安妮·西格尔
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2020年–今天
2024 [公元31年] 海军陆战队Louarn , 纪尧姆·科莱 , Ève Barré , 蒂埃里·费斯特 , 奥利维尔·达梅隆 , 安妮·西格尔 , Fabrice Chatonnet公司 :
Regulus利用离散化和似然约束从少数样本的信息中推断出有符号的监管关系。 公共科学图书馆计算。 生物。 20 ( 1 ) ( 2024 ) [第15条] 凯里安·瑟利尔 , 安妮·西格尔 , 洛伊克·保列夫 :
基于CEGAR的组合优化模量化线性算法问题求解方法。 啊啊啊 2024 : 8146-8153 2022 【j30】 安娜·尼亚拉基斯 , 达格马尔·沃尔特马 , 詹姆斯·格雷泽 , 福尔克·施赖伯 , 莎拉·基廷 , 大卫·P·尼克森 , 克劳丁·朝义亚(Claudine Chaouiya) , 安妮·西格尔 , 文森特·诺埃尔 , 亨宁·赫姆贾科布 , 托马斯·赫利卡 , 西尔万·索利曼 , 劳伦斯·卡尔松 :
寻址 系统生物学中计算模型的全面性、可访问性、可重用性、互操作性和再现性障碍 。 生物信息简报。 23 ( 4 ) ( 2022 ) [公元29年] 海军陆战队Louarn , Fabrice Chatonnet公司 , 泽维尔·加尼尔 , 蒂埃里·费斯特 , 安妮·西格尔 , 凯瑟琳·法隆 , 奥利维尔·达梅隆 :
提高数据生命周期中的可重用性:监管电路案例研究。 J.生物识别。 塞芒。 13 ( 1 ) : 11 ( 2022 ) [公元28年] 皮埃尔·维格内特 , 让·科奎特 , 塞巴斯蒂安·奥伯 , 马特奥·布代特 , 安妮·西格尔 , 纳塔利·塞雷特 :
大规模信号网络集成和分析的离散建模。 公共科学图书馆计算。 生物。 18 ( 6 ) ( 2022 ) 2021 [公元27年] 弗朗索瓦·莫里斯 , 雨果·西蒙 , 安妮·西格尔 , 弗洛伦斯·冈德雷特 , 艾曼纽尔·贝克尔 :
PAX2GRAPHML:使用BioPAX进行大规模监管网络分析的python库。 生物信息。 37 ( 24 ) : 4889-4891 ( 2021 ) [公元26年] 马埃尔·柯南 , 纳塔利·塞雷特 , 索菲·兰古埃 , 安妮·西格尔 :
构建代谢的异种生物图谱,预测能够与DNA结合的催化代谢产物的酶。 BMC生物信息。 22-S系列 ( 三 ) : 450 ( 2021 ) [公元25年] 劳伦斯·加扎雷克 , 尤利塞·盖耶 , 雨果·多雷 , 格雷戈里·法兰特 , 马克·霍贝克 , 洛琳·布里莱特·盖根 , 安托万·比什 , 马蒂尔德·费里尤斯 , Jukka Siltanen公司 , 埃尔万·勒科尔 , Gildas Le Corguillé , Morgane Ratin公司 , 弗朗西斯·皮特 , 马丁·奥斯特罗斯基 , 马埃尔·柯南 , 安妮·西格尔 , 卡琳·拉巴迪 , Jean-Marc Aury女士 , 帕特里克·温克 , 大卫·J·斯坎兰 , 弗雷德里克·帕滕斯基 :
Cyanorak v2.1:一个可扩展的信息系统,用于可视化和专家管理海洋和微咸苦蓝细菌基因组。 核酸研究。 49 ( 发布数据库 ) : D667-D676型 ( 2021 ) [第14条] 凯里安·瑟利尔 , 卡罗琳·巴罗克 , 亚历山大·博克迈尔 , 卢多维克·科特雷特 , 洛伊克·保莱韦 , 安妮·西格尔 :
在调节代谢网络中学习布尔控制:一个案例研究。 CMSB公司 2021 : 159-180
2010 – 2019
2019 [公元24年] 克莱门斯·弗里克斯 , 托尔斯滕·绍布 , 塞巴斯蒂安·谢尔霍恩 , 安妮·西格尔 , 菲利普·万科 :
混合代谢网络完成。 理论与实践。 日志。 程序。 19 ( 1 ) : 83-108 ( 2019 ) [第13条] 海军陆战队Louarn , Fabrice Chatonnet公司 , 泽维尔·加尼尔 , 蒂埃里·费斯特 , 安妮·西格尔 , 奥利维尔·达梅隆 :
