克里斯托夫·德斯莫斯
人员信息
优化列表
2020年–今天
2023 【c9】 Petros Liakopoulous公司 , 博尔巴拉·班法尔维 , 王欣怡 , 新浪马基甸 , 塔里西奥·门德斯·德·法里亚斯 , 克里斯托夫·德斯莫斯 , 安娜·克劳迪娅·西蒙 :
通过联合SPARQL查询预测基本蛋白质。 SWAT4HCLS公司 2023 : 173-174 【c8】 塔里西奥·门德斯·德·法里亚斯 , Tatsuya Kushida公司 , 安娜·克劳迪娅·西蒙 , 克里斯托夫·德斯莫斯 , 千叶弘子 , 贝里克·巴斯蒂安 , Hiroshi Masuya先生 :
阿尔茨海默病研究中使用的数据:结合基因表达、形态、生物来源和疾病数据集。 SWAT4HCLS公司 2023 : 177-178 2022 [公元41年] 阿里娜·尼切佩罗维奇 , 阿德里安·奥尔登霍夫 , 克里斯托夫·德斯莫斯 , 新浪马基甸 :
OMAMO:基于同源性的替代模型生物选择。 生物信息。 38 ( 10 ) : 2965-2966 ( 2022 ) [j40] 安娜·克劳迪娅·西蒙 , 塔里西奥·门德斯·德·法里亚斯 , 玛丽亚·阿尼西莫娃 , 克里斯托夫·德斯莫斯 , 马克·罗宾森·里查维 , 埃里希·兹宾登 , 库尔特·斯托金格 :
Bio-SODA-UX:通过用户消歧,在知识图上实现自然语言问答。 分布式并行数据库 40 ( 2-3 ) : 409-440 ( 2022 ) [公元39年] 亚尼斯·内弗斯 , 塔姆辛·E·M·琼斯 , 杜希扬斯·乔蒂 , 贝珊·叶茨 , Meritxell雪貂 , 劳拉·波特尔·西尔瓦 , 莱亚·科多 , 萨尔瓦托尔·科森蒂诺 , 玛丽娜·马塞特·胡本 , 安娜·弗拉索娃 , 莱蒂蒂亚·波伊德温 , 阿诺德·克雷斯 , 马克·希克曼 , 艾玛·佩尔森 , 伊万娜·皮利佐塔 , 克里斯蒂娜·吉亚罗·克拉克 , 阿德里安·奥尔登霍夫 , Elspeth A.Bruford公司 , 克里斯托夫·德斯莫斯 , 英戈·埃伯斯伯格 , 大卫·M·埃姆斯 , 托尼·加巴顿 , 娜塔莎·M·格洛弗 , 胡艳辉 , 岩崎和太郎 , 奥迪尔·勒孔普特 , 本杰明·利纳德 , 玛丽亚·马汀 , 大卫·S·罗斯 , 埃里克·桑哈默 , 保罗·D·托马斯 , 大卫·蒂伯特 , 克拉斯·范德佩莱 , 萨尔瓦多·卡佩拉·古蒂雷兹 , 阿西尔·冈萨雷斯(Asier Gonzalez-Uriarte) , 哈维尔·加雷奥·文塔斯 , 德米特里·雷普切夫斯基 , Vicky Sundesha女士 , 埃里克·L·L·桑纳默 :
2022年骨科矫形基准服务的探索。 核酸研究。 50 ( 第1周 ) : 623-632 ( 2022 ) [i7] 塔里西奥·门德斯·德·法里亚斯 , 克里斯托夫·德斯莫斯 , 阿伦·阿利隆-贝尼特斯 , 陈阳 , 焦龙 , 安娜·克劳迪娅·西蒙 :
联合和查询异构和分布式Web API和三重存储。 CoRR公司 腹肌/2206.01594 ( 2022 ) 2021 [公元38年] 维克托·罗西尔 , 亚历克斯·沃里克·维斯特罗奇(Alex Warwick Vesztrocy) , 马克·罗宾森·里查维 , 克里斯托夫·德斯莫斯 :
