014 [j8] 詹姆斯·巴尔霍夫 , 瓦西拉·达杜尔 , 托马斯·德切奇 , 希尔马尔·拉普 , 保拉·马比 , 托德·J·Vision :
表型多样性注释:使用Phenex分离数据管理和本体管理。 J.生物识别。 塞芒。 5 : 45 ( 2014 ) [i3] 丹尼尔·卡茨 , Sou-Cheng T.Choi先生 , 希尔马尔·拉普 , 凯坦·马赫什瓦里 , 弗兰克·洛夫勒 , 马修·特克 , 马库斯·D·汉维尔 , 南希·威尔金森-迪尔 , 詹姆斯·赫瑟林顿 , 詹姆斯·豪森 , 谢尔·斯文森 , 加布里埃尔·艾伦 , 安妮·埃尔斯特 , G.布鲁斯·贝里曼 , 科林·文特斯 :
可持续科学软件第一次研讨会总结:实践与经验(WSSSPE1)。 CoRR公司 abs/1404.7414 ( 2014 ) [i2] 詹姆斯·巴尔霍夫 , 亚历山大·德切奇 , 保拉·马比 , 希尔马尔·拉普 :
进化表型的存在-缺失推理。 CoRR公司 abs/1410.3862 ( 2014 ) 2013 [j7] 彼得·米德福德 , 托马斯·德切奇 , 詹姆斯·巴尔霍夫 , 瓦西拉·达杜尔 , 尼扎尔·伊伯拉希姆 , 希尔马尔·拉普 , 约翰·伦德伯格 , 保拉·马比 , 保罗·塞雷诺 , 蒙特·韦斯特菲尔德 , 托德·J·Vision , 大卫·C·布莱克本 :
脊椎动物分类本体:一个跨模式生物和物种表型进行推理的框架。 J.生物识别。 塞芒。 4 : 34 ( 2013 ) [j6] 阿林·斯托尔茨福斯 , 希尔马尔·拉普 , 奈姆·马塔西 , 海伦娜·德乌斯 , 布莱恩·西德劳斯卡斯 , 克里斯蒂安·马塞克 , 高拉夫·维迪亚 , 恩里科·蓬泰利 , 凯伦·克兰斯顿 , 罗格斯A.沃斯 , 坎贝尔·O·韦伯 , 卢克·哈蒙 , 梅格·皮尔龙 , 布莱恩·奥米拉 , 马修·彭内尔 , 西瓦什·米拉拉布 , 迈克尔·罗森博格 , 詹姆斯·巴尔霍夫 , 霍莉·M·比克 , 特蕾西·希思 , 彼得·米德福德 , 约瑟夫·布朗 , 艾米丽·简·麦克塔维什 , Jeet Sukumaran(杰特·苏库马兰) , 马克·威斯特尼特 , 迈克尔·E·阿尔法罗 , 亚伦·斯蒂尔 , 格雷格·乔丹 :
Phylotastic! 使生命之树知识变得可访问、可重用和方便。 BMC生物信息。 14 : 158 ( 2013 ) [i1] 戴西·黄 , 希尔马尔·拉普 :
软件工程是科学软件长尾的工具。 CoRR公司 abs/1309.1806 ( 2013 ) 2012 [j5] 安德烈亚斯·普里奇 , 希尔马尔·拉普 :
这个 PLOS计算生物学 软件部分。 公共科学图书馆计算。 生物。 8 ( 11 ) ( 2012 ) 2011 【j4】 淑贞(Sook Jung) , 娜玛·门达 , 塞斯·雷蒙德 , 罗伯特·布尔斯 , 马伦·弗里森 , 尤里·本达纳 , 莱西·安妮·桑德森 , 希尔马尔·拉普 , 泰因·李 , 鲍勃·麦卡勒姆 , 柯斯汀·贝特 , 斯科特·凯恩 , 戴夫·金文斯 , 卢卡斯·穆勒 , 多里·梅因 :
Chado自然多样性模块:大规模表型和基因分型数据的新通用数据库模式。 数据库J.Biol。 数据库管理 2011 ( 2011 ) 【c7】 詹姆斯·巴尔霍夫 , 瓦西拉·达杜尔 , 希尔马尔·拉普 , 彼得·米德福德 , 托德·J·Vision , 蒙特·韦斯特菲尔德 , 保拉·马比 :