使用语义Web技术提高生命科学资源的可重用性。 电子科学 2019 : 217-225 2018 [公元23年] 克莱门斯·弗里克斯 , 埃诺拉·弗雷米 , 卡米尔·特罗蒂尔 , 安妮·西格尔 :
微生物联盟对代谢功能进行了可扩展和详尽的筛选。 生物信息。 34 ( 17 ) : i934-i943型 ( 2018 ) [公元22年] 梅齐安·艾特 , 玛丽·雪瓦利埃 , 克莱门斯·弗里克斯 , 卡米尔·特罗蒂尔 , 珍妮得到了 , 玛丽亚·帕斯·科尔特斯 , 塞巴斯蒂安·门多萨 , 格雷戈里承运人 , 奥利维尔·达梅隆 , 尼古拉斯·吉拉德(Nicolas Guillaudeux) , 毛里西奥·拉托雷 , 尼科拉斯·洛拉 , 加布里埃尔·V·马尔科夫 , 亚历杭德罗·马斯 , 安妮·西格尔 :
基因组尺度代谢模型“a-la-carte”重建的可追溯性、再现性和维基探索。 公共科学图书馆计算。 生物。 14 ( 5 ) ( 2018 ) [公元21年] 米斯巴·拉扎克 , 洛伊克·保列夫 , 安妮·西格尔 , 朱利奥·塞兹·罗德里格斯 , 杰雷米·波登 , 卡里托·古齐奥洛夫斯基 :
从多路时间进程数据中计算发现动态细胞系特定布尔网络。 公共科学图书馆计算。 生物。 14 ( 10 ) ( 2018 ) [i6] 克莱门斯·弗里克斯 , 托尔斯滕·绍布 , 塞巴斯蒂安·谢尔霍恩 , 安妮·西格尔 , 菲利普·万科 :
混合代谢网络完成。 CoRR公司 abs/1808.04149 ( 2018 ) 2017 [公元20年] 圣地亚哥·维德拉 , 朱利奥·塞兹·罗德里格斯 , 卡里托·古齐奥洛夫斯基 , 安妮·西格尔 :
caspo:用于对逻辑信号网络家族的响应进行自动推理的工具箱。 生物信息。 33 ( 6 ) : 947-950 ( 2017 ) [公元19年] 文森特·皮卡德 , 安妮·西格尔 , 杰雷米·波登 :
检查反应网络概率稳态性质的逻辑。 J.计算。 生物。 24 ( 8 ) : 734-745 ( 2017 ) [公元18年] 西尔万·普里金特 , 克莱门斯·弗里克斯 , 西蒙·迪塔米 , 斯文·蒂勒 , 阿卜杜勒哈利姆·拉里米 , 纪尧姆·科莱 , 法比安·古特内赫特 , 珍妮得到了 , 达米安·埃维拉德 , 杰雷米·波登 , 油炸普勒尼亚克 , 蒂埃里·托农 , 安妮·西格尔 :
Meneco,一种基于拓扑的间隙填充工具,适用于退化的全基因组代谢网络。 公共科学图书馆计算。 生物。 13 ( 1 ) ( 2017 ) [第12条] 克莱门斯·弗里克斯 , 托尔斯滕·绍布 , 塞巴斯蒂安·谢尔霍恩 , 安妮·西格尔 , 菲利普·万科 :
混合代谢网络完成。 低密度核磁共振 2017 : 308-321 2016 [公元17年] 马克斯·奥斯特罗斯基 , 洛伊克·保列夫 , 托尔斯滕·绍布 , 安妮·西格尔 , 卡里托·古齐奥洛夫斯基 :
从扰动时间序列数据中结合动力学抽象和逻辑编程进行布尔网络辨识。 生物晶体。 149 : 139-153年 ( 2016 ) [公元16年] 维森特·阿库尼亚 , 安德烈斯·阿拉维纳 , 卡里托·古齐奥洛夫斯基 , 达米安·埃维拉德 , 安妮·西格尔 , 亚历杭德罗·马斯 :
解读协调应对环境变化的转录规则。 BMC生物信息。 17 : 35 ( 2016 ) 2015 [公元15年] 斯文·蒂勒 , 卢卡·塞隆 , 朱利奥·塞兹·罗德里格斯 , 安妮·西格尔 , 卡里托·古齐奥洛夫斯基 , 斯特芬·克拉姆 :
扩展了符号一致性的概念,将实验数据与信令和监管网络拓扑联系起来。 BMC生物信息。 16 : 345:1-345:13 ( 2015 ) [公元14年] 圣地亚哥·维德拉 , 卡里托·古齐奥洛夫斯基 , 费德里卡·埃德瓦蒂 , 斯文·蒂勒 , 马丁·格布瑟 , 雅克·尼古拉斯 , 朱利奥·塞兹·罗德里格斯 , 托尔斯滕·绍布 , 安妮·西格尔 :