OMAmer:树驱动和无对齐的蛋白质分配到亚家族优于最近序列方法。 生物信息。 37 ( 18 ) : 2866-2873 ( 2021 ) [公元37年] 克里斯托夫·德斯莫斯 , 特蕾莎·M·普尔兹蒂卡 :
ISMB/ECCB 2021程序。 生物信息。 37 ( 补充 ) : 7-8 ( 2021 ) [公元36年] 阿德里安·奥尔登霍夫 , Clément-Marie火车 , 金伯利·吉尔伯特 , 石田中藤 , 塔里西奥·门德斯·德·法里亚斯 , 大卫·莫伊 , 亚尼斯·内弗斯 , 哈尔·塞达·拉多伊科娃 , 维克托·罗西尔 , Alex Warwick Vesztrocy公司 , 娜塔莎·M·格洛弗 , 克里斯托夫·德斯莫斯 :
2021年OMA正畸学:网站大修、保守亚型、祖先基因顺序等。 核酸研究。 49 ( 发布数据库 ) : D373至D379 ( 2021 ) 【c7】 安娜·克劳迪娅·西蒙 , 塔里西奥·门德斯·德·法里亚斯 , 玛丽亚·阿尼西莫娃 , 克里斯托夫·德斯莫斯 , 马克·罗宾森·里查维 , 埃里希·兹宾登 , 库尔特·斯托金格 :
Bio-SODA:在没有训练数据的情况下,通过知识图实现自然语言问题解答。 SSDBM公司 2021 : 61-72 [i6] 安娜·克劳迪娅·西蒙 , 塔里西奥·门德斯·德·法里亚斯 , 玛丽亚·阿尼西莫娃 , 克里斯托夫·德斯莫斯 , 马克·罗宾森·里查维 , 埃里希·兹宾登 , 库尔特·斯托金格 :
Bio-SODA:在没有训练数据的情况下,通过知识图实现自然语言问题解答。 CoRR公司 abs/2104.13744 ( 2021 ) 2020 [j35] 亚历克斯·沃里克·维斯特罗奇(Alex Warwick Vesztrocy) , 克里斯托夫·德斯莫斯 :
使用否定注释对基因本体功能预测进行基准测试。 生物信息。 36 ( 补遗-1 ) : i210-i218型 ( 2020 ) [j34] 塞缪尔·布赖恩 , 克里斯托夫·德斯莫斯 , 纳迪娅·埃尔·马布鲁克 , 曼纽尔·拉丰德 , 加布里埃拉·洛宾斯卡 :
标记树的广义Robinson-Foulds距离。 BMC基因组。 21 ( S-10型 ) ( 2020 ) [公元33年] 阿德里安·奥尔登霍夫 , 哈维尔·加雷奥·文塔斯 , 萨尔瓦托尔·科森蒂诺 , 大卫·埃姆斯 , 娜塔莎·M·格洛弗 , Ana Hernández广场 , 亚尼斯·内弗斯 , Vicky Sundesha女士 , 达米安·什克拉茨克 , 何塞·玛丽亚·费尔南德斯 , 莱亚·科多 , 正交测井联盟之旅 , Josep Lluis Gelpí , 詹姆·韦尔塔-塞帕斯 , 岩崎和太郎 , 史蒂文·凯利 , 奥迪尔·勒孔普特 , 马蒂厄·穆法托 , 玛丽亚·耶稣·马丁 , 萨尔瓦多·卡佩拉·古蒂雷兹 , 保罗·D·托马斯 , 埃里克·L·L·桑纳默 , 克里斯托夫·德斯莫斯 :
2020年,Orthologs基准服务和共识呼吁的探索。 核酸研究。 48 ( Web服务器问题 ) : W538-W545型 ( 2020 ) [公元32年] 大卫·莫伊 , 劳伦特·基尔乔尔 , 巴勃罗·阿吉拉尔 , 克里斯托夫·德斯莫斯 :