在Phenoscape知识库中使用推理。 国际商业银行 2011 【c6】 詹姆斯·巴尔霍夫 , 彼得·米德福德 , 希尔马尔·拉普 :
将解剖学和表型本体论与分类学层次相结合。 国际商业银行 2011 [c5] 瓦西拉·达杜尔 , 詹姆斯·巴尔霍夫 , 希尔马尔·拉普 , 彼得·米德福德 , 托德·J·Vision , 蒙特·韦斯特菲尔德 , 保拉·马比 :
表型:连接进化和模型生物表型的用例和解剖本体需求。 国际商业银行 2011 【c4】 托德·J·Vision , 朱迪思·布莱克 , 希尔马尔·拉普 , 保拉·马比 , 蒙特·韦斯特菲尔德 :
语义描述集之间的相似性:解决数据集成以外的需求。 LISC公司 2011 2010 [j3] 片山俊一 , 荒川和弘 , 中尾光介 , 小野圭一郎 , 清子F.Aoki-Kinoshita , 山本雅素 , 山口敦子 , 水池川岛 , 洪宇春 , 詹·埃尔茨 , 布鲁诺·阿兰达 , H.Barboza勋爵 , 拉乌尔·让·皮埃尔·博纳尔 , 理查德·布鲁斯基(Richard M.Bruskiewich) , 简·克里斯蒂安·布莱恩 , 何塞·玛丽亚·费尔南德斯 , 阿基拉·福纳哈西 , 保罗·M·K·戈登 , Naohisa Goto先生 , 安德烈亚斯·格罗斯克思 , 亚历克斯·古特里奇 , 理查德·霍兰德 , 卡诺吉野 , 爱德华·卡瓦斯 , 阿诺德·科霍努 , 埃里·基布卡瓦 , 阿基拉·R·金珠 , 迈克尔库恩 , 希尔马尔·拉普 , 海基·莱瓦·斯莱霍 , 中村弘之 , 中村靖国 , 西泽达也 , Chikashi Nobata公司 , 野口达胜 , 托马斯·奥因 , 冈本信步 , 斯图亚特·欧文 , 埃文格洛斯·帕菲利斯 , 马修·波科克 , Pjotr普林斯 , 雷内·兰津格 , 弗洛里安·赖辛格 , 卢卡斯·萨文斯基 , 马克·施赖伯 , 马丁·森格 , Yasumasa Shigemoto公司 , 达伦·斯坦德利 , 苏加瓦拉(Hideaki Sugawara) , Toshiyuki Tashiro先生 , 奥斯瓦尔多·特雷尔斯 , 罗格斯A.沃斯 , 马克·威尔金森 , 威廉·约克 , 克里斯蒂安·马塞克 , 清崎浅井 , Toshihisa Takagi先生 :
DBCLS生物黑客马拉松:生物信息学web服务和工作流的标准化和互操作性。 J.生物识别。 塞芒。 1 : 8 ( 2010 )
2000 – 2009
2006 [注2] 杰森·斯塔伊奇 , 希尔马尔·拉普 :
生物信息学的开源工具和工具包:意义,我们在哪里? 生物信息简报。 7 ( 三 ) : 287-296 ( 2006 ) 2003 [j1] 诺伯特·布伦德尔 , 霍斯特比绍夫 , 希尔马尔·拉普 :
稳健的DNA微阵列图像分析。 机器。 视觉。 申请。 15 ( 1 ) : 11-28 ( 2003 ) 2000 【c3】 陈洪扬 , Norbert Brändle公司 , 霍斯特比绍夫 , 希尔马尔·拉普 :
遗传斑点阵列图像的稳健斑点拟合。 ICIP公司 2000 : 412-415 【c2】 诺伯特·布伦德尔 , 陈洪扬 , 霍斯特比绍夫 , 希尔马尔·拉普 :
斑点阵列图像的稳健参数和半参数斑点拟合。 ISMB公司 2000 : 46-56
1990 – 1999
1999 【c1】 诺伯特·布伦德尔 , 希尔马尔·拉普 , 霍斯特比绍夫 :
包含引导点的遗传斑点阵列图像的自动网格拟合。 CAIP公司 1999 : 357-366