用ASP.NET学习信号网络的布尔逻辑模型。 西奥。 计算。 科学。 599 : 79至101 ( 2015 ) [第11条] 马克斯·奥斯特罗斯基 , 洛伊克·保列夫 , 托尔斯滕·绍布 , 安妮·西格尔 , 卡里托·古齐奥洛夫斯基 :
多重时间序列数据的布尔网络识别。 CMSB公司 2015 : 170-181 [第10条] 蒂莫·朱利维特 , 安妮·西格尔 :
由替换产生的自诱导系统的可判定性问题。 MCU(微控制器) 2015 : 3-16 2014 [j13] 卡里托·古齐奥洛夫斯基 , 圣地亚哥·维德拉 , 费德里卡·埃德瓦蒂 , 斯文·蒂勒 , 托马斯·科克勒 , 安妮·西格尔 , 朱利奥·塞兹·罗德里格斯 :
使用应答集编程详尽地描述信令网络的可行逻辑模型。 生物信息。 30 ( 13 ) : 1942 ( 2014 ) [公元12年] 乌马鲁·阿卜杜·阿尔比 , 索菲·莱莫斯奎特 , 贾普·范·米尔根 , 安妮·西格尔 , 杰雷米·波登 :
通过系统输出前体集的定量研究,探索复杂生物体的代谢灵活性。 BMC系统。 生物。 8 : 8 ( 2014 ) [公元11年] 皮埃尔·布拉维 , 弗洛伦斯·冈德雷特 , Sandrine Lagarrigue公司 , 贾普·范·米尔根 , 安妮·西格尔 :
使用一个关于反应和调节的大规模知识数据库,提出参与细胞代谢的各种分子组的关键上游调节器。 BMC系统。 生物。 8 : 32 ( 2014 ) [j10] 瓦莱里·伯瑟 , 蒂莫·朱利维特 , 安妮·西格尔 :
与Arnoux-Rauzy替换相关的分形的连通性。 RAIRO提奥。 信息学应用。 48 ( 三 ) : 249-266 ( 2014 ) 【c9】 维森特·阿库尼亚 , 安德烈斯·阿拉维纳 , 亚历杭德罗·马斯 , 安妮·西格尔 :
节俭假设监管网络建模:复杂性和启发式方法。 VMCAI公司 2014 : 322至336 【c8】 文森特·皮卡德 , 安妮·西格尔 , 杰雷米·波登 :
随机模拟算法的多元正态逼近:极限定理和应用。 南非统计局 2014 : 67-82 [i5] 瓦莱里·伯瑟 , 杰雷米·波登 , 蒂莫·朱利维特 , 安妮·西格尔 :
活塞替代产品的组合方法。 CoRR公司 abs/1401.0704 ( 2014 ) 2013 [公元9年] 卡里托·古齐奥洛夫斯基 , 圣地亚哥·维德拉 , 费德里卡·埃德瓦蒂 , 斯文·蒂勒 , 托马斯·科克勒 , 安妮·西格尔 , 朱利奥·塞兹·罗德里格斯 :
使用应答集编程详尽描述信令网络的可行逻辑模型。 生物信息。 29 ( 18 ) : 2320-2326 ( 2013 ) [j8] 罗兰·卡明斯基 , 托尔斯滕·绍布 , 安妮·西格尔 , 圣地亚哥·维德拉 :
使用ASP的逻辑信号网络中的最小干预策略。 理论与实践。 日志。 程序。 13 ( 4-5 ) : 675-690 ( 2013 ) 【c7】 瓦莱里·伯瑟 , 杰雷米·波登 , 蒂莫·乔里韦 , 安妮·西格尔 :
使用替换生成离散平面。 话 2013 : 58-70 【c6】 菲利普·博德伦 , 达米安·埃维拉德 , 亚历杭德罗·马斯 , 安妮·西格尔 , 斯文·蒂勒 :
ASP在集成生物学中的应用:功能基因单元的鉴定。 低密度核磁共振 2013 : 206-218 【c5】 纪尧姆·科莱 , 达米安·埃维拉德 , 马丁·格布瑟 , 西尔万·普里金特 , 托尔斯滕·绍布 , 安妮·西格尔 , 斯文·蒂勒 :
扩展新陈代谢网络 硅外果皮 使用答案集编程。 低密度核磁共振 2013 : 245-256 2012 【c4】 圣地亚哥·维德拉 , 卡里托·古齐奥洛夫斯基 , 费德里卡·埃德瓦蒂 , 斯文·蒂勒 , 尼尔斯·格雷布 , 朱利奥·塞兹·罗德里格斯 , 安妮·西格尔 :