使用MinHash的可缩放系统发育分析揭示了可能的真核生物有性生殖基因。 公共科学图书馆计算。 生物。 16 ( 7 ) ( 2020 ) 【c6】 斯图亚特·拜马 , 阿卡什·达萨德 , 阿德里安·奥尔登霍夫 , 克里斯托夫·德斯莫斯 , 詹姆斯·拉鲁斯 :
并行和可扩展的精确聚类。 协定 2020 : 217-228
2010 – 2019
2019 [公元31年] 安娜·克劳迪娅·西蒙 , 塔里西奥·门德斯·德·法里亚斯 , 埃里希·兹宾登 , 玛丽亚·阿尼西莫娃 , 曼努埃尔·吉尔 , 海因茨·斯托金格 , 库尔特·斯托金格 , 马克·罗宾森·里查维 , 克里斯托夫·德斯莫斯 :
支持跨联邦生物信息学数据库的语义查询。 数据库J.Biol。 数据库Curation 2019 : 巴西106 ( 2019 ) 【j30】 伊万娜·皮利佐塔 , Clément-Marie火车 , 阿德里安·奥尔登霍夫 , 亨宁·雷德斯蒂 , 克里斯托夫·德斯莫斯 :
系统发育方法用于识别同一基因片段,并应用于小麦基因组。 生物信息。 35 ( 7 ) : 1159-1166 ( 2019 ) [公元29年] Clément-Marie火车 , 米盖尔·皮格纳特里 , 阿德里安·奥尔登霍夫 , 克里斯托夫·德斯莫斯 :
iHam和pyHam:可视化和处理层次化的同源组。 生物信息。 35 ( 14 ) : 2504-2506 ( 2019 ) 【c5】 塔里西奥·门德斯·德·法里亚斯 , 库尔特·斯托金格 , 克里斯托夫·德斯莫斯 :
VoIDext:用虚拟链接增强可互操作数据集的词汇和模式。 OTM会议 2019 : 607-625 【c4】 布里斯特纳·奥普里萨努 , 克里斯托夫·德斯莫斯 , 埃米利亚诺·德·克里斯托法罗 :
GenoGuard到底“保护”了多少 基因组数据长期安全性的实证分析。 CCS的WPES 2019 : 93-105 [i5] 塔里西奥·门德斯·德·法里亚斯 , 克里斯托夫·德斯莫斯 :
通过虚拟链接增强互操作数据集。 CoRR公司 abs/1906.01950 ( 2019 ) [i4] 斯图亚特·拜马 , 阿卡什·达萨德 , 阿德里安·奥尔登霍夫 , 克里斯托夫·德斯莫斯 , 詹姆斯·拉鲁斯 :
用于同源蛋白发现的并行和可缩放精确聚类。 CoRR公司 腹肌/1908.10574 ( 2019 ) [i3] 奥普里萨努牛肝菌 , 克里斯托夫·德斯莫斯 , 埃米利亚诺·德·克里斯托法罗 :
GenoGuard到底“保护”了多少? 基因组数据长期安全性的实证分析。 CoRR公司 abs/1908.11315 ( 2019 ) [i2] 卡拉·卡勒布 , 亚历克斯·沃里克·维斯特罗奇(Alex Warwick Vesztrocy) , 阿德里安·奥尔登霍夫 , 克里斯托夫·德斯莫斯 :
扩展Orthologous Matrix(OMA)编程接口:REST API和 OmaDB公司 R和Python的包。 F1000研究 8 : 42 ( 2019 ) [i1] 安娜·克劳迪娅·西蒙 , 克里斯托夫·德斯莫斯 , 库尔特·斯托金格 , 莫妮克·扎恩·扎巴尔 , 塔里西奥·门德斯·德·法里亚斯 :
使用SPARQL跨多个数据源查询进化关系的实践介绍。 F1000研究 8 : 1822 ( 2019 ) 2018 [公元28年] 克里斯托弗·福斯伦德 , 塞西尔·佩雷拉 , 萨尔瓦多·卡佩拉·古蒂雷兹 , 阿兰·索萨·达席尔瓦 , 阿德里安·奥尔登霍夫 , 詹姆·韦尔塔-塞帕斯 , 马蒂厄·穆法托 , 马特乌斯·帕特里西奥 , 克拉斯·范德佩莱 , 英戈·埃伯斯伯格 , 朱迪思·A·布莱克 , 杰苏亚尔多·托马斯·费尔南德斯·布雷斯 , 正交测井联盟之旅 , 布里吉特·博克曼 , 托尼·加巴顿 , 埃里克·L·L·桑纳默 , 克里斯托夫·德斯莫斯 , 苏珊娜·刘易斯 :
在寻找直系木的过程中,准备好处理生命的马赛克性质。 生物信息。 34 ( 2 ) : 323-329 ( 2018 ) [公元27年] 亚历克斯·沃里克·维斯特罗奇(Alex Warwick Vesztrocy) , 克里斯托夫·德斯莫斯 , 亨宁·雷德斯蒂 :
使用层次同源群对引起QTL的候选基因进行优先排序。 生物信息。 34 ( 17 ) : i612-i619型 ( 2018 ) [公元26年] Wandrille Duchin公司 , 纪尧姆·根斯 , 安妮·穆里尔·阿里贡·奇福利奥 , 拉尔斯·阿维斯塔德 , 穆库尔·班萨尔 , 文森特·贝里 , 巴斯蒂安·布索 , 弗朗索瓦·切维内特 , 尼古拉斯·孔特 , 阿德里安·达文 , 克里斯托夫·德斯莫斯 , 大卫·戴卢斯 , 达米尔·哈西奇 , 迭戈·马洛 , 雷米飞机 , 大卫·波萨达 , 塞琳·斯科纳瓦卡 , Gergely J.Szöllosi先生 , 张路欣(Louxin Zhang) , 埃里克·坦尼尔 , 文森特·道宾 :
RecPhyloXML:协调基因树的格式。 生物信息。 34 ( 21 ) : 3646-3652 ( 2018 ) [公元25年] 阿德里安·奥尔登霍夫 , 娜塔莎·M·格洛弗 , Clément-Marie火车 , 卡拉·卡勒布 , 亚历克斯·沃里克·维斯特罗奇(Alex Warwick Vesztrocy) , 大卫·戴卢斯 , 塔里西奥·法里亚斯 , 卡琳娜·齐勒 , 查尔斯·史蒂文森 , 焦龙 , 亨宁·雷德斯蒂 , 加斯顿·H·贡内 , 克里斯托夫·德斯莫斯 :
2018年OMA正畸数据库:通过更丰富的网络和编程接口检索生命所有领域之间的进化关系。 核酸研究。 46 ( 发布数据库 ) : D477-D485型 ( 2018 ) [公元24年] 丹尼尔·米利钦 , 肖珊娜·沃达克 , Szymon Wasik公司 , 纳塔莉亚·绍斯塔克 , 克里斯托夫·德斯莫斯 :
向PLOS计算生物学和维基百科提交主题页面。 公共科学图书馆计算。 生物。 14 ( 5 ) ( 2018 ) 2017 [公元23年] Clément-Marie火车 , 娜塔莎·M·格洛弗 , 加斯顿·H·贡内 , 阿德里安·奥尔登霍夫 , 克里斯托夫·德斯莫斯 :
Orthologous Matrix(OMA)算法2.0:对非对称进化速率更加稳健,并且具有更大的可伸缩性层次化正交组推理。 生物信息。 33 ( 14 ) : i75-i82型 ( 2017 ) 2015 [公元22年] 阿德里安·奥尔登霍夫 , 尼夫·斯卡纳 , 娜塔莎·M·格洛弗 , Clément-Marie火车 , 安娜·苏基 , 伊万娜·皮利佐塔 , 凯文·戈里 , 巴特洛米耶·托米切克 , 史蒂文·米勒 , 亨宁·雷德斯蒂 , 加斯顿·H·贡内 , 克里斯托夫·德斯莫斯 :