用ASP。 CMSB公司 2012 : 342-361 [i4] 圣地亚哥·维德拉 , 卡里托·古齐奥洛夫斯基 , 费德里卡·埃德瓦蒂 , 斯文·蒂勒 , 尼尔斯·格雷布 , 朱利奥·塞兹·罗德里格斯 , 安妮·西格尔 :
用基于答案集编程的形式化方法重新审视蛋白质信号网络逻辑模型的训练。 CoRR公司 abs/1210.0690 ( 2012 ) 2011 [j7] 杰雷米·波登 , 达米安·埃维拉德 , 安妮·西格尔 :
将定量知识整合到定性基因调控网络中。 公共科学图书馆计算。 生物。 7 ( 9 ) ( 2011 ) [j6] 卡里托·古齐奥洛夫斯基 , 西尔万·布拉科恩 , 塔蒂亚娜·鲍穆拉托娃 , 高蒂尔·斯托尔 , 奥维迪乌·拉杜列斯库 , 安妮·西格尔 :
设计逻辑规则来模拟具有复杂交互作用的生物分子网络的响应:在癌症建模中的应用。 IEEE ACM传输。 计算。 生物信息。 8 ( 5 ) : 1223-1234 ( 2011 ) [j5] 奥维迪乌·拉杜列斯库 , 安妮·西格尔 , 伊丽莎白·佩库 , 克莱门·查特兰 , Sandrine Lagarrigue公司 :
基因调控的代谢网络:Gale-Nikaido模块和微分不等式。 事务处理。 公司。 系统。 生物 13 : 110-130 ( 2011 ) [i3] 瓦莱里·伯瑟 , 蒂莫·朱利维特 , 安妮·西格尔 :
与Arnoux-Rauzy替换相关的分形的连通性。 CoRR公司 abs/1101.1784 ( 2011 ) [i2] 瓦莱里·伯瑟 , 蒂莫·朱利维特 , 安妮·西格尔 :
替代Arnoux-Rauzy序列具有纯离散谱。 CoRR公司 abs/1108.5574 ( 2011 ) 2010 【j4】 塔蒂亚娜·鲍穆拉托娃 , 迪迪埃·苏尔德斯 , 伯纳德·德尔扬 , 戈蒂埃·斯托尔 , 奥利维尔·特拉特 , 奥维迪乌·拉杜列斯库 , 安妮·西格尔 :
在尤因肉瘤基因调控网络中定位潜在活性转录后调控。 BMC系统。 生物。 4 : 146 ( 2010 ) 【c3】 马丁·格布瑟 , 卡里托·古齐奥洛夫斯基 , 米哈伊尔·伊万奇夫 , 托尔斯滕·绍布 , 安妮·西格尔 , 斯文·蒂勒 , 菲利普·韦伯 :
基于答案集编程的大型生物网络中的修复和预测(不一致情况下)。 韩国 2010 [i1] 托尔斯滕·绍布 , 安妮·西格尔 :
从监管网络和数据集进行测试、诊断、修复和预测。 ERCIM新闻 2010 ( 82 ) : 30 ( 2010 )
2000 – 2009
2009 【c2】 西尔万·布拉科恩 , 戈蒂埃·斯托尔 , 卡里托·古齐奥洛夫斯基 , Andrei Yu。 季诺维也夫 , 艾曼纽尔·巴里略 , 安妮·西格尔 , 奥维迪乌·拉杜列斯库 :
通过基因影响网络将患者间基因拷贝数变化与基因表达关联的方法。 AIAI研讨会 2009 : 72-87 2008 【b1】 安妮·西格尔 :
分析系统的动态特征。 例如,nombres和biologie moléculaire的应用。 (用离散方法分析动力系统。在数论和分子生物学中的应用)。 法国雷恩1大学, 2008 [j3] 菲利普·韦伯 , 卡里托·古齐奥洛夫斯基 , 米歇尔·勒博涅 , 奥维迪乌·拉杜列斯库 , 安妮·西格尔 :
推断转录因子在调控网络中的作用。 BMC生物信息。 9 ( 2008 ) [注2] 迪迪埃·考卡尔 , 安妮·西格尔 :
前言。 RAIRO提奥。 信息学应用。 42 ( 三 ) : 415 ( 2008 ) 【c1】 卡里托·古齐奥洛夫斯基 , 杰里米·格拉尔 , 奥维迪乌·拉杜列斯库 , 安妮·西格尔 :
通过评估其与表达式数据集的一致性来管理大型监管网络。 CIBB公司 2008 : 144-155 2004 [j1] 皮埃尔·阿诺克斯 , 瓦莱丽·贝塞 , 安妮·西格尔 :
二维迭代态射和离散平面。 西奥。 计算。 科学。 319 ( 1-3 ) : 145-176 ( 2004 )