2015年OMA正畸数据库:功能预测、更好的植物支持、合成视图和其他改进。 核酸研究。 43 ( 发布数据库 ) : 240-249 ( 2015 ) [公元21年] 马特·拉文霍尔 , 尼夫·斯卡纳 , 弗洛伦特·拉萨尔 , 克里斯托夫·德斯莫斯 :
推断水平基因转移。 公共科学图书馆计算。 生物。 11 ( 5 ) ( 2015 ) 2014 [公元20年] 埃里克·L·L·桑纳默 , 托尼·加巴顿 , 阿兰·索萨·达席尔瓦 , 玛丽亚·耶稣·马丁 , 马克·罗宾森·里查维 , 布里吉特·博克曼 , 保罗·D·托马斯 , 克里斯托夫·德斯莫斯 , 正交测井联盟之旅 :
寻找正交曲线时的大数据和其他挑战。 生物信息。 30 ( 21 ) : 2993-2998 ( 2014 ) 2013 [公元19年] 戈德曼 , 保罗·伯顿 , 陈思源(Siyuan Chen) , 克里斯托夫·德斯莫斯 , 艾米丽·勒普鲁斯特 , 波顿西波斯 , 伊万·伯尼 :
在合成DNA中实现实用、高容量、低维护的信息存储。 国家。 494 ( 7435 ) : 77-80 ( 2013 ) [公元18年] 米凯尔·桑纳克 , 阿尔贝托·乔瓦尼·布塞托 , 艾琳娜·努米宁 , 朱卡·科兰德 , 马蒂厄·福尔 , 克里斯托夫·德斯莫斯 :
近似贝叶斯计算。 公共科学图书馆计算。 生物。 9 ( 1 ) ( 2013 ) 2012 [公元17年] 克里斯托夫·德斯莫斯 , 托尼·加巴顿 , 大卫·S·罗斯 , 埃里克·L·L·桑纳默 , 哈维尔·埃雷罗 :
在寻求直系木的过程中达到社区标准。 生物信息。 28 ( 6 ) : 900-904 ( 2012 ) [公元16年] 阿德里安·奥尔登霍夫 , 罗曼·斯塔德 , 马克·罗宾森·里查维 , 克里斯托夫·德斯莫斯 :
解决正态分布推测:正态分布趋向于弱,但重要的是,在功能上比Paralog更相似。 公共科学图书馆计算。 生物。 8 ( 5 ) ( 2012 ) [公元15年] 尼夫·斯卡纳 , 阿德里安·奥尔登霍夫 , 克里斯托夫·德斯莫斯 :
计算推断基因本体论注释的质量。 公共科学图书馆计算。 生物。 8 ( 5 ) ( 2012 ) 2011 [公元14年] 克里斯托夫·德斯莫斯 :
编辑:矫形学和应用。 生物信息简报。 12 ( 5 ) : 375-376 ( 2011 ) [j13] 布里吉特·博克曼 , 马克·罗宾森·里查维 , Ioannis Xenarios公司 , 克里斯托夫·德斯莫斯 :
基于参考基因树的系统发育数据库基准的概念框架和初步研究。 生物信息简报。 12 ( 5 ) : 423-435 ( 2011 ) [公元12年] 克里斯托夫·德斯莫斯 , 行官斯特凡·佐勒 , 特丽莎·马努萨基 , 寰球 , 阿克塞尔·梅耶 , Shigehiro Kuraku先生 :
比较基因组学方法检测低覆盖率基因组中的分裂编码区:嵌合体的教训 叶吻银鲛 (全新目,软骨鱼类)。 生物信息简报。 12 ( 5 ) : 474-484 ( 2011 ) [公元11年] 克里斯蒂安·莱德格尔(Christian Ledergerber) , 克里斯托夫·德斯莫斯 :
下一代测序平台的基本呼叫。 生物信息简报。 12 ( 5 ) : 489-497 ( 2011 ) [公元10年] 路易斯·杜普莱西斯 , 尼夫·斯卡纳 , 克里斯托夫·德斯莫斯 :
基因本体论的内容、位置、方式和原因——生物信息学家的入门。 生物信息简报。 12 ( 6 ) : 723-735 ( 2011 ) [公元9年] 阿德里安·奥尔登霍夫 , 阿德里安·施耐德 , 加斯顿·H·贡内 , 克里斯托夫·德斯莫斯 :
OMA 2011:1000个完整基因组的同源推断。 核酸研究。 39 ( 发布数据库 ) : 289-294 ( 2011 )
2000 – 2009
2009 [j8] 亚历山大·C·J·罗斯 , 加斯顿·H·贡内 , 克里斯托夫·德斯莫斯 :
大规模正交推理的OMA算法。 BMC生物信息。 10 ( 2009 ) [j7] 亚历山大·盖蒂克 , 克里斯托夫·德斯莫斯 , 阿德里安·施耐德 , Ioannis Xenarios公司 , 马尔科·帕格尼 , 雅克·罗杰蒙特 :
用于比较基因组学的Microbe浏览器。 核酸研究。 37 ( Web服务器发布 ) : 296-299 ( 2009 ) [j6] 阿德里安·奥尔登霍夫 , 克里斯托夫·德斯莫斯 :
正统推断项目和方法的系统发育和功能评估。 公共科学图书馆计算。 生物。 5 ( 1 ) ( 2009 ) 2008 [j5] 亚历山大·C·J·罗斯 , 加斯顿·H·贡内 , 克里斯托夫·德斯莫斯 :
大规模正交推理的OMA算法。 BMC生物信息。 9 ( 2008 ) 【j4】 克里斯蒂安·莱德格尔(Christian Ledergerber) , 克里斯托夫·德斯莫斯 :
具有非重叠移动、反转和串联重复的对齐 O(运行) ( n个 4 )时间。 J.库姆。 最佳方案。 16 ( 三 ) : 263-278 ( 2008 ) 【c3】 克里斯托夫·德斯莫斯 , 丹尼尔·马加丹特 , 加斯顿·H·贡内 :
DLIGHT-在统计框架中使用成对进化距离进行横向基因转移检测。 重组 2008 : 315-330 2007 [j3] 阿德里安·施耐德 , 克里斯托夫·德斯莫斯 , 加斯顿·H·贡内 :
OMA浏览器-探索352个完整基因组之间的同源关系。 生物信息。 23 ( 16 ) : 2180-2182 ( 2007 ) 【c2】 克里斯蒂安·莱德格尔(Christian Ledergerber) , 克里斯托夫·德斯莫斯 :
非重叠运动、反转和串联重复的对准 O(运行) ( n个 4 )时间。 茧 2007 : 151-164 2006 [注2] 克里斯托夫·德斯莫斯 , 曼努埃尔·吉尔 , 阿德里安·施耐德 , 加斯顿·H·贡内 :
同源序列三元组中两个PAM/JTT进化距离之间差异的快速估计。 BMC生物信息。 7 : 529 ( 2006 ) 2005 [j1] 曼努埃尔·吉尔 , 克里斯托夫·德斯莫斯 , 加斯顿·H·贡内 :
系统发育距离树的无量纲拟合度量。 J.生物信息。 计算。 生物。 三 ( 6 ) : 1429-1440 ( 2005 ) [c1] 克里斯托夫·德斯莫斯 , 吉娜Cannarozzi , 曼努埃尔·吉尔 , 丹尼尔·马加丹特 , 亚历山大·C·J·罗斯 , 阿德里安·施耐德 , 加斯顿·H·贡内 :
OMA,一个从完整基因组数据中鉴定同源物的综合自动化项目:简介和首次成果。 比较基因组学 2005 : 61-72